EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS130-02765 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MDA-MB-231 
Coordinate
chr1:221897860-221901320 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:221899869-221899890AATGTAAAAATGAAACTAGGC-6.34
RUNX1MA0002.2chr1:221900945-221900956TTCTGTGGTTT+6.32
YY1MA0095.2chr1:221899558-221899570CAAAATGGCAGC+6.18
ZNF263MA0528.1chr1:221898388-221898409TAAGGAGTAGGGGGAAGAAAA+6.09
Number of super-enhancer constituents: 21             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04249chr1:221897812-221899915Brain_Anterior_Caudate
SE_05268chr1:221894479-221899945Brain_Cingulate_Gyrus
SE_08233chr1:221897820-221900053Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09465chr1:221894191-221902221CD14
SE_12905chr1:221898705-221899851CD34_Primary_RO01480
SE_13404chr1:221898637-221900264CD34_Primary_RO01536
SE_14214chr1:221898545-221899665CD34_Primary_RO01549
SE_20410chr1:221898637-221902069CD56
SE_26005chr1:221898468-221900254Duodenum_Smooth_Muscle
SE_29951chr1:221898845-221899614Fetal_Muscle
SE_32563chr1:221898183-221902778GM12878
SE_36211chr1:221896302-221900304HMEC
SE_37566chr1:221895001-221900255HSMMtube
SE_48429chr1:221897741-221898954Psoas_Muscle
SE_48429chr1:221898983-221899461Psoas_Muscle
SE_48429chr1:221900936-221902013Psoas_Muscle
SE_51295chr1:221897827-221904146Skeletal_Muscle
SE_52175chr1:221895486-221899980Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_54816chr1:221897959-221899962Stomach_Smooth_Muscle
SE_63303chr1:221886936-221925458NCI-H82
SE_64034chr1:221895405-221899994HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1221899063221899285
chr1221899063221899693
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I221721chr1221895207221901673
Enhancer Sequence
CACCTACAGC ACATCTCTGT TTGGACTGGC CCCATTTCAA GTGCTCAATG GCCACGTTTG 60
GCTTGCAGCA AGGCTACTAT ATTGGACGCT GCAGATAGAT TTAATACTAT TGCTATCCCC 120
ATTAAATGAG TTAATGCTCA GTGTCATAAT TGTTCCCATT CTACAAATGT TAACTAAAAT 180
ATGTGTTTGT TTGCATGTGA ATGTGTGTGC ATGCACATGG AGGGGTAGTG ACCAATGACT 240
AAAATCTACG GTGCTATAAG CCACACTACA CCAGGAAGTC ATTCGGCTCC CATGGAACAT 300
CAAATAGCCA CTCTATTTTC AGGAAAAGAA ACACTTCAAC TTGGAGAAGA GAGGCTCTCT 360
GATCGATTAA CTACAGCATG CTCTTTTATT TCAGCACTCC AACATCTCCC AGTGCACGTT 420
TTAATATGAG CCAAATCAAG TAGCCACGAC AATAGCTTTG AATGAGAAAA GACACCCCAA 480
AAGCAGTGCG CAGATACATG GGGATGCCTG AAGGAGCTCA GAATGGCTTA AGGAGTAGGG 540
GGAAGAAAAA CTGCAGAGAG GAGCTTTGAC TCACTGAGTC ATTGAGCAAC TGTTCTGTGC 600
CCTCTCAGGC TACTTCCCAC AGCCACCGCC CAGCCAACAG CTAGCTGCAC CCAGCCAATC 660
ACTCACTCCA CTCCCTGGAA AAAGCTCCAC ATTGGGAAGC CAGAAGAATG TCACTAGCAA 720
GAGATTGATT TCAAGGTAAT TATTTAGGCA ACTTTGTAGC ATCTCATTCT CAGGCCTAAA 780
AGTGTTCTCA AAGTTTGTTT TAATAAATGC ATGTATTAAT ATGAAGTCTC TGTGTCTTTT 840
AATAATGATA TACCACATTC AGCTCCTCCC AATCTTTGTA AGAGAGGGCT TCCTGGACTC 900
CATAACCACA GCATTCCTCC AGCTCTTTCT ATTCACTGGA GCAGAAATGG GGCTTTCTAG 960
CCATCCTCAA GGTAGGAATT AAGAGATTCA CCTAGTAAGT GTACATGAAT AGATTTTTAC 1020
ATAATATGCA AAATTAATTA TAATATACTC AACCAATTCA CATATTTTAT CAAGGAAGAC 1080
AAGCTAATTA TCTGTCAAAG AATTATCTCC TATTTAAAGG GCACTTTACC TCAATTTGGC 1140
AAAATGAACT AATGGGAATT ATCTTTCCAT TCTGATGTGT TTTTGCTGCC TGTGTTTGCT 1200
TAAGCCCCTA GAAGACTTCA GCACTGCACT AAAACCTCAG GATTTAGAAA AGTTGAGAGG 1260
AAGGGAGACA CAAACACATC TACTCAGCAT CTCACTAAAT CTACCTCTTG CTGCTTTTAT 1320
TGTCCCTTTC AGAGTGTTTT ATCTACAGTG TAAAACTGGG AGTGACTCAT ATTTATGAAA 1380
TAAGGAGCCG TTGTTAGCCT TGCCAGATCA TTCACTTCCA CAATAGCTTC TGATTTTTAA 1440
TAGCGCTGAG TGGTGCTTCC TCATGTCCTC ACTCTATCCA CCAAAGAGGT CCAAGATCTG 1500
CAATATGTGC CTTACAGGAC ATGTGGTAAA CACACACATT CAGGATCAGT ATCAAGACCT 1560
GTGGTCAAGG ATAAAGATGT CCCTAAAAAC TCACAACTTT GATAGGTATT TGGATCTTAC 1620
ACTCAGGAAA GAAAAGCAGA AGTTAAAAAG TGAAAGAGAA TTGGGGGGAA AAATAAACTC 1680
AAACTGGCAA CTAGCACCCA AAATGGCAGC TAGTACCCAT TTCTCTAAAT GGGGAGTGCA 1740
GTTGGGTGGG AAGGTGGAGA AAATTCCAAA CAAGGGTTTC CTTCAAGAGG TTTCTCTTGT 1800
CATACCAAAA CCTTGGAAAC AATCTTAATT TATATTAATA GGCAAGTAAG TAAAATGTGG 1860
TAATAAGACA GGTTACAGCA TTAAAGAAGA AAATCTATGA TCACAACACA GGAAGCAAAA 1920
GTACATGCAA TATAAAGTGA AAATGAATTT CAGTTACTAT GTGAGAAACC CTGAAAAACA 1980
TGCACATATA TGGGTAGAGA ACAAAAAGAA ATGTAAAAAT GAAACTAGGC CAGTCAGGGC 2040
GGGATTAGTA ATATTATGTT TTTCTTTCTA AAATGTTCTT AATATCTTAA CAATAAGTAT 2100
ACATAAAGTG TTTCTGCTAA GACTTTTATA AGATTTCCTT ACATAGAAAT AGCATATAAT 2160
TTTTCAGCAC AGCACTATTT CAGGAAAAAA AAAAAAAAAA ACCCTATGTA GTTATCTATC 2220
CACCCCAAAA GAAACACTGG GTTTTTCCAA ACTTTTAAAC AAAAAGATCT ACCAAGCATC 2280
AGAAAAGTAT CTCCTACTTG TACTGCATTA GTGGTGACAT CAAAGCATTT TACTGAACTA 2340
TACCACTCAT ATATCAGTTG AATATAAGCA GATTATGAAT TATTATTGTA GAGATTCAAT 2400
ATTATAATTA TGGTTGATTT TCAATAAATG TTAGCTAGTA TGCATTCGTT ATTGTTCAAA 2460
GCACTTCTAC ATATGTTATC TAATTCTCAA TTGAGCCCAT GAGAAAAGAG CCATTACCCT 2520
CCCCATTTTA TAGACAAGCA AACAGAGGCA CAGAAAAGTG AATTTGTCCA AAATTATAAT 2580
AATTGGCAAA ATCAGAATTC AAACTCAGCA GCCTGGTTCC AGAATCTGTG CCCTTAACCT 2640
CCAAACTATA CTCCCTTCGC AAGAAAATAT ATAAACTGAA TACAAATATA AGGGAGCATC 2700
AGCCGGCTCA TTCAATTAGT CACTATATAC GCTCCTAAGA AAGGTAATGA GAAAAATTAT 2760
GGAATGACCT GGCTGAATAC TTGAACCCAC AAGATTTGCT TATTTAACAA CAACTCAGAT 2820
ACTAATCCAA AGGATTATAT ACTGGTTGGG CTTCTAAACA CCCTAAACTG AGAGTTAGGA 2880
AACATGAATC CTATGCCAGT ACTGCTAATA GCTATTTATA TCCTCCTGGA TAAGTAATCA 2940
GTTTCTATGT CTGTAAAATG GGATGGTTAG ATCAAATGCT TGATAACATC TCTCACAATT 3000
CTGTAACACC ATGTTCTTTG AAAAATGTCT TTCCTTTCTA ATTCAACATA GAGTAAGTGA 3060
ATGCTTGCTG TGCAATGGAC TATAATTCTG TGGTTTTTCA ACATTTCTAA AGTCATCCTG 3120
GGGTTGTTGT GGTTCAGAAA ACTTACCTTG CCATGTAAAT GTGAGAACTT ATGATCAGTG 3180
AAGTTAATCT CCTTGAATTT ATTTTAAGCT TTCTTAAAAT TGATTACTTT TATATTTCAG 3240
AATAAAAAAT GCTCAGATTT TTAAATTTTG TTCTCCATTC ACTAATTCTA CTGCCTTGAT 3300
CACCCATGTC CCCCTCCCTT CCCCTCTCAC TGGAGGACCT GAGTGTTTGG GGTGACCTTA 3360
CTGCTATGGT TTGAATATGT CCCCCAAAGT TCATGTATTG GAAACTTAAT TGTCACTGTA 3420
GCAGTATTAA AAGATGGGGC CTTTAAGAGG AGATTAGGTC 3460