EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-02166 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr1:95533640-95536680 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:95534461-95534479CCTTCAGTCCTTCCCTCC-6.55
HES2MA0616.2chr1:95534765-95534775GGCACGTGCC+6.02
HES2MA0616.2chr1:95534765-95534775GGCACGTGCC-6.02
LMX1BMA0703.2chr1:95535604-95535615TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr1:95535598-95535611AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:95535597-95535610AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr1:95535601-95535614TAATTAATTAAAT+6
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:95534064-95534079TGAACTCCTGACCTC-6.22
PHOX2AMA0713.1chr1:95535605-95535616TAATTAAATTA-6.62
POU6F1MA0628.1chr1:95535599-95535609ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:95535599-95535609ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr1:95535605-95535616TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr1:95535605-95535616TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr1:95535605-95535616TAATTAAATTA-6.62
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr19553456695535413
chr19553434195535469
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I095066chr19553190095536373
Enhancer Sequence
CTATCCATGC CTCACTAGAA GGCAAGCACC ATACTATGAG GGCAGGGATT TGTGTTTGTT 60
ACTGCTGTAC CTCCTATTCC TAGAAATAGC AGGCTGTCCT ATTGAATGAA AGAATGAATG 120
TTTGATATTA AATCTAACAT TTGCCTAAGA AGGCTGTATT ATGTTTCAAA GAAAAGTAGT 180
TTTGGCAAAT GTTCTCTGAA CAGAAGTGAT CTACTAATAA TTTTTTATTT TTTTGAGATG 240
GAGTCTTGCT CTGTTGCCCA GGCGTGATCT CGGCTCACGG CAACCTCTGC CTCCTGGGTT 300
CAAGCGATTC TCCTGCCTCA GCCTCCTGAG TAGCTGGGAT TACAGGCACC TGCGACCATG 360
CCCAGCTAAT TTTTTTGTAT TTTTTAGTAG AGATGGGGTT TTGCCATGTT GGCCAGGCTG 420
GTCTTGAACT CCTGACCTCA GGTGATCCAC CTACCTCAGC CTCCCAAATT GCTGGGATTA 480
CAAGCGTGAG CCACAGTGCC TGGCCTACTA ATAATATTTT ATGATATCTA AAGAGTAAAT 540
GTCGCTTGGT CTTCAAGGTA AATATTGAAA ATGCCTTCTG CCTCCTCCAA AATTTTGGGC 600
ATGAACTATT AAACTGCTTA TTTGATTACA AGTCTTCCTT TAATTGGCAT GGTTCTTTCA 660
GGCCCTTGAT ACCTTCCTAC CCTCAATAAT CTGAATGAAG GCACCATTTG CCAGGTGAAT 720
TATCAACCTT AATTTTGGTT TCTAGTCCAC CAAATGTAAC ACTATCAAGT GAATGGTTCT 780
AACATCCATC CATTTGTTCA AGTCAGAAAC CTGGAAATCA CCCTTCAGTC CTTCCCTCCC 840
ACATCCTCTA CTTTCAATCC ACAGTTGTGG ATTTAACTCC TAAAATCTTC CAATCTCATC 900
TGAATGCGAT TGCTTTTCTC CAGCCCCACA CCTATCACTC CAGTCAGACT CCAGTCTCTC 960
AACTCTGGCC ATTCCAAGTG CTATCACCTT CTTTTCACAT CCTTATCTGA AATATTCAAA 1020
AGGCTCCTAT TTGTTTCTCT ACTTCGGTCT TTGTCAAGAC ATTCTTTTGA CAATGCAGGC 1080
TTGAAGTGGG TGACTCTCCA CTGAAAAAGA TAAGTCATGT GCGGTGGCAC GTGCCTGTGG 1140
TACCAGCTAC TCGGGAGGCT GTCTCAGAAT CGCTTGATCC CAGGATTTAG AGGCAAGCCT 1200
GGGTACATAA CAAGAGTCTG TCTTAAAAAC AAAAACCAAA ACAAAACTTC AAAAGCTCCT 1260
TTTGCCACCA AGACTAATAA CAGTAACCAT TTATTAAATG CTTATGTAAA AAGAAAAGAA 1320
AATGTCAAGA CCTTCCAAAT TTATTATGCC AAGGGGAAAA GCTAAGCCCT GGAAACTGAC 1380
TCATGTAACA TGGCTTTTTC TCTTTGGTGT ATGTCTGTTG CTTCCTGACC TTTGTGTTGA 1440
GATGTTATAC ATTAACCAGA TTCCCTAGTC TTTATTCAAA CCTAGACTAA ATGACATTGG 1500
AGATAGAGGC CTTTGTGATT GTTACCTCCT TATACCAGAA TGTTAAACAA ATCCCTTAGT 1560
GTGTAATCAA TAGTAGTGTT GGGACTTAGA AAATAATATC CCAAAATGAA GGCCTTAGAA 1620
GCAAAAATTT TTCTCTGGCC TTCTCCTGTC CTCTGTCTCT CAGTCCCATA CTCCCCTGAG 1680
GCTTGCCATA GAAACTAGAA TCTCTCTTCC CCAGGGCGGG TCACAGAAAC CAAGAACTCC 1740
TTCTCCCAAA AGCTGGTCAT AAAACCTAAA AATACTACTC TAATTTTACT CCACCTTTCT 1800
GTGTAAAAAC TGGCCATAAA GAAATTATCC GAGCTGGGGA GCTGGGCGAG GTGGCTCACA 1860
CCTTTAATCC CAGCGCTTTG GAAGGCAGGA GAATTGCTTG AGGCCAGGAG TTCAAGACCA 1920
GTCTGGCACA CATAGCAAGA CACCATCTCT ATTTTTAAAA TTAATTAATT AAATTAAAAA 1980
AATTATCTGA TCTACCTTGT TTGACGGTAG GTCATAAGAC CCCCATTCCA GAGAGGGCCC 2040
TACCCCACAT CCAGAAGGAA AGGAATGCAT GCTCAGAGAG ACCAAGAAAA ATCTAGACAG 2100
GCCTTGCTGG GCTTCCCTAC TGTCTATTAG CATTAAATTA TACCCTTTTG TCCAGTCATA 2160
ATTCTACATG GCTGTCCATA CTTTGCTGAA CCTAAGCATA AAAACAGACC ATTTCCCTTG 2220
TATCTCTGGG TCTTCATTCA GAACACTTTC ATATATGCTT CATAAATTTG TATGCCTTTT 2280
CTCCTATTAT TTCTGCCTCA TCAGTGATTT TCAGTGAAAC TTCAGAGGGC AAAAGGGAAG 2340
TTTCCCCTTG GCCCTTACAG TAGCCAACCA AATCTTGTAT CTGTATGTTG GCCTTTGTAT 2400
GGAAAATATT GTAATTTTGT TCAGCATCTC TGTTCTTGCG TATACAAACT ACCTTCATTC 2460
TTCCCCACAT GGGGAGCACT GATTACATTC TTTGGTATAG GTTTGCTCCC CAGACACCCA 2520
ATCTCACGCT TTGTGCTTGA ATAAACTCTT CTAACTGGAT ATTGAGCCCT TTGATTATTT 2580
TAGGTTGACA CTATATGTCA AGCACTTTAC TGAACACTTT ATTTTTTAAT TTAAGCTTTT 2640
GATTATATCA TTTTATTTTA TTTCATTTTG AGACAGGGTC TCACTCTGTC AACCAGGCTG 2700
GAGTGCAGTG GCACAATCTC AGCTCACTGC AACCTCCACC TCCCAGACTC AAGTGATCCT 2760
CCTACCTCAG CCTCCCAAAT AGCTGGGACT ATAGGTGCAT GCCACCACAT CCACCTAATT 2820
TATTTATTTA TTTTAATGTA GAGACAGGGT TTCACTATGT TGCCCAGGCT GGTCTCCAAC 2880
TCCTAAGCTC AAGCAATCCG CCTGTATCGG CCTCCCAAAT TGCTGAGATT ACAGGTGTGA 2940
ACCATCACGC CCGGCCTAAA CACTTTAAAT ATGATCCTAT TTAATCTCTC CTGTCCTCTC 3000
TCAACCCATG TAGAAACAGA AGGTTCAGCG AGGTTAACTA 3040