EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS121-02970 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
LNCaP 
Coordinate
chr1:156453220-156460300 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs3790455chr1156456301hg19
rs1171563chr1156456529hg19
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:156459286-156459297ACAGATAAGGA-6.14
Gfi1bMA0483.1chr1:156455391-156455402AAATCACAGCT+6.14
IRF1MA0050.2chr1:156455632-156455653TTTGACTTTTTTTTTCTTTTT+6.07
MEF2AMA0052.3chr1:156460264-156460276GCTATTTTTAGC-6.44
MEF2BMA0660.1chr1:156460264-156460276GCTATTTTTAGC-6.92
MEF2CMA0497.1chr1:156460263-156460278GGCTATTTTTAGCCT-6.68
PLAG1MA0163.1chr1:156459529-156459543GGGGCCCTTGGGGG+6.3
POU2F2MA0507.1chr1:156458371-156458384ACATGCAAATGAG-6.54
TFAP2AMA0003.3chr1:156453363-156453374TGCCTGAGGCA-6.02
ZNF263MA0528.1chr1:156455131-156455152GAAGGAGGAGAGGGAAGGCAA+6.14
ZNF263MA0528.1chr1:156455128-156455149AGGGAAGGAGGAGAGGGAAGG+6.27
ZNF263MA0528.1chr1:156455127-156455148GAGGGAAGGAGGAGAGGGAAG+6.2
ZNF740MA0753.2chr1:156456961-156456974CCGCCCCCCCCAC+7.82
Number of super-enhancer constituents: 81             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00337chr1:156457065-156458145Adipose_Nuclei
SE_00337chr1:156458785-156462158Adipose_Nuclei
SE_00902chr1:156454182-156455162Adrenal_Gland
SE_00902chr1:156456670-156457855Adrenal_Gland
SE_00902chr1:156457886-156465033Adrenal_Gland
SE_01624chr1:156458406-156465126Aorta
SE_02937chr1:156459147-156460802Bladder
SE_03183chr1:156456043-156465384Brain_Angular_Gyrus
SE_04141chr1:156455754-156476291Brain_Anterior_Caudate
SE_04925chr1:156442957-156476137Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05851chr1:156442823-156476598Brain_Hippocampus_Middle
SE_06826chr1:156452870-156455319Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_06826chr1:156455584-156476327Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07824chr1:156444206-156476920Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09328chr1:156448622-156455242CD14
SE_09328chr1:156455579-156476984CD14
SE_10496chr1:156456452-156464992CD19_Primary
SE_11165chr1:156449814-156479014CD20
SE_12168chr1:156456935-156461868CD3
SE_13485chr1:156456265-156458192CD34_Primary_RO01536
SE_13485chr1:156458238-156464737CD34_Primary_RO01536
SE_15064chr1:156456690-156463250CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16164chr1:156457379-156459814CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16728chr1:156457977-156460457CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17138chr1:156457236-156458338CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156458341-156459309CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156459405-156460421CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17525chr1:156454079-156455440CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17525chr1:156455508-156476948CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18052chr1:156455796-156465002CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18886chr1:156449989-156454873CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18886chr1:156455595-156466497CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19364chr1:156456364-156463048CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20186chr1:156455831-156464221CD56
SE_21124chr1:156457099-156461742CD8_Memory_7pool
SE_21730chr1:156458726-156460216CD8_Naive_7pool
SE_22205chr1:156457256-156460201CD8_Naive_8pool
SE_22473chr1:156453361-156455475CD8_primiary
SE_22473chr1:156455624-156476936CD8_primiary
SE_23670chr1:156458712-156461319Colon_Crypt_1
SE_24009chr1:156458815-156460139Colon_Crypt_2
SE_25163chr1:156458742-156460751Colon_Crypt_3
SE_25856chr1:156458944-156461980Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26648chr1:156457546-156463758Esophagus
SE_28187chr1:156458987-156460424Fetal_Intestine
SE_29274chr1:156458941-156460473Fetal_Intestine_Large
SE_29623chr1:156457659-156476054Fetal_Muscle
SE_31030chr1:156457385-156464605Fetal_Thymus
SE_31445chr1:156457284-156462277Gastric
SE_32703chr1:156456813-156464850GM12878
SE_33523chr1:156455889-156465173H2171
SE_37054chr1:156457835-156464275HSMMtube
SE_38176chr1:156459372-156461851HUVEC
SE_40614chr1:156444648-156455540Left_Ventricle
SE_40614chr1:156456530-156477045Left_Ventricle
SE_41764chr1:156458508-156459348LNCaP
SE_42136chr1:156456472-156476277Lung
SE_45962chr1:156459159-156461844Osteoblasts
SE_46671chr1:156458747-156461587Ovary
SE_48054chr1:156442802-156481304Psoas_Muscle
SE_48580chr1:156457242-156467895Right_Atrium
SE_49466chr1:156457509-156462281Right_Ventricle
SE_50090chr1:156456568-156476106Sigmoid_Colon
SE_51078chr1:156452559-156454976Skeletal_Muscle
SE_51078chr1:156456787-156481370Skeletal_Muscle
SE_51995chr1:156459182-156460267Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52473chr1:156456590-156465184Small_Intestine
SE_53429chr1:156457271-156464857Spleen
SE_54540chr1:156458123-156476924Stomach_Smooth_Muscle
SE_55197chr1:156458029-156461282Thymus
SE_58979chr1:156449810-156478804Ly3
SE_59740chr1:156457157-156478970Ly4
SE_60601chr1:156449917-156475935DHL6
SE_61299chr1:156450124-156478621HBL1
SE_61431chr1:156449469-156496609Toledo
SE_62421chr1:156450235-156479388Tonsil
SE_63341chr1:156457704-156475426NCI-H82
SE_63769chr1:156459121-156461353HSMM
SE_65297chr1:156454045-156455158Pancreatic_islets
SE_65297chr1:156456555-156461791Pancreatic_islets
SE_68350chr1:156458923-156476306TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr1156459000156459400
chr1156456600156457200
chr1156455896156455956
chr1156456267156456663
chr1156458442156458923
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I156482chr1156452419156455475
Enhancer Sequence
TCCTGGAAAG GGAGGGTCAT GAGAGGTCTC TGAGCCCCCA AAACCCCCAG CCCTGCTCCC 60
TGGGCACACA GGCCAGACTC ACAGCGCCCC TGTGAGAGGC TGGCAGCATC TGAGCTCCAC 120
CCTCAACATG AGGCAATGCT GTCTGCCTGA GGCAATGGTA TGCCACAGCC AGGCACAAGC 180
TGGAGCTCAC ACCAAGGCCC AGACTCTTTC CCCTCGGTCA CTGCTGTCCT CAGGCTCCAG 240
GACAGAGTAA ATGGACCTCC TGGCTTCCAA GGTCTGGGTC TCAGAGAATA TCCCATGGCC 300
CATTCTTCTC TCTAGAACCT GCTTGTACTA TAGACACCTG GGTGCTCCAG CTGCTCCTCT 360
GGCCTAGAAC TATGGTTCCC ATTCTGAAGC TTGGAGAAGA GACAACGCTG AGAGGACATC 420
TGCCCAGTCA GTGAACAACA AGCATGGTAT ACCTGGTGCC AGGATGGGAT GTCTCTGGTG 480
CCCCTGGCTC AAGAACATAC CAGAGCAGGT CTAGAGCAGT GGGCCTCATA CCGACTCATG 540
GAACTCTGGG GCCTGGAGTC CTGTAGTGGG GCTTGGGGTT GTAGCACCCA CATCTCCCTT 600
CAACTAGAGT TCCTCCACAC TAATCTGTTT TACTCAGTGA GCTTAAGCCT AAGGTTTCTT 660
TTTATTTTTA TAAGCCTAGT CAAGTGCAGT AGTGAGAAGA GAAGAAAGAG TAGAACAAGG 720
AGTTCGATCT GTAACTGACT GTGAACAATC AATTGAGCTA ACTCACTACC TTTGGACATG 780
CCCAGCCTAA GATTTTTGTT TGAGGAAAGA GTTGTGCTGC TTAAAACAAT GAAACCATTC 840
CTCTAGACCA GGAGATGGAA ATTTTTGGGC CAGATAGTAA TATTTCAGGC TTTGCAGACC 900
ATACAGTCTC TGTTGTAACT ACTCAACTCT GTCACTGTAC CATGAAAGCA ACAGACAGCA 960
ACACATAAAC GAATGAGTGT AAGCATGGCT GTGATCCAAT ACAACTATAT TTACAAAAAT 1020
GGGCATGGGC CAGATTTGGT CCACGGGCCA TAGTTTGCTG ATTCCTGCCC TAGAGGTATG 1080
GACCACATCT AGAACCCAAG CTCAGTCTAA GAGTAGTGCT TCCCAACCTT GTACATCTTG 1140
AAGCAGACAG AGAAAATACA GGAACAAATG ACATACACTG GGGAGGCCAC TGGCAGCCAG 1200
GCGGATGCAG GCACCAGGCA GAGAACCTGC TGTCTCAGGA CACCTGTAAC CCCCTCACAG 1260
CCCACTAGTT GAACAGCTCC ATGCTAAAGC CAGGATGAGA AACAGCCCCT GCACTGAACA 1320
ACTCCAGGAG GCACCATAGG ATAAGAGGGG GCTCAAGGAT GGCAGCACAG CCTGGGCCAG 1380
AAAAGGCGCA TTCTCTCCGG TATGGGCAGT GCCTACATAG GCTGGGTGAG TCCTTGGGGA 1440
CTGGAAGGGC CCAAGATGGG ACGGAGGCAC GGAATGACTT CAGGGCCCCC TCTAGCTCTG 1500
ATTCCAGGAG TCCTTGCATC AAAAGTGGAG CTTTCTGGAA GATGTTGGAA GAGGATAGTG 1560
AACTGGGGCC CATGCTTTCT AAAGCCACTC TATTTGGGTC CTGGGAGGAG CCTGGACCAG 1620
AGAAGGCCCG CCCTCCCCTC CAGAGCTCCC CTTCCATAGA GCCCCATGCC CAGAGACCCT 1680
ACTGTAGAGT CTAGGGATGT AGACCCCCAG CCACTGTCTG ATCCTCTGCA CCCACTGCAC 1740
ACTACCTGGG GAGAGGTGTT TGATGACAGA GAACAACTCT TACCCCTACC CCCCAGCTCC 1800
CACTGCCAAT GGCTGCTGAG TTTCCCTGGA GCCTTTCCAG CCCAACTCTA CATGGCCCCT 1860
ACGGTACCAC AGTAGATGCT AAAGTTCAGC CTTGGTCTCT TGCTCATGAG GGAAGGAGGA 1920
GAGGGAAGGC AAGGAATCTA TCAATTTGGG AGGAGCTGGG ATACTGGCCC CATCCCATTA 1980
CCAAGACTGC TCCCCAGCCT AGCTGGAGAG CTTCTGCTTT GCCTGGATAT CTACAGAAAA 2040
CAATGCAGAT AAATGCATTG CGCTTCAAAC GACTCCCTAC CCTTCTCCTT CTTCTTTTTT 2100
TTTTTTTTTT TTGGTGGTGG TTGTTGTTTT TTAAGATAGG GTCTTGCTCT GTTGTCCAGG 2160
CTGGAGTGTA CAAATCACAG CTCACTGCAG CTTCAACCTT CCAGCCTCAG CCTCCCAAGT 2220
AGATGAGAAT ACAGGTGTAT GCCACCACAC CCAGGTAATT TATTAATAAT TTCTTTTTTT 2280
TTTTTTTGGT AGATACAGGG TGTTGCTTTG TTGCTTAGGC TGGTTCAAAC TCCTGGGCTT 2340
AAGTGATCCT CCTACCTCGG CCTTCCAAGT AGCTGGGACC ATGAGTGTGT ACCACCATGC 2400
CAAGCTAATT TTTTTGACTT TTTTTTTCTT TTTTTTTGTG AGACAGAGTC TCACTCTGTC 2460
ACCCAGGCTG GAGTGCAGTG GCGTGATCTT GGCTCACCGC AACCTCTGCC TCCCGGGTTC 2520
AAGCGATTCT CCTGCCTCGG CCTCCCAAGT AGCTGGGATT ACAGGTGTCT GCCACCACAC 2580
CTGGCTAACT TTTGTATTTT CAGTACAGAC AGGATTTCAC CATGTTGGAC AGGTTGGTCT 2640
CGAACTCCTG ACCTTGTGAT CCACCCACCT CGACCTCGTG CTCCATGGGC CCTGGGCCTC 2700
CTACTGGTAC CCTGGGACAA GAGCAACACC AGCCCAGCCA GCCCTGAGTG GCCCAGCAGA 2760
CACCTGAGCC CCAAACCAGC TCCAGACACC CCATTCCTCA CCTGTGACCC CAGTGTCTGC 2820
CAAGTTCCCA TTGCAAAGGC TCCAGCCCAG GGATTTCAGC TCCCCTGCTT CCCAGTGCAA 2880
TCCAAAGACT GTGCTTTCTA GAGCTACAGT GGTGTGGGCT TTGGCAGGGA AGGTAGGGGA 2940
GGGCACACAG AGGGCAAGGG GAGGGGGCTA CAAATAGTTG GCTTTTTAAA TGGGATTCTC 3000
TGGCCTAGTC TTGAAAACCC AATCTAGACT GTTAAATGCA GGAACTGCTG AGCTCCTCTG 3060
GCTTACAGCA TCTACCCTCC CTCTCTCCCC TTTACTATCT CCCTCTCACC ACCTTTAGTT 3120
CATAACCGAA TTCTTGCAGA GATGTAACCT CTGTCAGCTG ATGACCAATA CTGCCTCTTC 3180
CTCCAAACTG GAAGAGAAGC CTCTCTTTGT TCTCATGACC CTCAGAAAAG TCATTCTTGC 3240
AGTCTTTCTA GCATTTATCA CAATTGTGAA TAACTATGAT TCTGTGCTTC TATTTAACGC 3300
CTGGCTCCTC TATGAGACTA AAGTTTCATG AGGGCAGGAA TCACATCTGT CTTTTTCACT 3360
ACTCTATCTC CTATAAGAAG GGAGCTGAGA AAATGTCTGT TGAAAAGAAG AAAATACTAT 3420
TTCATTGTTG TGGTGCTGTG AGAAGTCCTT CTTGCAGTCT AACCTCCAAC AGTCTTGCTG 3480
CAGTACCAGT TCCTCTCACT CTATCCTCTA TGGAGCTAGA ACCCTTGCTC TCCCAACTGC 3540
CCCTGAAGAT TTGGACACCA CCTACCCTCC AACCACCCCT GGTATCCCAG TCCTCAACCC 3600
TCCCCACCCT CAGGTTGGTT GGTGCAGAGG GTGAGACTCT AAAGTCTTCT AAGGAGCAGC 3660
CCTGAGCACA TGGAGATGGA GAGGATGGGG TTGCTTAGGC AACTGTCGCC TGGCAACCAG 3720
CTCCCTGGCT GATCTCCTAC ACCGCCCCCC CCACCCCCGC CTCATGCTGG GGGAGCTGGG 3780
ACGAGAGAGG GATCAGGGCT GAGAAGGCAG GGAAGCAACA GAGATTCACT GAGCATCGTC 3840
TGACAGAGAG AAGTCAGGGT TAAAAAGACT AGGCCCCATC TATCCCCACT CCCTACCAAG 3900
GTAGCCCAAA GCACTTTTTA TAATTCCATG CTTCCCAGGC CCCTTTCCCC ACTGCTGCTC 3960
CCACTTCTGT GCCAACACTG CCAGAGGAGG AGATGCCCCT GTCTTAGGCA GTCCTTCCTC 4020
CCATCTAACC ACAAACCCCT CTACAAAGCA GATGCAGTCT ATACTGACCT TTTTTCCTTC 4080
TGCTATCCAT TCCACATTGC TGCAGGGTCT TTGAAAGCCC TGAGGCAAGA ACATGAACTC 4140
AACCCTGATT TTGGAAGAAG GGGTAGCTGG GGCCTAGGCA GGCACAAAAT ACCCTAACCT 4200
GACCCTATCC AAGGTTTGGA GGCCTATCCT AGCTAAACTT CCCTCCTACC CAATTAGGGA 4260
GGTTTTAATG AACACCTGGA CCTCCTTAAT TAGCCCTCTG CCTAATTACC TAACCAACTG 4320
GCAGGAGCCA GAGGCCTGGG CATCTGTTCT CCAGATGTGA GTCTCTCCTC TCCAGCCTCA 4380
CCTGGCCCCA TTCTTCTCCT GTCTGGTCTA CTCCTCCTCT AGGAAGCCCT CGCAGATGAT 4440
CCGGCCCTTG GCTGCTTCTC TTCTAACCAT CTCTCCTTCA CCCTGCCTAG TATCTGGAGC 4500
CCAGGGCTTG GGAGGACTTG GGCTACCAAA GAGACAGGGG GTTGGCCAGG ATGGCCTTCC 4560
TGTTCTGATG GCCCCAGGGC CTGCCCAATC CTGACCTCAG GCCACAACTA TGACTCCTCG 4620
GGCTGACAGT ATCTATGTCA CCAAAAGTTC CCCTTCAAAG GCTCTCAAGG CTCTGGCTGA 4680
TTGACTCTGA TTCACCTGAC TCCGTGGACA GGACAAGGGT GGGGCGGAGT GAACCTTGTG 4740
GGTGGCAGGG GGTTGGGACA GGCAGAGGCA GGGCCTTCCT GGTGGACATG GGAGAAGCAA 4800
AGATGGGCAG GACATTTGGC AATGCCCACC CATATCTGTT CCCATCCTAG TGGTCCCAAG 4860
GCTCAAAGAA ACTACAGGGC ATCTGCTTTC AAAGCTCCCA TACCAGCACA GGTCAAAAGG 4920
GAGCAGATGC CCAGAGAGGG AAACAGGCAC AAACTCACCA ACTGTGGAGA AGGGTGGCTG 4980
AGGAGAAGCC TTCACAAATG GACAGCAGGG AGGATGCAGG GCAGGAGGCC CCTCTGACAA 5040
CACCCTTGAC AAAGAGAGCT GAGGGGACCA GGGGGAATCA AGAAGGACCC CACTGATAGC 5100
CATTTTTCCA ATCCCAGGTA CCGACCCAAT TAGAACTTGT GGGTTGTGTT TACATGCAAA 5160
TGAGCTACAC ATGATGTGCA AAATGTACCG TAAAGGAGGA CTGGTTTGGA GGGGGCATGG 5220
GAGAAGAAAC AGGTCCCTGC CTCCCCCAAT GCAACACCTC TGGGTACCTG AGCAATATTC 5280
AAACCATTCT CGGGTTTCAG AATGATGCTA TCTCAGTTCC TGTGTGAAGG TGGCCTGGGG 5340
CCAGTGGGGA GAGCGGTGAA GGGGAGAGGT CAGGGTAGCC TCCTTGCAGC TGCAGCAGGG 5400
CTGAGCAGGG CTGTCCTTCC CATGGAGCTG CAGGGGAATT CCTTTCCGAT AGCCAGCCTC 5460
TATCCTCTCT TTCTTGCTCT TGGCAGGGGA GTACCTACCT GTCCTTCTCC CCTACACCCT 5520
TCCACCCATA TCTGTTCCCA TCCTAGTGGT CCCAAGGCTC AAAGAAACTA CAGGGCATCT 5580
GCTTCCAGAG CTCCCATACC AGCACAGGTC AAAAGGGAGC AGATGCCCAG AGAAGCTGAG 5640
TGAGCAGCCT CGCATCACAG AGCAGTGGGC CTCAACCTGC TCTTCCTCAT GGTGAGAAAG 5700
GGAGCTCTCA TTAGGCAGGC CCTTCATCTC TTCCTCCCAG GCTGCTCCGG GCTGCAGGCT 5760
GAGGACTGGA GGGGAAGGCA GGAGGCGCTG GAGACAGCTG TCATCCCTCC TCCCGCCCCT 5820
TCCCTGTGGC TGGGCTGCAG GGCATGAAAT AAGCAGCAGG CGCTGGGGGA GGGGGTGACA 5880
ATCCAATCCA CCTGTCACCC CCACAGTCAG GCAGCCTCAA GCAGCCTGCT CACTAACGAG 5940
GGAGGAGGCG TGGGTGAGGC AGACACAGAA GAGGGTGGCA GAGGGGGGAC AGACACACAG 6000
ACACAGGAAA GATGACAGAG AAAAAGAGGC AGCGAGGCCA GAAGGCATTA TGGGGCAGAG 6060
GCAGAGACAG ATAAGGAGAG GGCTAGAGGA GAGGGAGAGG CAGGAGACCA CAGAGACAAA 6120
GATTCAGAGA GAAGCAGGTA GAGAACAAGA GACAGGTTCA ACAACGGCTT CCAGGACTGA 6180
CTCCTGGCCC AGCGCTGGGG GAATAACTCA ACAGGACACC ATCCCTGCCC TCTGAGAACT 6240
TGCAGTGCAG CCAAGAGACA GACAAGGGAG GGGCAGGTCC CACCCAGGGC AAGGGCAGGG 6300
AGAGGCAAGG GGGCCCTTGG GGGCCTGGAC TGGACCCAGA CACAGCCCCA GAAGGAGCAT 6360
CCCAGAGCAG GCAGGCCGGC CCTGAGAGGC AGCAGAGGTG AGGACCGAGG ACCAAGGACG 6420
ACAGCTGCCC AGCTGAATCC CCAGGCCCTG CCTTATTACC CAGTCTACCC TCAGGTTCAC 6480
AACCTTCCTA GTCATTCTCT CTTCCAACTT CAGCCCTGGG ACCTCCTCCC TAGTACAGAG 6540
ACACAGGCTA AGGAGCTCTG GGAGACAGGG CAGGAAGGTG AAGCCGGTGA TGCCCCCAAA 6600
CACCCAGGCA AGATGGTCCA GGATCATTCT GTGGTTCACA CAGTGAGCTC TTCCTTCACA 6660
AAAGAAGTGG GGGGCATTAC CCCTCCGAAG TCTGAGCCAA GGCAGGAGCC TCACATTGTC 6720
CCTCTCCCCA TCCCACACAC AGCCCAATTC TCACAACCCC TCCTGCGAGG CCTGCTCCCC 6780
ACGCCCCTAC TCCTGGGCCC CTCTCGGGTC TCCTTCTCAT GCTCCGTTCC CTCTGCCCCC 6840
TCTCTGTCCC CGCCCCCTCC CACAGCAGCC TCTTTTCTTC ACCCCAGAAG TGCTTCTAGG 6900
GTCTGATCTC AAAGGCAGAG ACCCAGCCCC AACCCTTCAA AGTTCTGTCT GGCAGGCTCA 6960
CTACCCAAAT CCCTGGTTCC CACCGTCTTT CCCTCCCTCG GGGACTCCCC TCCCCCAGTC 7020
CAGCAGCCTC AGGGCTGGGC AGGGGCTATT TTTAGCCTGG GCACTGAGCT AATTTTAACT 7080