EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS138-00772 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MSC_BM 
Coordinate
chr1:39623010-39627270 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CREB1MA0018.3chr1:39624486-39624498GGTGACGTCACT+6.22
CREB1MA0018.3chr1:39624486-39624498GGTGACGTCACT-6.22
Foxq1MA0040.1chr1:39624109-39624120TATTGTTTATT+6.62
Hnf4aMA0114.3chr1:39624505-39624521GTGGTCAAAGTCCAGT+6.51
KLF4MA0039.3chr1:39625567-39625578ACAGGGTGTGG-6.14
Nkx3-2MA0122.3chr1:39625399-39625412AATAAGTGGTTTT-6.14
ZNF263MA0528.1chr1:39625134-39625155TGGGGAGGAGGGTGGAGGGAG+6.03
ZNF263MA0528.1chr1:39625137-39625158GGAGGAGGGTGGAGGGAGGAA+7.19
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02052chr1:39623700-39625273Aorta
SE_06399chr1:39623194-39625443Brain_Hippocampus_Middle
SE_08441chr1:39623554-39625364Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_14598chr1:39623413-39625353CD4_Memory_Primary_7pool
SE_25799chr1:39623252-39625649Duodenum_Smooth_Muscle
SE_30410chr1:39623509-39626362Fetal_Muscle
SE_32006chr1:39623632-39626196Gastric
SE_35822chr1:39623459-39627010HMEC
SE_36947chr1:39622990-39632657HSMMtube
SE_37973chr1:39623508-39626483HUVEC
SE_42256chr1:39623665-39625283Lung
SE_42256chr1:39625384-39626180Lung
SE_45768chr1:39623568-39627263Osteoblasts
SE_47164chr1:39622875-39627546Panc1
SE_51765chr1:39623560-39625373Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53123chr1:39623552-39625824Small_Intestine
SE_54583chr1:39623552-39625585Stomach_Smooth_Muscle
SE_63563chr1:39623442-39625404HSMM
SE_64261chr1:39623623-39625416NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr13962394539625358
chr13962649939626706
chr13962634439626656
chr13962377339626200
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I039157chr13962297839627255
Enhancer Sequence
CTCTCTGTTT TTACAATGCT ACTTACACAG TTTCTCCACC TGCATCCAAT CTGTAATTGG 60
GAGTTTTGCA GAGCAGTGTA TTTGGTATGC TGTGAACTCT TCCCTAGGTC ACCCAATGGC 120
ATCTTGTGAG CCAGGTTGTC TGAAAAACTT CAAATCTTGG TGGCAGTGTG GTGGGTGTAT 180
CTCCCATATG AGGGATTGTT CCAGGGATCT GACTCAATTG ACAGCTCCTG AATTTCTAAT 240
ATGCCAAGGC TTTTGTGGTA AGATGAGCAA GAATTTTTCA AGCTCAGATT TGGGGAACAT 300
AGCTTCTTGC CATGCTATCT CATTGGCATG ATGTGTGACT TTTGGGCAGA TTACTTAACC 360
TCTGTCTATT TACTTTTTCT TTTTTTGAGA CAGGGCCTCA CTTTGTCACC AAGGCTAGAG 420
TGCAGTGGTG TGATCTTGGC TCACTGCAGC CTCAACTTCC CAGGTTCAAG CGATCCTTCA 480
TCCTCAGCTC CCCAAGTAGC TGGGACTGCA GGAACGTACC ACCACACCCA GCTAATTTTT 540
TGGAGTTTTT GTAGAGACGG GGTTTTGCCA TGTTGCTCAG GCTGGACTTC TGTCTGTTTT 600
CTCATCTGAT AATGAAAAGT TGCAATTATT TTCACAAGAT ACTTTCAAAG ATGAGTCTAA 660
TAATGCAGAT GAGCCATTTT GAGTTCCTTA CAACAAAGAT GCTGTGGAAA TTTCAGGATT 720
TTCCCCCTTT AGTTATAATA TGGGTAGCTT ATCCTAAGAA CCTGTGACTA TTGGGATGGT 780
CATCTTTTTG AGGCCAGCAG TAGAAAGAAA TTTGCAGTAG TGACTGACAC ATTAAAGCAA 840
CCCCGAAACA AATCAGAGTG AAATAGTGTC CTGGAGTTGG GGATATGTGG GTGATATCTG 900
GGCTGCATTT TCTCTCTAGG TATCCATGGA GAGGGTCCTG TCTCCCTGAA TGGTTGTGCT 960
TTCAACAGTT AGGGAATGAG CTTGACAGTT TCTGCTTCTT CCCTCCCCTT GCCTTGAACT 1020
GCCTTGATAT GCAGTGCCTC CTCTGTTGTG TGGCTGTATT CCAGTCCGTA AACATGACTG 1080
CTGTAAGGAG AGTACAGAGT ATTGTTTATT TTGTAAAACT TGTCTCATTG CCATGTAATA 1140
TTTGCTCAAG AGCTCCTGTT GTGGTGATAT TCTTGTGGTG AGCATGGCCC TTTAAAGATT 1200
TTGTTCTCAA ATGTTAAATG AGCCCCTGAC TGGTGTCCTG AAAAGCATTT AAGCTTCTCT 1260
CCCTAGAGTT TAAGCAAGAG GAGCAGTAAT CCCAGTGGAG CCTGGGCTGG GGTCTAGAGA 1320
GAAGGTGGCA GATGAGGTGG CAGATGACAG GCAGGGGCGG TTGTGGTCCC GTAGCTCATT 1380
TGCACAAAGG AGGGGCTGGC CTCTCCTGGG GAGGTATTTC CGCTCACTGG AACAAATGAG 1440
GGCGCTCAAA AGGCTGTAAT GTAATGAGGC TTCTCTGGTG ACGTCACTTG TAAATGTGGT 1500
CAAAGTCCAG TTCTTGGGGG CTAGTAGAAG CGGGAGTAGA GATCATTCGG TTTGCATGCT 1560
TTCACTTCTC AGCTGTCACT GTGCCATGGT GCCTACTTTC AGCCAGTGAA CCAACTCAAC 1620
TGGGCCGGGC ATGAACGCTT ACAAGTATCA GAAGTTCCTG GAGGGACTCA ACAACCTTAG 1680
AGGTATTACA AGGCTTCAGG CTCCCTACCC TTTGTCCTTG CTGATCGTGT GAGCACTTAT 1740
TATGGTGTGT ATTGTATAGG GTCTGTAAAA CCCTCCTGCT CTGAGCTGGC CCTATTTTTT 1800
ATGCGTTTAG GCAATTAAAC AGAAGGGATA GAGTTTGTAA ATGCAATCCT AAGTGAGTAG 1860
GAGAGAATCT CCTTAGGTAC TTCAGCAACA GCCTGTTGTC TTGCTTGAAC GGACAAGTAA 1920
GAAATGTCCC CTGTATTCTT GAGCTCAGAG GGCTCAGGGC ACTCCCTGTT TTCTTTGAGG 1980
TGGCCAGACA GTGTGGGTGG AGGGCTCTTG CCATAGGGCC CTGCAGCCTC ACCTAGGTGT 2040
AGTTATGTTT CTTGGGCCAG GTTTTCCAGT TGCTTGTGTC TACAGTGAGT CAGAGTCCCA 2100
TTTGGAGAGA ACTGGAGTTG GGAGTGGGGA GGAGGGTGGA GGGAGGAATG CAGGTTGATG 2160
GGCTATTTGT AAGCCCATTG TAAAGTAAGC CTTTGTAAAG AGTAAAACAA TGACTTTGAA 2220
AGAGGAAGCT TTTTATTAAA GTTTTAAAGG AAATAGTGTT TTCTTTGCAT CATGGGCAAA 2280
TTCTTCACTG ACCAGACATG AGAAGAATGT ACTCAGATGT GATGTAGGAC TCTTTTTGGA 2340
TATTAAAGAG AAAAATGAAT GAAATCTTTT TACTTTCCCT TCTCTAATTA ATAAGTGGTT 2400
TTATTTCCAT TTGCAGAGGA GGGTGCTTAA ACCATTTTTC TTTCATCAGT AGTTAGGATT 2460
CTGGACCCAG AGCAACCATG GGGTGTGGAG AGAGTGGGAG GGGGTAGAGG GAGGAAAGGA 2520
GTAAACTGGG TTTTTTCAGG GATGAGGAAA GTGGCAGACA GGGTGTGGGC AGGAGATCTG 2580
TACTCCCTTC TTGCCAGGGT ATGTAGATGT TTTACTTTCT TTCACTATCT GTTGAAGAAC 2640
TCTGGTTCTA AGAAATATAT ATGGAGAGCT TTGTATGCTA TAAAGGGATA TACAGGTCGG 2700
GCATGGTGGC TCGCACTCGT AATCCCAACA CTTTGGGAGG CTGAGATGGG AGGATCGCTT 2760
GAACCCAGGA GTTCTAGACC AGCCTGGGCA ACATAATGAG ACCCCCATCT CTACAGAAAT 2820
GTTAAAAAAT TAGCTGGGCA TGGTGATATG CACCTGTACC CTTAACTACT TGGGAAGCTG 2880
AGGTGGAAGG ATCACTCTGA GTTCATCTTA GAGGTACAGA ACCCAAATAA CACAGCAAAG 2940
AGCCCCAGAG TCTGGAGTGA GAAGAGTGCT GCTCTCTGGT GCTAGAGACC ATGTGAAGAA 3000
GGGAAGAATA CCCACATCTG ACTAAGCATA TGTGTAAATG CACCTTCCTC TCTGAGACAA 3060
AGAGCTGTAG TATGGGGCTT TAGAGTGAAG GTAATAGATC TTTTCTCTCC ACACTACTAC 3120
TCACCTTGAA TGGAGTTCTG TTTTCTAATC TTTCATTCAC TATTGTTTGC TTCATTCACT 3180
TATATACACT GTATAATAGT CTTTATAGCA TAAAACATAC AATATATAGC AGTTTCTCTT 3240
GTTGACCCAA AGAAAGGATC AGATTTAAAC TCTTCTTTGC TCCTGCAACC TGAGTCTTTT 3300
TCAGGTGGGA GAAGTTCCTG GAAAGAGGAC ATGTAGTTTT TTTGGTTTAG TCCTTATCAT 3360
TTTTTGGAAT GTTGCTATAG GTCTTAGACA ACTATTCCCC CAATTCTGGG CTGCCAGGCA 3420
GAGAGTTAGA TACAAACCAT TGCCTTTGTC AAATCCTCCT GTGGGTTGAG TTTCACCCAC 3480
TGTGCCCCCT GATTAAGGTG AATGGTTACT TCCCTTCTTC TTTTCACTTA ATATCTTTGT 3540
GTATTCCAGA AGGGCTGATG GAAAGAGGTA ATTGGCTCCC CTCTTCATTT AGTTACTGAC 3600
TGTTGCTTTT CTTGGCATGG TTCAGCTTGT AGACATTCCT CCATCTAGTG GGTAACTGTT 3660
GAAGGGAATC CAGTGGGAGA ATAGAGACAT TGTACAAGTT TTTGAAGTTC TGATCCCCAA 3720
ATTCCTATGA ATTTTTGGTG TTTTGATCCA GAATTGGGGT GCAATATTTT CCACTGCTCG 3780
TGCTTTTTCT GGAGGGCTTT AACTTATATT TCTCAAGCCT GTCAAAAACC TTAGTTATTG 3840
GGGTGATTTC TGGCCAGATG GACCTCTCTC ATGGGTATGA CAGGCTGAAC TATTGGCCCG 3900
AGTCCTGATT TTTGGCAGAG TCCAGACCTG TGCCATGACT GGGATAAGTA GGTAATTAGG 3960
GATTAATTAG GGAAGCAGAG AGGTAGGTGA AGTAGAGTGG TGAGAAAGTG GTTCACTAGC 4020
CTTTACTAAG AAAAATTTAT GATAGGACTA TGAGATAACT GACTTTTAAA ACAGAAATAT 4080
AATGGCCAGG TGCAGTGTCT CATGACTGTA ATCCCAGTGC TTTGGGAAGC TGAGGCAGGA 4140
GGATCAGTTG AGGCTAGGAG TTTGAGACCA TCCTGGGCAA CAGTAGCAAA ACCCTGTCTC 4200
TAAAAACAAG CAAACAAACA AAAAAACAAT ACAAAAACTA GCCGGTGGCT GGGCACGGTG 4260