EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS130-02076 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MDA-MB-231 
Coordinate
chr1:155939340-155942500 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:155940615-155940633CTTTCCTGCCTCTCTTCC-6.46
SPI1MA0080.4chr1:155940531-155940545AGAAAGGGGAAGTG+6.22
SPIBMA0081.2chr1:155940533-155940545AAAGGGGAAGTG+6.07
ZNF263MA0528.1chr1:155940475-155940496GGTGGAGGAGGGGAAGAGATG+6.06
ZNF263MA0528.1chr1:155940472-155940493AGAGGTGGAGGAGGGGAAGAG+6.32
ZNF263MA0528.1chr1:155941463-155941484CTCTCCCTTTTCTCCTCCTCT-7.14
ZNF263MA0528.1chr1:155940867-155940888CCTCTCCTCCCCTCCTCCTCA-7.22
ZNF740MA0753.2chr1:155939594-155939607GTGGGGGGGGCAG-7.34
Number of super-enhancer constituents: 59             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00371chr1:155935629-155941788Adipose_Nuclei
SE_00371chr1:155941812-155954742Adipose_Nuclei
SE_01845chr1:155934724-155941198Aorta
SE_01845chr1:155941600-155942535Aorta
SE_02626chr1:155939841-155941067Astrocytes
SE_03231chr1:155935411-155941178Brain_Angular_Gyrus
SE_03231chr1:155941693-155943349Brain_Angular_Gyrus
SE_03962chr1:155934540-155952025Brain_Anterior_Caudate
SE_04939chr1:155933998-155950544Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05884chr1:155934346-155954766Brain_Hippocampus_Middle
SE_06771chr1:155934659-155951687Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07892chr1:155934208-155950911Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08811chr1:155939381-155941119Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08811chr1:155941811-155942519Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09348chr1:155934545-155952363CD14
SE_10611chr1:155939601-155941209CD19_Primary
SE_11511chr1:155934212-155955089CD20
SE_13030chr1:155941760-155942660CD34_Primary_RO01480
SE_13504chr1:155935749-155952228CD34_Primary_RO01536
SE_14255chr1:155936695-155940384CD34_Primary_RO01549
SE_14255chr1:155940500-155941268CD34_Primary_RO01549
SE_14255chr1:155941301-155942851CD34_Primary_RO01549
SE_14748chr1:155935670-155954509CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18702chr1:155935061-155954101CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19282chr1:155938352-155941313CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19282chr1:155941489-155942675CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_21118chr1:155939699-155941564CD8_Memory_7pool
SE_26270chr1:155938718-155940935Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27178chr1:155935912-155941094Esophagus
SE_27178chr1:155941715-155942392Esophagus
SE_29653chr1:155935863-155942574Fetal_Muscle
SE_32195chr1:155937995-155941084Gastric
SE_37367chr1:155935140-155941528HSMMtube
SE_39002chr1:155938017-155941141IMR90
SE_40164chr1:155939595-155941322K562
SE_40938chr1:155934691-155941319Left_Ventricle
SE_42293chr1:155934607-155941204Lung
SE_42293chr1:155941692-155942591Lung
SE_45406chr1:155939727-155941212NHLF
SE_47089chr1:155939119-155939881Ovary
SE_48803chr1:155935124-155941166Right_Atrium
SE_50236chr1:155936031-155941345Sigmoid_Colon
SE_50236chr1:155941532-155942599Sigmoid_Colon
SE_51497chr1:155935853-155941418Skeletal_Muscle
SE_51497chr1:155941703-155954664Skeletal_Muscle
SE_52309chr1:155938679-155941227Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53045chr1:155936636-155941195Small_Intestine
SE_53512chr1:155935694-155941433Spleen
SE_53512chr1:155941650-155942607Spleen
SE_55468chr1:155940202-155940999Thymus
SE_56150chr1:155938459-155941237u87
SE_58809chr1:155914126-155961123Ly1
SE_59086chr1:155939045-155960951Ly3
SE_59715chr1:155907656-155970179Ly4
SE_61625chr1:155913651-155954372Toledo
SE_62496chr1:155912775-155960919Tonsil
SE_64071chr1:155936894-155941241HSMM
SE_66797chr1:155940143-155941171Jurkat
SE_69165chr1:155940220-155941042H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1155940203155940968
Enhancer Sequence
GGCTGCCTCC TGTTGCCACT CATCTCCCTG GCTCTAGGTC TCTGCGTCCT CACTCCACCT 60
TCCCAGCCCT AGCTCTGCTC ACCCCCGAGC TGCTGTACTC TCTTCTCTGT GCTAGGGGGA 120
AGATGCGCAG AGAGGAGGGG AGAGCAGGCG AAGCGGAGGG TGCCAGCTCA CCAGCGCTTT 180
CCAATCTATG GGAGTTAGCT CCTCTTATAA CCATGACAAC CAGTGTTGGA TCTGCTGTCT 240
CTGTGGCAGT CACAGTGGGG GGGGCAGGAG ATCCCCTTAT TAGATTGGCT GAAGGGGGCA 300
GAATGCCTCC CCTGCCACCC CCAACCCAGG GGTCAGGATC CCAGACCTCT AACTCTTTTC 360
ACCAACCCTC AGCCACGGCA CACAGGGCCT GTCTGGGAGG CAGCATGTCC CCTACTAACC 420
TTGAGGCAAA GGCAGCTAGC TGCCTTTGGG TCACTCTTCC ACTCTGGGAT CTTTAAGTAA 480
GGAAGCTCAG CCAGCCATCT TGGTTGCTTC CAGCGGAAAA TCTCTCCTGC AGTCTAACTT 540
TTATCCCTCT CATACTACTT TCCAGAGTTA AAACCTAGGA GAGTTTCCTC TATTGCTCCT 600
TACCCAACTG GTCTCTCCCA TCCTAGGAAG TCCTTTCTGA CATCTACCCT CCATCCTTCA 660
GTGTTGATCT CCGCAGATGG CGCACACCTT CCTCGGAGCC TCTGAGCCGC ATTTTCCATC 720
TCTGCTGTCT CCCATTTCCC CCAGTGCCCC TGCCTCTGCA AGTCAAGTCA TTCTCCCTGA 780
CCTCCAATCT GTCCCTCTTC AAGCCCCTGT GATTCCCAAA AAGCCTGAGA AGGTGAGAAG 840
AGGGGGATAT CACTCTTCCC ACTATTCTAG GACCTTCCTT AGTTGTGACT CTGATCTCTG 900
GATTTTCCCT CCGCTCTTGG AGCAGGACTA GAAGCTGAGA AGACCACTCC CTCCAAGGTT 960
TCCCAGGCTC TCAGAAATCA AAAATCAGGA TCCAGATGGC TGAGGGTAGA AGCCCCAAGT 1020
CAGAGGACCT GGACTGGGGA CAGAGGATTA CAGTTCAGCG GGAAGCACTC AGCCCGGACT 1080
CTAGGAGACC AGTACTGACT CAGCCGAGGC CACGAGGCCA CGCCAGCAGC TGAGAGGTGG 1140
AGGAGGGGAA GAGATGCACG GGCCTGGTGC TTGGGGCAGA AAATGGTAGA AAGAAAGGGG 1200
AAGTGTGGAG GGGCTGAGTC AACAGTGCAG GGACAGAGGG CATGGGGCTG CAGTGCCTGG 1260
GCCCAAGATC CTTCTCTTTC CTGCCTCTCT TCCCAAGCTC CAGGTTTGCC TGATGATGTC 1320
CAGAGCCCAG AGGTCTTGGG GTCAATCCCT TCTCCCCTCA TGCATCCTCC CCATCCCCAA 1380
TCATCCATTT TTCGCATCCT CCTCCTGTCT CCTGCTCTCT CTATGTCCTC CCTTCTCTTC 1440
TCAGGGTCTC CCTCCTAGGC TCCTCCCGCT CTGCCTTCCC TTTCTCAGCC TTGCTTCTCC 1500
GCCACTGTTC TCCTCTCCCG CCCACAGCCT CTCCTCCCCT CCTCCTCACG CAGGCCAACT 1560
GCTCCTCTAC CTAGGCTTAT TCAGGAAGCT GAGCTGCCTC TAGCCTCTAA CTCAAACCTC 1620
TAAAATGTTC TGGCCTCCTT TTTTCTATTC TGGCACCTAC CTACCCGGAC CACTAGAAAA 1680
TGCTCCCTTT GGTCTAACCT CCACCTATCT TGCACCAAAT TATACCTCTT TAGAAGTTCA 1740
AATTCAGGCT GGGTGCAGTG GCTCACACCT GCAATCCCAG CACTTTGGGA GGTCGAGGCG 1800
GGTGGATTAC CTGAGGTCAG GAGTTCGAGA CCAGCCTGAC CAACATGGTG AAACCCCATC 1860
TCTACTAAAA ATACAAAAAA TTAGCTGGGC GTAGTGGCAG GCACCTGTAA TCCCAGCTAC 1920
TTGGGAGGCT GAGGCAGGAG AATTGCTTGA ACCGGGGAGG TTGGAGGTTG TGGTGGGTTG 1980
AGATTGGGCC ACTGCACTCC AGCCTGGGCC ACAGAGTGAG ACTATGTCTC AAAAAAAAAA 2040
AAAGAAGTTC AAATTCACCT TTGAATAATA ACCTCACAGG ACCTCAAACA CCAAGTCCAA 2100
AAATCTCTTC CCACTGCCAT ATACTCTCCC TTTTCTCCTC CTCTCCTGCC CTCCCAGCCT 2160
TCTATATAAC TCAAACCAAA AGTTTGAGCA TGTATTACAT TTGAATTAAA AGCAAGAGGC 2220
CGGTGAGGTG GCTCACACCT GTAATCCCAG CACTTTGCGG GGCTGAGGTG GGAGGATCGC 2280
TTGAGGCCAG GAGTTTGAGA ACAACCTGAG CAACACAGCG AGACCCATCT CTATAAAAAA 2340
AAAAAATATA TACATATATA TATATACACA CATAAGTAAA AGCAAGCAAG CTGAAAATAG 2400
TATTAAAAAA AACAACATGG CTGGACCAGG GTCACTCCAG AATGGGCAGT GCTGCAGCTC 2460
TGCCCCAGTG CTGCTACGAG TACTCTCTTC CACACCTGAC CTCTGTCCTT TGCCCTCCAC 2520
CCTCCCCCTG TGGCATCCAC AAACACTCAT CTGTCTGACC AGCTCAGATG GAGTGGCAAA 2580
GGGAGGGAGA AGACTGGGGC AGCCAGAGAA CAGGGTCTCT AGTGGCCCTT CCTCTCTCTG 2640
GCATCAATGC TCCACAGACA GCCCTGGTAC TCTGGGCCCT GCCTCCTCCA CCTCCCAACA 2700
CTCACCCTCT CTCGAAGTGA CCCCTGCTCT AGGTGGGCCA GCAGCGGGCA GCAGCCACAG 2760
CAGCAGCACA TCCCAGCATG GGCACTGCCC AGCAGCAAGC GACCCTGGCA CTGCCTAGTG 2820
CTATTGTCCC GGAGGTTGCC TGTGCCCGCC CCAGGGCTCA GGCTTCTGAG GATGGAAGGA 2880
CATAGGGCCT GCTTACCAGG GGTGCCTGCT CCAGAGGTGG AGTGAGTGGG CTTGTTTGGT 2940
TCTTTGTCCT ACTCTTTTCC AGGTATTCTT AAGATAATCA CATTGGTCTC CCATTTACCC 3000
ACGCCCAAGT AGGACAGCCC TTTACCTCCA AGACCCAACC TATGCACCAA GAAAAAGGGC 3060
CCATTACTCC ACAATCCATA ACACCCACCC CAGTGCTCAG AGGCCCTTCC TGCTTGGTTC 3120
AGTCCTTTGC TCTCCAGCAT CTAGATACTT TTTTTTTTCT 3160