EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS128-01741 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF-7 
Coordinate
chr1:203280180-203283450 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs17534202chr1203281175hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr1:203283070-203283080TCTAATTAAA+6.02
IRF1MA0050.2chr1:203282860-203282881TCTTTCTTTCTTTTTCTTTTC+6.48
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_10871chr1:203254420-203281750CD20
SE_14427chr1:203280250-203281606CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17312chr1:203272204-203281464CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_30896chr1:203271565-203281822Fetal_Thymus
SE_30896chr1:203282010-203283026Fetal_Thymus
SE_31419chr1:203280136-203281559Gastric
SE_40419chr1:203280224-203281611K562
SE_52362chr1:203280759-203281450Small_Intestine
SE_55095chr1:203280159-203281507Thymus
SE_58291chr1:203236214-203310877Ly1
SE_58901chr1:203236169-203298087Ly3
SE_59628chr1:203236329-203298077Ly4
SE_60396chr1:203236100-203315897DHL6
SE_61013chr1:203236073-203298344HBL1
SE_61446chr1:203236043-203309894Toledo
SE_62225chr1:203236326-203298200Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1203280200203281622
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH01I203311chr1203280261203280530
GH01I203312chr1203280622203281587
GH01I203313chr1203282011203283026
Enhancer Sequence
CCAAAGTGCT GGGATTACAG GTGTGAGCCA CCGCAGCTGG CGGTGACCTG TATTTAAACT 60
AAACTTTACA CATGTTGCTT CATATACAGT GACAACTCCC CCAACTTCAT TTCTTACCTC 120
CATGACCTTT ATCAACAAAC ATACAGTTTT CCCTAGATGT GCTATGTTGG AAGTAGCCCA 180
GGGAGGCTGT GTGTGCTATG CCTGTGTTGA GTGAGGAGGG TAGGGGAGCC AGGGATGGGG 240
TTAGGGAAGG CCAGGTCATC TGTATCATAA ATAGAATTTG GTTAAGACTC ATTGTATCAA 300
GGGGTTGTTA CTGAAAGGAG TAGTCCCATT TTTATTTGTA GCTTCTGAAA TAAATGTCCT 360
AGACACTTGT TTAAAAAGAC CTACTTTTTT GGATGTAAGG ACAGGGTTAG TTAGGGTTGA 420
GGAATTTTTG CCCACCCTCT TTTGAGTGTA TGGTACAAAG TCAGCATCTA TCTTCCTGAT 480
TCCTAAAAGG CCTAGCTCAT GAAGGATATT TCCTTGTTTA GTGGAAAGCC TGAAATTCGG 540
GGAAGGTTGT CTGGAGACTG AGGGGACCCT TCACCCACGT GTGTCTTCAA GTCAGGGAAG 600
CCACAGCATG GCAGATTCAC CTCAGGGCCA CTCTCGGCTG TTGGTAAACT AGTAGTCCCT 660
CAATTTACAT GAGAGGGTTC TGTGGTCAAG CAATGTGTTT TCTTTTTTGA TATGAACCAA 720
TTTCAGTAGA ACTGGAGCAT ACCCATTGGC TACCTGGGGT TACAGGGGCT CTGGCCTGAA 780
ATTGCTTGAA GAGTTGCAGT TGGTGGCTTT CATGTGTTCA GGGACTAGGC ATTGGTTGGT 840
CTGTTCTGCT TCCATCTTCT CCACTTGGTA AGCAGTGCCA GCCTGGGAGA CCTGTGGTCA 900
GTCAGCTGTT TTTGAATGAT AATGCACCTC CCCAGAGAGT GTAGACAAGG CTCTGCATGC 960
TGCAGATTAA GAGCCCATCC TGGATCCTGA TAAGGAGTTC TGGGTGGAGG AGTCCTTGGT 1020
GCTGCAACAA ACAAGTCCCA GGAGGAAGAA ACCCACTTCT GTAGGCCTGA CTCCTGTAAG 1080
GAGCCTTTGG TAAGGAAGGT GAGGACTCAG GTGTCCTGGC TTCCAGGCCA ACACAGCATC 1140
CCTGGCCCAA CAAAGATTGG TGCAACAGAA AGAGTTCTGG ACTGGGAGGA AGAATGTATG 1200
GGTTGTGGTC CTGGTACTTC TTAACTAGCC ATGTGAGTCT GGACAAGCTC CTCAGCTTTT 1260
CTGTCTTAAA AATTAGGGAG TTGGCTGGGT GCAGTGGCTC ATGCCTGTAA TCCCAGCACT 1320
TTGGGAGGCC GAGGCAGATG GATCACTTGA GGCCAAGAGC TCAAGACCAG CCTGGCCAAC 1380
ATGGTGAAAC CCTGTCTCTA CTAAAAATAC AAAAATTAGT CAGGTGTAGT GGTGCGTGCC 1440
TGTAGTCCCA GCTACTTGGG AGGCTGAGGC AACAGAATCA CTTGAACCCG GGAGGCAGAG 1500
GTTGTAGTAG CCGAGATTGA GCCACTGCAC TGTAGCCTGG GCGACAAAGC AAGACTCCGT 1560
CTTAAAAAAC AAAAAAAAAA AACTGGGAAT GGTGGCTCAT GCCTGTAATC TCAGCATTTT 1620
GGGAGGCTGA GGTGGGCGAA TCACGAGGTC AGGAGTTCGA GACCAGCCCG GCCAACATGG 1680
TGAAACCCCG TCTCTACTAA AAATACAAAA AATTAGCTGG GCATAGTGGC GGGTGCATGT 1740
AATCCCAGCT ACTTGAGGCA GGAGAATCAC TTGAACCCGG GAGGCCAAGG TTGCAGTAAG 1800
CCAAGATTGC GCCACTGCAC TCACTCCAGC CCGGGCAACA GAGTGAGACG CCGTTTAAAA 1860
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAT TAGAGTTTTG GATTAAATGA CCTACGTTCT TTTCTTTGGC 1920
TATTTATTTA TTTATTTATT TATTGAGACA AGGTTGCACT CTGTTGCTCA GGCTGTAGTA 1980
TAGTGGTATG ATCACAGCTC ACTGCGGCCT TCATCTCCGA GGCTCAGGTG ATCCCCCTGC 2040
CTCAGCTTCC CAAGTAGCTG GGACTACAGG TGTGAGCCAC CTCTCCTGGC TAATTTTTTG 2100
TTATTTTTTT TAGAGATGGG GTCTTGCTAT GTTGCCTGGG CTGGTCTCAA ACTCCTGGCG 2160
TCAAGTAATC CTCCTGTCTT AGCCTCCCAA ACTGCTGGGA TTACGGTTCT TGCCCAGCCT 2220
TTTTCAGCTT TTGATTCTAA ATCATCCATC CCCATTATAC TGCCAATCAC TGGGGGGGCA 2280
AATTAGCACC ATTATTATCA TTATTTTCAA TTAGTTGAAC TGAAAGGTAA GGTAATTTGG 2340
GCTGAGAAGT ACAGTAATTA ATAATCTTTT GCTTGGGTCA GACTCCTGCC TGTTAAGGTT 2400
TCAGTTTGCA AACACTGTGA AGCAGTACTA CAAAGAGGTT AGGAGCTCAG GCTCTGGTGT 2460
TAGGCTCCCT AGGGAGGTTT AATCTCAGCT CTACCACCCA CCTATCCACT GTGCAACCTG 2520
GTGGCTAGTG ACTTTAGCCA AGCCTCAATT TCCCCCTTTG TAAAATGGAA TGAAGAATAT 2580
AACCAACTTA AAAATGTTGT TACGAAGATT AAATGAGAGC CATAATCTAC TTATAATTGT 2640
CCTGGCACAG GTAAGTACTC GATAAAAAGA GAATACTTGT TCTTTCTTTC TTTTTCTTTT 2700
CTTTTCTTTT TTTTTTTTTT GAAACAGAGT TTCGTTCTTG TTGCTCAGGC TGGAGTGCAG 2760
TGGCATGATC TCTGGTCACT GCAACCTCTG CCACCTCGGT TCAAGAGATT CTCCTGCCTC 2820
ACATGGGCAA GGACTTCATG ACCAAAACAC AAAAAGCAAT GGCAACAAAA ACCAAAATAG 2880
ACAAATGGGA TCTAATTAAA CTAAAGAGCT TCTGCACAGC GAAAGAAACT ACCATCAGAG 2940
TGAACAGGCA ACCTACAGAA TGGGAGAAAA TTTTTGCAAT CTACTCATGT GACAAAGGGC 3000
TAATATCCAG AATCTACAAA GAACTCAAAC AAATTTACAA GAAAAAACCC CATCAAAAAG 3060
TGGGCAAAGG ATATGAACAG ACACGTCTCA AAAGAAGACA TTTATGCAGC CAACAGACAC 3120
ATAAAAAAAT GCTCATTATC ACTGGTCATC AGAGAAATGG AAATCAAAAC CACAATGAGA 3180
TACCATCTCA TGCCAGTTAG AATGGCAATC ATAAAGTCAG GAAACAACAG ATGCTGGAGA 3240
GGATGTGGAG AAATAGGAAT GCTTTTGCAC 3270