EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS128-00100 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF-7 
Coordinate
chr1:8179900-8184410 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:8180424-8180435AAGCAATAAAA+6.32
DUX4MA0468.1chr1:8180471-8180482TGATTGGATTA-6.02
Foxd3MA0041.1chr1:8183921-8183933GTTTGTTTGTTT+6.32
Gata1MA0035.3chr1:8182665-8182676ACAGATAAGGA-6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:8184158-8184173TGAACTCCTGACCTC-6.22
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02013chr1:8179206-8183891Aorta
SE_26216chr1:8175633-8183999Duodenum_Smooth_Muscle
SE_29143chr1:8180232-8183189Fetal_Intestine_Large
SE_33765chr1:8178958-8183804HCC1954
SE_34231chr1:8172961-8184115HCT-116
SE_36931chr1:8180494-8182174HSMMtube
SE_38712chr1:8179136-8183823HUVEC
SE_39254chr1:8179884-8182961IMR90
SE_47106chr1:8172886-8184011Panc1
SE_52130chr1:8180608-8181873Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_54673chr1:8175167-8188141Stomach_Smooth_Muscle
SE_55699chr1:8180305-8183159u87
SE_63913chr1:8180516-8181887HSMM
SE_67928chr1:8180305-8183159u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr181800198180158
chr181807128181860
chr181836728183958
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I008124chr181842598186364
GH01I008115chr181752698183809
Enhancer Sequence
TAAAAAATGT TTTTTACTGT CGAGTAGGGG TTCAGGACAG ACTGCCCCCA AATATGCCAC 60
TTTGGAATGT TGGTGATTTT GAGCAGAAAG CACTGGAAAA CAGTAAATGC AGAGACATGG 120
TTTCCCTGAA CTCCTCTCAT CTGCCCAAAG GCAGAGCCTC CAAAAGGACA TCAGTTGTCC 180
TAAGTCCCCT CCCCAGGAGT CAGCAAGGGC TGCCTTAACA TCCGGACAAA CTGCCACAAA 240
CCCTCGTATC TCCCATCTAG TCTTCTAAAG GCCCATTTTT CTTTCCTAAA AATCATTTCC 300
TCTCCTCACG GTAGCCCACA TCTCCTCTCC CTTTTCTCTG TTAAGATGGC ATCACTTTTT 360
TGTGATATTG TTTTTTTCTT CCTATGATGG CCCCTGTGCA CATATTAAAA ATTAATAAAT 420
TTGTTTACCC TTTTTCCTGT TAAATCTGTG TATTGTCAGT GTATTTCCTA GACCCAGCTA 480
TCGAACCTAG ATGGTAAAGT CTTTCTTCCC CTGACTCTAT TTCAAAGCAA TAAAAAAGTT 540
TAAAATGCCC CAAAAGACAT AGTTTACTCT ATGATTGGAT TATTAGAAGA CGTTAGCCCA 600
GGGAGGTTCT ACTCTGTTTT TCAGGGGTGG AGCTGGTACT AGAATTCACA GCCTGGTTTT 660
CATCCCAGCT GGGCCATTCC ACAAATGGAA CTTTAAACAA ATACTTCTCC TCGAAGTAGA 720
AGCTGGGTTG GGGTCTGGTC TTGAAGGATG GATCTGAAAT GGCGGAGGAG AGCCTGGCGA 780
AGCCCTCCGG CCTCCTTCCC AACGGGTCCC AGCTTTTTGC CACTTCCCTA CCTTGTATTT 840
GGCTACTAAG GAATCTAATC TGTCCAGTTT TTTATCTTGG TCATCCATAG TGTTCTATAG 900
ATCACATAGA AAGATGGTTA CAATGTTCAG CACCTCTTGC TAAACATCCT GTCCTGGAGG 960
CACATGGAGA AGGTTGACAA AGCCTCATTC CTCTGAAACA TTTCATGCAA CGGATTTGGT 1020
TGAAACCCCA GATTGTGATC TGGAGTCTTT AGCAACTGTG CTCATTTCCT ACCTTGAGCA 1080
TTTCATTTTT GAGCAACTAG AATAACAACT GGTCTTTTTT AGTCTTGACC AAAGGGGGAT 1140
AAGGGAACCA AAAATCCTTT GCTCCTCGTT TCCTGTTAGA TTGTGAAACA AAAAGGTAAA 1200
CATTTAACGG AATGTGGCAG CTCAGAACAA TTACCCCTAT TGTGGCATGA ACACTGATTT 1260
CTATTCCTTT TTACACAAAC TCCTTCCGGT AGAGAAGCTG AACAAAAGAA CGTGCCAGCC 1320
CAGCCCGTGG GCTCCTCAGG CCGATCAGAT CGGGAAGTGA GAAACGCCGG CAGAGATTTG 1380
CTCTGGGAAA GTTTGTAGAC ATTTTCAAAG TCAAGGGTGA AGTGTCCTTG GTTTACTTAG 1440
AATCGTTTTC TTTAAAGGAA ATCACTGTCA CAACTTCAGA AGCCCCGACA TGCCTGTGTA 1500
GTTATGAGAA GGGATGAAGG CTTCGCATAG CTTCATAACC TTGTTATTAA GAGTCTGGAA 1560
CTCAGTGACT GGCTGGGTGC TTGACCCTTT GTTCAGTAGC CTTGGCAAGT GCTCTCATTT 1620
TCTTCCTTTT TAGGTTTCCC CACTGCGAGC CCTTCGAGAA CAATGTCATG TTGATCGATG 1680
GCAGTGACTC ACACCAGATC TTTCCATGCC TCCTCTGCAA GGACTCAAGA GAGTCGAGAG 1740
CAAAACCGTG CCATAGTTCC ATAAGGAGGG CAAAGAGCTT TATCCACGCT GAGGAACAGG 1800
CGGATCATGC GGCTACAGCA CTGGTCTTTA CCTTTTAACT GCTTGATTCG AAACATTCCA 1860
GCCAGGAACA GTGGCTCACA CCTGTAATCC CAGCACTTTG TGGGGCCAAG GCAGGTGGAT 1920
TGCTCGAGCT CAGGAGTTCG AAACCAGCCT GGGCAACCTG GCAAAACCTC ATCTCTACAA 1980
AAAAATACAA AAATTAGCCA GGCCTGGTGT GTGTGCCTGT GGTTCCAGCC ACTCGGCAGG 2040
CTGCGGCCAG AGGATCACTT GAGCCCAGGA AGTGGAGGCT GCAGTGAGCT GAGATCGTGC 2100
CGCCACACTC CAGCCTGGGT GACAGAGCCA GACATTGTCT CTAAAAAAAA AAAAAAAAGA 2160
AAAGAAAAGA AAGAAAAAAG AGAAATAGTC CAAGACTAGG GAGAAAACCT TCTTTGGGGT 2220
CAGTGTGAAC CATTCTTTCA TTTGTTCAGC AAATGCTTAC TGAGGAGCTA CTGTGTCCCT 2280
GAAATTGCCT CCACCTCCAA GAAGACAGTG GTGAGCAAGT CAGACAATAC CTCTAATCTC 2340
ATGGTATTTA TAAGTAAATG GGCCGTTAAA ATTACCAGAT CAGAAGTGCT GTGTTCAGCA 2400
AATAGAGGCT CATGGGAAAC TCCTAAGAAG GGCTTCTGAG CTGGACTTGG GGGTCAGGAA 2460
AGGCAGAATG AGGGGGCTGA CTCATCCAGA CTGGGGCGGG GTTGCCGGGG GTGCCTCCCA 2520
CTTACTATCT GTCTCCTTCT AGACTGACTT CTCTGTCATC ATGAATACAC CCCTTTAAGA 2580
CATACATTTA AGAGAAAATA AGAGGATGCC TTATTTATTT AAAGGTTTGT TACAGTTTTA 2640
CTAACAACCA CATACCTAAA GGAAAGTCGC AAGTAGAGCT CAAAAACTTT TTTCTCTGGG 2700
GCAGTGAAGA GTCAGTTGCC AGCCAGAAGG CCCACTGAGC CTGAGCACTT CAGGGTGTGC 2760
TTCCTACAGA TAAGGACATC CTCCTGCATA ACAGGAAAGG GGTCCTGATC CAGACCCCAA 2820
GAGAGGGTTC TTGGATCTCG CACAAGAAAG AATTCCGGGT GAGTCTGTAA AGCGAAAGCC 2880
AGTTTATTAA GTAAAGGAGT AAAAGAATGG CTATTCCATA GACAGAGCAG CCCTGAGGGC 2940
TGCTGATTGC CCAGTTTTAT GGCTGTTTCT TGATGATATG CTAAACAAGG GGTGGATTAC 3000
TCATGCCTCC CCCTTTTAGA CCGTAGAGGG CAAGTCCTGA TGTTGCCATG GCGTTTGTAA 3060
ACTGTCATGG AGCTGGTGGG AGTGAAGCAG TGAGGATGAC CAGAGGTCAC TCTCGGCACC 3120
ATCTTGGTTT TTGGTGGGTT TTAGCCAGCT TCTTTACTGC AACCTGTTTT TTCAGCAATA 3180
TCTTTATGAC CTGTATCTTG TGCCGACCTC CTATCTCATC CTGTAAATTA GAATGCCATT 3240
ACCATCTGGG AATGCAGCCC AGTAGGTCTC AGCCTTATTT TACTCAGCTC CTATTTAAGA 3300
TGGAGTCGCT CTGGTTCGAA CGGCTCTGAT ATAACTGCTG CTCAGCCATT GACGTCGGGA 3360
AGGTAGCACA GGCTCATTGC CACCACTGAA CCCTCAGACC CCACCCAAGT GTTGCCAGTT 3420
GTTCCAATAA TGTCCTTTAT GGTGAAAGGA CCAGATCCAT GGTCACATAT TGCATTGAAT 3480
TGTCACGTCT TCTTCTTTAG TCTTCCCTCG ACCTACATGA CCTTGCCATT TTTGGAGATA 3540
ATAGTTTAAC AGTCCAGTGG GTTCACCTTG CCCGCTGCCT AGACAGAGCT GGTTGATCAT 3600
GACAGGGGAG TTGCAATGGA CAATGGAGAA AGCGTAATTC ACACAGAGTC GACTGTGTGG 3660
GAGACCAGAG TTTTGTTAAT ACTCAAATCA GTCTCCCTGA GCATTTGGCG ATTAAAGTTT 3720
TTAAAGATAA TTTGGTGGGT AGGGGCTTGG GAAGTGGAGA GTGCAATGGA GATGGAATCA 3780
CAGGGGGTCG AAGTGAGTTT TTCTTGCTGT TTTCTGTTCT TGGGTGGGAT GGCAGAACTG 3840
GTTGAGCCAG ATTACTGGTC TGGGTGGTGG TAGCTGGTCC ACTGAGTGCA GGGTTTGCAA 3900
AATATCTCAA GCACTGATCT TAGGTCTTAC AATAGTGATG TTATTGCCAG GAGCAATTTG 3960
GGGAGGTTCA GACTCTTGGA GTCAGAGGCT GCATGACCCC TAAACTGTAA TTTCTTGTTT 4020
TGTTTGTTTG TTTTGTTATT GTTGTTTGGT TTTTTTTGAG ACGGAGTTTC ACTCTTGTTG 4080
CCCAGGCTGG AGTGCAATGG CATGATCTCA GCTCACCGCA ACCTCCACCT CCCAGGTTCA 4140
AGCAATTCTC CTGCCTCAGC CTCCCAAGTA ACTGAGATTA CAGGCATGTG CCACCACGCC 4200
CGGCTAATTT TGTATTTTTA GTAGAGATGG GGTTTCTCCA TGTTGGTCAG GCTGGTCTTG 4260
AACTCCTGAC CTCAGGTGAT CTGCCTGCCT TGGCCTCCCA ACGTGCTGGG ATTACAGGCA 4320
TGAGCCACTG CGCCTGGCCA GTAATTTCTA ATCTTGTAGC TAATTTGTTA GTCCTGCAAA 4380
GGCTGAGTGG TCCCAGGCAA GAAGGGGGTC TTTTTGGGAA AGGGGTTTTA TCAATTTTGT 4440
TTCAGAGTCC AACCACGAAT TGAATTCCTT CCCAAAGTTA GTTTGGCCTA TGCCCAGGGA 4500
TGAACAAGGA 4510