EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS134-01025 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Mesendoderm 
Coordinate
chr1:39862150-39865910 
Target genes
Number: 8             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MafbMA0117.2chr1:39863354-39863366AAAGTGCTGACT+6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:39863017-39863032GAGGTCAGAAGTTCA+6.38
Nr5a2MA0505.1chr1:39864021-39864036GCCGGCCTTGAACTC-6.01
PRDM1MA0508.2chr1:39863451-39863461TCACTTTCAC+6.02
RARAMA0729.1chr1:39863017-39863035GAGGTCAGAAGTTCAAGA+6.88
RUNX1MA0002.2chr1:39864323-39864334TTCTGTGGTTT+6.32
Number of super-enhancer constituents: 15             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00753chr1:39863212-39865727Adipose_Nuclei
SE_02098chr1:39862162-39863067Aorta
SE_02098chr1:39863552-39864939Aorta
SE_02863chr1:39863503-39865158Astrocytes
SE_26157chr1:39855144-39866292Duodenum_Smooth_Muscle
SE_30690chr1:39860149-39865801Fetal_Muscle
SE_37092chr1:39855581-39868937HSMMtube
SE_38617chr1:39862318-39865931HUVEC
SE_46332chr1:39860146-39866167Osteoblasts
SE_47389chr1:39856575-39867060Panc1
SE_55086chr1:39859150-39865239Stomach_Smooth_Muscle
SE_55918chr1:39856681-39866226u87
SE_64104chr1:39860136-39863063HSMM
SE_64104chr1:39863212-39866034HSMM
SE_67929chr1:39856681-39866226u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr13986336239865691
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I039391chr13985681239867008
Enhancer Sequence
AGAAAAACTA GAATGTATCC TGTGCAGAAC TTGTATGTAT TGATCGTTTA GTAGTTGATT 60
AGTAAACATG GTTAAGATAA GCACAGACTT GCAGAAAAGG ACTGATCCTC ACTGTGCCTA 120
GAAATGAATG GTAAATGGTC TCAGCCTTAG GCTGGTTCTG GAGCTTCAGA AAAATATCCT 180
GGGCACTTTC AAGCTCGCTA ATAAGCTATG AGCTTCTAGG AAGTACGATG AGTTTCTTTG 240
AAGGGCCGTT TATTGTTAGA GTTGCTGGTT TACTAGGAAT AAAATGACTT CCACAGGGAG 300
TTGTGTCAGG TCACTGCACC AAACCATCAC TGTAAAGGGC TGTCTCCTGC TGAATGGATT 360
CTTCACAAGT CTCAGCTGTC CCAGTTGGAA AAACCCAGCT ATGGGTAGAA TGTGCACCCT 420
CCCTACTTTG CCACCACTAA GTGCTTTTCA ACTACGAGTC TCTCTTATTG ACTATAGAAG 480
GTTAATGGAA TACACTTACT CTCTAGGACG TCATAAACTA TTTTTCTACC ACCAGTCATG 540
TCATTTGAAA TATGGATCTT TGCTACACAT GGTGATGGTT CATGGATGGA GGTTAAAAGG 600
AAGTGATTCC ATATTCCTTT TAACCCATCC TTACTGGGCA GTTGCTCTGT GCTAGTCCTT 660
GTGGTGGGTA CTGGAGTCTC AGATAGTCTC TAGTTAACAG TGTACAGATG TGCCTTGACT 720
TACAGTGAAA TTATGTCTGG AAAAACCCAT CATAACTCGA AACTATTGTA AGTCAGAAAT 780
GCATTTAATG TACCTACTGA CAGCCGGGTA TGGTGGCTCA TGCCTGTCAT CTCAGCACTT 840
TGGGAGGCCG AGGTGGGTGG ATCACCTGAG GTCAGAAGTT CAAGACCAGC CTGGTCAACA 900
TGGTGAAACC CGGTCTCTAC TAAATATACA AAAATTAGCC GGGCGTGGTG GCGAGCGCCT 960
GTAATCCCAG CTACTCAGGA GGCTGAGGCA GGAGAATTGC TTGAACCCGG GAGGCAGAGG 1020
TTGCAGTGAG CTGAGATCAT GCCATTGCGC TCCAGCCTGG GCAACGAGCG AAACTTCGTT 1080
CCAAAAAAAA AAAAAAGTAG CTACTGACCA TCATAGCTCA GCTTAGCCTA CCTTAAACAT 1140
ACTCAGACAC TTACATTAGC CTACAGTTAG GCAAAATCAT CTATCAGAAA GCCTATTTTA 1200
TAATAAAGTG CTGACTCGCT CATGTAATTT ATTGAATATT GTACTGAAAT AGAGAAACTG 1260
AATGATTGGG TACTTGAAGT ATGGTTTCTA CTGAATGCAT ATCACTTTCA CCATCATAAA 1320
GTTGAAAAAT CTTCAGTTGA ACCATTGTTA AGTCAGAGAC CATCTATAGT AAGGGAAACA 1380
GATACAGAGA ATTACAGTGG TACTGATGTA GTGGTAAATG CAGTAAGAAA GATCTGAGTC 1440
TAAATGATCT CTGAAAAAAA CTCTAAATCA GACATTTAAA ATCCTATTTT GCAGATAAGA 1500
AAACTTAAGA CTTGAAGAGG TTAAAATAAC TTGTTCGAGC CACATAGCAA GTAAATATTA 1560
GAGTTGGGAT TGGGAAGGTC TGTTTGGCAC CAAAGTTTAT GCTACACCAG TGGTTGTCAA 1620
CCAAGCATAG CTTTGCAGAG ACTCCCACTC CCCGCCACTC CTTTTTTTTT TTTTTTTTTT 1680
AAACAGTTTC ACTCCCATCA CCCAGGCTAG AGTGCAGTGG CACAATCATG GCTCACTGCA 1740
GCCTCGACCT CCCAGTCTCA AGTGATCCTC CTGCCTCAGC CCCACAAGTA GCTGGAATTA 1800
CAGGTGCATG CTGCCATTCC TGGCTAATTT TTGTATTTTT TGTAGAGATA GAGTTTCACC 1860
ATGTTGCCAA GGCCGGCCTT GAACTCCTGA GCTCAAATGA TCTGCCTACC TCAGCCTCTC 1920
AGAGTGCTGG TATTACAGGA ATGAGCCACA GTGCCTGGCC CAGAGACATT TTTTATTGTT 1980
ATGACTGGAA AAGCTGCTAC TGGCATCTAG TAAGTGCTGC GAAACAACCT ACAATACACA 2040
GGATGACGGC CCCTTACAAT GAAAGAATTA TTCAGCTTAC TTCTAGAAAG CTAGGGAATT 2100
TGATTTTTGC CATCTTCAGA TCCCATGACA AGTAAGAGTT AACTGATTAA ATAGTTCCAC 2160
TCGCTGGGGG TGCTTCTGTG GTTTTCCTCT CCTTTTAAGA AAATTAGTTA AGAAATAGTG 2220
TTGCTTCCGG GAGTGACTTA CACAGATAGA GTCAGGATCT TGGGGAACTA ATCTGAGTCA 2280
GCGACTGAAG AATTTTCTCT ATGCCTGACC AGTCCCCACC CCACACTGCC ACAAGGCTCC 2340
TGCTGTGGAA ATCAATCAGC TGTGTATCTC AGGCTGCTTC CTGTAGGGTG TGTTATGGAA 2400
TGGCATCAGC CCTTGCACCA GCTGGGAGTA CTGATCTCAG TGTGATTTTA TCAGACTATG 2460
TTTCTTTTGA GCCTTACTGT TTGGAACAAA GGACCCTCTG TTAAGAATGC AGAGAGCTGG 2520
TGTGATTGGA TAGCTAGCAT ATACATACAT GGTTCCTATG GGAAAAAAAC AGACATAAAT 2580
TATGCTATAG CCCTCTAAAA TTTTCATCTC CAAAATGATT TCCTGACCTT CTGTCTGTAT 2640
TCACAGTTCT TTCTGTAAGT GCTTATCCTT CCCCCAAAGC AATTCGAAGG CCATCTGATC 2700
TGATAAATGG TTGTATCCTT CAGAACTAGC CTATTTCTGT GTCTCCAGTC TTGGATGTAT 2760
TTGATCCCCA CTATCTTTCC AGTGTTATTT CCTATATAGA CCATACACTA CATCCAGTTA 2820
CCCCAGACAC TCCTTATACA TTTTAGGTAT TTGATTTCTG AAGTCATAGC TCAAGTCCAC 2880
TTCTTTATAA AGCTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTGAGATG GATTCTGGCT CTGTCACCCA 2940
GGCTGGAGTG CAGTGGTGCG ATCTCGGCTC ACTGCAATTT CTGACTCCCA GGTTCAAGCG 3000
ATTCTCTTGC CTCAGCCTCC CAAGTATCTG GGATTACAGG CACGCACCAT CTTGCCTGGC 3060
TAATTTTTTT GTATTTTTAG TAGAGACAGG GTTTCGCCAC GTTGGCCAGG CTGGTCTCGA 3120
ACTCCTGACC TCAGGTGATC CACCCACCTC GGCCTCCCAA AGTGCTGGGA TTATAGGCGT 3180
GAGCCACCAT GCCCGGCCTT ATAAAGGCTT TTGATCTCCC CAGCTCACTA CTCCTGATCT 3240
CTTAATCATT TACAATGTAT AACTCACTTG GCTTTTATCA CATACCACCT AATTTTGACA 3300
TTTTCTGATT ATATCCATTT GTCCTATCCC CTCAGTTAAT TCACTTTTGT GTCCCTTAAT 3360
GTAGTTAGCA TATTGGTATA TACACAGTTG GAGATGAGAC AATATTTGAC TGACTGGATG 3420
AACATTCTTT ATTTCTCATA AGCCATGTGA GCTCTAGGAT TCAAAATGCT ATCTACTCTG 3480
CAAGACTTGA GGTATATATC CTTGTGTGTC CTGAAGAAAT TCTAATCTTA GCCTGATTTC 3540
CTCAGTTCTC CATCTTTCTT CTGGGCTTCC TTCCTTCTCT GCTAGTTAGT ATATGTTAAG 3600
GGAACACAAT CTTTTTTCAG TATAAGAGGG CAAAACTAAG AAAGAAATGT GCTACTTCTT 3660
ATGCACAGAG TCATTGCTAC TTACTCAATT AGTTGACAGT TTGGTGTAGT GAAAAAAACT 3720
GAATACAAGT TCTAGTCAGA AGTATCCAGG TTTGAATCCT 3760