Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS133-00322 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | melanoma |
Coordinate | chr1:11432960-11434770 |
Target genes | |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
ESR1 | MA0112.3 | chr1:11434608-11434625 | GGGGTCACGGTGACCTG | - | 7.23 | ESR1 | MA0112.3 | chr1:11434608-11434625 | GGGGTCACGGTGACCTG | + | 8.52 | ESR2 | MA0258.2 | chr1:11434609-11434624 | GGGTCACGGTGACCT | + | 6.9 | ESR2 | MA0258.2 | chr1:11434609-11434624 | GGGTCACGGTGACCT | - | 8.07 | PPARG | MA0066.1 | chr1:11434606-11434626 | TTGGGGTCACGGTGACCTGC | - | 6.51 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11434074-11434094 | GTGGTGTGTGTGGTGTGTGG | - | 6.01 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11434410-11434430 | GTGGTGTGTGTGGTGTGTGG | - | 6.01 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11434459-11434479 | GTGGTGTGTGTGGTGTGTGG | - | 6.01 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11434478-11434498 | GTGTGGTGTGTGGTGTGTGG | - | 6.01 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11434253-11434273 | TGTGGTGTGGTGTGTGGTGT | - | 6.05 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11434474-11434494 | TGTGGTGTGGTGTGTGGTGT | - | 6.05 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11434434-11434454 | GTGTGTGTGGTGTTTTGTGT | - | 6.07 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11434087-11434107 | TGTGTGGGTGTGTGTGGTGT | - | 6.11 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11434481-11434501 | TGGTGTGTGGTGTGTGGTGT | - | 6.14 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11434175-11434195 | GGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11434016-11434036 | TGTTGTGTGGTGTGTTGTGT | - | 6.22 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11434113-11434133 | TGTTGTGTGGTGTGTTGTGT | - | 6.22 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11434199-11434219 | TGTTGTGTGGTGTGTTGTGT | - | 6.22 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11434328-11434348 | TGTTGTGTGGTGTGTTGTGT | - | 6.22 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11434358-11434378 | TGGGTGTGTGTGGTGTGGTG | - | 6.32 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11434385-11434405 | TGTGGTGTGGTGTGTTGTGT | - | 6.33 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11433912-11433932 | TGGGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.37 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11433931-11433951 | TGGATGGGTGTGGTGTGTGG | - | 6.4 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:11433689-11433709 | TGTGTGTGTGTGGTGTGTGG | - | 6.68 |
|
| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 2 | Chromosome | Start | End |
chr1 | 11433074 | 11433400 | chr1 | 11434076 | 11434518 |
|
Enhancer Sequence | CTCCAAAGAT TTTAAATAAC GTGGCAGGCA AGGCTGCCTG AAGGCTGGGA CAAGCGATGG 60 TCCCTGGGCT CCTCCCCAGA GCTCGACTTC TCCTACGCTG GAGCTGTCTC CACAGGCCCC 120 CCTGTGTACA GTGCAGGATT GGAAGGAGCA CTGGACGGGG AGTCAGTGGA GCAGATGTGA 180 GTAGCAGCCC CAGGCCTGCC TGCTGGGTGA TCCTGACACA GGCGGTTGCA TTTTCTGATC 240 CTCAACAGGC TCGTTGTGAA TGGATGCTGA TACCTCCCTG GCAGGGCTGC TGCAGGGATC 300 AGGCCAGACT TGAATGTGAA AGGGCTCTGA ATAGCCGAGT CCAGGGTGGG TGAGGGAAGG 360 TAGCATCGGC AACCTGCGGG TGGGCCCTGG CCACACTGAC GGAGGAATTG TCTCCCTGTT 420 ATCCTGCTCA CTCTCTGTGG GGTTTTCAGA GGAAGCAGAG TCCCTCAGCT TCAAGCCAGA 480 TCTGGGATTC CAAAGACCCA CAAGGGAGGC CCAAGCAGGG AAGGTTATGG GAGGATTCTG 540 GAGAAGAGGG TGCAGGGGGC AAAGCCTCTG CCAAGCAGCT CCTCCCCTGT GCATGCGTGT 600 GTGTGGATGG GTGCGTGGAG TGTGTGGTGT GTGTGTGGAT GTGTGTGTGT GTATGAAATG 660 TGTGTGGATG TGTGTGTGTG GTGTGTATGA ATGAGTGTGG TGTGTGTGTA TGGGTGTGGT 720 GTGTATGGAT GTGTGTGTGT GGTGTGTGGA TGGGTGTGTG TGTGGATGGA TGTGTGTGTG 780 TATGTGTGTG TGGTGTGTGT ATGAGTCTGG TGTGCATGTG GATGGATGTG TGTGAATGTG 840 TGTGTGGTGT GTGTGTGAAT GAGTGTGGTG TGTGTAGAGT GAGTGGTGTG TGTAGAGTGA 900 GTGGTGTGTG TGTAGTGTGT GCGTGTGGAT GGGTGTGGTG TGTATGTATG GATGGGTGTG 960 TGTGGTGTGT GTGGATGGGT GTGGTGTGTG GATGGATGTG TGTGGTGTGT TGTGTGTTGT 1020 GTGTGTTGTG TGGATGGGTG TGTGTGCTGT CTTGTGTGTT GTGTGGTGTG TTGTGTGCTA 1080 TGTGGATGGG TGTGTGTGGT GTGTTGTGTG TTGTGTGGTG TGTGTGGTGT GTGGGTGTGT 1140 GTGGTGTGTT GTGTGTTGTG TGGTGTGTTG TGTGCTGTGT GGATGGGTGT GTGTGATGTG 1200 TGTGGTGTAG TGTGTGGTGT GTGTGTGGTG TGTGTGGTGT GTTGTGTGGT GTGTTGTGTG 1260 CTGTGTGGAT GGGTGTGTGT GGTGTGAGTG GTGTGTGGTG TGGTGTGTGG TGTGTGATGT 1320 GTGTGGTGTG TTGTGTGTTG TGTGGTGTGT GGATGGGTGT GTGTGGTGTG TTGTGTGGTG 1380 TGTTGTGTGC TGTGTGGATG GGTGTGTGTG GTGTGGTGAG TGGTATGTGG TGTGGTGTGT 1440 TGTGTGTTGT GTGGTGTGTG TGGTGTGTGG ATGGGTGTGT GTGGTGTTTT GTGTGTTGTG 1500 TGGTGTGTGT GGTGTGTGGT GTGGTGTGTG GTGTGTGGTG TGTGTGGGAG TGCTCTCTGG 1560 CCAGGTGCAA TCTCCTTCCT GTTCAGCTCC TGGGGCTGCT GCTACTCTTA GTTCAAAAGA 1620 CTTTTTATCC CTGGCAAGGA CAATTATTGG GGTCACGGTG ACCTGCCTGT TTCAGCGCCT 1680 GCTTGGGCTT GTTTCGTTTG GCCTAAGACA AAAGCTTGAA CTCTGGAACT GCCCAGAGGG 1740 GCGAGGGGTG CAAATTCCCT CTGCCTGACC TAACTGCAGT GTTCACAGGA CTGACTCATT 1800 GTCCCCCCGG 1810
|