EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS130-01040 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MDA-MB-231 
Coordinate
chr1:85792860-85799080 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs2268667chr185793746hg19
rs28489187chr185797110hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:85793614-85793632CATTTCTTCATTCCTTTC-6.06
IRF1MA0050.2chr1:85794687-85794708GAATTGAAAGAGAAAGAAACA-7.01
RREB1MA0073.1chr1:85798969-85798989ACCCTAACCAACCAACACCA+6.31
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02338chr1:85793006-85798614Astrocytes
SE_35266chr1:85790947-85798610HeLa
SE_37476chr1:85793138-85799262HSMMtube
SE_37964chr1:85789961-85801615HUVEC
SE_39280chr1:85792961-85798232IMR90
SE_44427chr1:85792983-85799323NHDF-Ad
SE_44926chr1:85793440-85798600NHLF
SE_45615chr1:85789836-85801531Osteoblasts
SE_47178chr1:85790694-85797488Panc1
SE_51850chr1:85793492-85798592Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_63644chr1:85793492-85798696HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr18579469885795078
chr18579585585796291
chr18579659585797055
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I085325chr18579115885798973
Enhancer Sequence
TCTACAAAAA AATTAGCTGG GTGTGGTGGC ACACACCTGT AGTCACCTCC TCAGGAGGCT 60
GAGGTGGGAA GATCATAGAG GTTGCCACCA GCCGAGATAG TGCCACTGCA CTCCAGCCTG 120
AGCCACAGAT AATCTGTCTT GGAGTCTAAT CCTTAGTCTT AAAAACCATA AAAGACTAGA 180
CCTACCATAT TCTCACAATT ACTTCTTCAG CTTCCTTCTT TCTAAGGCCT ACGTTAACAT 240
GTAATCTAGT AGTGTTGCAG GCTTAGCATC CCTTCTACCT AGATCCCCTA GAGAGATAAT 300
TGCTACAAAG TTCCCAAAGT TTTTGGAATA AGGACAAATT TTACTATGAG TTTTTGTGCA 360
GTTTTGCTCT CTTCAACCAG ACTGCTACCT CCTTGAATGC AGGTCCAGGC ATAATGAGGT 420
GGACAGAGCA TGGGCTTCAG AGTCAGAAAG GTCTGGGTCT GAAGCCTTGC TCAGCCACAC 480
ACTAATTGTG TGACTTTGGG AAAGTCACAT ATGCCCTGTG AGCCTCAATT CCCTCAGCAG 540
TAAAATGGGA TGGGAATGCT ATACCTATCC TCCACAGGGT AACTCTGAAG ATTATTTAAA 600
AAAAACCCCA AAACAGATAA TGTACATAAA ATGCTTAGCA CAAGCTTCTA GCAGATATTA 660
AATGTGTAAT AAAAGTCGGT TCACTTCCCT CTTTGTTTCT TGCAAGTCAC TTGACATATA 720
GCAGGTGACC AAAATATGTT TGCACTAACT GGTTCATTTC TTCATTCCTT TCACCTTTTT 780
AAACGCTACA GAGAACCTCA GGAGGGCACT GTGATGAACT GTGTGGTCAA TCACATGGGT 840
AAACAATTGA ATTCCCTCAG AGAAACAAGG TATGGTCTAT GTCCAGAAAC AGAAATACAA 900
CTCATTATTT TTAATGTGAA AAAACATGGC TAAAATCAAC AAGGCCAAGG TTTGTCTGTT 960
TTTCAAAGCC ATACAGAAGG GCACTATACT CTGTGGTCCT AACTCAAATG ACTCTGGATG 1020
ACAAAGTAAG ACAACAGGGG GTTGGATCTG GAATTACCTG CAGAGTATGT GGCACCTAAG 1080
GGCATTCACA GAAAGAAAGA AAAGAAAAAC TTTTGTGTAT ATCAAACCGA ACACATAAGC 1140
CTCTGTCAGG TTGTGACCCC AATTTAGTAA AATAGTCCAT AAACCCAATG GGCAGATTGA 1200
CTTCTTCATA GTAGAGTGGG GCTGCCTCGA TATGCAAGGT GGCAGTTAGG ATTTGTGAAA 1260
CTTCTAGACA ATAGCTTTTG GTCAGTCTCA CAAACGTGCT TTTTTCCAGG TGCAGGGAAT 1320
GGGATTCCAC TATGTCTAAA TCTCTGTTTA TTATGTGCTG TTGAGGGTGG ACCAAGATGG 1380
CCAGTCTGCT CATGTTTGCA GTCAGAACTG GACGGTCATC CTGTCACATG AATTGGACCT 1440
AGTTTACCCA AGAAGTTCAG AATTTCTTCC AGACAACTGG GGAGGCAGTT CTCTGAGCCA 1500
GAGGTTTACT AAGTAGGACC CCAGTGGTTT GAGGACCTCA GAGAGATCCT TAGAACATGT 1560
ATACACAACC ACTGCTACCT GGTCAACCTA GACACAAACA AAACAAAATC TAGAAAATCT 1620
ATTACTCACA TTGACTTACT TTTCTAAGCA ATTGGGAAAA CTGTGTGTGG CATATTTTGG 1680
CCCACACATT CAGGCTAAGT GCTCCCACCA CTCATAATCA CCAGATAACT GCCAGTTGGC 1740
TTTCCATTTT AATTTGTGAT CTGCAGAAGC TTCATTGTAC TCTTTACCCA CAGATAAATA 1800
AATCACCCAT GTCTCTTAGT ACCAGATGAA TTGAAAGAGA AAGAAACATG GCAAGACTAC 1860
ATCTCTTAGG CCTGACTTTA TTCACTGGAT CTAGCGGTCT GGGCAAATTC CCCACCTCTC 1920
AGTGTGACTC ATGCATGTCC GGAGGTGACT ACAAAGCAAA AGCATGGAAT GTCATACATT 1980
CCAGAGGAAG TGTTCTCAGG GATTGTTATC AGTGCTGACT TCTTGTTTAC CAGTGAGGAA 2040
ACAAACTAAA ATCTCCAAGG TTGTGCCCAT CTCAGAAAGT ACCACGTGTC ACTGAAGTGA 2100
CAGGGCCTGT CCAGTTGACT TCAGCTGTTT CCATGCTCTG CCCTATCCCC CAACCTCACC 2160
TCCTTGAGTG AACAATCCTC TCCCCTACTT GGTTCCTATT TGAATTGTTC TTCAGTTACT 2220
GGCATGTATT TGAAATTGTA ATCACTCTTC ATTCTTTAAT GCTTCTTCCT TTTCTGAGCC 2280
TTATTTTTTA TCATTTAAAG CTTCTGGTGG GGACATTCCT ATACTTACTA ACATAAAGGC 2340
CAGTACCTAC TTTAGAATTA TTTGAGGACA GTTTCAATTT TTCATTACTG GGAGGAAAGG 2400
AATTATAATA TCTTTAGTGG GGAAATAATT TAATGCTGAG AATATATGAA GTAATTCATT 2460
GATAAATTCT ACTGAGAGTT ACTCTTAAAA TAAATGTCTT AACAAAACCC CAACAAAGCT 2520
ACCTTAGGAG AAGCTTTTCA ATTAATTTAT CAAGACTCCA CGGTTATCAT TTTAAGACAG 2580
ATTTAAGAAT ATGCCCAAAG AAATGACTTT TAATAATGAA CAGGCCCCAT TTGGAGCAGT 2640
GAGTAGTTCT GCTTAACTGA AAAAAATTAC AAAAGTTATG TCAGGTGTAG CCTTTCTAAA 2700
TAAAAGGGAT GTATGAAGTG GTAACTGTAG ATAACAAACA AGAAATATGC TTTTCCCCCT 2760
TGAAAATGCT AAAGGTGCTT ATTATAAACA CAAAGAGATT TTGTCTTTCG AGGCAAAGAA 2820
CAGATTTCTC CTTTCCTGTT GGAGTAATTA TTTTCCTTTC TCTTGTATGT TGTTATTGTC 2880
TGAATAAGCT TACCATTTAT TTGTAGCTGG GTTTAGGAGA CACATGTATG TACACAAGAC 2940
AGGGTGCTGG CCATTCAGCA GGGAACATGC AGAGAAAGAT GCAGGAAGGC TGTGTTGCTC 3000
TTGAACATCT TTCCCTTTTT ACACCCTAAT GGGCACTGTG AGGATGTGTT AACACATCCT 3060
GTCTGGTAGG GTATCACCTC AAAGAGCTCA GGCTCCTGAG GACTGAGCAA CAGTGAGGCC 3120
AAGGAACAGG TTCTGTTTCC CCTTTGTGGA TGCACAGAGG CTTTGTTAAA AGATGAGCAC 3180
CATTTCAAAT ATCCCGAGAA TGCAGCTGTT GGGCCGTTTA GTTCTGTTCC AACATTTTTT 3240
CCTAAAAAAG CATGGAGGAG GTGGTACTGC TCCAGTGCTG TATGTAGTGT TTTTCCAACC 3300
CCAGGGACTG TACTTCCTGC TTCTCACTGT GTCTCAAGCC AGAATGGAAA GGAGACACAC 3360
CTAAACCCTC CACACGTCAC CACAAATTCC TTTCCCTAAG AGCAGATTAC TTGATATCCT 3420
GAGAGGCCCC AGACTCAACT CTGAATGATA CAAATGAGTT CTACAGGATT TGGGGGAAAG 3480
ATCTGAGAAG TCAAGTTGCT GTTCCGAATG CCCTTTCTGA ATTTTGCCAA AGGAATGATT 3540
CCACTTTATG GAAACTAATT TGAGTGATTA TTATGGGGAT TAGATCAATT GGTGGTCAGC 3600
TCTGTTCAAC AATCTTTTAT GGTACGCCCC CTTCGGGCTC AGCACAATGG CAGTGTGAGG 3660
TGGGAAAGGG AAAGAGATGC CTTCAGGAGA TGAAAAGCTA TCATTTAAGG CAGGACAAGC 3720
ACATGAAGAG TATGCTAGCA GTAAAAAGAC AGTCAACCTC ACTTTTATCA TAGGCAACTC 3780
CTTAACGAAG AAGGCACGCA GCTGTAGGGA GGAAATAGCT CTGAGAATCA TTGTGGCCAC 3840
ACTGTCATGG TCTGTTATGC AGCTGCTGGT TGGAGGAATT GGCCTTGTTC CCCAGGGTGG 3900
AGCTGTCACA AAATAGAGTG GGAACTGTCT GGCTTTCAGC CCAAGAGAAT CTGCATGGCA 3960
AGTTGCATTA ACAACCAGGC ATTTCCGGCA GTTCCCAACA TTTCTGGGAA TTTTCTCATC 4020
CAAACGACTG AAAGCCCACT CCATTCTCTT GCTTCTTACT CATGCTTTCT TTGTATAATG 4080
GTAATTATGT TTTAAAAAAT CCTGGGCTAT GTTGTTTCAT GGAACAATTT AGAACTTATT 4140
GGTCAAACTC TGAAGCAAAG GTATATAAAA GGTAGTTAGA GATGTTTAGG GAATATTCAA 4200
AGCACATTTT TGGGTCACTC ATAATTGATC TTTATATTCA TATATGTATA TATATATATA 4260
TAACATAATG TACCCATCTT AACATATCAA AGCTAAACCA GTATTAAAAA CAACTGACTA 4320
TGGTCTATTG ATACAATATA TGATGCCCAA GTACACTCTT CATTGCTACT GCATATCTAA 4380
AATCATTTAT TTATTTATCC ATCCATCAAG AGTGTATTGA GAGCCTGACA ACATACCAGC 4440
ATCAAGCCCT GGAGGTCTTT TTAAGGCTGA GCCAATATAG CTATGGATAA CATTCTAAAA 4500
CTGATAGCAT ATTTTCATGT TTTATAGTCT TTCCACAGAC TAGTTCAAAA TGAACACTGC 4560
CTGAGAGGGG CTTTAAGATG ACTGACTAGA GGTACTGGAC ACCTGTTTCC CCAGCAAAGA 4620
AGAGCCAAAA TAGCAAGTAG ATAATCATAC TTTGAATAGA CATCTAAGAG AGAATGCTGG 4680
AATTCAGCAG AGAAGTGACA GAAAACACCT GAGATACTGA AGGAGAGGGA GGCAAGGTAG 4740
ACAGCCTGGC TGGAATCAGC TGGGAGCCCA GAGAGGGTCC CTAGTGAGAG GAAAGGGTAA 4800
GTGAGAGATT CCCAGTGGTA CATGTTCCCA TGTTGACTGC TGAAATCCTA GTCATAAGAG 4860
TCTCTCAAAC CCCAAGGACC CTGAAACTGG TATTCCCGGG GTCCGTGTGG CAGCATTGCT 4920
CCAGAGATGG AGCCCACTCG GGTCCCATGT ACCCACTTAG TTCTGGACAG ATAGAGAGCC 4980
AGTTAGAAAG CCCATTTCCC ACCAGACTGC ATTGTGCCCT GGGACCCAGC AACCCCTGTA 5040
TCTTCACATC CCTGGAGCCC CACTAACAGA GGGCTGCAGG GTGCAATGCA GGTTGGACAC 5100
AGTAGAGTGG CAGGGTCTCC AGAACTCTAG CCCACACATT GTACTGCACA CTGGGGAGGG 5160
TGATCCTGGG ACAAAGGGAG CTGAAGCATG TGTTTCCCAG AGCATGAAAC CTGATTTCCT 5220
GGGGCCACTG TCAATGAAAT AAAACCCTGT TCCCACAGTA GAAGGGCTGC TTCACACTAG 5280
CATGTGTCCT GAGGTCAGGC TGCCACCATT GTCATAGCCA CCTGAGCAAA CCGTCTGGGG 5340
CTTGGAAATT GCTCTGCCTT GTTCACCACA GCCTGGGCCC ATGGGCCCCA TGGGGGGCCT 5400
GAGAATAGGC CTGCCTGGCC TGGCACCACC CCTGTCCTCC ATCAGTGCCC AAGCACATTG 5460
CCTGGGGGCC TAGGGATTGC CCCTCCCCAT TGGTTGACCC AGGTGCATAT GCATGCCATC 5520
AGGGGGCCTA ACAGGACCAG AAAACCTACT GCTGAAACCC AAGCATGCTG TCTGGAGGCT 5580
GGGGGATTGC CTCACCTTGT CTACAACAGC TGGCATCTGG GCAATACTCC TGGAACTTGA 5640
GAATAGGCCT GCCCAGCCTG CCACCACCAC CACTGCTGGC AATCTTCTGC ATGCACTACC 5700
TGGAGGATTG GGGACTGGGC TGCCCAGCCC ATTGCAGCCA CCGCTAATAT CAGTGAGTGC 5760
CCATGGGGAG CCTGAGGACT CATCCAGTCA TCTGGCACAC TGCTGCCATA ACCAGCACCC 5820
AAGAAAGCTG CCTGGAGGCC CCAAAATCAG CCCTCTGGAC TTGCTAACAC TGGCGCCCAC 5880
ATATGCCACC CCGGGACCCA AGAACAGGCA TGCTTGGTCT GCCGCTGCCA ACAGCAGGGC 5940
CTGAGGACTG GCCCACCTGG CGTCCTATCC CCAGGAAAAC CTCAGCATAA TCTCTACTAA 6000
CAACGGCAGC CTACGCCACT GAGGAAATCA CAGACACCAC TGATGGTGTA TAGCCAAAGA 6060
AATCCTATGG AGACTGCACC ACCATATATG CCCAGAATAA AAGAAAAGTA CCCTAACCAA 6120
CCAACACCAT AGATCTATCT ACAGGAAAAT GTCTTCCCCT ATGAAAACCA ATCTAAAAAA 6180
TTGGAGGAAG TGACTGTTAC ACCAGATGCA CAGATATCAA 6220