EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS128-00276 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF-7 
Coordinate
chr1:21663690-21667960 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr1:21666141-21666152CTAATCCCCTT-6.32
LMX1BMA0703.2chr1:21667338-21667349TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr1:21667335-21667348AAATTAATTAAAT+6.07
Nr2f6MA0677.1chr1:21665975-21665989TGACCTTTGAGCCT-6.37
RxraMA0512.2chr1:21665975-21665989TGACCTTTGAGCCT-6.14
STAT3MA0144.2chr1:21666573-21666584CTTCTGGGAAG+6.14
ZNF263MA0528.1chr1:21664550-21664571CCCCTCTGCCCTCCCTCATCC-6.55
ZNF263MA0528.1chr1:21664532-21664553CCTTCCTTCCCCTTCTGCCCC-6.58
ZNF263MA0528.1chr1:21665441-21665462GGAGGAGGATGGGGAGAGGAG+8.11
Number of super-enhancer constituents: 43             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00105chr1:21656775-21671990Adipose_Nuclei
SE_00854chr1:21663168-21667245Adrenal_Gland
SE_00854chr1:21667352-21672486Adrenal_Gland
SE_01643chr1:21663301-21667219Aorta
SE_01643chr1:21667344-21672121Aorta
SE_02944chr1:21664000-21666080Bladder
SE_02944chr1:21666135-21667266Bladder
SE_02944chr1:21667360-21668291Bladder
SE_04518chr1:21663353-21665909Brain_Anterior_Caudate
SE_05710chr1:21664624-21665800Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05944chr1:21659989-21673592Brain_Hippocampus_Middle
SE_08398chr1:21663323-21665931Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08398chr1:21667381-21673694Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_26127chr1:21663680-21666771Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26127chr1:21667455-21671889Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26770chr1:21663415-21667226Esophagus
SE_26770chr1:21667319-21672743Esophagus
SE_28486chr1:21663392-21666819Fetal_Intestine
SE_28486chr1:21667334-21672947Fetal_Intestine
SE_29337chr1:21663370-21667087Fetal_Intestine_Large
SE_29337chr1:21667313-21673152Fetal_Intestine_Large
SE_31433chr1:21663236-21672659Gastric
SE_39164chr1:21663441-21666942IMR90
SE_39164chr1:21667486-21670213IMR90
SE_42174chr1:21663299-21667069Lung
SE_42174chr1:21667300-21672712Lung
SE_45045chr1:21663454-21666210NHLF
SE_46660chr1:21664031-21667287Ovary
SE_46660chr1:21667360-21668323Ovary
SE_47592chr1:21663572-21665292Pancreas
SE_47592chr1:21665303-21666898Pancreas
SE_47592chr1:21667472-21668246Pancreas
SE_48583chr1:21663300-21667219Right_Atrium
SE_48583chr1:21667258-21672989Right_Atrium
SE_50108chr1:21663357-21673470Sigmoid_Colon
SE_52633chr1:21663378-21667298Small_Intestine
SE_52633chr1:21667302-21672599Small_Intestine
SE_53334chr1:21663536-21666469Spleen
SE_53334chr1:21667327-21672651Spleen
SE_54639chr1:21663094-21674002Stomach_Smooth_Muscle
SE_56171chr1:21663474-21665484u87
SE_65263chr1:21660486-21671744Pancreatic_islets
SE_67931chr1:21663474-21665484u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr12166399121664182
chr12166440021664833
chr12166494721665143
chr12166700021667175
chr12166425521666064
chr12166736221667447
Enhancer Sequence
CAGCCACGGA CATTTACACG TACATCCACC CAATGCGGCA CGACTCAGCC TAAAAAGGAG 60
CAGATGCTGG TACAGGCGAC ACGGACAAAC CTCAAACATT CCTTGCTGTC CAAAGCTGAA 120
GAAAACCAGG CACAAAAGAG CACACATGAA TGAATCCACA CAGAGAAAGC TCAAAACCAG 180
GCCAAACTAG AGGGCCAGTG GCCACCTGCT GCAGGGGACT GATGGAGGAG GCACACGGGA 240
ACTGTGGGAA TGGTTCACAC TTTGGTCCAG GTAGTATGCA GGTGTGTGCA TTTGTAAAAC 300
GTGAGCTGTA CAAGATATGC ATACATTACT TAAGTAAATT ATACTATACC ACAATTTTTA 360
GAAACGTACA ATCTCTGCCC TCATGAGGTC CAGTCTGGCA TCCTGTGTCA TCATCGTAAC 420
AGTCATGACA ATAACAGCAG GTGACACCGA CTGAGTCCTC TGTATGTGCC AGCCCTCAGC 480
TGGGCTACTC TGAAACAGGA TCTGATTGAG CGTTTCTAAC TACTGGGCAA AATACTGCCC 540
CAGGAGCTCC ATATTAGAGA CAGGAGAATA AAGCTTAGAG AGGTGACACG CTGTCCAAGG 600
TGACAATGCA AAAAGTGAGG ATGCCAGGTT TGAACCTGGG CCCATCAGTC TCCAAGGCCC 660
ACTCCTGCTG CACGGGCAGA TCCCGCCTCC CTGCCCTCTC CTCCCCACAC TGCCTGCTCA 720
GATGTGGCAC CTGGAGGCAG CCAGTCCTCG CCCCTCGCCC CCTCCTCTCC AGTGCTGGAA 780
GGAACAGCTC ATGTGTGTAA TGGACTCGAA GCTTCTGTGA AAGAGCTGCT GAGGAAATGA 840
GTCCTTCCTT CCCCTTCTGC CCCCTCTGCC CTCCCTCATC CCTCTCATGG CCACATAGCT 900
CTGAGGACAT TTCAGCCCTG GACCTCCGCC CAATAAGAAG GGACTCCAAT GGCCAGGCAG 960
CTGGGGGTGT GTGTGGTATT GACCAAGGAG CTTTCTCAAC CCCTGGACAC CCCAGCCCAG 1020
CCTGTGGCCT CTCAGAGGAC CAGGAGGACA TGAGGTTAGA GTCCCCACCC TTGGCTCCAG 1080
TTTCCAAGTG ACGCAACCAA GTGTCTGGAT TCAGAGAATC GCAAAATGTT TATCTGGAAT 1140
CACAACCACC ACCATGACCA TTTAATCAAA CCTTATCCTG TGCCAAGTGC TACAAACATA 1200
GCTCATGAAT CCTCACCAGC AAACAAAATG GGTACTGCTA GGCTCTCATT TTACAGAGGA 1260
AGAAAGTGGA GCTCAAAGGG GTTAGGTGCC TTGCCCCAAG TCTCACAGTG AGGAAGTGGT 1320
GGGGCTGGAA TTCAAACCCA GATTTGCACA ACTTCGAGTC TATCCTCTGA ATGAGAGTAT 1380
TATACTTGTC ATCCTGCATG TCATTACTGA AGACGGCCCT GGAGTCAGTC TGCTCCAGCC 1440
ATGTCATTTC ACAGATGGGA AGACTGAGGC CCACGAAGGA AGACCGTGGT TCAGGAGGAC 1500
AAGGATTAGT GGCAGAGCCT GGGCTGGAAG CCACCCTGGC CTTGCTTTCA ATGACCAGAT 1560
CAGAGCCTGG GAGCGGGCCA TGTGCAGCTG GATGGGCAGC TGGAGGGAGT CAGGCAGGGA 1620
GGTGGGAGGC TCTGCTTCCA GGCAGAGGTA AATATTGACA TGACTGTGTT TACGCTGTAA 1680
CCTAACTCTG CCTGGCTGCT GCCCCAGGCC CACCCTCCTG CCTTCCCAGC CAAGGAGGGA 1740
AGGGAGCTGT GGGAGGAGGA TGGGGAGAGG AGGCTTCTGG GCCAGGGGCT GCTCCTCCTG 1800
CTTAGAGGGC TATGTGGTCA GAAAGGCTGG GACATCAGGT GTTAGGGGTG GGGGTTAGTG 1860
GAGACCCAGG CCAGGGGACC AGGTGGTGCC AGACAGGGAG GGGCTGTTAT CTGAGCTGGG 1920
GAGCTGGGGA TCTCAGGGCG GGGGACTGGG CTGGGAGTCA CAAGGCCTGA GTTCAAGTTC 1980
TAGTTCTGCT ACTGATTGGC AGTGGGAATC CAAGAACAGT CGGTGAATGG GGAAGAAAAG 2040
GTCTAACTGT CAAGTGCGGT GCAAAGGTGA ACAATAAATA ACCAGCATTT GAGCCTGGCC 2100
AGTGTCCAGC CCCAGTGAGC TCTCAACGCC TCTGGCTACC GGCTCAACAG TCCTATCCCT 2160
GTCCCAGTGG GCTTTCCCAG GAAGGCCAAG TTTCTGCCAA ACTGAGTGGC AGCTTGGGAC 2220
TGAAGCCATA ATAATCTAGA GGAATCGGGG AGCCACTGTC TAGCTCCCGT CCCTAATTCC 2280
CTAAGTGACC TTTGAGCCTC AGCTTTTACA ACTCTGAAAT AAGGCTCACC CTCCTCCCTG 2340
GGGTTGGTGT GAAGAGCAGA GATTACATTT AAGTGCCAGG CACATAGTAG ATGCTCATTT 2400
TGTCTCTCAG TCTTCCCACT TGTCAAACAG GGGCCTCGAA GTTGGTGGTT CCTAATCCCC 2460
TTTTCATACA AGCGCTCTAG CGTCTTTAGA AGGCCCAGAA GCCAGGCCCA CCTCCCTGAT 2520
GTTAGATCCC CACCTAGCCG ATTTCCTGAA TGCTCTCTAG AAACTTGCTC CCCTGTTTAC 2580
ACCTCCCCCC AGGAAGTCCA AAGGGGCCCT GTTGGGAGGA GGGAGCCATT CCTAGGCTTG 2640
TCAGCCCACC AAGACAGGCC TGGGGCATCC CAGCCACTCT GCCCTCAGGG GCCCAAGGAA 2700
AGGGCAGGCC CCAGGTCCTG GACTCCAGTG CCACCCTGAC AGTGGGGTTC CGCCAGCACT 2760
GGTTGTTCAT TAAACTGTGC CCCTCAGACT ATTAACTCTT CAAGGACAAG TGAACCCCCC 2820
TCCTAATTTT TTATGTGTCC AAAACTTGGC GTCTAGGAAG CATTCCACCA AGTGTTAACA 2880
CCTCTTCTGG GAAGGCTTCC CTGATACACA CCTATGGGCA GGATGACTCT GGAGCTGCAT 2940
CCCCAGGTTG GCACATAGCA TTTTCTACCT TATTTCAGAG CGATCTGGGA ACTTGTTCTT 3000
TCTCCTCTAT TAAAGGCTCT GGAGACCAGG GCCCTCGGCT GGTTATCTGC CTGAAAGGAT 3060
GAGGGGAAGG GTCAATACAT TCAGGAGAAG GGGCTGTCTG GGACCTCTGT CTGGGGCCAC 3120
AGCCTCCTTC TGTCTTCACT GACTGCTCTG GGCAGCATGC CAGGGGCGTG GTTTGGGCTA 3180
GAGGAGGACT GGATGGTGCC TGCAGCACCA CCTTTCTCCC AGGGCCACTT CAGGTGCCTC 3240
CTCACTGGTT TCCCAGCCTT CGGCCTCACT CCTTCTACTC AATCACCACA AAGCAGCCTG 3300
TGACCATCTC AGAATGCAAA TCCGACCGTG TCACTCCCCT GACTCTAAAC TCCTCAGTAG 3360
GCTGGGTGCG GTGGCTCACA CCTGTAATCC CAGCACTGTG GGAGGCTGAG GCGGGTGGAT 3420
CACTTGAGGT CAGCAGTCCA AGACCAGCCT GGGCAACATG GCGAAACCCG GTGTCTACTA 3480
AAAAAATACA GAAGTTAGTC GCATGGTGGC ACGCCTGTAA TCCCAGCTAC TCGGGAGACT 3540
GAGGAGAATC ACTTGAACCA GGGAGGCTGA GGCTGCAGTG AGCTGAGATT GCACCACTGC 3600
ACTCAGCCTG GGTGACAGAG CAAGACTATG TCTCAATAAA TAAGTAAATT AATTAAATTT 3660
AAAAAATAAA CTCCTGAGTG GCTCCCCACT GCCCTAAGGA TTGAGCCCCA GGTCCTTCAT 3720
ATGACCATCC CTGAGTGCAC CCTCCGGGCC ACCTCCTAAG CACAGTCCTC CGTGCCTCCA 3780
GATGAACCAT CCCTGAAGGC ACAGCGGTCT GTACTCTTGC ACATTCTGCT CCCTCCACCC 3840
CCCGCCCCCC AACACTCTTC CCAGTCCCAC TCGCTCTTTA GGTTATGATT TTAATGCCAT 3900
GTGCTCAGGG AGCCTTTTCT GATCCTCAGG TCAGGTTCCC GGTCCAATCC CACAGCCCCC 3960
CGCGTGTCTC CCTGACAACA GTAATTGCGC TTGTAATTTC CTGCTCTGTA TCTGTCTGCC 4020
TGCCTGTCCA TCAGACTGTG GGAGAGAGAG ACCTATCAGT CTCACTCACA CTGACCACGG 4080
CCCCCATGCC TCGTGTTGTG CCAGACAGAC TTGTTTGGTG AGTGAGTGAA TGAACAAATG 4140
AATGAAGCCC TTTGACTATG GCAGGAGGCT TACCCAGTCA ATTGGAGAGA AAAAAATTGA 4200
GCAGAAGCAC AAAAAATTGT AAACATTTGC TCATGGTTCC TCTCTCACCG TAGACATGAA 4260
AGTGTGGACT 4270