EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS126-00019 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
LY1 
Coordinate
chr1:8495240-8500760 
SNPs
Number: 4             
IDChromosomePositionGenome Version
rs172531chr18495590hg19
rs301801chr18495945hg19
rs34976449chr18498327hg19
rs301803chr18498680hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ELF3MA0640.1chr1:8498713-8498726TTACTTCCGGCTA-6.54
ONECUT1MA0679.1chr1:8498368-8498382AAAAAATCAATATA+6.62
ONECUT2MA0756.1chr1:8498368-8498382AAAAAATCAATATA+6.91
ONECUT3MA0757.1chr1:8498368-8498382AAAAAATCAATATA+7.19
RESTMA0138.2chr1:8495373-8495394CCCAGCACCTAGAACAGCACT+6.23
Sox3MA0514.1chr1:8495348-8495358CCTTTGTTTT+6.02
Sox6MA0515.1chr1:8499620-8499630CCATTGTTTT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 28             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00045chr1:8497982-8499894Adipose_Nuclei
SE_02022chr1:8497126-8497782Aorta
SE_02022chr1:8498913-8499948Aorta
SE_03947chr1:8498778-8499975Brain_Anterior_Caudate
SE_04978chr1:8498182-8500162Brain_Cingulate_Gyrus
SE_07042chr1:8498385-8500215Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07921chr1:8498882-8500242Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_11329chr1:8496575-8500743CD20
SE_25808chr1:8497845-8499987Duodenum_Smooth_Muscle
SE_28078chr1:8498322-8500011Fetal_Intestine
SE_29095chr1:8498172-8499988Fetal_Intestine_Large
SE_29887chr1:8497659-8500219Fetal_Muscle
SE_31622chr1:8498521-8499967Gastric
SE_40658chr1:8498953-8499664Left_Ventricle
SE_41679chr1:8497482-8498209LNCaP
SE_41679chr1:8499010-8499949LNCaP
SE_42166chr1:8498911-8499835Lung
SE_48103chr1:8498931-8499864Psoas_Muscle
SE_48600chr1:8498898-8499546Right_Atrium
SE_51176chr1:8495183-8496762Skeletal_Muscle
SE_51176chr1:8496821-8497964Skeletal_Muscle
SE_51176chr1:8497978-8500178Skeletal_Muscle
SE_53408chr1:8499004-8499850Spleen
SE_54752chr1:8497250-8500103Stomach_Smooth_Muscle
SE_58576chr1:8455425-8501956Ly1
SE_60225chr1:8480836-8499894Ly4
SE_60758chr1:8454848-8500160DHL6
SE_62661chr1:8450826-8509851Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr184957618496105
chr184985928498880
chr184970768497737
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I008435chr184951848496762
GH01I008437chr184976518500633
Enhancer Sequence
CTCTATAACC TTACTCTGCC TTCATTTTAA GGCCTAGCTC TTATCACCAT ATGTGATATG 60
ATTAGATAAC ACGATATAGG CTACGTTACT GAATATATGA GGAAAGGGCC TTTGTTTTGT 120
TCACTATTAT ATCCCCAGCA CCTAGAACAG CACTTGACAA CATATAGCAG GTGCTTGACA 180
ACCACTGGTT CAGTACAAGA ATGTATCTGG AGATGATTGG GCTTAGTGTT CCTCCAAGGC 240
TATTTGACCT CTCATCACCT GTTCTCCAGT TTGACTCAAC GTCTCTTAAT ATATATTCAC 300
TGCACTGTTA AGTTTCTAAC TCTCTAACTA CTACTGACAA AACCATTAGA TGTTCTTCGT 360
TCAAACCCAC TAGAGGAACT ACACCATCCC CTCCGTGATG CCAGCTCAGC ATCCAGAGTA 420
GAGCCAGTGA TTTCCTTTGT CAACACACCT GCATGCCAAA AACCCTTCCC AGGAGGTCTC 480
AAATATCAAA TAAAAGTTAC TCCATTTTTC ATTCAAAGAC CATGTGCCCA ATGGGAAAAT 540
GACCTCATGT TGTGGTTTAA ACAGCAACTG CACCCACTAG CACAGCCCAT TGAGCTATCC 600
TATATATACA TCTCTGTCAG TGCCCCTCTG GGTCTAGATA ATTACACTGA GTACACTGAA 660
GTCCTTTCAT TATTGCAGGC CCAACAAAAA GTACTGCCAC TGGGTGAATA TCAGAAAGCA 720
TGCATCAATG CACTTTCAAG TCAAATGAGA ACTGGCTAGT TAAGCAGCAG CATTAACAGA 780
TGTAGAGATT GTGCCAGCCA AATGCCTCTT GCCAATTATG GCCACACAGC TACGCCCAAA 840
TTAAAAATAA CCCAACACGG CCAGGTGCAC TGGCTCATGC CTGTAATCCC AGCACTTTGG 900
GAGGCTGAGG CAGGCAGATC ACGAGGTCAG GAGTTTGAGA CCAGCCTGGT CAACATGGTG 960
AAACCCCAAC TCTACTAAAA ATACAAAAAT TAGCCAGGCG TGGTGGCGTG TGCCTGTGAT 1020
CTCAGCTCCT TGGGAGGCTG AGGCAGGAGA ATTGCTTGAA CCCGGGAGAC AGAGGTTGCA 1080
ATGAGCTGAG ATTGTGCCAC TGCACTCCAA CCTGGGCGAC AGAGCGAGAC TCAATCTCAA 1140
ATAAATAAAT AAAAAATAAA TAAAATAACC CAACACTCAT AACAGAATCC AAATGGGCAT 1200
GGGAGGCTCC TTCTCTCCCT ACAATATCAC CCTACAGTCG CTACATAAAT GCCCCTGTAA 1260
AGTGGCTCCT AAGTTATGTC ATTAAAATGT TCACCTTTCC TTGGCAAAGT AGATCTCAAC 1320
ACAGGAGGAA AGAGAAATAA GCTAAAAAAA GAAATGTGGA TTGTCTAGAA GTTACAAGGG 1380
AACAAAAAAG TAGAAATCCT CCGTGAGAGG ATTTTGCAAA AACTGTAATT AAAGGAATCT 1440
AGACCAGTGG TTGCCCGATA GAAATATAAG CCAAAAATGT AAGTTTTACT CTTCTAGTAA 1500
CCATACTTTA AAAAGAAACA GGTAAAATTA ATTTAAATGT TTTATTTAAC TAAAAAGATC 1560
AAAAATATTA TCATTTCAAC ATGTAATCAA TATAAAAGTT AGTAATGAAA TATTTTACAT 1620
TCTTTTTCTT CCTGCTCAGT CTTTGAAATC AGTGTGTATT TTACACTGAC CGTGCATCTA 1680
CACTTGGGCC AGCACATTGC AGATGCTCAA CAGCCACAAG AGACCAGTGG TTACCACATT 1740
GGAAAGCACA GGTCTAGAAT AATCCTAACT TCTTTTTTTG TAAAATACTG AAACATCCAA 1800
AGCACTCCAA GTTTTCTATT AGGGAGGCAA AATAACTATA CTGTTAGAAT CATGGGCAAC 1860
GATATCATAA ATTCCTAAAA TAAAACCACA TAGGGCCGTT ATTTCAAATT ACATAAAACT 1920
TGTCTTCTAG AAGAATTCGA CCAAATGCCA AAGTTCTTAA GATCTGCCCC ACTTCCCAAA 1980
CAAGGGAAAC TGAAGACCTC GACCAGCACC AGGGCCTTCC GTCAGCTCCT GATACAGGAG 2040
GGGCTCCTGG ATTTTGTTTC CCCTTCTTGA CAATACAACA TGGGACTGGG TTCCTCATTT 2100
GACTCGGTTC ATTTAAAGAA TGATCTCAAA GAAGAAAGGA AAATCAATGA CCCCTTTAGG 2160
AAATGTAGTC CAGGGTGGGG GTGGAGGAAG CATTTCAATG ACAAAAGCCA AACCTCAGTC 2220
ATAATGCAGA TCCCTGTCTA ACAGGTGATC ATTGTTTTTT TTTTCTATTA CAGGCACTCT 2280
GGTCTCCCGC CTACCCCATG CAGGATGGCT ATCCCCATGC AGAATGGCTG TGACTTTCAA 2340
GAGAGTCCCC CAAGGGAGGG TCCCAAGATC AGGGGCTGGT AATGGGCCCC ACCACAAGGC 2400
TACGCTGCTG GCTTTTGTTT GGAACAATAG CGCTCCCATG ATACCTCACT CTTGCTGACA 2460
ATATTGGTAA TACGGGAGCA TGAACACAGC TGTGTGTAAA TTACACACAC AAACAGATTA 2520
GATCTGTATA TTTATAAGGA ATACAAACAT ACTAATAGCT CATTTACATA CACAGCTGGA 2580
TACAATGGGC TGCATGCAGA GGGGAGTTTG AGTTCCAAAG TATTTCTCTA AAATTTTACA 2640
AAAAGAAATG CTCAGATTAC TGCTAACCCA GGCTGAGACT TCTGCTCCCC CCACCCCCAT 2700
GCAGTATGTC CCCCGAAATA GAGTCCTTTT CATCCTCGTT TGTGATATTT GAGATGCTAT 2760
GAAGGAGAAA CCTCAACAAG TGCTGTTAGA TTTCACTTTT ATTATTATTT ATTATTATTT 2820
TTAGAGACAG GGTCTTGCTC TGCCACCTAG GCTACAGTGG TATGATCACA GTTCACTGTA 2880
ACGTGGAGCT TCCGGGCTCA AATGATCCTC CTGGCTCGGC CTCCCAAGTA GGTCAGACTA 2940
CAGGTATGTG TCAGTTACCA TGCCCAGCTA ATTTTAAAAA TATTTTTTTG TAGAGACGGG 3000
GTTCTCACTA TGTTGCCCAG GCTTGGTCTT GAACTCTTGA TTTCAAGCAA TCCTGCTGCC 3060
TCAGCCTCCC AAAGAGTTGG GATTATGGCA TGAGCCACTG TGCCCAGCCA GATCTCACTC 3120
CTGTAGGAAA AAAATCAATA TAGGATAATT TTCAGTTAAA AAGATGTATA TACATACGAA 3180
GAGGGAGACC TACTAAAACA TCTGTTACAA CAGCATATAG TAAGGCAGAA TCTTTGCATT 3240
TTCAAAATGT TTTCATAAAC TTTATTTGTT AGAGCAATTT CAGGTTCACA GCAAAACGGA 3300
ACAGAAGGTA TAGGGATTTC CCATATAGAT GGGTCTCTGG ATTTTTCAGC TAATTTTGAA 3360
AAATAGGGAA AAGAGCAATC AGCATTTTGT GCTCACTACA GTAAACCAGG AACACAGGCA 3420
TCAGGAGAGC TGGGCTCTGA TTCAAAGGCC TGATTCTAGC AAGGCCTCAC AGTTTACTTC 3480
CGGCTAGCCA TGAACACTCT CTGCGCCTGA GGTTTTCGTG GAAAGACAGC ATCACAAGTA 3540
CTCAAATGTA GCGTTTAAAA GTACTAACTT TTAAAATGTT GAATGTTCCA GTAAAACAGT 3600
TAAAGAAAAA AAAAGGTAAT AATCCAACTA AGTAAAAATA TTAACTTATA CATATCTGGA 3660
TAGATGATAA GCTCATTACA GGCCCTAATT TTATTATTTA AAATGTTTAC AACAAAACTC 3720
TCTAATTGAT ATTCTCCCTC TCTCTCTCTT TTTGCCTTGA TATGGTTTCT ATAAACTCTT 3780
GGTTTAAAAA AGAAAAAAGG TCCATTTCTG AGGCTTGGGT TTACTGTACT TACAGTTCCA 3840
CCAGTAAATC GTCTCCCAGT CTGGGCTGGA GAAGCGCTGG CCACGGTTTG ATTGCTCCAG 3900
CCCCAGGTTG CCAGGCAACC CACACAAGGG GGAAGTCTGA GAACCGCTGA CAGATAGCCA 3960
AGTGGCTGAA ACAACAGACT TCTCTCTGTC AAAAATGTGT TTGAGAGAGC CACTTGCCCA 4020
CCTCTGCTCT CTGCTAAACA CTACATGATT GTAAAATCAA AATCAAAAGG CCACTGTAAT 4080
AAAAACACAC TTCCTGCTCA ATTACTAATT GTTCTAAAGC TGTGGGGAGG CCCAGATCCT 4140
ACAGTGTATG GCAACAGAAA TGCGATACTG TAAATGAGAT AAAGCCAGCA GCATGCAAGA 4200
AACCTGATCT AAATGCATCT CCGTAGCTTC AAGTCAGGAG AGCTGGTGTG TGGAGGAATC 4260
AACTGCCTAA GAAAACACCA GGAAGAAAAT AATGAATGTC AAGATGTTAA AGAAACAAAC 4320
CAATCAATAA CTACGAAGCT AGAGGTCAAG ACTACTTAGT AATAAAACCA AGAACATTCT 4380
CCATTGTTTT GAAACACAAT CTGGAGGCAA TGAAAGTTTT CTCCCTCAGA TGGAAAGGAG 4440
GAGCAAGAAA GGTCAATGAC CCTTGGGAAC CACACCCCCT GGCGGTTCCA GGTGGATTCC 4500
CTGATACTTG ACTGTAAATG GGATTACAGG AAATAGTAGC ATCCTTAGGA TAATGCAGGA 4560
CAATAACAGG TCTGAGAGTC TAATGCAACA TTTAAAATAC CTATGGTGTG AGCTGGGCAC 4620
AGTGGCTCAC GCCTGTAATC CCAGCACTTT GGGAGGCCGA GGTGGGTGGA TCACCTGAGG 4680
TCAAAAGTTT GAGACCAGCC TGGCCAACAC AGTGAAACCC CGTCTACACT AAAAATACAA 4740
AAAATTAGCT GGGCATGGTG GCAAACGCCT GTAATCCCAG CTACTGGGGA GGCTGAGGCA 4800
GGAGAATTGC TTCAACCCGG GAGGCAGAGG TTGCAGTGAG CTGAGATCGC GCCATTACAC 4860
TCCAGCCTGG GCAACAAGAG TGAAACTCCC TCTCAAACAA ACAAAAACAA AATATCTATG 4920
GTGCATGTAC CAAGCCAGTA ACATTGTGCC CAACACCAAC TCTATGCAGC ATCCTTCCAT 4980
GAAACCACTG TATTGAAACT GTCATCTTGG ACTCTGGAAA CTATTTGTAG TATGTGGAAG 5040
GGGCCAGCAC TGAGTGCACA GTTCTTTATC TCTTCTGTGC CATGGACCCT TTGGCAGTCT 5100
GGTAAAGCCT GACTCCTTCT AAAAATGGTT TATGGCCAGG CACGGCTCAT GCCTGTAATC 5160
CTAGCACTTT GGGAGGCCGA GGCAGGCGGA CATGAGGTTA GGAGATCGAG ACCATCCTGG 5220
CCAATATGGT GAAACCCTGT CTCTACTAAA AATACAAACA ATTAGCTGGG CGTGGTGGCG 5280
CATGCCTGTA ATCCCAGCTA CTCAGGAGGC TGAGGCAGGA GAATCACTTG AACCAGGGAG 5340
TCAGAGGTCG CAGTAAGCCG AGATCATGCC ACTGAACTCC AGCCTGGCGA CAGAGCGAGA 5400
CTCCACCTAA AAAAAAAAAA AAAAAGGCTG GGCACGGTGG CTCCTGTCTG TAATCCCAGC 5460
ACTTTGGGAG GCCGAGGCTG GCGGATCACC TAACGTCGAG TTTGAGACTA GCCTGGCCAA 5520