EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-02168 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:153531730-153533580 
Target genes
Number: 43             
NameEnsembl ID
SPRR1BENSG00000169469
SPRR2DENSG00000163216
SPRR2CENSG00000229035
SPRR2BENSG00000196805
RP1ENSG00000230779
PGLYRP3ENSG00000159527
PGLYRP4ENSG00000163218
S100A9ENSG00000163220
S100A12ENSG00000163221
AL591704.5ENSG00000237008
S100A8ENSG00000143546
S100A7AENSG00000184330
AL591704.9ENSG00000203781
S100A7ENSG00000143556
BX470102.3ENSG00000238279
S100A6ENSG00000197956
S100A5ENSG00000196420
S100A3ENSG00000188015
S100A4ENSG00000196154
S100A2ENSG00000196754
S100A16ENSG00000188643
S100A14ENSG00000189334
S100A1ENSG00000160678
CHTOPENSG00000160679
S100A13ENSG00000189171
SNAPINENSG00000143553
ILF2ENSG00000143621
NPR1ENSG00000169418
AL713889.1ENSG00000242565
RP11ENSG00000235015
INTS3ENSG00000143624
SLC27A3ENSG00000143554
GATAD2BENSG00000143614
DENND4BENSG00000198837
CRTC2ENSG00000160741
CREB3L4ENSG00000143578
SLC39A1ENSG00000143570
JTBENSG00000143543
RAB13ENSG00000143545
RPS27ENSG00000177954
TPM3ENSG00000143549
UBAP2LENSG00000143569
C1orf43ENSG00000143612
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:153531982-153531993AATTTAATTAA+6.32
LMX1BMA0703.2chr1:153531985-153531996TTAATTAAAAT-6.62
Lhx3MA0135.1chr1:153531973-153531986AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr1:153531974-153531987AATTAATTAATTT-6.92
MEOX2MA0706.1chr1:153532985-153532995GTTAATTACT-6.02
PHOX2AMA0713.1chr1:153531981-153531992TAATTTAATTA+6.62
POU6F1MA0628.1chr1:153531975-153531985ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:153531975-153531985ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr1:153531981-153531992TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr1:153531981-153531992TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr1:153531981-153531992TAATTTAATTA+6.62
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
SE_68094chr1:153505033-153542157TC32
Enhancer Sequence
ACCAAGGCAG GTGGGACCCT TGAGTCCAGG AATTTGAGAC CAGCCTGGGC AACATGGTGA 60
AACACTGTCT CTACAAAAAA TGCAAAAATT AACCAGGTAT GGTGGCGTGT ACCTGTAGTC 120
CCAGCCACTT GGGAGGCTGA GGCAGGAGAA TTGCTTGACC CTGGGAGGTG GAGGCTGCAG 180
TGAGCCATTA TTGCACCACT GCACCCGGGC CTGGGTGACA GAATGAAACC CTGTCTCAAA 240
AATAAATTAA TTAATTTAAT TAAAATTAAA ATTAATAAAT CTTAAGCCTA CCAGCTTCCA 300
CGTAGGCCTC ATGCAATGCT CACTTTGGGA TTTGTCCTCT CAGGACCCTA CTGCCATGCT 360
CTAAGAAGCT CAAGCCACAT CGAGAGGCCA TGGTAAGCAC TCCGGCTGGC AGTTCTAGCT 420
GAGGTCCCAG CTCACATTCG ATATCAGTTG CCACGCATGT TAAGCAAGCT ACCGTAGAAG 480
TTGAGTTTGT TCAAACATTC AGATTACTCT AGCTCCGATT TCCACCTACA TGGAAGACCC 540
CACGTGAGAA CCATCAACTA AACCCAGTCT ACCTGCAGAA CCATAAGAGA TAATAAATTT 600
TTGCTCTCGG CCGGGCATGA TGGCTCACAT CTGTAATCCC AGCACTTTAG AACCCGAGGC 660
GGGCAGATCA CCTGAGGTTA GGAGTTCAAG ACCAGCCTGA CCAGCATGGA GAAACCCGTC 720
TCTACTAAAA ATACAAAATT AGCTGGGCGT AGTGGCACAT GCCTGTAATC CCAGCTACTC 780
AGGAGGCTGA GATAGGAGAA TCACTTGAAC CCGGGAGGCG GAAGTTGCAG TGAGCAGAGA 840
TTATGATGCC ACTTCACTCC AGCCTGGGCA ACAGAGCGAG ACCCTGTCTC AAAAAAAAAA 900
GAATGTACAA TATAATATAG AATGTGTTGT ATAGAATACA ATACACTTGT TTTCTGAAAA 960
CAGGTGTACT GCCTGTCTTG GTCCATTTTG TATTGCTACA ACAGAATACC ACAGACTGGT 1020
ATTCAAAACA AAACAGATAT TTATTGGCTC ACCATTCTGG AGGCCAGGAA GTCTAAGCTG 1080
GAGGGGGTAA CACCTGGAGA AGGCCTTCTT GCTGCATCAT CTCCTGGTGG AAGAGCAAAG 1140
AGAGGGAGAG AAATAAAAGG TGGGGGGACA AATTCATCCT TCTATAAGGA ACCCGCTCCT 1200
GTGATAACAG CACGAATCCA TTCATTACAG CAGAGCCCTC ATGGCCTAAT CACCTGTTAA 1260
TTACTATTGC TTTGGAGATA AAGTTTCCAA CACATGAACT TTGGGGAACA CATTCAAACC 1320
ACAGCACTGC CTATGGCCTG TATTCTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTGAGACAC 1380
AGTCTTGCTC TGTTGCCCAG GCTGGAGTCC AGTGGCCCAA TCTCAGCTCA CTATAACCTC 1440
CATCTCCCAG GTTCAAGCAA TTCTCCAGCG TCAGCCTCCC GAGTAGCTGG GAATACAGGC 1500
ATGTACCACC ACACCCAGCT AAATTTTTTG TATTTTTTGG TAGAGACGGG GTTTCACCAT 1560
GTTGACCAGG CTGGTCTCGA ACTCCTGGCC TCAAGGGATC TGCCTGCCTT GGCCTCCCAA 1620
CGTGCTGGAA TTACAGGTGT GAGCCACCGT GCTCGGTCTA ACAAGGAATC TTTTAAATAA 1680
AGCTTTGCGG GGTCGATTAG ACTAATTCAT ATCTCTTGAG TAGATCCTGG TACAACTCAT 1740
TACTTGCAGT ATTGAATGTT AAGGTCTGTC CTTTATTCTG AAATTATACC TTTCCTCCTT 1800
TATTGGAATT GAAATTTTAT CTTTTTATGA AATGATAGTG ATGGTGGATG 1850