EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS133-03980 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
melanoma 
Coordinate
chr1:243430150-243433400 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs28599724chr1243430818hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MEF2AMA0052.3chr1:243432695-243432707GCTATTTTTAGA-6.52
MEF2BMA0660.1chr1:243432695-243432707GCTATTTTTAGA-6.22
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02504chr1:243430798-243434276Astrocytes
SE_07448chr1:243430547-243434541Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_10132chr1:243425915-243434523CD14
SE_13193chr1:243431192-243432252CD34_Primary_RO01480
SE_13791chr1:243430609-243434464CD34_Primary_RO01536
SE_14286chr1:243430759-243432150CD34_Primary_RO01549
SE_15055chr1:243430581-243434330CD4_Memory_Primary_7pool
SE_38593chr1:243430405-243434176HUVEC
SE_43371chr1:243431112-243431529Lung
SE_43371chr1:243431855-243433626Lung
SE_53968chr1:243430368-243431555Spleen
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1243431252243432294
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I243262chr1243425706243434391
Enhancer Sequence
AGGAGAACCA TCTGAACCCT GGAGGCAGAG CCACAGTGAG CTGAGACTGC ACTACTTGCA 60
CTCCAGCCTG GGCAACAAGA GTGCAACTTC GTCTCAAAAA AAAAAAAAAA AAAATGCTGG 120
GCGCGGTGGC TCACGCTTGT AACCCCAGCA CTTTGGGAGG CCGAGGCAGG CGGATCACAA 180
AGTCAGGAGA TCGAGACCAT CCTCGCTAAC ACGGTGAAAC CCTGTCTGTA CTAAAAGTAC 240
AAAAATTAGC TGCGCGTGGT GGCGTGTAAC TGTAGTCCCA GTTTCTCGGG AGGCTGAGGC 300
AGGAGAATGG CGTGAACCTG AGAGGCGGAG GTTGTAGTGA GTGAAGATCG CACCACTACA 360
CTGCAGCCTG GGCGACAGAG CGAGACTCCG TCTTAAAAAA AAAAAAAAGA AATATACATG 420
ATAGGAATTC CAGGAATCTT ATGGATTCTT CTTTTAAGGT CCCGGTCACT GGGCGTGGTG 480
GCTTACGCCT GTAATCCCAA GACTTTTGGA GGCTGAGACG GGCGGATTTC ACCTGAGGTC 540
GGGAGTTTGA GACCAGCCTG ACCAACGTGG AGAAACCCCG TCTCTACTAA AAAAAAATAC 600
AGAATTAGCC GGGCGTGGTG ACAGGTACCT GTAATCCCAG CTATTGGGGA GGCTGAGGCA 660
GGAGAATCGC TTGAACCCGA GAGGCGGAGG GTGCGGTGAG CCGAGATTGC GCCATCGCAC 720
TCCAGCCTGG GCGACAAGAG CCAAACTCCC TCTCAAGAAA AAAAAAAAAA AAGTCCCGGT 780
CAACTGTGGG CACAATGTAA CACTTACACA CACTTAGGCT GAGTTACTCT CTGTACTAAG 840
CAGTCATGTG CATAGGTTCC TGTGTGTGTA CATGGTAATT GTTCAAATCT TGGATCCTTG 900
GCGATCCTTA GAGCCACTCA ATACTTCTGC CCCAATTTCT CAATTTCAGC CATTACACAA 960
TCAGTTATAC AAGGGATACA CTTGACATGC AGACAGCCCA TCATTGACTG CACTAAGTCC 1020
AGTTTGGCTT TTATGGAAAA GTTGATAAAG TTGGTATCAA CGAGGATGTG GTAAGGTGGG 1080
CCCAGCTGTG TATTATATTG GCAAAATAAT CAGGAAAGGT GTTGCGGAAC TTCTCTTTCC 1140
TTTAACGCGC TGGGATCCTT CTTTTCTTTC TCTTTAGGTT TTAATCTATC CTTTTCTTTA 1200
AGCCTCTGAT CTCTGAGACT AAGCGTTTGC TTCATGGTTG TATAGTTCCT CATTTTCTTT 1260
TGCTTCCTCA TGGTCACACC ACACTCCTGT TTCTTCCGTA ATCACCAACG GTGCAATGCT 1320
TTTACCTGGA ATACATTTTT ATGTTAGTCA AACTGTCTCG TTCCTTTCTA ATAGATTCAA 1380
TAAAGATAAG TGTTTTATTC GTGGATTTAA GGGCATAAAT CTAAAGCTCC ATGAACTGAA 1440
TTGCTTATCA TGTAACACTT TGATTTTCCT TTTCCATGAC CAAATCGCTT TTCTATTCTA 1500
TTTTCTAATA CTAAGTTATT GTAAAACTAT CACAGTTTCA TATATTCCCA AAACCAGGAA 1560
TGCGTCTTAT CTGAACTTCC TTAAACTCAT GATGAGTCAG AGGAGGCCAG TTTTCATTAG 1620
TAATCAGCGC CAAATTCATT TCAAAGAAAG ATCTGTGTGG ACATAGGATT GGTATGGAGA 1680
AAAATATGGT GATAAATTAA CTGTGTCTCT TGTATAGTTG AGTAATAGAA TTTCATTGTC 1740
GAACCCTGAC CTGAAATACA TGTTTTCTTT TATCAAAGTA GAAAATGAGT TGCTGCAAGT 1800
AAAGAAACTG TATTAGATAT TGTATAACAG AGACTTTTTT TTTCTATTAA GTACTAACAT 1860
TGCTTTTGTT TCTGTTCCAA ACTTTGAAAT CAGTGCACTT GGACAAAATG GAAACTGCTT 1920
TTCAAGGTCC TACAGAATAT ATGTTTATAA ATGTATTTTT ATACATGGTT GGTAATGAAT 1980
CAGGTCTCTT TCGTGCCATT GCAGTTAGAG GGCCTCTGGT GCTGGAGTCC TCTGGAGGAC 2040
TGGGCTGTCA GAGTGGGGCA GCGGGGTGCA GCGCGGGGAG GGCTTTTCTC TTTCTTCGTG 2100
CCTCTGGTGC TGGAGTCCTC TGGAGGACTG GGCTGTCAGA GTGGGGCAGC GGGGTGCAGT 2160
GCGGGGAGGG CTTTTCTCTT TCTTCATGGG GTCTCAGGGC CTCTCTCTTC CTCTCCACGT 2220
ATGCTCTTCA CAGGTCTCTC CAGCAGGGTA GTCAGATATC TTACATAGCG GCTTAGGGCT 2280
CCCAAAAGCA AACATTCCAA GAGGAAGCAG AAGCTGCCAG TCCTTTTAAA GATGAGGCTT 2340
GGGTGTGACA TGGTATAACT TTTATTGCAT TCTATTGGTT AATGCAGATT ACAGGCCCAG 2400
TCAGTTTCAG ATTAGAAGAG AACAAGGGAA TGAGGCTGGG TTCCTTGGAG GCTATTTTTT 2460
TTTTTTTTTT TTTCTGAAAC AGTCTCGCTC TCTTGCCAGG CTGGAGTGCA GTGGTGCGAT 2520
CTCGGCTCGC TGCAACCCCT TGGAGGCTAT TTTTAGAGAT GAACTATCAC AGTAATATAC 2580
CTTAAAATAC TTCATTTTAG ACAGTTTTTG TGTGTTCTAG GGGTGGTCAG TTGCACTAAC 2640
CAAGAATCTA TGAGGTGTGG TTGGCCAGCA GTATATAGAA AGAGCTGTAC CGCCGGGGCT 2700
GCCACTATAA GCACTTCAGC TATGCAAATT TTGATCAAAA CTAGGCCAGA CATGTGGATG 2760
TCTCTTGGTG GGGGAGGGAT TTCCTGTCCC CAGGGACAAT GAGGCTTCCC TAGGTTGGAA 2820
CTGGGTGTGA CGCAGTCCCT TTTGCTGGCT CTTCCCACCT CCCCACTGCT CCTTTCGTCC 2880
CCCTCTGTCT CCAAGTTGGT AAAGGAGTCA GGCATGGTGG GAAGGAGAGC ACTTCCCTTA 2940
GCAAGTTATT GTTTAATGGG AGCTGGTGGG AAGAGTTCTG TCATTTAATC CTTGCCGGTG 3000
GTGCTATATG TAGTGAAATC AACTGCTACA GTGGTAGGGG CCTTAGAGAT CATCAAGTCC 3060
TACCTCTAAA CCATGAAGTT AATCTTCTCT CACCATCTTT GGCACATCCC TCAGCAAGCT 3120
AGAAACAGAA CTCTGCGTTT TTTCCATAAA GTACGAGAAA TAATGATTTC ACCTTTAAAA 3180
ACTGCCTTCC TGAGTAAGTG TCCGTTTGGT CAACCAGACT CCATGGGTCC TAACTTTCGT 3240
CAGGTTGTTC 3250