EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

EnhancerAtlas 2.0

Tag

Content

EnhancerAtlas ID

HS129-02216

Organism

Homo sapiens

Tissue/cell

MCF10A

Coordinate

chr1:154686290-154687230

Target genes

Number: 28
Name	Ensembl ID

RP11	ENSG00000226855
IL6R	ENSG00000160712
UBE2Q1	ENSG00000229780
CHRNB2	ENSG00000160716
PBXIP1	ENSG00000163346
PYGO2	ENSG00000163348
SHC1	ENSG00000160691
CKS1B	ENSG00000173207
FLAD1	ENSG00000160688
ZBTB7B	ENSG00000160685
DCST2	ENSG00000163354
DCST1	ENSG00000163357
ADAM15	ENSG00000143537
EFNA4	ENSG00000243364
EFNA3	ENSG00000143590
EFNA1	ENSG00000169242
SLC50A1	ENSG00000169241
DPM3	ENSG00000179085
HMGN2P18	ENSG00000223452
KRTCAP2	ENSG00000163463
MUC1	ENSG00000185499
MTX1	ENSG00000173171
MTX1P1	ENSG00000236675
GBA	ENSG00000177628
FAM189B	ENSG00000160767
SCAMP3	ENSG00000116521
CLK2	ENSG00000176444
FDPS	ENSG00000160752

TF binding sites/motifs

Number: 13

JASPAR ID

Coordinate

Motif Sequence

Strand

-Log10(p-value)

RREB1	MA0073.1	chr1:154686745-154686765	GTGGTGTGTGTGGTGTGTGG	-	6.01
RREB1	MA0073.1	chr1:154686996-154687016	TGTTTGTGTGTGGTGTGTGT	-	6.06
RREB1	MA0073.1	chr1:154686860-154686880	GGGGTGTGTGTGTGTGGTGT	-	6.11
RREB1	MA0073.1	chr1:154686979-154686999	GGGGTGTGTGTGTGTGGTGT	-	6.11
RREB1	MA0073.1	chr1:154687016-154687036	GGGGTGTGTGTGTGTGGTGT	-	6.11
RREB1	MA0073.1	chr1:154686657-154686677	GGTGTGTGTGTGGTGTGTGT	-	6.16
RREB1	MA0073.1	chr1:154687020-154687040	TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT	-	6.16
RREB1	MA0073.1	chr1:154687031-154687051	GGTGTGTGTGTGGTGTGTGT	-	6.16
RREB1	MA0073.1	chr1:154686911-154686931	GGGGGGTGTGTGTGTGGTGT	-	6.23
RREB1	MA0073.1	chr1:154686896-154686916	GGATGTGTGGTGTGTGGGGG	-	6.36
RREB1	MA0073.1	chr1:154686877-154686897	TGTTTGTGTGTGGTGTGTGG	-	6.57
RREB1	MA0073.1	chr1:154686772-154686792	GGTGTGTGTGTGGTTTGTGT	-	6.94
RREB1	MA0073.1	chr1:154686948-154686968	GGTGTGTGTGTGGTTTGTGT	-	6.94

GeneHancer

Number: 1
ID	Chromosome	Start	End

GH01I154714

chr1

154686574

154689656

Enhancer Sequence

CCTTATTCTC AACTTTTCAG GGATTCCCCA AACCTCTCCA TCAGAATGAA TGTTTTCATC 60
CTTTGCTTTT CCACTATACT TTTAAAAACT CCTCCATCAC AGAAAGCATC AGCCACGGTT 120
TGTTTTGATT TGAGTTGCAA TGCATGGTGT GTGTGATGTG TGGTGTGTGC GGGGTGTGTG 180
TGTGTGTGGT GTTTGTGTGT GGTGTGTATG GTGTGTGTGA TGTGTGGTGT GTGCGGGGTG 240
TGTGTGTGTG TGGTGTTTGT GTGTGGTGTT TGTGTGTGGT GTGTATGGTG TGTGTGATGT 300
GGTGTGTGTG GGTTGTGTGT GTGGTGTTTG TGTGTGGTAT GTATGGTGTG TGTGATGTGT 360
GGTGTGTGGT GTGTGTGTGG TGTGTGTGTC GTATGTGGTG TGCATGGTGT GTGTGGGGTG 420
TGTGCGGTGT GTATGGTGTG TGTGATGTGT GGTATGTGGT GTGTGTGGTG TGTGGTGTGT 480
ATGGTGTGTG TGTGGTTTGT GTGAGGTGTG TGTGTGTGGT GTTTGTGTGT GGTGTGTATG 540
GTGTGTGTAT GGTTTGTGTG AGGTGTGTGT GGGGTGTGTG TGTGTGGTGT TTGTGTGTGG 600
TGTGTGGGAT GTGTGGTGTG TGGGGGGTGT GTGTGTGGTG TTTGTGTGTG GTGTGTATGG 660
TGTGTGTGTG GTTTGTGTGA GGTGTGTGTG GGGTGTGTGT GTGTGGTGTT TGTGTGTGGT 720
GTGTGTGGGG TGTGTGTGTG TGGTGTGTGT GTGGTGTGTG TGTGTGGTGT GTATGGTGTG 780
TGTGATGTGT GGTGTGTGGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTAGAATG 840
TGAAAGCTCT TAGAGGTTCT TACTCTAGTT TTTACCTTCC ATAGCAGCCT GCCCAATTCC 900
TGGCATGTGG CTGGTGCAGT CAGTGAGTGA TCAGACCCAG 940