EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-03722 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr1:205252800-205255350 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MyogMA0500.1chr1:205254178-205254189GACAGCTGCAG+6.62
TFAP4MA0691.1chr1:205252821-205252831ATCAGCTGTT-6.02
Tcf12MA0521.1chr1:205254178-205254189GACAGCTGCAG+6.14
ZEB1MA0103.3chr1:205253262-205253273CCCACCTGCCC+6.14
Number of super-enhancer constituents: 31             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02431chr1:205253201-205255000Astrocytes
SE_03194chr1:205253181-205253866Brain_Angular_Gyrus
SE_03194chr1:205253899-205254801Brain_Angular_Gyrus
SE_03963chr1:205252695-205257315Brain_Anterior_Caudate
SE_04837chr1:205252438-205255709Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05801chr1:205252449-205257899Brain_Hippocampus_Middle
SE_06736chr1:205252450-205256085Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07799chr1:205252396-205255918Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_11085chr1:205251353-205259013CD20
SE_26974chr1:205252457-205257684Esophagus
SE_29391chr1:205253543-205255044Fetal_Intestine_Large
SE_32765chr1:205252644-205254723H1
SE_38936chr1:205252877-205255818IMR90
SE_43852chr1:205252499-205258684MM1S
SE_46173chr1:205253006-205257823Osteoblasts
SE_50327chr1:205252697-205257801Sigmoid_Colon
SE_52983chr1:205252823-205257708Small_Intestine
SE_54130chr1:205252675-205258056Spleen
SE_55645chr1:205253025-205256564Thymus
SE_56704chr1:205252917-205256555u87
SE_56879chr1:205252970-205254378VACO_400
SE_58462chr1:205242169-205295027Ly1
SE_58967chr1:205242236-205295022Ly3
SE_60263chr1:205242326-205284722Ly4
SE_60576chr1:205242267-205294889DHL6
SE_61365chr1:205242037-205294994HBL1
SE_61423chr1:205183427-205322469Toledo
SE_62465chr1:205242393-205294944Tonsil
SE_65493chr1:205252784-205254787Pancreatic_islets
SE_67308chr1:205252499-205258684MM1S
SE_68815chr1:205252846-205254572H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1205254805205255191
chr1205253892205254222
chr1205252845205255229
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I205283chr1205252730205258354
Enhancer Sequence
AGGTCAGAGT TTGTCTTTTG TATCAGCTGT TTTTCAAGTG AGAGTAACCC TTATGCTGAA 60
ATGGCATATT TTGGTGTGGC ATATTCTGTC CCTCTTCAAA GATACATGAG ACGACATATG 120
CAAAGCATTT TGCATTGTAA GATGCTTATT ACTGTCACTT CACAGATGGG AAATGAGATC 180
TAGGCAACTC TCAGGGTCCA GCCACCAGAA GGTTGAGGAA TGCGGGCTCT AACCTACATC 240
TGTCGACTCC AAAGCCACAC AGCCGCCCAC ACAAGGTAGC TCTTTTCCTC ACCTCACCCC 300
CTGAGCTCTG GAACACCTTT GTTCTGCCCA AACGAGAATG AAGCAGCAAC GGAGGCAGCG 360
GCAGGGGAAC TGTAAGGTGG CCCCAAACTC AGACTGTCCC CAAGTTGGAG GCCTGCTAGG 420
GCCTGGGAGC ACAGCAGTCC CCCACCAGGG AGTCTTCCCT TCCCCACCTG CCCACTGCAG 480
ACTGGGCACC CCTGCTGCAT GTGTCTGACC TCTGTGAACC TCAGTTTCCC CAACATACAA 540
TAACCCTGAC AGTCTGTCAT TCTGTGCTTC TGTGACGTCA GCCTTAGGAG TTATCAGGGA 600
CCCAAACTTG GGCTTCACAG GGGGCAGGAT GGAGGCCCTG CCACTCGGAC CAGACCAGGT 660
TGTGGTGAGG GGCAAGGGTG GTGCCTCCAG GCACCAATCC AGAGTGACCT CACTCTCTGC 720
AGGCTCCCCT GGGGCCCTGA GGGAGGGTGG GGTGCTGGAC AGGCCTGCTA GATGGGAGCA 780
GGTTTGGAAG GAGGTTTAGG AAGGGTGCGG TGGGGAAGGT GTGCCGCTCA GGTTCAGTGT 840
GATCACTAGA GAGGGGCACG CCTGCCTGCA TCGTCTGCCA TGCCAGACAG GGCAGGACAG 900
CTTCTCCCCC AGCCTGGGCC TTTAGGATCC ACTGTGTGAC CATCCTGAGC CCCTTAGCAA 960
GGTGTGAGCG GGGTTGGACA CCCTCCCCTC AACATCCATC TAATGTCAGC CACCAGCCCT 1020
GCCTTGCTGC ATGATGGGAA ATCAGGGTAA GGGAGCCAAA CCCCAGCTGC TCTCAGAGCT 1080
GTGAGGACAA GAGTGGAAAA CCTGCCCTCA CAGGCCCAGC TGGCCAGAGG GCTTGTCTCT 1140
TTCAGTCGCC CTCCCCCAGA GGGAGCAGGA GCAGACAATG GCCACCATGA CTCACCAGTG 1200
AGCCATCTTC CCCTCCCCAC CCCTCCAGCC TGGCCCATGA CAGCTTAGCT TGTCCTCCAA 1260
GGGAGCTGCA GCCCAGCCTC CCAGGGCCGC CAGCTTCCTC TCTCTTCACC CAACCTGGCT 1320
CCCCCCCTGC TTGTGCAACA CCACATCAGA GGGTTGTGAA GTGGAGAGGG AGGAGTTTGA 1380
CAGCTGCAGA CCCAGGCAGA CAGAGCAGAC TCCTTTGTGA AGGAGATAGA GGCTGCAGGG 1440
GCCCAAGTCC AGCCTGTACT CCCCTGCCCT GACCCACAAG GCATCACCCA GTCTCCCCAA 1500
ACCCTAGGGA AGTGGTCATT GTCATTTATT TGTTCCTTTC TTAGATAGAG CTTGGATCCT 1560
GTCTGCAATT TATTCCTTCC TGCAAAACCA AGTATGTGAG GCAGAGGAAA GTCCTATTCC 1620
ATTCCAGGAG GGACAGGGCT CCCTGTTGGA AAGTATTTCC TTTTGCTAAG TTTCTATCTG 1680
CCTCCCGGGT AGACTCCACT AGGCAGTATT TCAAGAAGTT AACGCACTTC CAATCCCCAT 1740
CTAACCTATA TTCTTTGCCG CAAGCCAAAT ACCCTTAGTT CTTTCAGTCA TTTCTCCTAA 1800
GACATGGATT TAAGACCTTT TGACAGCTTG GCCTGTATCC TCTGGAAACA TTTCCATTTA 1860
CCCAAGTTCT TCTTAAAACA TTATGTCTTT GTCCAGGTGC AGTGGCTCAC GCCTGTAATC 1920
TCAAAGTGGA GGCTGAGGGA GGAGCATCAG TTGGGTCCAG GAGTTTGAGA TCAGCCTGGG 1980
CAAGATGACA AGACCCCATC TCTAGTTAAA AAAAAAAAAA AAAATTACTG ATTCTCACCA 2040
AAAAAAAAAA AAAAGCCAGG CGTGAAGACA TGGGCCACCT ACTTGGGAGG CTGAGGTGGG 2100
AAGATCGCTT GAGCCTGGGA GATCAAGGCT CTTGAGCCTG GGAGATCAAG GCTGCAGTGA 2160
GCTGTGATCA CGCCACTGTA CTCTAGCCTA CGCGACAGAG TGAGACTCCA TCTCTAAAAA 2220
AACGAAACTA ACCAACCAAA AAAAAAAAAA AACCACAAAA AGCATGTTGT TTTGAACAGA 2280
GCGCAGTGCT CCAGCTAAGG TCAGGCCAGC ACAGAGGGTG CTAATGAAAT TCACCTCGCA 2340
GGCTCTGGCA CTGTGGTTCT CATGAGCTCT GTTAGCTTGC CGGTATTTTC AGACCCACAT 2400
AGGCATGTCC TTGTTGAGCA GGTCACTTCG GTTCATGAAT ACGGCCACCA AGGATTTGAG 2460
GCCCCTCTGC CTGCCCCCCA TGGAGGGAGC CCTAGGGCTC AGATGGTGGC TCTTAACAGA 2520
CCTCAATGGT CTGATGAAAA CTCTGCATCC 2550