EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-02446 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr1:120560620-120563140 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs372562666chr1120561314hg19
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF2MA0051.1chr1:120562394-120562412GTTTTCCTATCACTTTCC-6.44
JUN(var.2)MA0489.1chr1:120561770-120561784AGAAAATGAGTCAC+6.06
JUN(var.2)MA0489.1chr1:120561775-120561789ATGAGTCACTTTTT-6.86
Nkx3-2MA0122.3chr1:120561555-120561568TCAACCACTTAAA+6.24
Nr5a2MA0505.1chr1:120561831-120561846AAATTCAAGGCCATG+6.18
ZNF263MA0528.1chr1:120562867-120562888CCCTTCCTCTCACCCTTCTCC-6.39
Number of super-enhancer constituents: 20             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00001chr1:120545720-120570355Adipose_Nuclei
SE_03065chr1:120560868-120562770Bladder
SE_03434chr1:120554599-120564678Brain_Angular_Gyrus
SE_03980chr1:120549079-120570221Brain_Anterior_Caudate
SE_07385chr1:120548934-120569847Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08816chr1:120560737-120563322Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09137chr1:120545789-120570232CD14
SE_12867chr1:120560851-120563850CD34_Primary_RO01480
SE_13322chr1:120545914-120570095CD34_Primary_RO01536
SE_14057chr1:120546042-120569730CD34_Primary_RO01549
SE_18945chr1:120550673-120570213CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_29608chr1:120554644-120561087Fetal_Muscle
SE_36951chr1:120560204-120563380HSMMtube
SE_41312chr1:120555136-120563468Left_Ventricle
SE_42341chr1:120556611-120563456Lung
SE_43397chr1:120554561-120565886MCF-7
SE_45586chr1:120545832-120570231Osteoblasts
SE_46953chr1:120561329-120563259Ovary
SE_49875chr1:120554642-120565868RPMI-8402
SE_53396chr1:120556680-120563463Spleen
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I120018chr1120560624120563022
Enhancer Sequence
TCTAGAAAGA AAAGTGTTGG AGCCTTCTTT CCATTCCCCA ATGTTGGTGG ATGACCACCT 60
TCAAAGTTCT GAAGTCCAAA AAATATCTAA AAGCAGAGTA ATTTAAAAAG CTTACTGTTT 120
AGTCTAAAAG GATTTTCCTA GATCAAAAAC AACTGTACCT ATTTGGATAC CAAAAATGAA 180
AAAGAAATAG TGCAGAATCT TTAGATTGCC TAATGGGATC TGGAGAAACA GCTCTTAGTC 240
CCAGTCTACA TTCTAATGAG TTATGTAATA AAGGCTAATT CGCTTAGCTG TATTACACCT 300
CAGCCGCCTC ACTTATAAAA CAAAATGAGT GACAAAGGTG CTTTCCAAAG TCCCTTTGAC 360
CTCCTAAGTG TGATGACTCT ATAATCTTGG CCTTTGAAGT CCCTTGGCAA TACCACCCAA 420
GGATGTAATG ATGCTTGCTG ATGTTAATGT TTGGGTGTTT GTGGTTGTAT ATGTCTTGAC 480
CACTGTCCCA CTCCAAGCAG GGGATCCTAG GGTAAGAACT GTACTGTGTC TCTTTTTTAA 540
TATCCCTCAC AGTGCCCATC ACCCTCTAGG TGCACAGATA ATTCAATATA CACTTATGTA 600
AATGAATTGT TCCACAACTC ACACTTTCAG CTAGCCCCTC ACAGATGCAT AAGAAAGCAA 660
AGAACAACCA AACAGAAGGA ACAATATATT TAAATAAGAT AAGGGGAATG AAAAAGAATC 720
TTGTGTTTAA AAGGGATAGA AAGGTCTAAC CATCTTCTAT CCCAAACAAC TGGCCAACAT 780
GAGAGCCTGT TTTCTTGAGC ATAGAATGGT GGTAGGTATT TCAGCCTCTA TGGAATCTGA 840
CCTGCTGATT AGTTATACAA GGCTAAAACT GACTGAAGTG TGTATGTAAG ACAACGGTCT 900
GGGAAGAGAA GCACTAAATT TAAGCTCACA GGGAATCAAC CACTTAAAAT GGTAAATTCA 960
GATAGAACTT TATCCAGATT TCATTTTTAT GCATCCTCTC TACAAGCATA AACGCTTATC 1020
TTACTCACTT CCCATCTCAT GATGCTATCA TCAATTCTTA TAAAATTTAG AAAAGAATAG 1080
GTGATGTCTC CTAATTAGAG AGTTTGCTTC TGTCACAAAC TGTGACAGTC AGTGTCAGCC 1140
TTTGCCTGGA AGAAAATGAG TCACTTTTTC ATTAGTAATC AAGTTATGTC TATTTTTTAA 1200
GAGTGACCCA GAAATTCAAG GCCATGAGTT TCAGCAATAC GAGACAGAGA ATCAGACACC 1260
ACAAACATTG TATACAAATA GAATTAAGAC AGAAAAATTA AAGTCAAGGA GGTACAGAGT 1320
TACTTTTCAG GATGACTGAG GTTTCAGAAA GGGCAAGTTG CCCCGTAAAA TATTCTCAAG 1380
ATGTGTCTGG CTTACACAAC GAGAACCAGT ATTTCAAAAT CTTAAAGTGA CAGGCAGTTA 1440
AACGACTAAG GCACTACCAT CGTCTAGGCA AGAGAATCTT AACCACCATC AAATGTTTTC 1500
CACACAGAAT AGGCAGACCT AGTTTATTCT GGAAAATTGA GGGTTTGGAT ATGTACTATA 1560
TAATCAGAGG AAACAAGCAG TAAAGGACCT GAGCTAATTT GGGGTAACCA AAGACTTGGC 1620
TAACAGATGC TTCCTTACTC TGGATCCCTC ATATGAATCA GATCTGGCCA GCGATATGCT 1680
GGACAGAAGA TATCTGAGGT TGAGATACCT GATTTCTCAA CTAAGGGAAT GAACTATGCA 1740
GTACATGAAA ACCAACCCTC TTCTTAGTGC CTCTGTTTTC CTATCACTTT CCCTATCCCA 1800
ATCCATTCTT GCTCTTGCCT TAGAGATTCT TAGATTCTGA TTTTCCTCGC AAAACATGGC 1860
CACAAGCCTA CCGCCTCTCT GTCTGGTAGA AGTACAAGAA TCAAGAGTCA AGGCCAAAAA 1920
GGTCTGAGGG AAGGAGCATA ATTGCTCCCA GCTGCCCTCT CTTCCTGTCC CCAGGTCCTC 1980
TCCTTCACCC TCACTCTAGG CATTCTACCT CCAAACGTTC AAGTTAACAT GTGCTAAAGG 2040
AAGGATTTTC TAAATCACTT ACCTGTCACT GTGAAACTAG ATTAATCCAC ATACTGGTTT 2100
AGTAAAACCT CACACAAACC AGCATATACA CAGAAGACAG CAATCAAGAT GAAGAAAACG 2160
TTTGAAACTG TGTCATTAAG AAAATGTGAT GAAGAAATTG GTAATGATTA TTCCAGGAAA 2220
TAACAGTCCC TTCTAGTCTC CTCAGCTCCC TTCCTCTCAC CCTTCTCCTA CCTATCCGTC 2280
TTCTAAGGCA CCACTAATAT TCAAAGATTT AGGATCTAAG CAGTGCACCA AAAGTCCTCT 2340
GATTTTACTC TTTTGTCCCA CAGTACTTGT TCCTTTGTCT GAGTGTCCAT AGTTATTATC 2400
TGTGCCCCTA CACTGGGATA TTACAAACTG TTTTATTTTA CACATCTCTG TATGCTTCAT 2460
CTCCCCAGCA AGACTTCAGA AGACTGCCAC CATGTCTTAT GCAGGAGAAA CTGCATTCAC 2520