EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-03035 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:204375440-204378610 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:204375661-204375676GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
SOX10MA0442.2chr1:204375446-204375457AAAACAAAGAC+6.14
ZNF263MA0528.1chr1:204378445-204378466GGGTGAGGGACAGGAGGAGAA+6.1
ZNF740MA0753.2chr1:204376021-204376034CTGCCCCCCCCAA+6.23
Number of super-enhancer constituents: 27             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00064chr1:204374155-204384372Adipose_Nuclei
SE_07775chr1:204376171-204381746Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_12242chr1:204377042-204381849CD3
SE_13020chr1:204376800-204382840CD34_Primary_RO01480
SE_13620chr1:204375885-204382713CD34_Primary_RO01536
SE_14222chr1:204375835-204382864CD34_Primary_RO01549
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SE_17095chr1:204375880-204381997CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17602chr1:204373560-204382940CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
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SE_19722chr1:204375797-204381837CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
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SE_20531chr1:204378096-204381867CD56
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SE_21890chr1:204376513-204381870CD8_Naive_7pool
SE_22694chr1:204375889-204382158CD8_primiary
SE_23499chr1:204377184-204377830Colon_Crypt_1
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SE_26359chr1:204376035-204383017Duodenum_Smooth_Muscle
SE_28866chr1:204378208-204381807Fetal_Intestine_Large
SE_30374chr1:204378166-204381865Fetal_Muscle
SE_34711chr1:204376816-204384293HeLa
SE_36671chr1:204376037-204381866HMEC
SE_40776chr1:204378176-204381817Left_Ventricle
SE_45371chr1:204378023-204381984NHLF
SE_64411chr1:204375728-204381833NHEK
Enhancer Sequence
CCTACAAAAA CAAAGACTAA TTTTAATAAC TGTCTAGGAT CTTACAATCA GCATTGAGGT 60
CAATAACCCT TTATGCTACC AATTCTTTCA GAATATTCCC AACTAAGAAT AACATATTAT 120
TATTAGGAAT ATTTGGTCCC AGCTATATTT GAAGTTAAAA AAAAAGTTCT GTCACGCCTG 180
TAATCCCAGC ATTTTGGGAG GCGGAAGCAG GCGGATCACC TGAGGTCAGG AGTTCAAGAC 240
CAGCCTGACC AACACAGTGA AACCCTGTCT CTAGTAAAAA TACGAAAAAA TTAGCCAGGC 300
GTGGTGGCAC ATGCCTGTAA TCCCAGCTAC GCAGGAGGCT GAGGTAGGAG AACAGTTTGA 360
ACCTGGGAGG TGGAGGTTGC AGTGAGCCAA TATCGCGCCA CTACACTCTA GCCTGTGCAA 420
CAAGAGCAAA ACTCTGTCTC AAAAAAAAAA AAGTTCAGAT TAGATGGCAT TTGGATAAAA 480
TAGTGAACAA ATGTCACCTA AATATTTCAT ATAGAGATAT ATATCTTTCA TCTATATATA 540
CTTCATTTAT CTATATCTGC ATAATATACA CACACAGTCG TCTGCCCCCC CCAATCCCCC 600
ACCAGCCCTT GGCTTTTGGT GTTAATAAAA TGAATCCAGA TAGGGAATTG AATTTTTCAT 660
GCTGTTATTA ACCCCTGCTA TTTTTTAATC CTTAGGGAAA TACAGTTCTG TGATATTTTT 720
CCCTCAAAAT GACAAGCAAA ATATTTCTGA AAATAACCAC TATATCCCTG GAAGTCACTG 780
TTTTTATCAC TGCATAAAGG CTTTAACAAT ATTTTTGCTT ACTTCTATTC TTTTTCCTTT 840
TAAAAATTTT TTTCACTTTC CAACTTTTAA ATCAACATGT TGTACTATTT TTGTATCATT 900
ACTTTGGCAA TAACAATACA GAAGAGAAAA AGTTACTTAG TAAACAAAGT ATAGCAAAAT 960
TAGTATTTTT AAAGCTGTGT TACTCTAAGA AACTTTGTAG TTAAGATTTT AAAAACCTTT 1020
GTATTCAATA TGCTATCACT ATATATGAAA TTGTGATTCT AATATACATA ATGACATGTA 1080
ATGAGTGACA ATCCCTACTC ATTACTAATC ACTACTTAAT TTCTAATGAA GTTTCTTTCT 1140
AAGATATCAA ACTCCAAAAG TAAATACTTG CTTTCAAGTA TGTTTAATAG TTACATCAGC 1200
TAACCCCAAT GTGGCCTACT ACTTTCGTTC CCTTTACATC AAGCCAAGGG ATGCCCCTGA 1260
GGACAATTAG CAGGTATGTA ACACCTTACT AGTTATTGCA TTCTAGTCTT GAATACTACT 1320
CATTCATTGT GTCATTAAGA TAAATAATAA AAACGTACAG TGTTTACCAT ATACCAGGCT 1380
TTTTTTAAAG AGCTTTACAT TTTTATCTCA TCTAATCCTC ACATTAACCC TATGAGGTAT 1440
GGACTATTAT CATCCCCATT ATACCGATAA GAAAACAGAG GTAGAAGGGT TTTTTAGACT 1500
CACTGTCCAT CATCCTATAT ACTCCATATA TTCCATACAC CATTCCCCAT ATATACCAAT 1560
GGCAGGTAGT CAAAGGCTGT CAAATAATTA TATCATATTC AGACATAATC ATTTATAAAT 1620
TCTGCTTCTA GTTCATAGTC AATAGTATCA TCTACTCCAC TCATTTCATT TTACTCAACG 1680
AGCAAGCTAA AACAAGACAT GAGACTGGCC TGAGGTCTCT CAATAAGAGC TAGCATTTAA 1740
AGGCAAGGCA ATAAATTCTG AGTTTTATTT ACTTGTCTCA TTTAAATCTT GCAATAACTT 1800
GTACAATAGA TATTATTATT TTACCCATCA AGTAAGAGTG AATTGAGGCC ATGAGAGTCA 1860
AGCAACTTCC CAGGTCTGGC TGCCTTCCAA ATCTCTGCGC CTTAACCACT GAGGAGTAGA 1920
GAACACAGGG CTCCAGCTGC CAAGTGCTCA TTCCATTGCC CCACTTTGTT TCTTACCTAT 1980
TCATTCTAAA TAGGTCATTT TGTCAGGGGC CCCTTAAAAG GACAAAGAGA GATGGCATTT 2040
ACAAAGTGTG AACTAAAATT TAATCTTTAA CATGACTTAT TCTGCCCTAA AGGTAAGACG 2100
TAAGATTATC ACCATTTTGA GACATTTTCT ACCCAGGAAT AATTTCAAAG TAGTAAGCTG 2160
GCCATGTGGA GCCAAGAGAT TATGGTACTG TCCATTTGAA ACGCCCCAGT GAGGCAGAAT 2220
CTGAGGTCAA TAATAACTCA CCCACTAACT TCTCTCTCCA AGTAACGGTA TAGAAAACTA 2280
AAAAAACGTT CCCTCTACAA TAATAGACAC CTTTGAGTTT GGAGAAGAGT TCAATTAATA 2340
ACTTTAGTTG AATCAACTAT AAAGAAAAAC AAACCAACTC TAAAGACTCC CAAAATAAGG 2400
TTAACCTGAC AATGTAATTA AAGCGTAAAA TGCTGCATGA AGTTTTAAGA CTAGCCTGGG 2460
AAAAGGAAGC AACTAGTCAA GATAAACCAA GTAAGTGGCC ATCACTGTTT ATTATTAATA 2520
TTAACCTGTA GCTGACCACT GATAACTAGC ATTGCATTCC TAAGAAAAGG CAATACCACT 2580
TCCTGTACTG GCTTTGACTT TCAATTAAAA CCATGTAATG TCAAAACCAG TGAAATTACT 2640
ATTTAATTTC ATGGCCAATT GGACCAGATA AATCTGACTT GCTACTTGAT ATCATCATCC 2700
CTTTGGGTTG TAATGGACAG GAATGAAGAC ACTCTTGTTA TATGCAAAAA AAATATTAAG 2760
TATTTGCAGA CAACATACAT TTAAAATCAT TTTAAAACTC TATGGCTGTA ACAGGACCTT 2820
TTCAATCTCT AGAAAAATTA AATCGTGTAC ACACAAAGTT TAATAGTCCG TTAAAAAGTG 2880
TGAAAAATTG AAGCTTGTAA GGAAACAGTC CAGAACTACC AACCCAAATA AAAATGGCAC 2940
TTTCCTGCTA ACATCTACAC ACTGGTATGT TCGTTTTGGA CAGCAACAAT GTGCATTGGG 3000
GTGGGGGGTG AGGGACAGGA GGAGAAGGGT CATTTACATA TTTCTCAATC CAAGTATATG 3060
AATTTAGAGG CCTTCCTCAA AAATACATGC ACTCCTAAGC CTCCAAAGTC ATGCTGCTAT 3120
ATTTAAGCAT ATAAAAACAG TCAGAACATA TCAGGCATGT TAAAAGACAA 3170