EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS161-00018 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
PC3 
Coordinate
chr1:1002020-1007010 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs3934834chr11005806hg19
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF14MA0740.1chr1:1004737-1004751GTGGGGGCGTGGCC-6.39
KLF16MA0741.1chr1:1004739-1004750GGGGGCGTGGC-6.62
KLF5MA0599.1chr1:1004502-1004512GCCCCGCCCC+6.02
KLF5MA0599.1chr1:1004521-1004531GCCCCGCCCC+6.02
KLF5MA0599.1chr1:1004157-1004167GGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr1:1004196-1004206GGGGCGGGGC-6.02
Klf1MA0493.1chr1:1005572-1005583TGGGTGTGGCC-6.62
NKX2-5MA0063.2chr1:1006876-1006886CTCAAGTGGT-6.02
NRF1MA0506.1chr1:1004721-1004732GCGCCTGCGCG+6.14
Pou2f3MA0627.1chr1:1002525-1002541TATCATTTGCATAGCA-6.09
RFX1MA0509.2chr1:1004774-1004790CGTCGCCATGGTGACC+6.11
RFX1MA0509.2chr1:1004774-1004790CGTCGCCATGGTGACC-6.12
RFX2MA0600.2chr1:1004774-1004790CGTCGCCATGGTGACC+6.2
RFX2MA0600.2chr1:1004774-1004790CGTCGCCATGGTGACC-6.2
SP1MA0079.4chr1:1004499-1004514CAAGCCCCGCCCCTC+6.34
SP2MA0516.2chr1:1004498-1004515GCAAGCCCCGCCCCTCA+6.23
SP3MA0746.2chr1:1004738-1004751TGGGGGCGTGGCC-6.57
SP4MA0685.1chr1:1004499-1004516CAAGCCCCGCCCCTCAT+6.24
SP8MA0747.1chr1:1004738-1004750TGGGGGCGTGGC-6.11
ZNF263MA0528.1chr1:1003831-1003852CCTTCCTCCTCCTCCTGCTCG-6.88
ZNF263MA0528.1chr1:1003819-1003840CCCTCCCCATTTCCTTCCTCC-6.89
ZNF263MA0528.1chr1:1003825-1003846CCATTTCCTTCCTCCTCCTCC-7.03
ZNF263MA0528.1chr1:1003822-1003843TCCCCATTTCCTTCCTCCTCC-8.3
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
SE_24070chr1:1002554-1005867Colon_Crypt_2
SE_24817chr1:1002490-1006081Colon_Crypt_3
SE_27529chr1:1001798-1011077Esophagus
SE_34539chr1:1002321-1004360HCT-116
SE_34539chr1:1004454-1006480HCT-116
SE_41944chr1:1001963-1005965LNCaP
SE_58139chr1:1004236-1004768VACO_9m
SE_65935chr1:1001682-1006445Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr110034591003600
chr110052931005547
chr110060441006328
chr110036001006245
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I001066chr110018371006486
Enhancer Sequence
AAGAATCACT ACAAGAACAT CCTTCCCTGT GAGGGCGGAG GCCAGGGCGT CACCCGTCGG 60
GCCTGGGGGA GGTGGGGGGC AGGCCGAGCA TCTGCCACCG CTGACCTGAG GCTCCCCCTT 120
GCATACCCTG GACCCTCCAT CTCTGCTCAC CACAGGGTCT GCGGGCAAAG AGGCAGGGTG 180
AGGCCCACGA GCTGTGCCCT GGAGAACTGA GCGGCACCTC CCTTCCCAGT TGATGCTACC 240
CTTGAGTCAT CCTGCTCAAC GAGGATGACA GCGGGCCCGG AGCCGACTAC ATCAGGGTGG 300
GTGTGTGCGG GAGGCGGGGC CTGGGCCCAT TGCTCCTGGG GGGCTCAGGA AGAACCAGGG 360
TCCCCAAGGG AGGGGTGGGC GGCAGTCTCC AAGGGGTCCT CAGAGAGGCT GGACGGGCAT 420
TGGTCCTCAG CCCCTTGCTG GCCTGGAGTG AGGAGTGTGT TTAAGCCACC AGGGCTCTTT 480
GCATAATATT TGTGTGTCGT TTGCATATCA TTTGCATAGC ATTTGCATGG ACTTGTTTGT 540
CCTCTGTTAA CAGCAGCAGT TGGCCTCATT CCCTTTCAGA CTGACCCTGA GGAGGAGCCG 600
GGCCATGGCA GGGGCAGGGT GGACATCCCT TGTGGCCCTG CCCCGCCGCA CCTGCACCTG 660
CACAGCCCGC GTGGGCCCGC CCCGCCGCAG CTGAAGTGCA CCACCATGGG CCCGGCCCGC 720
GGCTCGCGGC TCGCGGCTCT GGGCCCGGTT CACCTCGTCC CGGAAGCCGA GGACGCCGGC 780
GGGATCGGTC CGGACGCCGT AGTCCGGCCA GCCGAAGTAC TGGAAGTGCT GCACCGTACG 840
CTGTGGCTCC TCCCCGCGGG GCAGGGCCTC GCGGGCGCAG GGTGTACATC GCCTGCAGGG 900
CTGTCTGCAG GCCTGTCTGC AGGCCACGGT GGCTGCTTTC TGGGCCACGG TGCACCAGGA 960
GAACACGCGT GTCATCGTCA TGACCACCAG GGAGATGGAG CGGGGCCGGG TAGGGGTGCG 1020
GTGCCAGTGC TCCCAGTGCC CATCCCACCC CGTGCATCTT CGGCTGCCCA AGGCCCTTCC 1080
CGACCAGGCC AAGGAGGCTG TGGGACGCCG TGGGAGTGGG GAGGCTCCCA CAGAGCCCCG 1140
TGGCTGCACG TACACACCTG CGTCTCTGCA GGTCGCAGGG GCGGGGTGCC GAGGTGCTGC 1200
CAGCAAGGCT GATGCAAAGC GCTCCCCTCG GAACAAGTGT TTCCGGGACT GGCCAGAGCT 1260
GCCCGGCAGC CAAGAGTTCG GCCGTGTGCA CATGCGCGTC CTCGGCAAGG GCCAGGCCCA 1320
GGGCTACTGC GTGCGGGAGC TGCAGGTGTG GCGGCCGGGC CAGGTGAGCC TGGCGGCTGT 1380
GGAGCGTGCC TGCTGTCGGC CTGCACTGGG AGACCCCACA CCTGCCTGCA TCCAACCCCA 1440
CTGCCTTTGG GGGCTTCCAC ACCCCTCAAC CCAGGAGGTG CATTCCAAGC CTGGACAGGG 1500
GTCACTGACG TGGCCACATT CTCAGCCCTG GGCTGGCGGC CGCTCCTCCC ACACACCTCT 1560
CCAACTGCAG CTTTGGTCTC CGTTGTATAC CAGAGACGCC CATTTCTGCT CCGGGCAGAT 1620
TACCTCGTGT TCCCTCCAGC CCCCGCCCAG TGTGTGTGGG GGGGTCCTCC AGGACCCCAT 1680
GGACCCCTCA CATTTGGTTT TTCCTTATAA AATAACTGTC CTCACAGCCT GCTTCGCCCG 1740
CCCCCAGCTC CCTCTTCCCT TCCCCAGGCA CCTGAGCCAC CTGGGGCCAT CTCGGCGCCC 1800
CCTCCCCATT TCCTTCCTCC TCCTCCTGCT CGCCTTGGCT CCCGCAGCCC CTCCGCTTGG 1860
GCACTCCCGG AAACCCAGCT GTGCCTCAGC CTCCTCCTCC CACCCTGGGG TCACACTCAC 1920
CGCTTGCCCC GCTCAGGAGG AGCCACAGCG TACGGTGCAG CACTTCCAGT ACTTCGGCTG 1980
GCCGGACTAC GGCGTCCGGG CCGATCCCGC CGGCGTCCTC GGCTTCCGGG ACGAGGTGAA 2040
CCGGGCCCAG AGCAGCAAGC CGCGGGCCGG GCCCATGGTG GTGCACTTCA GCTGCGGCGG 2100
GGCGGGCCCA CGCGGGCTGT GCAGATGCAG GTGCGGCGGG GCGGGGCCAC GCGGGCTGTG 2160
CAGGTGCAGG TGCGGCGGGG CGGGGCCACG CGGGACGACG AGGGCGGAGC CATCGGGTGG 2220
GCGGGGGCGC CCCCGCCCCC GCCCCCCACT CTCGTCAAAG GCCGCCTAGT TTGTCCTCAG 2280
TGGGGGCATC GGATGCACGG GCACCATCAT CGTGATTGAC ATCCTGGTGG ACGTCATCCG 2340
CAGGCAGGGC GAGCCGCTCC ACTCTGGGTC CCCCCGCCCT GCCCTGCTAT AGCCCCACCC 2400
CTCCGGGCGA CCCCACCCCT CCGGACGACC CCACCCCTCA GGACGACCCC ACCCCTCAGG 2460
ACGACCCCAC CGCTACCGGC AAGCCCCGCC CCTCATCAGC AGCCCCGCCC CTGCCTGCCG 2520
GCACCTTCCC CCCATCCGTA GCCCCTCCCC AAGCGCGCTT GTCCGCAGGG CTGGACTGCG 2580
ACACCGACGT CCCGAAGACG ATCCAGCTGG TTTGGCGGCA GCACTGGGGA ATGGTGCAGA 2640
CGGAGGCTCC GTACAAGTTC ACGTACCTGG CGCTGCAGCG GCACATCCGG GGCGAGTAAC 2700
TGCGCCTGCG CGAGCAGGTG GGGGCGTGGC CCTGCGGGGC GTGGCCTGTG CGGGCGTCGC 2760
CATGGTGACC GGCGGCCCCT CCCCCCAGCG CGAGCCGCCT CAGGAGCGCG AGAACCAAAA 2820
CGTGGGCGCC GCCCCCCGCT AATCGGGTTG CAGCCCCCGG CTCCCCGGGC ATCCCCGGTG 2880
TGAGTGGAGC GCCGGGGCCG GTCCGGAGTC CTCTGGGAGG GACTGGGACG TGCGGGGTGC 2940
AGGGCTGAGC CGCTGCTCCG CGCGCAGAAC CCCGCAGCCC TGGGACGGCG AGGACGCGAA 3000
CCTGCGGAGC CGCGGGTGTC TGAGGAGCCG CAGGGAACCC CCGGCCTAGC CGCGCCCGCG 3060
TGTGGCCGGA GCTGCGGGCC GGGACTGTGT CCAGGACAGA GCCACAAGCT TGTCCCCAGC 3120
TCAGGGAGGT CCAGGGGCGG CAGAGGGAGC GACAGGCTGC GAAGCCCACC GGTGACCACG 3180
TGTGAACCCG CGTGCGCCCC CAGCTCGGCC ACTCCGTGCG GGTCTGCCCT CACCGCAGCT 3240
CCGGCCTGCC GGCCCTGCCT GCTCCCGTGG TCTGGGATGT GGCCCCGGTG AGGACCCGGC 3300
CCCATCAGGC ACAGGGTGGA TGTCTGTGGA GTGAGGTGTG TGTGACATAT TCATGTGACC 3360
ACCCGTGCAG CGTCACGCGC CTGGCCCTGC CGATGACAAG GGTGTGGGCC TGCGTGGGCA 3420
TGACTGTGTG TGTGACACAG AGTGATGTTG CTGTGACCCG TGGCTGCACT CCCCACATCA 3480
CCGGCTTTCA CAGCCTTCCG GTAAAGTGCT GTGTTCTCCC TTCTGTGTCT TCGCTGGGAC 3540
CTGGGGCAAG GGTGGGTGTG GCCCCCACAG CTGGAGTCAG CTTCTGTGGG GCCTTCCCGA 3600
GCCCTCCCCA CCCTGGACCA GAGGCCCAGC TGGTTGGAGC AGGAAGTACC TGGGCTCTGG 3660
GGTCAGGGAT GGGAAGGCTG AGGAGGCCTG CGTGAGCTGG ACCTGGCCTG GGCCCTCCTG 3720
GCCGTGCCTG CCTGGTGGTG CAGGATTCCT GGGGCTGATG ACAGACGGGG TAGGGCTGGG 3780
GTTGGCGAGC CTCCTGCCGA TACCTCACGT AGCTGACCTC TGACTCTTCC CCAGCCAGGC 3840
TGGCCCTGGG AGTTGCCGGA GAGTCAGTGG ATCTGCAGGC TGCACGCTGG CTGTTACCTT 3900
TGCTTCTGGG TTCCCACAGG GGTCATGGTT CTGTGGTTCT CCAGTCAGGG ACCCTAGCAG 3960
GGCCATGGGG CGTGACTTCC TGGAGGTGTG GCCTAGTATG GCCACGGCAG AGGATGGGGG 4020
AAGAGAAAGG CCCCCTTTGT CAGCCCCCGG GCTCTGAACC AAGCTGAAGC CCTCCCCCTG 4080
GTCCAGCCTG CCCTGCCCCA AGTGTCCTGG GCCTCTCCCC ATCTCCCTGG GGAGCCTCAC 4140
ATTGCTGAGT CGCCAGCCAA CTCCAGAAAC CCCCAGCCTG TCTGCAGCCA GAGGGGCTGG 4200
GAGTTGGACC CCCTAGAACC TTGGGCCCAC CTGTCCCAGT GGCTGCTGGG AGTCTAATTC 4260
TGTCAGGGTA TCCTCTGGGT TGAGGCTGCA GCAGGGGCAC CCAGGGTGAG GCCCTCTTGC 4320
CAAAGATGGA TACAAATAAT TTATTTTAAA AGGTACAATT CACAAGGTTG GAGGGGTAGC 4380
TGGAAGTTTC TGTGGTTACC TTGCACTGGG GGGCTGCCCT GCCTCCACTC TCTCCCCACA 4440
GTCCGAGGGC AAGATGAGCA CCCCCACCCA ATGGCAGGAC CAGCCCTGCG GGGAAATGTC 4500
AGCATGAGTG GAAGCACGGC AAGGCCCCTT CCTTCTTGGC AAGGGGCTTC CCTGGCAGGC 4560
AGTTCACAGG GTGTGTGGGT GGGGGGGATG CTGACCAGCT GCTCTCCTGG ACCCTTCCTG 4620
TACGAGCCTG TTTTTTTTTG TTTTGTTTTG AGACAGGGTC TCCCTCTGTC GCCCAGGCTG 4680
GATGCAGTGG TGCAATCTTG GCTCACTGCC ACCTCCACCT CCCCGGTTCA AGCAGTTCTC 4740
CTGCCTCAGC CTCCCCAGTA GCTAAGAGGC ACCCACCACG ATGCCCGGTT AATTTTTGTA 4800
TTTTTAGTAG AGATGGGGTT TCACCATGTT GGCCAGGCTG GTGTCAAAAT CCCGACCTCA 4860
AGTGGTCTTT CTGCCTCAGC CCTCCAGAGT GCTGAGATGA CAGGCGTGAG CCACCGCGCC 4920
CGGTGAGACT GTGGTTCTTG GAGGCTTTGG GGATCCTCTT GTCCACCCCG TCAGGACCCA 4980
GCCTGGAGAA 4990