EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS128-02143 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF-7 
Coordinate
chr1:235130410-235135420 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr1:235131113-235131125AGGTAAACAGAA+6.14
Gata1MA0035.3chr1:235135082-235135093TCCTTATCTGT+6.14
HOXA13MA0650.2chr1:235133786-235133797GCCAATAAAAC+6.14
MEF2CMA0497.1chr1:235134602-235134617TTCTATTTTTGTTTT-6.05
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:235134839-235134854TGAACTCCTGACCTC-6.22
RREB1MA0073.1chr1:235133853-235133873GGTTTGTGTATGTTTTGGGG-6.25
ZNF263MA0528.1chr1:235133557-235133578CCCTCTTCCTCTTCCTCCTGC-6.33
ZNF263MA0528.1chr1:235133560-235133581TCTTCCTCTTCCTCCTGCACA-6.3
ZNF263MA0528.1chr1:235133548-235133569CCTTCTCCCCCCTCTTCCTCT-7.21
ZNF263MA0528.1chr1:235133551-235133572TCTCCCCCCTCTTCCTCTTCC-7.53
ZNF263MA0528.1chr1:235133554-235133575CCCCCCTCTTCCTCTTCCTCC-8.78
Number of super-enhancer constituents: 67             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00182chr1:235132070-235134749Adipose_Nuclei
SE_00983chr1:235132696-235134085Adrenal_Gland
SE_01666chr1:235129484-235131123Aorta
SE_01666chr1:235132634-235134729Aorta
SE_02305chr1:235132393-235134804Astrocytes
SE_03114chr1:235132692-235133313Bladder
SE_03114chr1:235133318-235134312Bladder
SE_03567chr1:235132569-235134234Brain_Angular_Gyrus
SE_04136chr1:235130012-235131231Brain_Anterior_Caudate
SE_04136chr1:235131991-235134794Brain_Anterior_Caudate
SE_05487chr1:235129532-235131103Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05487chr1:235131945-235134879Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06052chr1:235129346-235131366Brain_Hippocampus_Middle
SE_06052chr1:235131994-235135218Brain_Hippocampus_Middle
SE_07547chr1:235132318-235134577Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08384chr1:235129603-235131222Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08384chr1:235131992-235134807Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08945chr1:235133383-235133960Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08945chr1:235133978-235134494Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_13412chr1:235129943-235131209CD34_Primary_RO01536
SE_23314chr1:235132636-235134674Colon_Crypt_1
SE_23955chr1:235132758-235134628Colon_Crypt_2
SE_25800chr1:235131954-235135918Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26806chr1:235132586-235135865Esophagus
SE_27663chr1:235132550-235134785Fetal_Intestine
SE_28576chr1:235132675-235135014Fetal_Intestine_Large
SE_29689chr1:235132364-235135490Fetal_Muscle
SE_31235chr1:235132616-235134790Fetal_Thymus
SE_31572chr1:235132590-235134615Gastric
SE_33758chr1:235132042-235135404HCC1954
SE_34767chr1:235132208-235135879HeLa
SE_36058chr1:235132085-235135381HMEC
SE_36952chr1:235131940-235135413HSMMtube
SE_37966chr1:235131769-235135434HUVEC
SE_38924chr1:235132552-235134482IMR90
SE_40653chr1:235132048-235135276Left_Ventricle
SE_41640chr1:235132784-235134356LNCaP
SE_42265chr1:235132024-235135164Lung
SE_43462chr1:235132049-235134492MCF-7
SE_44202chr1:235131946-235134698NHDF-Ad
SE_44805chr1:235132348-235134259NHLF
SE_45558chr1:235131834-235134721Osteoblasts
SE_47080chr1:235132746-235134159Ovary
SE_47119chr1:235129550-235131246Panc1
SE_47119chr1:235131948-235136095Panc1
SE_47599chr1:235133217-235133781Pancreas
SE_48462chr1:235132051-235135851Psoas_Muscle
SE_48697chr1:235132019-235132614Right_Atrium
SE_48697chr1:235132641-235134789Right_Atrium
SE_50071chr1:235132556-235135612Sigmoid_Colon
SE_51271chr1:235131986-235135676Skeletal_Muscle
SE_51773chr1:235132105-235134716Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52352chr1:235132074-235135269Small_Intestine
SE_53330chr1:235132665-235134459Spleen
SE_54553chr1:235131986-235137396Stomach_Smooth_Muscle
SE_56068chr1:235132114-235134614u87
SE_56760chr1:235129522-235131076VACO_400
SE_56760chr1:235132046-235134273VACO_400
SE_57395chr1:235132616-235133199VACO_503
SE_57395chr1:235133223-235134688VACO_503
SE_58041chr1:235132784-235134331VACO_9m
SE_60969chr1:235059965-235155853HBL1
SE_62329chr1:235047040-235185428Tonsil
SE_63542chr1:235132039-235134797HSMM
SE_65393chr1:235130322-235131295Pancreatic_islets
SE_65393chr1:235132279-235136205Pancreatic_islets
SE_67736chr1:235132114-235134614u87
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I234993chr1235129347235131366
GH01I234996chr1235132070235136616
Enhancer Sequence
CTCTCTTTAT TTTATTTCTT GCCAATTCAT GCCCTGCCTT CCCTCCAGAA CTCAACCCTG 60
AACCTTCTCC CACCGGCACA ACCGTCTGTA ACCAGCCCCT GCTAACTCCT CAGAACGAGT 120
GGATGCCGGA GAATGTTGAC TTCCTCCCAA GAAGAAAGTG AAGGAAGCAG AAACCTCCTG 180
TCAGCCAGAT CCCACCAGGA CCCCTTCCCA CAGACCCACT TGATGCTGCC TCTCACGGCA 240
GCAGGGGAAT GCTTGGTGGG GGTGGCTCTG CTTCTCATAG CAAAGAGAGA ATTCTTGGAG 300
GGCAGAGGCT GTCCTCAATA TATTTTCCAC CTGGTCCCCA CCCTCTAACC GGTGTTCTGT 360
TAGAAATGCG TGCACCACAC ATGTCTCTCA GAGGCCAGGC GGGCTTCAGG GCTACCAGGG 420
CACCTGGATG GGCTCCACCC CATGCCCAGA ACCTCAAGAG CTCTCTGTCC TGGAGGGAGT 480
CCACTTCCTC CGAACTTCCC AGGAAGCCAT CCAGCCCACT GACATCCATC AAAAACAAGC 540
TCCCTGGGCA GGCTGTGCTT GGAGGAAGGA TCCTCTAATG TAGCATCATC CCTATGGGGG 600
AGACCTGAAG CAGACTGTTT TCAAAGTAGT TTTTCTATCA AGGCCTGGGC AAAATGCATT 660
CATTAGAAAA ATCAGAGGTG GAAGGAAGCT CATGAACTCA TCAAGGTAAA CAGAATCTGC 720
AGTTGGTTTA CAATCGTCTC TCTGATATCC CAGGAAAAAT ATATCTTACA GTTTATCTTA 780
GGGATGCCAT CAGAGAAAGG TATATATGTA TAGGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 840
TGTATGTGTG TGTGTGTGTA TATATATATG CATATATATG TGTATATATG TGCATATATA 900
TGTGTGTATA TATAGGTATA TATGTGAATA TATAGGTATA TATGTATATA TAGATATATA 960
TGTGTATATA TGTATATATA GATATATATG TATATATGTA TATATAGATA TATATGTATA 1020
TATGTATATA TAGATATATA TGTATATATG TATATATAGA TATATATGTA TATATGTATA 1080
TATAGGTATA TATGTATATA TAGATATATA TGTATATATA TGTATATATA GGTATATATG 1140
TATATATAGG TATATATGTA TATATAGAGA TATATGTATA TATAGGTATA TATGTATATA 1200
TAGAGATATA TGTATATATA GGTATATATG TATATATAGA GATATATGTA TATATAGGTA 1260
TATATGTATA TATAGAGATA TATGTATATA TAGGTATATA TGTATATATA GAGATATATG 1320
TATATATAGG TATATGTATA TATAGGTATA CGTGTATATA TAGGTATATG TGTATATATA 1380
GGTATATGTG TATATATAGG TATATGTGTA TATATAGGTA TATGTGTATA TATAGGTATA 1440
TATGTGTATA TATAGGTATA TGGGTATATA TAGGTATATA TATGTGTATA TAGGTATATG 1500
GGTATATATA GGTATATATA TATGTATATA TGTATATATA TACGCACACA CATAGATATA 1560
CACCATATAT CTGTGTATTA ATCCTGTTTA TATATAAATC ATATATATGT ATATACTATG 1620
TGTGTATGTA TACATATGCA TATATACAAA TATACACCTG CTCATATACA TATACACGCA 1680
AAGGCATATT TATGTGCTGT TTTTTTGTTT TGTGTTGTTT TGAGACGGAG TCTTGCTTTA 1740
TCGCCCAGGC TGGAGTGCAA TGGCGCCATC TCGGCTCAGT TTTTAATAGC AAAACATTGG 1800
AAACTTCTTA AATGCCCATC AGTAGGTGAC AGTTTAAATC ACAGGTCTGC AAGTGGGCCA 1860
GTGGGCCAAA ACCCAGTCTA GGACCTATTT TGTGAATAAA GTTTTATTGG AACATAGCCA 1920
CACCTGGTCA TTTACGTCTT TGACCAATTT GGAGCTACAA TAACAGAGTT GAGTGTTTGC 1980
AGCAATGACC ATCTGACCCA CAAAACCAAA AATATTTACT ATCTGGCCAT TTACAGGAAA 2040
AGTTTGTCGA CGCCTAGGTT AAATTATGCT TCCTCTAAAT GAAGCTATTA AACGATCCTG 2100
TAAGTCTGTA ATTATGGCTA CGAAAAGCCC ATGATCTCTT AAAAAGTAAG AAAATTAGTT 2160
GGAAAATGTT AACACAATCC CATTTTTATC AAAGCAAAAT GTATTCACCT GAACGTGCAT 2220
ACAAAAATGT GCATTGAAAA CTATGTATCT TTCCTCTAGA AAGTTATGGG AGAAGGAAGA 2280
TAATAGACGG TGTTTTTTCT TCCTTATATT TTCTTTTTGT GTTTGATTTT TAAATAATGA 2340
GTACACCTTA AAGTTCTTTT TATTGGGAGA AACAGTTGCT CACTTCCTCC ACTCCCTAAT 2400
AGCTGGTGAA AGGTGTCAGC TTTAGGAAGG GCTGTGTCAG GGAAATATCT TGGCTTCTGG 2460
GGTGTTGGGG CAACAAAGGG CCAGGAAAGA CAGCCCCTCA GAGGAACAGA CCCCAGTGAC 2520
ATCCTTGGGT GGGCCCCCGC CTGAGCAGCA ACTTCTTCCA GCTCTGTCTC CCACTACAGC 2580
CTCTGCCCTT GGCATGGTCC AGAGCTGCGA TGGCGAAAAC TCATCACCAA GCATTGCCTC 2640
CGCTGCACCC AACCCAGCAG AAAAAGAGTC CAGAGAACAT CCTGGTCCTG AGTCAGCCCC 2700
TGGCTTCAAC CCACAGGACA CCACAGGGCG CCACGGGACA TGGCACAGCG CCAGATGCCA 2760
GGGATCCGAG GAGACAGAGC ATGATGTCCA AACATGAATG GCTTATTTTT AGCAAAGTCC 2820
AGCCCTCACA TCCTGGCCCT GCTCCAGGGT GAGCAACAAC ATTCCCTCTG ACTCAGCTCC 2880
GCAAGCTGAC TCGGTTTCAG AGGAACAAGG TAGTCTCTCC TTGCTGACGT TAGCGGCAGG 2940
CAGTCCTCCC CTTCAGGAAA AATCTGTACA GCAGTTCTGA TTCCTTCTGG GACTGTGTGC 3000
TGGCTGCTTC CAGAAGAAAC ATAACTATTC CCTTCACAGT CTGGGCTTCG GAACTGGGTG 3060
CAGAAACTTC CACACTCCAT CTCCTGGACT CCCATCTTCT AACCTTCCCG TGTGATTTCC 3120
AAGGAAACCA GATGGCTGCC TTCTCCCCCC TCTTCCTCTT CCTCCTGCAC AATGAGCCGA 3180
GAGACCCAAC CCTGCAGCTC TGGCCTGAAA CTGGGGCCTG TTTCTCGGGG GTTTCTGTCT 3240
CTTCAATCAG TCCCCACACT GTGTCCAGCA GACTAGAGCA ATGAAGGGAG GAATCATTTT 3300
CTTCCAGTAA CGACACTAGA ACCTATGTTC TGCTGTAATG AATGATACAG GTTTGCCAGG 3360
AAGACGTGTC ATCAATGCCA ATAAAACAAG GCAGAGTACA GATACCTCCA GAGATCTTGC 3420
CAGAGAGGCT CACAGCCCCG ATAGGTTTGT GTATGTTTTG GGGTGGGGGA ACATGAGAGA 3480
ATGAGAGATT ATTTTCCTTC TGGACGTTCT CAACATGCCT GAAATAGCAA GGACACAGCT 3540
GTCCCTCCCC AGTTGTCCCT GTGTGATTGG AATTGCAGGA GTCAGTTGTC TCAAAGCAAA 3600
GAAAGTGCAG AGCCTGCACG TATCCAGATC TTCCGAAAGA CGAGGCCCTG TTCTCCTGGC 3660
CTGGCGCCTG GGTTTCTCAT TTGCTCCTAG GTCTCTGGTA TTGTGCCGCC TGCATCCCAG 3720
GCAACGCCAG CAACCCAAGC CCCGCTGAAC AAGTCAAGAC CTCTCTGGAT GAGGTCAGGA 3780
GCTGGAGCTT CCCCTTATTT TGTTAGGAAG CACCATGCGT CAGCCTTTAT TCACACCCTA 3840
TAAAGTTGTA GCCTTTAAGG TTAGTCTCTT CCACACCTAT AATTCTCCAC CAGAGCAATT 3900
TGCTGCAGAG AAAGAGCCCT CCAGCAGGCA GTACCTGTGA GTCACGGCTT CTTCCTGGCC 3960
CCCGCCCGCC CTAAAGGAGT GGCTACTAAC AGGCACCTTT GATCCTCAGG CTGCTCTGGG 4020
AGTTGGAAGA GTCGCGGAGG CTCACCTGTA GTCATAAGGT CAAGAGACTT GCCATGAGAA 4080
ATAGTAACAG TAGCACCGCC TGGATCCCAC CCCCGGTCTT CTCCTTTGGG CCTCTGTTCT 4140
TCCTCTAGGG GTTGGATCTT TCAGCTCTGC CATCTGCCTT TCATATCATC AGTTCTATTT 4200
TTGTTTTGTT TTTGTTTTTG TTTTTGTTTT TGTTTTTGAG ATGAAGTCTT GCTCTTTTGC 4260
CCAGGCTGGA GTGCAGTGGC GTGATCTCGG CTCACTGCAA CCTCTGCCTC CCGGGTTCAA 4320
GCAATTCTCC TGCCTTAGCC TCCCAAGTAG TTGGGACTAC AGGCACCGCC AGGCTAATTT 4380
TTGTATTTTT GGTAGAGATC GGGTTTCACC ATGTTGTCCA GGCTGGTCTT GAACTCCTGA 4440
CCTCAAGTGA TCCACCCGCC TCAGCCTCCC AAAGTGCTGG GGTTACAGGC GTGAGCCACC 4500
ACGCCCAGCT TAGTTCTATT TTTGAGTGAA CAACACTCTC CATTGGCAGG GAAAGGTCAC 4560
CTTGGTATGT GGCCTCGCTT ACGGAGTAGA GTTTCTCCAG GGCCTCTCCC AGGGCTGTTC 4620
AAATGACCCA GCACAACCCT TCAAGTGACT TCCCCTTCTC TAAGACTCAG TTTCCTTATC 4680
TGTCCAATGG TGGAATTGGA GTAAATATTT GCTAAGTTTC CATCCAGCTC TAATGTACTA 4740
AAAATCTATG AAAATCTGGA TTTTCCCATT TCCAGACAAG CCTGGTACTA CTCAACCTTA 4800
ATCTACAGCC ACCAGATGAA ACCCGCTGCA GAGCCAACCC TGACACCAGC ACCATGAGCT 4860
TCAGTTCACA AGCACCATTC TCACTGGAGC CCCACCAGAC CTCGATGATG TGGACAGTGC 4920
CAGTTACGTG GACAGGCTGA GATGGGCGGA TCACTTGACG TCAGGGATTC GAGACCAGCA 4980
TGGCCAACAT GGTGAAACCC TGTCTCTGGA 5010