EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-01167 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:54751780-54754040 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:54753246-54753264GGAAGGAGGGAGGGAGGG+7.12
ZNF263MA0528.1chr1:54753243-54753264TGGGGAAGGAGGGAGGGAGGG+6.23
ZNF263MA0528.1chr1:54753247-54753268GAAGGAGGGAGGGAGGGATGC+6.37
ZNF263MA0528.1chr1:54753244-54753265GGGGAAGGAGGGAGGGAGGGA+6.61
Number of super-enhancer constituents: 30             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01019chr1:54752247-54754319Adrenal_Gland
SE_01595chr1:54751203-54759655Aorta
SE_03451chr1:54752074-54754199Brain_Angular_Gyrus
SE_04187chr1:54751873-54754162Brain_Anterior_Caudate
SE_04901chr1:54751170-54754425Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05919chr1:54750929-54759710Brain_Hippocampus_Middle
SE_07802chr1:54751293-54754608Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08904chr1:54752439-54752817Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08904chr1:54752873-54753200Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08904chr1:54753284-54753585Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08904chr1:54753701-54753990Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_24580chr1:54752076-54754303Colon_Crypt_2
SE_25961chr1:54751204-54754577Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26701chr1:54751969-54754451Esophagus
SE_28122chr1:54751720-54754452Fetal_Intestine
SE_29698chr1:54751486-54754587Fetal_Muscle
SE_31383chr1:54751291-54754337Gastric
SE_33414chr1:54751466-54754498H2171
SE_41585chr1:54752012-54752806LNCaP
SE_41585chr1:54752835-54753501LNCaP
SE_42582chr1:54751871-54754530Lung
SE_46626chr1:54752006-54752816Ovary
SE_46626chr1:54752831-54754462Ovary
SE_47967chr1:54752871-54753560Pancreas
SE_47967chr1:54753564-54753881Pancreas
SE_50141chr1:54750323-54754516Sigmoid_Colon
SE_52383chr1:54751201-54754495Small_Intestine
SE_54182chr1:54751464-54754325Spleen
SE_65414chr1:54751886-54754405Pancreatic_islets
SE_68686chr1:54751900-54754312H9
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I054284chr15475047454757956
Enhancer Sequence
TTTTGTGATC AAAGATTAAA CACTACCGAG AGACCTGTTA TCTGAGCCCA CAGATAACAG 60
TGGGTGACAT TGGGTTCTAA CCGCCCAGGC CTTCCTTCCT CACCAATGCT TATCCACTTT 120
TTGGACTCAA GAAAGCCAAC TCAAACCACC CATGCAGTTT GGTAACATGC ACTTTAAAAA 180
ACAACAACAA AAACAACAAA TAAAGCTAAT TTAAAATTCT TTTCTAAACA GCAAACAGGC 240
CTTAAACAGG GTGATGAGGC CCATTCCAGC CAGGTGCCTC CTCTAAACCT ACAGTCAACT 300
TGAAAAGCCC GAAGTGCTTT CCCAGAGCAC TGCCTGAAGT TTGCCGTTCA CAGCCAGGGA 360
GACTTGTGAA GAGGACTGAT CCCACAGCTC CATCTCTAAA GAGCAGGGTT TCTTGATGAT 420
CCCAGGATGG GTACACAGCC ATGGGGCTCA GGGACTACCC CTGCCTCTGC CCTATCCATG 480
CTCCAACGGG ACAGACACAT GCCACTGCAA CCAGAGATCC TCAGCAATCC CACTCCGTAA 540
GGACACCTGA AAACCTCACC ACCAGTCCCA CCCTAGGAGA TGGATATTCC CCCTCTAACC 600
TCCAGGGTGG AGAAGCAGGG TTCAAACAGG GGGCCTCAGA GCGGTGCTTC CAAGAGAAAG 660
CGCCTTGGAA GCCAGGCTAA GGAATGGAAC TTTCTGCTCT GGGCAATGGC GGAGCGGGGG 720
GACATCTACT GCCCCACCTC ACCCTGTGCC GGGCATAGGG ACCTTTCATG CTCACTCAAC 780
AAATCCCAAT ACCACCAGAG TACCCCAAAT TCCAGGAGCA AGTGGACTTG ACGAGTCCCC 840
ACATTCCCAG AGGCCTCTCA TCCCACCCTG AGAGAGAAGC ATCTCAGAGT AGGCAACAGT 900
GTTGATGCTT TTCCTTCAAG AAGCAATGGT CCAGGGGCAT TCCCTGCAAG ATACTATCTT 960
CTGGCCTCAT TTCAAGAACC CCAGCTATCC TCACTCACAA ACTAGCCTGA GACCCCCGCT 1020
CCAACCCTCT CTTTAAAATT AGTTCTAGGC ACAGGAAGCT CCTGGAAAAC TGAATAAAAA 1080
CAAATGCTCA GAGGGAAATG TGGGACTCCT GCCAGGTCGG CCAACCCCTC CTGACTGATT 1140
TACAAGGCTG CAAAATGGTA CTTTGTTCTG CAAATCCCCT CCCCTCCTTG CCCCGCCCTA 1200
ATACTCAGGC CTTGGCGTGC AGCAGCTTGG GGGCCACATG CAGAACCGCA TGTGCAGACG 1260
ACTTCCTTGA CTGAAACTCA ACACAGGCTG CGTGGCCCAG GGCCCAAAAC ACCAGGGGGT 1320
GGGAGGTGTG TGCTGAGGGT GGAGCCATGT GCTCAAAGCT GGGAAATGGA GGTCACTCAA 1380
GGGAGCTTGG GGCACTCCTG TGATGACTAC ATACAGAGGG CAAGTGAGAC AGGAAGCCTC 1440
CAAGTGACGC CTGTCTGGTG GCCTGGGGAA GGAGGGAGGG AGGGATGCTG GCACTGGTTT 1500
CAGCAAGACA GGGGCTTCTG TGCAAACTAT GGAGTAACCC GGGTCCCTCT GGGGCCAGGT 1560
TTCCCAGAGG GAATTTCAGC AGCAACAACA AACTAAAGAT ATAAATCAGG AATGGAAGCG 1620
ACCGGGGGAA TGTCATCACC CAGATGGAAA GGCCAAGACA GACAGAACTG GGGTTCAAAG 1680
AAGGGAAGGG GACAGGAAGA GGATTCCTGG TTTCATATGC AGACCACAGA ACAGAATCAG 1740
TTTTGGAGAA CAGGGGCTCT AATTGTGCAG TTTAGAGAAA ACAGAGCTGT TGCTACGTGA 1800
AGAGGCAGAA CCAGCTGACG TTAAAAATAG GTTTGGATGA CACACAGGAG TGACACAAGA 1860
TCCCTGCCTT CAAATAGTCA GGGGGCCATC GTGTGGGAGG AGGGATGGAT GTGTCTCCCG 1920
GCACCAATGG ACGGCCCTGG GTCCAACAGT AGATGCCCCA AGCTACAAAA AGCTTCTTGG 1980
CTGCCTCAGA AGGGGGCGGG CTGTGATAAT TTGGGGTCGC TCCCAGCGGA GACATGGCAC 2040
AAACCATATT AAAAAAGGAT TGCCATAGGA CCCACCACCG CCTGGGCCTG GGGATTATTA 2100
AGACAAAAGA GTCCTGCACT GAGGGTCCCA GGATCAGGAT TCCAGCTCTG GCGGCAAACC 2160
ACCTACTGTG TGATCTGATC AGGCCTTCCT GCCCCGGGCC CTGGACTCCA CACAAGGCAG 2220
CTGATGTCCT GCTGCTCCAG TGACACTGTG GATGTCCAAG 2260