EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS104-01274 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HUVEC 
Coordinate
chr1:32395910-32399640 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:32399375-32399386TCCTTATCTGT+6.14
HOXA13MA0650.2chr1:32398515-32398526GCCAATAAAAC+6.14
NEUROG2MA0669.1chr1:32396271-32396281GACATATGTT-6.02
NFAT5MA0606.1chr1:32397502-32397512AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr1:32397502-32397512AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr1:32397502-32397512AATGGAAAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr1:32398521-32398532AAAACAAAGGA+6.32
STAT1MA0137.3chr1:32398195-32398206TTTCTGGGAAA+6.02
STAT3MA0144.2chr1:32398195-32398206TTTCTGGGAAA+6.32
Sox3MA0514.1chr1:32398521-32398531AAAACAAAGG-6.02
ZNF263MA0528.1chr1:32396594-32396615TCTTTCTCGTCCTCTTCCTCC-6.77
Number of super-enhancer constituents: 47             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00185chr1:32393819-32406495Adipose_Nuclei
SE_05505chr1:32395719-32399006Brain_Cingulate_Gyrus
SE_09496chr1:32393936-32406601CD14
SE_11611chr1:32389155-32406399CD20
SE_12303chr1:32395841-32397537CD3
SE_12303chr1:32398033-32399346CD3
SE_13610chr1:32396144-32399253CD34_Primary_RO01536
SE_14567chr1:32391765-32406526CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18176chr1:32389348-32406796CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18474chr1:32389295-32406605CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19618chr1:32393839-32406027CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20913chr1:32395596-32406593CD8_Memory_7pool
SE_22706chr1:32386302-32406312CD8_primiary
SE_25437chr1:32389224-32406301DND41
SE_26248chr1:32395890-32398987Duodenum_Smooth_Muscle
SE_28018chr1:32396596-32397745Fetal_Intestine
SE_28018chr1:32397803-32398809Fetal_Intestine
SE_29138chr1:32396441-32397611Fetal_Intestine_Large
SE_29138chr1:32397870-32398834Fetal_Intestine_Large
SE_30289chr1:32396325-32398903Fetal_Muscle
SE_31027chr1:32389104-32406257Fetal_Thymus
SE_31788chr1:32398167-32398970Gastric
SE_32591chr1:32393840-32406260GM12878
SE_34675chr1:32396340-32399347HeLa
SE_37823chr1:32396136-32397795HSMMtube
SE_38810chr1:32395795-32399591HUVEC
SE_39509chr1:32395916-32399693Jurkat
SE_39960chr1:32397903-32398957K562
SE_41137chr1:32397920-32398822Left_Ventricle
SE_42547chr1:32397971-32398838Lung
SE_45230chr1:32398018-32398642NHLF
SE_46136chr1:32395907-32399245Osteoblasts
SE_47391chr1:32395979-32411585Panc1
SE_49021chr1:32398137-32398708Right_Atrium
SE_50456chr1:32396381-32397236Sigmoid_Colon
SE_50456chr1:32398155-32398819Sigmoid_Colon
SE_51637chr1:32393841-32406302Skeletal_Muscle
SE_52642chr1:32396418-32397052Small_Intestine
SE_52642chr1:32398025-32398797Small_Intestine
SE_53748chr1:32396630-32397421Spleen
SE_53748chr1:32397996-32398978Spleen
SE_55181chr1:32398001-32399348Thymus
SE_56686chr1:32396402-32398915u87
SE_59623chr1:32331606-32430327Ly4
SE_62431chr1:32376082-32428121Tonsil
SE_64663chr1:32396802-32398695NHEK
SE_66311chr1:32395916-32399693Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr13239916132399464
chr13239880032399019
chr13239636132396900
chr13239599632398600
Enhancer Sequence
AACCTGGGCG ACAGTGAGAC TCCATCTCAA AAAAAAAATA AAAAATACCA TATCTCAGAA 60
CTTAGTAGTT TATGGGTCAA CTTAACTCTT TTCATTTCCC CATTTTGTCA AATGTATTGA 120
GCGTATTTAA AGGTCCTGTT CCAGTATTAA TCCCCAAAGA GAGTGAGGGA AACTCTCTAT 180
GGACAAGACA CAGAATAAAA ACATCCCAAA ATACATCTTG TCAACATAAA TTATTTTGTT 240
TGAGCCCCAG AAATGTTTCT GCTGTTCAGG CACTCTGATC CAAGTTTCCC CTATAACTGG 300
GTAAGTTACA CTTCACTTCC TCTCCTAAAC TTGCTTTTTA TAAATTACAT TATAGTTCAC 360
AGACATATGT TTGTGTACTG AGTACAATAC AAGATAAACA GTCAAGAATC CAAATCATTC 420
TATTTGAAGC TGCTGGTGGC CTTTTAAAAT GTACTGTCTA TCCACTAATT GTCCAATAAT 480
GGCATCCTTT CACAAAACAC AGTAACATTA CGATCTTTAA AAACCACACA GTGAAAGTAA 540
ATATTTCATA CTACATATTA ACGTGAAATA AAAATGGTGA AATAACTCTA TAATGCCATG 600
TCAAGAAGTT ATTCTTTACT CACTAGCTCA GCTCAACATG GATTCACCTT CCTTTTCTTC 660
CCAATTAAAG AATGCAAAAT TCAATCTTTC TCGTCCTCTT CCTCCAAATG TTTACTGAGA 720
TAAGGGACAA TATGTCACCT CCCAATTATA CCAAAATGCA GCACAGCCAA TCTTCAAACA 780
AGCATTTGCA GAGACGTGTG CACATCATAC AAACACTATC CAGGATCAAG CTCCTAGAAG 840
AATCAACGTG GGTGAAAAAT GCTTGATTGG TATTAAGTTT TCATATTACC ACCACAAATT 900
TTAAAGATAC AAAGTAAGCG TGAGAAGAAT GGAGTAGGAT TAAGACTTCT GAAGAAAGGT 960
AAAACTTTTA TAATAGAAAA CTGGTAGAAA CAGTGAAGGA ACCATGGTAG TGTGACTTGA 1020
GAAAGGTGCT TAGTCTTTGG TTAGATAACT CTGGAGAAGC CTTGACCGGG CTGAGAATTT 1080
CAGACCAATT CAAATGCAAT AAAAGCTCTT AGGAATTTCA AAGCAGAGTA GTGGTAAGAG 1140
AGCAACTCTT TGCTCACTGA GAAAAAGAGC AAATATTGCC ATATTTATGG GCCTCCCCTG 1200
ATCTACTGAG CAAGCAGCTC CGTAATTACC AAAAAGCTTA ACAAAAATTT TCTTTCAACT 1260
TACTAAATCA TAGTCAACAG ATAACGAGTT TAACTAAATT CTACCTGTTG ATGACCTCCA 1320
AATGAAGATC CAATCTAAGA AAACAATTGA GAATATAGCC TGTGACTTAT ATTTAAAGTA 1380
CTTTTCACCC AGAAAGACCC AATTTGCATA ATTTAAACTA ATCACCAAAG GAAACTTGTT 1440
TGTAACCACA CATGTGGAAT GAAAATAATG TCACTAGAAT CTATTGTTTC TCCATCATAT 1500
CCTTCTCTAT TTGCTGACAA ATCCTGCTGG TGACTCATAT CCTTCTGCAC TAACCAGTCA 1560
CTCCATCCCC TAATGAAAGG CTTTTCACCA ATAATGGAAA ATACAATACA CAACAATTTG 1620
TTCTGCTACT AAAAACAACA AATATCAACA TTTGTATATA AATCCAATTT ACAAATACTG 1680
TGGTGATACA ACCTAGTGAA TGTTTCCTGT AAAACGGTGG GGAAAATAAA AAGTTGGTCA 1740
AATTTAAACA AAAACTAAAG GACAACTGGA AGAAAACAGA CCTGATTGTG AATTTGAATT 1800
CCTGTCAAAC AATACATTAG TTAACAGCCA ACATATCTGG CCACTGCAGA AATAAAAATA 1860
TAAAGTAATT TATCTGATCT GCTAAAACAA ATATATCATG TGTACATTTT ATGCCAAAAG 1920
AATTAATGTC TTGAGAAGAC TAAAAGTTCA AATAAAAAAT ACTATGAGAG GAATTAAATG 1980
CACCACTTCT CTAAAGGTAA AGACTGTTCT AAATGTTCAA AATATTTTTT CAAACCAGGC 2040
TCAACTAGCA AAGAAAGGGT CACAAAAAAG CCTAATCTTA AAATTCTCAA GAATTTAAAA 2100
AGCCAACATT GTGTAAGGTA AATTTATATT CAAATGATGA AATTTAGTTT AGGCCACTTA 2160
AAATGAAGTG GATGCTGTGT TAACATAACC TGTGGGCAAG AAAATCAGTA TAGGCAAACA 2220
AAAACCGTCT ACATTCAAGT CACATAAAAA ATATCTGTAT AATCTGTCAA CTCCTCACAG 2280
TCATTTTTCT GGGAAAGATT TCTGTGTCCT GTAAATCTAC ACTGACTGAA CAAACAGTGC 2340
AGGAAACGAG TCATTCTCTC ACCTAAGTCC TGGTAACTCC ACAATGGGGA ACTGTGGAAA 2400
GCAGACAGCT AGTATTGCTG TGCAGCTTCT TTCATGGAGG TGCTAGGGTA GTGACAGTTT 2460
CTGGTTGAGC CTAGACCTCT ACCACTCCAA AGAGCAAAAA GATTTTCACA CAATATGCAC 2520
TTCAGCTCTA CACTAAGCAA CCTAAAAGGC TTCAAGTGCC AAGACAGTGG CCAGGGAGTC 2580
AAGGGAGCCC ATAGAATGAG GTTCAGCCAA TAAAACAAAG GATAATGAGA GAAAGCTAAC 2640
TGACACCTCT ATACGTAGTT AATAGTTCAA AAGATGAAAA TGGTGAAAAG ATTTTTTCTT 2700
TTTTTTTTTT GAGACAGGGT CTCCCTCTGT CTCCCAGGCT AGACTGCAGT GGCATAGTCT 2760
CGGCTCACTT CAGCCTTGAC CTCCCAGGCT CCAGTGATCC TTCCACTTCA GCCTCCTGAG 2820
TAGCTGGAAC TACAGGTTCA TACCACTATG CCTGGCTAGT TTTTGTATTT TTTGTAGAGA 2880
TGTTGTCTCT ATGTTGCCCA GGCTGGTCTC GAACTCCTGG CCTCAAGTGA TCCTCCCGTG 2940
TCTGCCTCCC AGAATGAGCC ACTGTGCCTA GCCAAGACTT TTCTAATATT TCACAGATTA 3000
AGAGACTCAA ATCACCATCT CCCAAAGTAA TTATAACTGG TGGTATCCAC TGTTCAACAG 3060
AGATTTAAGT ACTTTAAGCC CCTAAAAGGA AAAAAAAAAT TATTCACTGC TATCTATTTA 3120
TTGATAATCT TTAACTTAGA TTCTAAAACC TGGGATTTAA TAATCAAATC CCAGTACTTT 3180
GGGAGGCTGA GGCCAGCAAC TCAACGCCTG AGCTCAGGGG TTCGGGACCA GCCTGGGCAA 3240
CATAGCGAAA CCCTGTCTCT ACTAAAAATA CAAAAATTAG CTGGGCGTGG TGGCGCACGC 3300
CTATAATACC AGCTGAGGCA GGACAATCGC TTAAACCTAG GAGGTGGAGG CTGCAGTGAG 3360
CTGAGGTTGC ACCACTGCAC TCCAGCCTGG GCAACAGAGT AAGACTCTGT CTGGAAGAAA 3420
ACAAAATAAA ACAAAACCCA ACAACAATCA ATCTATAAAT AAATTTCCTT ATCTGTAAAG 3480
CTAAAAGAAT ACTACTTACA GGATTATTGA GTTTCAAATG AGACAATACA TGATTTGGCG 3540
TAAGAAAGGA ATGTGGAAAC CTAAACCCTG AAAGGGTAAT ATTGAACTTT ACCAGTACCC 3600
CAAGATCTCT ACCATCACCC TATTCGATAA ACATAACTAA GTCCACCATG TTAAAACTAT 3660
GGATCCTGGG CCGCGCGGTG GCTCATGCCT GTAATCCCTG CACTTTGGGA GGCCGAGGCA 3720
GGTAGATCAC 3730