EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-02848 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:200872840-200876960 
Target genes
Number: 11             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 4             
IDChromosomePositionGenome Version
rs35730213chr1200874229hg19
rs374827chr1200874327hg19
rs55838263chr1200874728hg19
rs12132349chr1200875242hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:200875430-200875445GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
PLAG1MA0163.1chr1:200872997-200873011CCCCCTTGGGCTCC-6.39
TCF7L2MA0523.1chr1:200874195-200874209AAAGATCAAAGGCA+7.73
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
SE_23181chr1:200873416-200874006Colon_Crypt_1
SE_23181chr1:200874081-200874690Colon_Crypt_1
SE_23181chr1:200874811-200875442Colon_Crypt_1
SE_23181chr1:200875626-200878812Colon_Crypt_1
SE_24573chr1:200876333-200878783Colon_Crypt_2
SE_25202chr1:200875656-200878870Colon_Crypt_3
SE_27435chr1:200873387-200874956Esophagus
SE_27435chr1:200875065-200878791Esophagus
SE_28769chr1:200876016-200879782Fetal_Intestine_Large
SE_33981chr1:200873398-200878744HCC1954
SE_50836chr1:200873411-200875646Sigmoid_Colon
SE_50836chr1:200875691-200878781Sigmoid_Colon
SE_52641chr1:200873442-200875476Small_Intestine
SE_52641chr1:200875601-200878779Small_Intestine
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1200873042200873235
chr1200874896200875384
Number: 4             
IDChromosomeStartEnd
GH01I200904chr1200873417200874006
GH01I200905chr1200874082200874690
GH01I200906chr1200874781200875150
GH01I200907chr1200876801200876990
Enhancer Sequence
ATAATCACTT GAACCCAGGA GGCGGAGGTT GCGGTGAGCC GAGATTGCAC CATTGCACTC 60
CAGCCTGGTG ACAAGAGCGA AACTCTGTCT CAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AGGGAAAAAA 120
GCAAACAACC CAAAAACCGA AATAAAAAAC CACCCTGCCC CCTTGGGCTC CATACAAGGG 180
TAATTTAGTT TGGGAAAGTA ACTGCTAGGT GAGAGTCATC AGCCATACTT TGCAGTGGCA 240
GGGAGCAGTC AGGTGTTGAG CTCATTTACT AGAGTGAACC GCATGAGGGC CACCCAGCAC 300
CCACCTGTGC AATGTAATAG GCACTCTGGA TGCATCTGTT GATCAACAAC ACCAGCCATT 360
AGCCACATCC TCATAACATT TTTTTTTTTT TTTTGAGACG GAGTCTTGCT CTCTCATCCA 420
GGCTGGAGTG CAGTGGAGCC ATCTCAGCTC ACTGCAACCT CCACCTACCG GGTTTAAGCG 480
ATTCTCCTGC CTCAGCCTCC TGAGTAGCTG GGACTGCAGA TGCGTGCTGC CACGCCCAGC 540
TAATTTTTGT ATTTTTAGTA GAGATGGGGT TTCACCAAAT TGTCCAAGCT AGTCTCGAAC 600
TCCTGACCTC AAGGGATCCT CCCGCCTTGG CCTCCCAAGT GGTGGGATTA CAGGCGTGAG 660
CCACTGCGCC TGGCCGCTCA TAGCATTTCT GAGATGGTGG AAGTGTTCTG TATCTGTGCT 720
GTCCAATACA GTAGCCACTC GCTGCATGTG GCTATGGAGC ATTTGAACTG TGCCTAGTGT 780
GACTGAGGAA CTGACTTTAT TTAGTTTTAA TGAAAATAGC CACATGCGGC TAGTGGCAAC 840
TGTGTTGGAC AGCATAGCCT TGGGGGAAGC TCAGCATTTG TGAGTAAAAT CTCCACCGTT 900
ACCCCTCTGT CTGGGGTGTC CTGCGATGCT GCTGCGGGGC AGGGGAACGC TGAGCTAGGG 960
CAGGGTTGGG ACAGTTGCTG AGATAGTGAG CAGCTCTCAG AAACCTGAAT CTTTTTTTTT 1020
TTTTTTCCAA TCTTTTTAGA GACAGGGTCT TGTTCTGTTG CTCAGGCTGG AGTGCAGTAG 1080
TGTGATCATA CCTCACTGCA GCCTTGAACT CCTGGGCTCA AGTGATCTTC CTTCCTCAGC 1140
CTCTAGTAGC TGGGACTACA GTCATGTGCC ACCACACCCA GCAAATTAAA ACAAAACAAA 1200
ACAAAAAAAC TATTTTAGAG ATGGGATCTT GCTATATTGC CCAGGCTGGT CTCAAACTCC 1260
TGGTCTTAAG CAAACCTCCT GCCTCAGCCT CTGGAGTAAC TAAGATTATA GGTGTGCCTG 1320
GCCCAATGAA AATCTTTATT CCTAAGGTTT TTATAAAAGA TCAAAGGCAG GAGACCAGAA 1380
TTCAGTAAGA GGGGGTCTCT TTAATTGAAC CCTAAAGCAA AGGCTACTTG TGAGCCAAGC 1440
AAAGCATGGG CTGGCTGGCT ACTCAGGAGT CAAGCCCAGC TCCTGGTACC GTATGTCCTA 1500
GAAATCTACT GCCTGCTCTG GGTAAAGATT TTTTCATTAA ATTGCGGAGC AGGCTGAGCA 1560
TGTTGGCTCA AGCTTGTAAT CCCAGCACTT TGGGAGGCCA AGGCAGGAGG ATCTCTTGGG 1620
CCCAGGAGTA TGAGACCTGC CTGGACCACA CAGGGAGACC CTGTCTCTAC AAATAACTAA 1680
AATAAAAAAA TTGGATAGGC ATGGTTGTGG ACACCTATAG TCCCAGCTAC TCAGGAGTCT 1740
GAGGTGGGAG ATTGATTGAG CTCAGGAGGT CAAGGCTGCA GTGAGCTGTG ATCGGGCCAC 1800
TGCACTCCAG CCTAGGCAAC ATTGTAACAA CCCATCTTTA AAAAGATGGG TTAAACCTTT 1860
GTGGAGCAAA GGTTAACAAA CTTTTCCATA AAGAGCCAGA CAGTACATAT TTTAGTCTTT 1920
GTAGGCTCTT TGGTCTTTAT CACAACTGTT CAACTCTGCT ACTTCAGTGC TAAAACAGCC 1980
AGACATTACA TAAACAAATT CATAGCCGTG TTCCAATAAA CATTTATTTA CAAAAGCAGC 2040
TATTGAACTG GATTTGACCC CTGGGCCATA GTTTGCTAAC CTCTGTTGTA AGGGATTTCA 2100
AGATGGTTGG AACTTTTTAC TTTTTTTGAA ACTTCCTGGG CAATGCCCAT GCATTTGAGA 2160
TGCAAGCTCA CAGGGGAGAG CCCATAAAGG GTTGTGGTTA AGAGCAGACT CCAGTCAGAC 2220
TGTCTGGGTG TGAATTCTGA CTCAACCACC TTTGTTGAAT GTATAACCTA AACCACGTTA 2280
CTCAACTCCT CTGAGACGTG GTTTCCTCAA CTGTCACTTG CAGGTGATAA TATCTACCTT 2340
ACGTGGTTGT TATGAGAATT ACCTGAATTA ATATATATAA AGTGCTGTAT TTAGAAATGT 2400
ATTGGCACAG TAGAAACATT AGCAATTATT ACTTTTTCCT CATCTTCATT CTCAAACACA 2460
GTTGAAAATG TTTCGTGAGT TCCATCCAGG TCACTTTAGG CTTATTCTCA AGATCTGAAG 2520
GCCTGGCCGG GTGTGGTGGC TCACGCCTGT GATCCCAGCA CTTTGGGAAG CCGAGGTGGG 2580
TGGATCACCT GAGGTCAGGA GTTCAAGACC AGCCTGGCCA ACCTGGCAAA ACCCCGTCTC 2640
TACTAAAAAT ACAAAAATTA GCCAGGCATA GTGGTGTGTG CCTGTAATCC CAGCTACTCG 2700
GGAGGCTGAG GCAGGAGAAT CGCTTGAACC TGGGAGGTGG AGGTTGCAGT GAGTCGAGAT 2760
CACACCACTG CTCTCCAGCC TGGGTAAGAG AATGAGACTC CATCTCAAAA AAAAAAAAAA 2820
AAAAAATCTG AAGGCTTAAG TTTCTTCAAA AGCAATAGCA CAAATGAGTT CCCTCTGATT 2880
TCTTAGGTAA AAAGTGCTGC TATACCATGA AGTAAAGTCA CACTGAATTT CCTTCAGGTG 2940
ACTTGCCAGA TCACCAACTG AAGAAACTTC CCTGGGGCCA GCTGGCCAGA CCTTATCTTA 3000
AATTCAAATT CCTACCTTGC GTTCCTCTTG TTGTTGGTAA CACAGGAGGT CTCACATTGG 3060
GATCTTTGAA TTGTGTTTGT GATGTGAGAT GATTATACAA AAGTTAGAGT GAAATTCCCT 3120
TTTTTTTATT TGAGACAGGG TCTCACTCTG TTGCCCAGGC TGGAGTGCGG TGGTGTGATC 3180
ACGGCTCACT GCAGCCTCGA CCTCCCAGGC TCAAGTGATC TTCCCATCTC AGGTTCCCAA 3240
GTAGCTGGGA CTACAGGCAT GCACCATCAT GCCTGGCTAA TTTTCGTATT TTTTGTAGAG 3300
ACCAGATTTC ACCATCTTGC CCAGGTGGGT CTTGAACTCC TGGGCTTAAG CCATCTGCTG 3360
CCTTGGCCTC CTAAAATGCT GGGATTACAG GCATGAACCA CCGCGCCTGG CCATGAAATT 3420
CTTTTTATCC TAAGGGCCTT CCAAAATGAC CCTTTGTCTT TCCTTTCCAC TACCAAGAAG 3480
CCCTGCCAGA GGACACCCTT TTTCTTTTTT TTTGACAGGT GGGGAAACTG AGGTCTAGAG 3540
CATTGAAATG GTTTATTCAA GGTTGCATAG CTAGTATCAG AGTCAGGATT AAAATCAGGT 3600
TTCCTGTCTC CTAGCTCTGC CTTCTATTTT TTTCTACTTC CATGTAGTAA GTTTACAGCC 3660
AGGCCAGGCA CAGTGGCTCA TGCCTATAAT CCCAGCACTT TGGGAGGCCA AGGTGGGATG 3720
ATCACTTGAG CCTAGGAGTT CAAGATCAGC CTGGGCAAGA CAGCAAGACC TCTTCTCTAC 3780
AAAAAAAATA AAATAATTTA GCTGGGTGTG CTGGCATGCC CCTGTGGTCT CAGCTACTTG 3840
TGAGGCTGAG GTGGGAGGAT CCCTTGAGCC TGGGAGGTCA AGGCTGCAGT GAGCCATGAT 3900
CACACCACTG CACTCCAGCC TGGGCCACAG GGTAAGACCC TGTCTCTTAA AAAAAAAAAA 3960
AATCACTCCC AATGTGTATT TAGCACACAG AGGGTATTTC CTCATAACTG ATGCTGTCCT 4020
GGGGGAGTGA TCAGGCCTGA GCTGCTCAGC ACTGCTGGTT ACTCATATCT GTTTGTTCAT 4080
TTCTTCACTT CCTTCTCTTC TCTCCCCTTT GTCTTTCGCA 4120