EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

EnhancerAtlas 2.0

EnhancerAtlas 2.0 integrated enhancers from 12 high-throupghput technologies including P300, Histone, POLR2A, TF-binding, DHS, FAIRE, Mnase-seq, GRO-seq, STARR-seq, CAGE, CHIA-PET, and MPRA. Users could click any tissue/cell type to view relative enhancers.




Homo sapiens

This species contains 6031402 enhancers across 277 different tissue/cell types.

786-O (9258)
A375 (10206)
A549 (49760)
AML_blast (565)
Astrocyte (44489)
BE2C (18191)
BJ (3275)
B_cell_blood (4356)
C4-2 (791)
Caco-2 (26695)
Calu-3 (274)
CCRF-CEM (4317)
CD133+ (1812)
CD14+ (895)
CD19+ (25121)
CD20+ (16914)
CD34+ (47306)
CD36+ (434)
CD4+ (14464)
CD8+ (26820)
Cerebellum (17103)
CMK (2318)
CNCC (35537)
Colo320 (1371)
Colo829 (4399)
CUTLL1 (15877)
CyT49 (16414)
DLD1 (1025)
DOHH2 (402)
ECC-1 (31905)
ESC (43128)
ESC_neuron (23486)
ESC_NPC (8453)
Esophagus (36215)
EWS502 (22989)
Fetal_brain (49925)
Fetal_heart (45289)
Fetal_kidney (13949)
Fetal_lung (72683)
Fetal_stomach (72506)
Fetal_thymus (28757)
FT246 (4177)
FT33 (9022)
GC_B_cell (16500)
Gliobla (1342)
GM10847 (8450)
GM12878 (49672)
GM12891 (37461)
GM12892 (26007)
GM18486 (16988)
GM18505 (6998)
GM18507 (17319)
GM18508 (5214)
GM18516 (5531)
GM18522 (7254)
GM18526 (5884)
GM18951 (8895)
GM19099 (1641)
GM19141 (432)
GM19193 (2057)
GM19238 (15394)
GM19239 (17256)
GM19240 (1500)
H1 (58821)
H128 (12099)
H2171 (17372)
H54 (544)
H9 (39732)
HACAT (22022)
HCASMC (38707)
HCC1954 (2971)
HCT116 (4418)
Heart (2797)
HEK293 (13167)
HEK293T (21417)
Hela (13557)
HeLa-S3 (56431)
Hepatocyte (321)
HepG2 (50160)
HFF (39714)
HL-60 (33112)
hMADS-3 (45045)
HMEC (32707)
hNCC (1126)
HSC (23)
HSMM (60216)
HSMMtube (23556)
HT1080 (346)
HT29 (47933)
HuCCT1 (24079)
HUES64 (27035)
HUVEC (63977)
IMR90 (85732)
iPSC (2503)
Jurkat (21360)
K562 (43148)
Kasumi-1 (24413)
KATO3 (5291)
KB (5158)
KELLY (15875)
Keratinocyte (39555)
Kidney (543)
LHCN-M2 (7444)
Liver (20227)
LNCaP (38910)
LNCaP-1F5 (739)
LNCaP-abl (6443)
LoVo (15330)
LP-1 (5775)
LS174T (115)
Lung (22538)
LY1 (3732)
Macrophage (33524)
MCF-7 (23858)
MCF10A (39286)
MDA-MB-231 (29258)
ME-1 (9870)
Melanocyte (1447)
melanoma (33138)
Mesendoderm (65966)
MM1S (2414)
Monocyte (21195)
MS1 (20)
MSC_BM (45184)
Myotube (59800)
Namalwa (3058)
NB4 (19621)
NCCIT (6696)
NGP (3421)
NH-A (12609)
NHBE (28156)
NHDF (15730)
NHEK (44686)
NHLF (19670)
NKC (1241)
NT2-D1 (12020)
OCI-LY1 (12849)
OCI-Ly7 (626)
Osteobl (4241)
Osteoblast (23195)
Ovary (14836)
P493-6 (12554)
PANC-1 (14835)
Pancreas (60477)
PBMC (148)
PC3 (16251)
PrEC (996)
Raji (13591)
Ramos (16388)
REH (703)
Retina (7439)
RPE (3708)
RPTEC (512)
RS4-11 (4194)
SEM (1254)
SH-SY5Y (15440)
SK-MEL-5 (7345)
SK-N-MC (35891)
SK-N-SH (44078)
SK-N-SH_RA (24907)
SkMC (26241)
Sperm (17470)
Spleen (22578)
T47D (32455)
T47D-MTVL (15279)
T98G (9619)
TC-797 (303)
Th1 (26137)
Th2 (13654)
Thymus (3112)
Treg_cell (13599)
Trophoblast (40886)
U2OS (14819)
U87 (37957)
VCaP (7682)
ZR75-1 (32462)
ZR75-30 (22784 )