EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-01897 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:144926090-144930580 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:144930019-144930030CTAATTAATAT-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:144928098-144928116GGAAAGAAGGAAAGAAAA+6.33
IRF1MA0050.2chr1:144929296-144929317AAAGAAAAAGCAAAAGAAAAG-6.15
NFIL3MA0025.1chr1:144929113-144929124TTATGTAACGT+6.32
RFX2MA0600.2chr1:144929714-144929730TGTTGCTATAGAAACA+6.13
RFX2MA0600.2chr1:144929714-144929730TGTTGCTATAGAAACA-6.1
RFX5MA0510.2chr1:144929714-144929730TGTTGCTATAGAAACA-6.15
RFX5MA0510.2chr1:144929714-144929730TGTTGCTATAGAAACA+6.16
Number of super-enhancer constituents: 24             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00089chr1:144920722-144935091Adipose_Nuclei
SE_02777chr1:144927291-144928120Astrocytes
SE_02777chr1:144928561-144933593Astrocytes
SE_03153chr1:144927381-144928053Brain_Angular_Gyrus
SE_03153chr1:144929095-144933474Brain_Angular_Gyrus
SE_04539chr1:144925659-144934489Brain_Anterior_Caudate
SE_07393chr1:144926819-144933846Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07793chr1:144927003-144934899Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_18717chr1:144921453-144938014CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_25738chr1:144924693-144933482DND41
SE_26266chr1:144920766-144933796Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27974chr1:144920641-144928497Fetal_Intestine
SE_27974chr1:144929716-144933812Fetal_Intestine
SE_28939chr1:144920546-144928637Fetal_Intestine_Large
SE_28939chr1:144929130-144933757Fetal_Intestine_Large
SE_38811chr1:144927061-144933285HUVEC
SE_45013chr1:144926640-144933471NHLF
SE_45547chr1:144921475-144934798Osteoblasts
SE_51073chr1:144925786-144934585Skeletal_Muscle
SE_55722chr1:144923321-144933760u87
SE_63039chr1:144924738-144942083Tonsil
SE_63706chr1:144927180-144928854HSMM
SE_63706chr1:144929163-144933352HSMM
SE_64855chr1:144928560-144933682NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1144927217144927550
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I120551chr1144925161144933968
Enhancer Sequence
ACAGAAGTTT TGAAAAGATC ATGCTGTGGT GAATGAATTA TTGGGGAGCA CCAAGAGAAG 60
CAGAGAGACC AGGTAGGAGG CTGCTGCGGT AGTGCAGGTG AAAGACAATA GTAGCTTGGA 120
TCCTGGTGGT TAGTAAAGGG AGGGGGAAAT AAATGGATAG ATATGGATAT GTTTTGAAAG 180
TATAGCTAAC AGGACTTGCT GGTGGACTGG ATAGAGGGAG AGGGAAAAAA GCAGCAAGGA 240
TAATGACTTC TGGAAAAATT ATTTGAGATA TTTGTTGTTG TGGGTATAAC AGGAAGCCTT 300
CACCTGAGGC AATATGAACT ATGTCACACC ATGGGCAAAG TAACCACATT AATAGATGTT 360
TACAATGATT CTAACTAATA AATAAATTCA TCATTTACTT AATGATAAAA CCATCTCTAT 420
AAAATTTGGC TTCTTACTTC TTCAGCGTAA AACAACAGTA ACACCTACAG TAAGATACTT 480
TGAAATTCAA ACTACAACAG GCAGAATTAA AGAAAATAGC TTCAAGTTTA AAATGGCAAG 540
GAAGGTGGTC ATATTTATTT ACTTTAAACC AAACAATCTT ACAGTGGTGA AGGAAACTTT 600
ATAAACTAAC CATCTGATCC AATCCTATTT TACATACAAG GAAATGGAAA CTTAGAGAAG 660
TAATTAGTCC AAGGTTTCAT GGGAAATCAG GAAAAAGATC CAATTAAACT GAACTGGATT 720
TCCACTCAGG TTGGGAATGT ATCTCTCATT TCTATAAACC CATTGCCTAC CATAATGCCG 780
GGAATACTGC AGAGATCAAA AGTTTTTGTT TAATGAACAA ATAAGAACAA TAAAAACAAA 840
CAAAAACGAG CCTTTAGTGG CTCTCTTAGA AATAAGACTG TATATAACAT ATATTCGAAC 900
AGCAACTTTA AAGCCAAAGA ATGCCACAGG AAAATACATA ATGTATTTGA ATCTCATATG 960
AATCAATCTT GACATGAATA ATAATAAGAA ACCTCTTTTT CTATAAATAA TGTACTGACC 1020
TAAAAGTTGG AAGATATTTG TTTCTTCTTT ATTTGTAATA ATTTACTATT TTGCATCTCA 1080
GAAAAATGTC CTTGCAGGTA ACAGTCTGCT GAAAGAGCAC TTAGCAAGTC CCACTAAGCC 1140
AACAACATAA TGAATTCTTG TGAAGTATCA AGTACATAAA ACAGTCACTC CTACAATGAT 1200
AGTGTAGCCC ATGAAATAAG TAATACCTGA TTTGGTAGAA TCAGTGTTAC TCTCTAGACA 1260
CTCAGGTACT AAAATCATGT GGAAATGATA ATATAATTTT AAATTAAGTC ACTTTTGACT 1320
CAGAATTAGG ACAAAGGCTT TCCAGTATCA GAAAAGAGAA CCGCTTCCAG GCCTAGTGTT 1380
GCACAATATG AGACTTTTTT TTAGGCTAAG GCCAGTTTTT AGACTTTTTG TGTTAACAGC 1440
AGTTTTCTTG GCACTTTCTA GTCCTCACAG TAGTGAGTTA TAGATCTCAA ACTGCTATAA 1500
TTGTCAACCC TATTGTTAAT AATAGGAGAC AGACAAGAAC CATTGACTAC CATAAAATTA 1560
AAGGCCTAAT CTTTTACCAG CATCTAATGC CAACATCTTC CAAAGGGCCT GATCCACTTC 1620
ACATAACTAA AATAAGAGTG GGATAAATTT ACCATAGTCA CAAAGGAGCA GACCTTGGCA 1680
TTGCAAGGTT TAAGGCAAAG ATCTTCTGTT CTTTGAATTT AGATAGAAAG GGAAATTGCA 1740
CATGGGCCAG AGCTCATTGC TGTTTACTAA GGGACCACAT CCCTCCCATC ATAGCTTTTC 1800
TAGTTCAGGG CCAGACAATA AAGAAGGGAA TTACCAGCTA GAAGAAGGCT TCAAACCTTT 1860
CTTTAGATAT CTGAACAGCC TTAGGTCCTC ATACATAAAT TCTGTAGAAG GGAAATAAAT 1920
TACTTTGTAT AATATCAGAA TATCAGTAAG CAGAACTACA CTGTTGCTAT TTTTCTTTAA 1980
TAAATAAGAA AGGAACAAAG AAAAAGACGG AAAGAAGGAA AGAAAAAAAA GAGGAAAAGC 2040
AATCAGGAGG AATCCTGATG TCAATATTTA ATAGTGCATA AAATATGGTA AGTGGAGGAT 2100
TAAACAAAGG AATCAAAATA ACCTTACAGA ACAATCTTGC TCTTTAAGAT AAAAGGTTTT 2160
CTCCATATTT GTGGCAGAAC TGAACTAAAG GAAACATTTT TTTCTTTCAT GGTTTCGTGT 2220
TTCTACAAAC TAAAAAAGAG AACTACCAAA AAAAATTATA TTATTTCTAT TCTTTCCATA 2280
TTTGTTCAGA GAAATAGACA AAAACCAGTC TGCCATTGTC CCATCTAGCA CTGGTTTTGT 2340
CATAAGGCTC TTAAGGAGCT TAAAAGTAAC CAGATTTAAA CAATAGATAC ACCGCCCATT 2400
TTATTTACAA ACATGTTGGG CCCAATTCAT CTATTTTCCC TGACATCCTA AATTATTAGA 2460
GAAAATGGCA TAATAATTAA ATGCCACATT TCTTGAAGCT GAATGACATT TTCTCCCACC 2520
TCCTAATTTT TGTTTTTCTA GAAACAGTAA ACAATGTAAG TCAAGTCACA GCAGAAAGGT 2580
CATACACTAC CATCTTAAAG CTCTAATGTC CAAATTTAGT GAAGTAAAGG GACTTGACCT 2640
GAAGATACAG TTACCATAGT TTATATGTGT TCATTCAGAT GACAATTTTT TTCACATAAT 2700
CTCTAAAGAA TCCTCCGAGC ATCCTTAGGT TAGAGAAAGA GGGCTCCTGG TTTAAAATAA 2760
GTACTTACTT AAATTAATAT ACTTCAGACA ATGGGGTTTA ATGTATAGAA TTAAAGTGTC 2820
TTGCCTGAGA ATGGTCAGAA ATCTTTGTCT CTGCATGGGC TACGTTAGTT AAACAAGGAA 2880
CTTTCCATAT CTCCAAATTG AGAGACTGCC TGAAGATGAT CTTTAAAATC CTTCTCCACT 2940
CCAAAATCCA GTCACCAAAA TATAGTATTT TATTTAAATA CGGAGAAAAA AAGATCTTGT 3000
TTTGGCTGTT ATTTTCTCAG TCTTTATGTA ACGTTCTACA ATATTGGTCA TATTTGGTGG 3060
CGGGCTGGGG GGACGAGTTT ATTTCCCATC CATCCTGGCC CAACTAATTT TAGACCCTAA 3120
TATGAAAACA CCATGTTTAA TTTGTAACAC CTATGTCTAG TCACAGAAAT ACTGTAAAGC 3180
CCAAATTTAG CTGCGAGGCT CCACTGAAAG AAAAAGCAAA AGAAAAGAAG TACACAGTGT 3240
TAAGCATACA GTGCTTAACA TTTTATACAA AATGAAAATG CACTGACTTT TTACCTTTCA 3300
TGACACTTTC ATCTATGCTG TTTCTCATCT ATGCTGCTTC TCATAATTTT GTGTAAATTT 3360
AAAAACTTTT CTCCTGTTTT CTGCTTAGGT TCTTATTGTG ATAGACAGTA TACATACCAT 3420
AGAACTACTT TCCAAAAATT TCAAGTGGCC ATCAACAATG TCACTTATCA AGCTCTAAAT 3480
TTCTGGAATG ACGTTGACCA GTAGCAGGCT TTCTAAAAAA TGCCTTCTAG ATCACATCTA 3540
CCTTTGTGAC AGTATTGTTA AATAAGTTGT ATCAAGTGGA ACATGCCAGA ATGTTTCACA 3600
AAGTTTATTG AAGCTAGCAT TTACTGTTGC TATAGAAACA AACTACCATA GTTGAATTTA 3660
AAAGGTTGGT ACAGAATCAA TTGGGCAGAC ACGAATAGCT CAAATTAAGC AATTAAGAAT 3720
TCAAGACTAT AATGAATGAA ACTCTCCTCT GATCCAATAA TGGGTTAATC CTTTCTTAAT 3780
ATCAAATATC TTCCAGTAGA ACTCAGTAGA GTTCTGGCTG TGAACAGTTT ATGCCTTAAT 3840
CTTTTGACTG ACAATACTGT ACTTGAATAC TTGAATTCCT GTCTCTTTTA TGAATGAGTC 3900
ATCACTAATC CTCAAATGAA CTATTAATTC TAATTAATAT GGTCCAGATG TTATAATACT 3960
TTACTGGTGG ATTAATAGGC TTTCCCCAAA CCTTTTACCT TATGCTCTAA TCATTTACAG 4020
GCATTTTGCG GATGAAGGCT TTAATGCTCC AGGAAGAACT AACTAGAGAA CTAACTGCCT 4080
TACAGAAAAC CATTGGGAGG AAACGTCTAT AAATCTGAAA ACAAGAACAA ATTTTAAAAG 4140
TTGGAAAAAA AAAAGAGGTA AGAGGAAAAG TTCTAGTGCC AGAAATGAGA TTAAATGTCT 4200
TCTTTTTATA GGAAAAAAGT GAAGTAGGAA TCTTTACCTT TTTGTTTTAA AAGGTATACA 4260
ATTTTGATAA TGGGAAAGTC AACAGATTTT ACAAAAAGGA TTGTGAAAAT CAAATTATCT 4320
GAGTGCAAAT CACGTTTACT AAATGAGACA GAGCAAAAGG TGCAGCAAAA ATGGGGTCAT 4380
GACTAATTTT CTCAAGTCCA GAATATTTCT AACCTCCACC TAGACCGAAA TCACGTGAAG 4440
CCAGAGGCCA GCTAGCTATA ATCAGAAAGG CACTATGTAG CCGTTTTGTA 4490