EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS113-00198 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Keratinocyte 
Coordinate
chr1:8962250-8966380 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 24             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HES2MA0616.2chr1:8964607-8964617GGCACGTGCC+6.02
HES2MA0616.2chr1:8964607-8964617GGCACGTGCC-6.02
Lhx3MA0135.1chr1:8965058-8965071TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr1:8965073-8965086TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr1:8965061-8965074TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:8965065-8965078TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:8965069-8965082TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:8965062-8965075AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:8965066-8965079AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:8965070-8965083AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr1:8965059-8965069ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:8965063-8965073ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:8965067-8965077ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:8965071-8965081ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:8965059-8965069ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr1:8965063-8965073ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr1:8965067-8965077ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr1:8965071-8965081ATTAATTAAT-6.02
TFAP2AMA0003.3chr1:8964140-8964151TGCCTGAGGCA-6.02
ZNF263MA0528.1chr1:8964466-8964487TCCTCTCCTTTCCTCTCCTCA-6.14
ZNF263MA0528.1chr1:8964456-8964477CCCTCCCCTCTCCTCTCCTTT-6.33
ZNF263MA0528.1chr1:8964444-8964465TCCCCTCTCCTCCCCTCCCCT-6.49
ZNF263MA0528.1chr1:8964451-8964472TCCTCCCCTCCCCTCTCCTCT-7.48
ZfxMA0146.2chr1:8962319-8962333CCCGCCTCGGCCTG+6.62
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_27088chr1:8962399-8963262Esophagus
SE_27088chr1:8963489-8964684Esophagus
SE_27088chr1:8965237-8966346Esophagus
SE_34103chr1:8962245-8964866HCC1954
SE_34103chr1:8965610-8966423HCC1954
SE_34433chr1:8962184-8964511HCT-116
SE_34916chr1:8962041-8965067HeLa
SE_34916chr1:8965216-8966534HeLa
SE_36553chr1:8962470-8964537HMEC
SE_36553chr1:8965481-8966338HMEC
SE_42834chr1:8963483-8964807Lung
SE_46612chr1:8962243-8964865Osteoblasts
SE_46612chr1:8965500-8966434Osteoblasts
SE_47312chr1:8961358-8966536Panc1
SE_56056chr1:8962341-8965238u87
SE_67633chr1:8962341-8965238u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr189623718964927
chr189640538964236
chr189653378966372
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I008902chr189624608964905
GH01I008905chr189655548966260
Enhancer Sequence
TTTTTAGTAT AGATGGGGTT TCACCATGTT GACCAGGCTG GTATCGAACT CCTGACCTCA 60
GGTAATCCAC CCGCCTCGGC CTGCCAAAGT GCTGGGATTA CAGGCATGAG CCACTGCACC 120
CGGCCTTAAT ACATTTTTGT TGAATGGATG AAGTGCTTCT CCATAAGGGA TGTTTGGGTT 180
CAATTTTCTG GCTCCCACAA ACCCACCTTC TGAGTCTCAG ACCCTCTCCT TGTCCATACC 240
TGTCCATGCG GAGATAGGCG GTGTGGTGTT ACGATAGATA CATACTGGTT TGCATCTGCA 300
GATCCCCGTT CCTAACTCCC ACAGTCCTGT GATAATGTTG GGGCACTTGA GGCCTCAGGA 360
AACAGAACCT CTCCTCTGAA CTTCTCCTGT TCCTCTTTCA CCTGTCCAAC CAGGATTCTA 420
ATCTGATGTG GGTCCAAAGA CCTTCATTCC AGAGAGGGTC CTGCCCCATA CCCTAGAGCA 480
AGACTGTTCA GCCCACCGTC CAGGATGGCT TTGAATGCAG CCCAACACAA ATTCATAAAC 540
TTTCTTAAAA CATTATGAGA TTGTTTCACA ATTTTTTTTT AAAGATCATC AGCTATCATT 600
AGTGCTAGAG TATTTTATAT GTAGCCCAAG ACAATTCTTC TTGTTCCAAT GTGGCCCAGG 660
AAGTCAAAAG ATTGGTCAGC CCTGCCCTAG AGGAAGGAAT GCTGAGAGAG AGGCCAAGAA 720
AAGTCTGAAC AGACAGGCCT TGCCGGGGGT TTAGATCATG AGATTTTTGT CCAATCACAT 780
TTCTACACGG TTATCAGTCG TGCCCATGTA ATGAAGCCTC CATAAAAAAG CCACGAGGAC 840
TGGGTTTGGA GAGGTTCTGG ATGGCTGAAT ACGTGGAGGT TCCTGGAGGG TGGTGAGACC 900
CAGGAGAGCA TGGAAGCTCT GCTTCCCCTA AACTCCACCC TATGCATGGC TTCATCTGTA 960
TCCCTTGTGA ATCCTTTATA ATAAACCACT AAACATAAGT AAGTGTTTTC TTGAGTTCTG 1020
TGAGCCATTC CAACATATTA ATCAAACCCA GGCTGGGCAT CGTGCCTCAT ACCTGTAATT 1080
CTAGCACTTT GGCAGGCCAA GGCGGGTGGA TTACTTGAGG TCAGGTGTTC GAGACCAGCC 1140
TGGCCAACAT GGTGAAACCC CGTCTCTACT AAAAATACAA AAATTAGCCG GACATGGTGA 1200
CTCACACCTG TAATCCCAGC TACTCAGGAG GCTGAGGCAG GAGAATCGCT TGAACCCGGG 1260
AGGCGGAGGT TGCAGTGAGC CGAGATCCCG CAACTGCACT CCAGCCTGGG AGACAGAGTG 1320
AGACTCCGTC AAAAACAAAA AAACAAAAAG CAAACAAACA AAAAAACAAA CCCAAAGAGG 1380
GGGTCATGGG AACCCCAAAT TGAAGCCAGT GACTCAGAAG TTCCAGAGGC TCAGACTTGT 1440
GACTAGCATT GGGGGAGATA GTCTTGCAGA CTGAGTTCTC AAGCCCTGGG ATGTGATGCC 1500
ATCTCCAGGT AGATAGTGTT GAAATTGAAT TGCAGGACAC CCAGCTGGTG TCCACCCCCA 1560
CACATTTGGT CACAGAAGTC TTCTTCTGTG TTGACTGTTG TGGTGTGAGA GTAGAGGAAA 1620
AATGCAGTTT GGATAGAGTT TTTTTCTGAC ACAGGTGGTG ATCTTCAGGA ACCCACCTGC 1680
ACCTGTGAGA TTCTGAAGAC GTGGACCCAG CCTTCACAGG CATCCAAGTT ACCTTCCCCA 1740
TGAGGACTTG TTTTACAGAT CACAAAAGAC ATCTGCACTT TGTATGGCTC CAGCAGGATC 1800
TCTCTGATCT GTGAGGATTA ATGAGCCAGC CACATCTCTC CCCAGCTTCC TGGACCAATG 1860
GCGCAAACCT AGTTCAGAAA CCCAGCAAGT TGCCTGAGGC ATTAGCCAGG CATCCGTGGT 1920
ATGCAAGTTT TGGCACTGGT TTGCTGTTTG GATGTTTTTC TCCTTCAGGC GGAAATTTAC 1980
AAAGCACTCA TGCTCCAACT ACCATGGCAG AGAGAGGAGG TGAAGCAAAT TGTAAAAACT 2040
TCAACCTCAG TATTGAGTTT CTCCTTGACT TGTGTTGAAG CCAATGATGG CAAGGGATGT 2100
GGATAACCTG GATGTTTTCT CTTGGGATCC ACCCTCTCAC AGGTGTTCCT CTGAGCACTT 2160
TGCAGGATGA GAAGTTGAAT AGGGAGGGGA GAGGTCCCCT CTCCTCCCCT CCCCTCTCCT 2220
CTCCTTTCCT CTCCTCACAG GGTCTCGCTC TGTTGCCCAG GCTGGAGTGC AGTGGTGTGA 2280
TCTTGGCTCA CTGCAACCTC CACCTCCTGG GCTCAAGCAA TCCTCTCACC TTAGCCTTCT 2340
GAGGAGCTGG GACTACAGGC ACGTGCCACT ATACATGGCT AATTTTTATA TTTTTTTTTG 2400
GTAGAGACGG AGTTTTGCCA TGTTGTCCAG GCTGGTCTTC AACTCCTGGG CTCAAGCAAT 2460
CTGTCTACTT CGGCCTTACA AAGTGGGTGC TGATTTCTCT GCAGCTTATG GACACACCAT 2520
AAGCTGGGGG CACCCATGGA AGTGCTTTAG CTTGTAATCT CCATCAACAT CTCCCACAAG 2580
ACACCTCCCC AAACTTGATC TGGTTTGGGG AGTCACTGCT GTCTGGAGGA AAACATCTCT 2640
AATTTAGCCC TCGAGATTAC ACATATTAAG TTCAACTAAG TACGAACTCA AGGTATATTA 2700
AATACAATTT CCAAACACAC CAGCCATCAT GAGTGAGAAT CAGCAGAAAC TATGAATGAC 2760
AGACTTAGGC CATCTCAGGT TTTTGGAGTG ATCAGATACA GATTATTTTA TTAATTAATT 2820
AATTAATTAA TTATTTTTGA GATGGAGTCT CTGTTGCCCA GGCTGGAGTG CAGTGGCATG 2880
ATCTTGGCTC ACTGAAACCT CTGCGATTCT CCTGCCTCAG CCTCCCAAGT AGCTGGGATT 2940
ACAGGCGTGC AACACCATGC CCGGCTAATT TTTGTATTTT TAGTTGAGAT GGGGTTTTGC 3000
CATGTTAGCC AGGCTGGTCT CGAACCCCTG ACCTCAGATG ATCCACCTGC CTTGGCCTTC 3060
CAAAGTGCTG GGGTTGCAGG CATGAGCCAT CCCGCCTGGC CAGATACAGA TTATTAAGCA 3120
TAGAGTTGTA AGGCAAGCGT TCTGGGTCTT TCTCTTTCTC TGTCTCTCTC TCTTTCTTTT 3180
TTTCTCTCTT TTTCTTTCTT TCTTCTTTTG AGACGGAGTC TTGTTCTGTT GCCCAGGCTG 3240
GAGTGCAGTG CCACGATTCA GGCTCACTGC AACCTTCACC TCCTGGGTTC AAGTGATTCT 3300
CCCACCTCAG CCTCTCGAGT AGCTGGGATT ACAGGCACCC ACCACCACCC CCAGCTAATT 3360
TTTGTATTTT TAGTAGAAAC AGTGTTTCAC CATGTTGGCC AGGCTGGTCT CAAACTCCTG 3420
ACCTCAAGTG ATCCACCCAC CTCAGCCTCC TAAAGTGCTT GGGATTACAG GCGTGAGCCA 3480
CTGCGCCCCG CCCTGGGTGT CTGTTTCGAT CTTGCTGCTC CTCTGAGCCT CCTATACAAA 3540
GATTCTGGCG CTACTGCACG CCCTGTGTTT GTGTCCTCTA TGTTAAAGTT CTTTTTCCTG 3600
GCTAATGTGG TCCAGACATG TTGGAAGGGA TTCTAAAGTA ACAATCCTGT GACCACGTGA 3660
CTGTGAGAAG AATTCTTTTC TAAAGAAAAG GATCTTCATC ACATACCGAC CCATCTCTTT 3720
CACTACCTTT AATACCACCT CAGATATCTC TCTTTTCATT TCCTGCAGCC CTTATTGCTT 3780
CCGTGGTGTT AGGCCCCTTG GCATTTTGTC ATATTTGTTT TTTTCCATTT TGTAGCTGAC 3840
TGTCTCACCA GTCACTCCTG TCTGGAGGAA AACATTCCCA GTTTAGCCCT TGAGATTACA 3900
CTTATTAAGT TCAACAAAGC ACAGCCTCAT GATACATAAT TTCCAAACAC ACAAGGAAGC 3960
CAGCCATGAT GAATGAGAAA CTATGAACAA CAGACTTAGG CCTCTTTAGG ATTTTGGAGA 4020
AATCAGATAC AGATTATTAA ATAACTACTC ATGGATTTTT TTTTGGGTGG GGCGGTGCTG 4080
CTTTTTGATT TCTTTCTTTT TTTTTTTTTT TGAGATGGAG TCTTGCTCTG 4130