EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS167-00435 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Retina 
Coordinate
chr1:8062110-8067600 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs147539868chr18065945hg19
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr1:8066589-8066600TTTGATACATT-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:8065680-8065698CCTTCCTTTCCTTCCTCC-6.04
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:8065668-8065686CACAGCTTCCTTCCTTCC-6.42
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:8065693-8065711CCTCCCTTCCTTCCTTTT-6.66
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:8065676-8065694CCTTCCTTCCTTTCCTTC-7.26
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:8065672-8065690GCTTCCTTCCTTCCTTTC-8.73
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:8065685-8065703CTTTCCTTCCTCCCTTCC-8.96
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:8065689-8065707CCTTCCTCCCTTCCTTCC-9.83
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Foxd3MA0041.1chr1:8064650-8064662AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:8064654-8064666AAACAAACAAAC-6.32
IRF1MA0050.2chr1:8065984-8066005TTTTTCTTTTTCTTTTTTTTT+6.09
POU2F2MA0507.1chr1:8067402-8067415AAATGCAAATTAA-6.25
RREB1MA0073.1chr1:8066362-8066382CCCCACACCAAAACCCCACC+6.72
ZNF263MA0528.1chr1:8065676-8065697CCTTCCTTCCTTTCCTTCCTC-6.17
ZNF263MA0528.1chr1:8065689-8065710CCTTCCTCCCTTCCTTCCTTT-6.55
ZNF263MA0528.1chr1:8066746-8066767CTCTCCTCTCCTCCTTTCTCC-6.5
ZNF263MA0528.1chr1:8065685-8065706CTTTCCTTCCTCCCTTCCTTC-6.64
ZNF263MA0528.1chr1:8065677-8065698CTTCCTTCCTTTCCTTCCTCC-6.66
ZNF263MA0528.1chr1:8065680-8065701CCTTCCTTTCCTTCCTCCCTT-6.84
Number of super-enhancer constituents: 21             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01874chr1:8063992-8066026Aorta
SE_26425chr1:8064054-8065901Duodenum_Smooth_Muscle
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SE_33765chr1:8066161-8067182HCC1954
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SE_34846chr1:8062960-8067246HeLa
SE_36407chr1:8062975-8067223HMEC
SE_36931chr1:8063255-8067283HSMMtube
SE_43122chr1:8063878-8066645Lung
SE_45526chr1:8063740-8066094NHLF
SE_45858chr1:8063107-8066058Osteoblasts
SE_45858chr1:8066119-8067206Osteoblasts
SE_47106chr1:8062173-8071866Panc1
SE_51696chr1:8063859-8066059Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_54897chr1:8063809-8066053Stomach_Smooth_Muscle
SE_55872chr1:8063778-8065976u87
SE_63484chr1:8063858-8066059HSMM
SE_64486chr1:8062964-8066094NHEK
SE_64486chr1:8066114-8067465NHEK
SE_67534chr1:8063778-8065976u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr180668968067015
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I008002chr180628908067152
GH01I008012chr180673618067481
Enhancer Sequence
GGCTAATTTT TGTATTTTTA GTAGAGACGG GGTTTCACTA TGTTGGCCAG GCTGGTCTCG 60
AACTCCTGCC CTTGTGATCT GCCCGCCTTG GCTTCCCAAA ATGCAGGGAT TACAGGTAGG 120
GGCCACCGTG CCCAGCCTAA CAGCCTGTTC TTATTTCACG AATATAATGT TCTGTCTAAT 180
CTCCAAGGAT TGTTTTAACA TGTTTGCTTT GTGAAATGTT TGCATGGGGA GTTGCATGTT 240
TATTGAGTTT TGTACTTTTC TTGATATTAA TTTTCCTCAA ATGCTTCGCA ATTTAAATTT 300
TGGGCTCATA TTTCAAAATT CCTATTCTCC TGTCTGTTGA ACCAGGTTCT GATGACATGA 360
GTTTGCCTCT GATAACCACA GCAGAGGAAA CACAGGGCAG TGTGAGGAAG GCTGAGTCCT 420
CTCAGTCAGG AGGGCCTTTC TAGCCCACCT AGAAATAGTG CAGATTTCTT GCTACCCAGG 480
GTCTTGCTGT GCCTCTTGTC ACCAGTGCTC TGGCCTGTGT GCACATACTC ACTGTGACAC 540
AGTTTAGCAT GAGAGAGGTG GGGAAGGGGG CGAAGGCAGC TGGCTGATCC TCCAAAAGCC 600
CCCAGATAAT CACCCTGACT CCTGCCCCAG GGCTCCTTCC TGTTCCCTAT TTCCATAAAG 660
GGCAGAGCTT TCTCAGAACT CACAGCCACC TTCACAGAAG TCATCTCCTA TAGATTTTTT 720
TGTTTGTTTG TTTTTTGAGA CGGAGTCTCA CTCTGTCCCC CAGGCTGGAG TGCAGTGGCA 780
AGATTTCGGC TCACTGAAAC CTCCGCCTCC TGGGTTCAGC AATTTTCCTG CCTCAGCCTC 840
CCGAGTAGCT GGAACTACAG GTGTGAGCCA CCATGTCTGG CTAATTTTTG TATTTTTAAT 900
AGAGATGGGG TTTCACCATG TTGGCTAGGC TGGTCTCAAA CTCCTGGCCT CAAGTGATCC 960
ACTCGCCTCG GCCTTCAAAG TGCTGGGATT ACAGGCGTGA GCCACTGCAC CCGGCCCCTC 1020
CTGTAGATCT TTTAGCCTTT GGTCTTTTCT TTGGTCTTAT TTCTCCATCA CACAAGACCC 1080
ATCTGTTTTC TATCTTTCAT GAATTCCTGA AACAGTCTGG TATGCCAATA AACACTTTTG 1140
TTTTTCAGTA ATGGGTTTAT TCTGAATTTC AGGAGATTTT CAGATGTGTA GCAGGAGGGC 1200
TATGGGACTC TTTGTGGCCC TCCATATCCA TGTTACATTA CACTCCTGGC TATGACCTGT 1260
CACATAGTTG TTCTGTGCCA CTTTGATTAA CAGCACAGTG TACCTTGTCT TGGTTGGTCT 1320
TCATGCTTAC AGGAAAAAGA CCTGCCAACA TCAGGATTTG TAACCAGAAA AGGCATTGAA 1380
AACATATCCT CAAAATCAGG CTATCAAATT TTAGAAGGAA ACCTTTCAGA CCTAGAATCA 1440
GTTATGGAGA AGTGAGATGA TAAACAGTTC CAGAAACTGT AAATGGACTG CTTCTAAGCC 1500
ACAACTTGTC TTCGTACACA CTGATGTATA CATAATATGG CAAAGTTTTA TGTGCAACTG 1560
AGGGTGTGGC ATTTATGATT CAGAAAGAAT GAGTTCGTGT AGATGGAAAT GGGCATTTGG 1620
GTGGGGATTA GGCAAGGACA GAATTATAAT GCACGCCGGG TGGATGGTAA CACCTCTTTT 1680
TGTCTATACC AAAACTGTTC AGAGAAAACT GTATCCATAA AACTGACTTT TTGCGATTAC 1740
TAAATACATA GAATCATTTA AGTATCCAAT TTGAGAAAAA AAATTACATG AGTAGAAGTC 1800
ATCCACAGAT GAGTAGTCCA GGTTTTAGAG GAAAAAAACT TTAAGTGAAC ATTTCAGTTG 1860
GGTAAATTCA GTTTCTCACT GAGAATCTTC TCAATCTCAT CTTGCCAGAT GACAAATGAC 1920
TGTCTATTAT TGTTAAGGTT TGTGGACTCT TACAAAAGGA ACAGTCGAAT TGATTCAGCA 1980
TCAGCTAAGC ATGGAAGAAA AAAAAATATG TAACTGTGAA AACAAAAACA AAACAGATTT 2040
CTGGCTGCTG TCCTCAGAAG CCTCCCGCAC AGACGATGTT CCTGACAGGA TCAACAAACG 2100
TCGCATTTCA CTGTCCCACA GTGCAGCTTC GTCCATCAGC CACTGACTGG CATGGGCCAG 2160
GAGCAGTGTT GGTCTCGGTG ACAGTGACTT CCTTGCCCTG CTCTGAATGA GTGTCCTTTC 2220
TGTGAAAGTA GGTCTCATGG TTCTAGGGCT GATCCCAGCG CCATCCCACA ACATTTCAGT 2280
GTGCCCGACA GCGTGCCTGG CAAGCAGCGA GCTCCTGACA ATTGGAAGCT GCTAATGCTG 2340
TTACAGACAT CTGCAAGCAA GTCAGATCAG CCAGCTTCCA TCACGTGAGA CACCTTGGAG 2400
GACAAAGCCA CATTGTGTGG AGGAAAACAC ACCACCATTC AGGCCCATCG TCATCCTGCT 2460
TTCTCCTATA CTCAGTCTCC CACAGTGCCA GGTAGTTTTC TGCCTGTACT AAGAAGGGTG 2520
AATGGAAAGG TGAGATGTAA AAACAAACAA ACAAACAAGG GCTCGAAATG TCTATGGGAA 2580
GATAAAATTG TAGCAGTGCT TTAGAAAACA AGAAGCGCAT GATTAAATGG ACTGTTGTTT 2640
TCTTTAGAAT GCGGGTATTA TCATTGGTAT TGAGGTGACG CATTAGGACT TTGAGGTGCC 2700
TCCCCCACCC TGGCCTCTGC GCTGGCAGTG AGAACCCAGC CCGTGCTATC TTCACAGTTC 2760
TCAGCCCATG GAAGCACAGG CCACCTGGGC TCCTGCAAAC ACCAGACGTG TAATTAGAGG 2820
CTCCTGGGCT GGGATGATGT GGTGTGCAGA CAAGTCTTAT CACGCGTCTG AGCCGCTGTG 2880
GGTGCCTGGA GTTGCCTCTG CAGCCCGGAG CGGATGAGCG GAGGCTCCCG TGACTCACCC 2940
AACTGCAGGA ACTGTCAACT GGCTTCTGCC CAGCCAAGAA CTTTTATCAA TCACTAAGTA 3000
GAGACACTGT GTACAAGGAC ACCGGTTCAT CCAAGAACAT CAGGACAGCC AGGAATTCAA 3060
AACACAAAAC ACAGCTTCCT GCATGTTGCA CCCCAGGCGG CTCTGAGGCT CAGCCCAAGG 3120
AAGGTTTGGG GCTCGGGCCA GAAAGACACG ATTCACTCTG ACTTACACAA GAGGGGAGTG 3180
TACAAAAGTC ATGCAGTCTC AGGGGAAGGC ACTGGGCTAA ACCCTCATGA CTGTAAAATG 3240
AAGAAATAGG CATGAAGCAT GACTAGGGTG TTTATTTGAC GAGGACCCAG AGTTATGTCC 3300
AAGGAATGAA GGCGTTGCCT TTCTACAACA GAGCAAAATG TCAAGTTAAC TGATAACATG 3360
TACATTCCTC AGGACTGGTC CCTCAGTGAG ACAGCGTTTT TAGCGGGGAA AAAAAGAACA 3420
AATATAAGTG TTTTCCTGGA TGCTGTTTTA GGGAGCTTGC TACAGGTTTA CTTGCTTGCG 3480
GTTCCTGGTA GGTTTCAGGA TTCCCAGGGT GAGAGGTGAT GGGCCAAAGA GAGGCACGCT 3540
AAACTGATAG CCTGAGATCA CAGCTTCCTT CCTTCCTTTC CTTCCTCCCT TCCTTCCTTT 3600
TCTTTTTTTT TTTTTGAGAT GGAGTCTTGT TCTGTGGCCC AGGCTAGAGT GCAGTGGCGC 3660
GATCTTGGTT CACTGCGAAC TCCGCCTCAC GAGTTCAACT GCCTCAGCCT CCGAGTAGGT 3720
GGGATTACAG GCGCCCACCA CTGCGCCCGG CTGATTTTTG TATTTTTAGT AGAGACGGGG 3780
TTTCACCATC TTGGCCAGGC TGGTCTCAAG ATCCACCCGC CTCAGCCTCC CAAAGTGCTG 3840
GGATTACAGG CGTAAGCCAC CGTGCCTGGC CTTCTTTTTC TTTTTCTTTT TTTTTTGAGA 3900
CGGAGTCTTG CTCTGCTGCC CAGGCTAGAA TGCAGTAGTG CGATCTCCGC TCACTGCAAA 3960
CTTCGCCTCC CAGGTTCAAG CCATTCTCCT GCCTCAGCCT CCTGAGTAGC TGGGATTACA 4020
GGCATGCACT ACCATGCTCG GCTAATTTTT GTATTTTTAG TAGACGGGAT TTCACCATGT 4080
TGGTCAGGCT GGTCTCGAAC TCCTAACCTC AAGTAATCTG CCCACCTTGG CTTCCCAAAG 4140
TGCAGGGATT ACAGGCATGA GCCACCATGC CCAGCCCCCA CAGCTCTCTC TCTAAGACAA 4200
GTGCAAACTA GTACCTGGAA AGGAGTCCTT TCTTTCCATT CCCGAGCCCC CTCCCCACAC 4260
CAAAACCCCA CCTGCTGCCA TGTGGCGGGG ACGCTGAGGA ACACTGACTA TCACAGAGCT 4320
GCCTTAATGT AAATGATTTC CTCAGGTGCA GAAAAACATA CACACCAAGT ATGGTTTGCC 4380
ACTCTGAATT CTGGACAGAT AACATGACGG CAGAAGTAAG CTTGTTTAAA CACGCTCTAG 4440
TAATAGCTTC TTAGTGGCTG AGGTTAAAGC ATAGTGAAAT TTGATACATT CAGGTGAAAA 4500
GCAAACATGA AAATTTGCAT CCTCCCAGCA ATCAAATTAC ATTAGACATG GCTAAATCAT 4560
GATTTCATGT AGTTAACAAG CAGTGAAGGG TGAGGCCAAC CAAGTTCAGA CAAATTGAAC 4620
CTTCTACCCA ATTCTACTCT CCTCTCCTCC TTTCTCCGAA TAAAACCCAA TACTCCTCTT 4680
TAACAAGTTG TATGATTCAC ATGCCGAGAG GAAAAGGGCC AGGTTGTTTG TCAATTGATC 4740
TAGTCTAAAG AAAACAAGTC CTTGACTGTA TTTTAGTTTG AACAAAACTT ATTTTCCTAA 4800
GGATAAGAAT ACCTCGAAAC TCTAGTACTA AGTTAGAAAT TCACACTATG CCTCCTGGCT 4860
TGTCACGCAC TTCCAATTTG AAAATATGGA ACCTCAAGGC TGTAGATATT TGAGGCCCTT 4920
AAGAGAAAAA CAATTCATGT TTTTTTGTGT GTGTGTTTTT TTTTTTTTTT TGAGACAGAG 4980
TCTGGCTCTG TCGCCCAGGC TGTAGTGCAG TGGTGTGATC TCGGCTCAGT GCAACCTCCA 5040
CCTCCTGGGT TCAAGCAGTT CTCCCTCCTC AGCCTCCCGA GTAGCTGGGA CTACAGGCAC 5100
ACGCCACCAT GCCTGGCTAA TTTTTGTATT TTTAGTAGAG ATGGGGGTTT CACTATGCTG 5160
GCCAGGCTGG TCTCGAACTC CTGACCTCGT GATCTGCCCG CCTCAGCCTC CCAAAGTGCT 5220
GGGATTACAG ACGTGAGCCA CCGTGCCCGG CCATGAATTC TTAAAAGTGT AAAGGACTGT 5280
TTTTATTAGA GCAAATGCAA ATTAACCTTG CAGGAAACCA TGGCAGATCA AAGTTAACAT 5340
GCCTTAATTT TATCTTTTCA ATGACAATGG CCATAATGCA TTATTTACAT GACTCTCTCT 5400
CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTATATATAT ATATATATTT TTTTTTATTT 5460
TTTTATTTTT TGAGACAGAG TTTTGCTCTT 5490