EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS130-00114 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MDA-MB-231 
Coordinate
chr1:8453940-8458380 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr1:8457948-8457959TAATTCAATCA+6.14
FOXP1MA0481.2chr1:8454265-8454277ATGTAAACAGAC+6.44
FOXP2MA0593.1chr1:8454265-8454276ATGTAAACAGA+6.02
Foxa2MA0047.2chr1:8454262-8454274CCAATGTAAACA-6.62
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:8455317-8455332AAGGTCAGGAGTTCA+6.04
Number of super-enhancer constituents: 41             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00045chr1:8452127-8460150Adipose_Nuclei
SE_02022chr1:8455562-8457961Aorta
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SE_02685chr1:8455412-8458882Astrocytes
SE_03407chr1:8456775-8457350Brain_Angular_Gyrus
SE_03947chr1:8455648-8458563Brain_Anterior_Caudate
SE_04978chr1:8455327-8458485Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06073chr1:8455339-8458577Brain_Hippocampus_Middle
SE_07042chr1:8455426-8457730Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07921chr1:8455522-8459037Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_11329chr1:8446106-8460302CD20
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SE_25808chr1:8455157-8458849Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27457chr1:8455422-8456672Esophagus
SE_27457chr1:8456762-8458594Esophagus
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SE_31622chr1:8455468-8456548Gastric
SE_31622chr1:8456995-8457584Gastric
SE_37218chr1:8454074-8459264HSMMtube
SE_39132chr1:8455453-8458614IMR90
SE_40658chr1:8455117-8459203Left_Ventricle
SE_42166chr1:8455452-8459030Lung
SE_44612chr1:8455413-8459062NHDF-Ad
SE_45170chr1:8454207-8458904NHLF
SE_45677chr1:8452328-8460198Osteoblasts
SE_47251chr1:8453660-8459514Panc1
SE_48103chr1:8455418-8458882Psoas_Muscle
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SE_51176chr1:8455007-8458926Skeletal_Muscle
SE_52016chr1:8454055-8455308Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52016chr1:8455374-8458830Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52725chr1:8455454-8458751Small_Intestine
SE_53408chr1:8455166-8459067Spleen
SE_54752chr1:8455534-8458192Stomach_Smooth_Muscle
SE_58576chr1:8455425-8501956Ly1
SE_60758chr1:8454848-8500160DHL6
SE_62661chr1:8450826-8509851Tonsil
SE_63725chr1:8453894-8455322HSMM
SE_63725chr1:8455410-8458900HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr184555358455974
chr184560118457893
chr184546558455368
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I008393chr184539948459064
Enhancer Sequence
CTTCATTTTT TGTTTATAAT TTGAAGGGCA ATTAGAAGCT TCAGATGATA GGAGCTCAAG 60
GCCCACGATT TTGCCATGAA GGCTGGCCAC CTCCAATCTC CACCTGGGGA CTTAAAACAC 120
TGCAAAATCC TATACACCAT AACCCAAGAA AAATCCCTGA TTTCTCCACT AAGGGCTCCT 180
GAGACCAGAA AGACAAGATG AAGGATGGTG ACCTATACTT TGGGAAAACC AAATTAGCTG 240
CCATTTCTTG ACATTCTATA ATCCCAACTT TCAATTTCTA ATGCAGGTGG CTCTAACTGC 300
ACAGGTAGGA CAGAGCTGAA ATCCAATGTA AACAGACACA ATTCATCTTG CACACAACAC 360
TATACAGAGC TTTCCCCATT ATTAAAAAGC TTCACCAAAA TCTTGATTGG AAGTATGCTA 420
AACATACTGC CCACAATTCC AAATTAAACA ATTTTGAGAA ATATTTCTTG CTTTTCAGAT 480
TCTCAAAATA TTTGAAGTTC GACAACTACA TACAGGCAAG ATCATTCTGA CCATCAACTA 540
CTCAATTAAT TCTCACTACT GTCCTGGGAA GCAGATAATA TTATCACCAT TTTATAGATG 600
AGAAAACTAA AGCACAGAGA GATGAAATAA TTTGTCCAAG GACAGCGGGA GTGGAAAAGG 660
AATTCACACA CATTTCCGTT TTCCAGTAAT TTAACTTAAG AAAGGAGCTA CTGCAGAGAA 720
CAAACTTATC AGTCATGGAA TCCCACATCA CTCAGTGCTG GAGAGGGGGA ATGAGCAACA 780
AAAAAGTGAC AAATCATAAG GTCTGAGTCC CAACTCTCAG CCAGAGTCAC CCAATTGCTT 840
CAGAAGACTG TTACCCCAAG GAAATAAGAA AAAAATACGT TAACTTGCTC TGTAAACCAT 900
AAAATCCACT ACTAGTATAT ATATATATTA TATCTCCATG AAGCACTTAC CACAGTTACA 960
CTTGGTTTTT GTTTGCATTT CTTAGCAGGT GATTAATACT TTAAGGGGAG AGAAACTGTA 1020
TTACTCATTT TTATATCCTC AGCATCTATC TAAAATGTCT TTCCCATAGA AACTCAAACG 1080
TCTGTTGAGT GGTTGAGTGA GTAAATAAAT GTAAATAAAA TAAAAAAGAA AACATATTTT 1140
AAGGGCCAAA CAGCCCAAAG GCATTCCATG AGGGAAGTTT GTTACTAAAC TTTCAGATAA 1200
GGTGTCTAGT ATTTCCTGTA ATAAGATATT GTATATTCCC CTTCTCCTGC CCACAGAATA 1260
AATCAAGTAC AAAGAAACTA AAAATAATAA TACCAAAGAA TGAGCAATTT CCGGGTCGGG 1320
TGCAGTGGCT CATGCTTGTA ATCTGAGCAC TTTGGGAAGC CGAGGCGGGT GGATCACAAG 1380
GTCAGGAGTT CAAGACCGGC CTCGCCAATA TGGTGAAACC CCATCTCTAC TAAAAATATA 1440
AAAAATTAGC CGGGCGTGGT GGCACACGCC TGTAGTCCCA GCTACTCGGG AGGCTGAGGC 1500
AGGAGAATAG CTTGAACCCG GGAGGCAGAG GTTGCAGTGA GCTGAGATCA CGCCACTACA 1560
CTCCAGCCTG AGCAACAGAG TGAGGCTCTG TCTCAAAAAA AAAAAAAAAA GAATGAACAA 1620
TTTCCTCTTT GGTCTTGTCT GCATAAAAAA GGAACCTCTC CTGCTCAGCT ATGCAGGCAC 1680
CTGGAGACAT TTGAAGCTGG AGGTAGGAAA AAAAAAAGGT GAAGGTGAGC TTGACCTAGA 1740
AGGGCAACTG TGAACAAGGT GCTTTGAGGA AGCAATGTCA AACCTGTGTG GACCTTTTTG 1800
TAAACAGGTT AATTTCCTAA ATTCTTTTGT GGGAATATAA GACATCCGTG TTTCTAAAAC 1860
GGGAGAGGAG AGGAAACAAA AACCAAAACC AAAACCACCA CCATGCACTG AAGGCCTGCA 1920
GTGGGGGCAC AGGAGGAAGT ATGAGAGGTT CCATGCCTGA GTTGTGATGT TTGCAGAGAA 1980
TTAGCCAGTG AGAGTGCCCA AGGAACACGG GAGCACAAAT CTGAGAAGGA ACACTCGAAC 2040
GAGGACCAAT TCTATTATTA TTATTCTGCT CTGTAAGGCA TAGGTGACAC CACCCCTCTC 2100
TCTGTGCTTA AAGGACAGCC ATTCCATTAA CTACCCACCT TGAATGGATT CCAGAGAAAG 2160
ACTTTGTTCC CCAAGAAATA TTAGCAAAAG CCTTCAAGCC AGGGCTAAGA GCCTTAGTGA 2220
CAAGTGAGAA GGCACAGAAC AACTGAGCAG AGATCATCTC TTGAAAACCT ATGCTAATTA 2280
TCCTGTTTCT ACCATCAGGA AAGTGGGAGG GGGGAAGGGC TGCTGTGCTA TCACTTGGGG 2340
TCCATTCTGG GGTCAAATTT GAATCCCAGC TTCTAGAGCT GAATTCAATG TGGAGTTTGT 2400
TGTCCATGCC AAAATTCAAA GGCTGATCAA GTTGAAGAAC GTGACATGGA CATAATGTGA 2460
AGTACATGAA AACTCACATA CAAAGTACCT GCCCTCCTGG AACCAGTCCC CAGTTATCAC 2520
AGAGCCGAGA GGAAACCAGT CCCCTATTAT CAAATCCTCT TACTCTTGAC TAGAGTGATG 2580
GAATTTGGGA AGAATGCAGC AGACTTCTAA AGACTGCTCA GCTACAAGCA GGATCTTCAT 2640
CTCCTTTTCA GCTGTGGATA ACAACGGAAG CAGTCAGCCG TCTAATAAAT CAAGTTTAAT 2700
TTTAACAGCA TGAAGTATTG CCCGCTTTGT AATTATACTT CCAAAGGTAA AACCCAACTC 2760
GAATTAACTT AAAAAAATTG TTATTGAGGT AAAATTCACA TAACATAAAA TTAATCATTT 2820
TAAAGTTTAC AATTCAGAGG CAGTTAATAC ATCTACAATG CGTGCAGCCC TCAGATCTAA 2880
TTCCAAAACG CTTTCATCAT CCCCCAAAGG AGACCCCTCC CCCTCATTAA GCAGTCAAAG 2940
TGAACTTTTT CCACAATGGC ATTCTTTGTG ATATATCATG CTTTCTCCAC AGTATCAGTT 3000
TATTCACTTT CAACAGCATC TTTGCATTTT AAAGGTAAGG GAAAACTCAA AGGACCATGA 3060
GAACTAACAC TCACAAATGT GCTTTCCAGT CTACCACGTG ACTGTATACA CATCTGGTGA 3120
GACAGTTATC TCAGGCAAAA TGTACTGTGT GTCTTCCCTG GGAGGAGAAA CAGGAGCTGA 3180
TTCTAATGGA ATGTTTACTA TGTGACAGAT ACTGAGTCAG AAACAGCACA GCAGCTAAGA 3240
CTGGGTGCTC TGCAACCACA CTGCCCAAGT TCCAGTTCCA ATTCAGTGTG AACTCTGTGT 3300
TCTTTGGGCA AGTCATCATA ATCTCTCTGC CTCCTTTCTC TTCACACGTA TTGTGATGGC 3360
AACACCACCA CTTGCCTCAT GGAGATGCTA TGAAGGTTAA GTAAGTTCAA GTGCTTAGAA 3420
CAGTGCCTAG TGCATAATAA GAGCTCAATC ACTGCTGCCT TATTCGACTT TCACTACGAC 3480
TCTGAGGGAG GTTCTATTTG TGCCCCCATT TCATTACTGA GGAACTTAAA TTTTACAGCA 3540
TCTAAGAGAC TTACCCCAAA CCCCCAGAGA ATAAGTGGGA TAGCTGGGAT TTGAACTCAA 3600
TTCTGAGTTC TGTTGGCTTA GCAACCATTC TGTAAAATGT ACCAAGGAAC AAAACCTTTC 3660
TGATCCCAGT TACCAAACTC ATGTTGAGCA AAATCACACT CACACAGGAA AAAAAAAAAA 3720
AAACACATGA AACTGTCACC AAAATGGCAA TAACCCAACT GTGCTACAGT TTTATTTCCT 3780
GCTGGCTTCT CAGTTCTCTA AGCCTTGAGG ATCCACGCGC CTTAGACCAT TATTACCTCC 3840
TCCCCCATAT GCAGTAAGTT CCTGACTCTT CTGATCTTTC CTGTTCTTAC TGGGCACCAT 3900
CCCCCAAGAC CTTCTGCTAT TTGTACTTTC TGATTTCAGG CTCTTTATTC TCTGATACAC 3960
ACTGTTGCCA GAATAATCTT CAAAAAGATT GACTGCAACT TTCAACTTTA ATTCAATCAT 4020
ACAAATATTT CTTGAGCATC TAGGTGCAAG GCACCATGAT GAAGATAATG TGAGTAAGAC 4080
AGTCCTTGCC TTCAGGAGCT CAATCCAAAA AGGGAGGTGT AAGATAGAAT TTCATAAGAC 4140
AATGCAGAGC CAGAGAAAGG CCCTAAGAGA GGCATGATGT TCTACAGGGG TATTCAAAGG 4200
ACAGAGTTAT ATCCTCCTCA GATTAGAGAA AGATTAATGA AGGAAATTAA GTTTAAAAAT 4260
GTAGAGCATT TCCACATGGA GTAACAGAAG GGCAGGCATT CTGGGCAGAA CACTGCAGGA 4320
AGAAATGGCA GACAGGAAGC CTGAGTGTTT GGCAAGGGCC AGAGGTGCAG AAAGAAAAGC 4380
AGTAGGGAAG GGGCTTGGAG AAGCTGATTT GGACCACAGT ATAAAAGGTC TTGACTCTCA 4440