EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-01337 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr1:43430980-43435630 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:43431092-43431103AAGCAATAAAA+6.32
IRF1MA0050.2chr1:43432426-43432447TATAACTTTTTCTTTCTTTTT+6.26
IRF1MA0050.2chr1:43432432-43432453TTTTTCTTTCTTTTTTTTTTT+6.59
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:43435499-43435514GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:43432065-43432080TGAACTCCTGACCTC-6.22
ZfxMA0146.2chr1:43435475-43435489GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02447chr1:43432142-43433694Astrocytes
SE_13825chr1:43432228-43433746CD34_Primary_RO01536
SE_14471chr1:43431004-43431659CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14471chr1:43431754-43433846CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20799chr1:43431815-43433934CD8_Memory_7pool
SE_23189chr1:43432416-43432938Colon_Crypt_1
SE_26580chr1:43431531-43433657Esophagus
SE_29267chr1:43432330-43433566Fetal_Intestine_Large
SE_33837chr1:43432036-43433676HCC1954
SE_34353chr1:43431811-43433741HCT-116
SE_35049chr1:43432420-43433623HeLa
SE_36013chr1:43431195-43434037HMEC
SE_37191chr1:43432098-43433888HSMMtube
SE_39883chr1:43432023-43433701K562
SE_55821chr1:43432004-43433896u87
SE_57045chr1:43432124-43433624VACO_400
SE_57045chr1:43434069-43434799VACO_400
SE_64340chr1:43431988-43433925NHEK
SE_68708chr1:43432497-43433576H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr14343266643433261
chr14343286343433109
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I042968chr14343407043434799
GH01I042965chr14343112343434012
Enhancer Sequence
TCTCAAAAAA AATTTTTTTT TAATAAAAAT AAAAAATAAT AATAAATGGA TGACTTGACT 60
CTAGAGAAAC TTGTTTTAAA TCAAATGCTG CCAGATTCTC TGCCTTTAAA GAAAGCAATA 120
AAAACAACAA AAACTCCAAC TGGCACTGCC TGCTCTGATC CAGCAACAGT ACAAGCAGTT 180
TGCTTTGCCT GGCTCTTATC GCTTAGATTA CAATTATTTG AGCCTTATCT TCCTCTGAGA 240
TAATGACCTC CTCTAGGGCT GGGGCTCAGG TATTCCTGTC TTGCCTCTGT CCAGCAAGTT 300
ATTTGGCACA AGAAAGAAGC TATAAATGTT TAATAAATGA ATTAATCAAA GAATGAATGA 360
AGGAGGAGGC TGACAGTGGT ATTTGGTGGG TGGACCACAG GTTTTGGAAA CAGACCTGCT 420
AGCTATGTGT CTTTGGGCAT GTTACCTCAC CTGAATCTCA GTTTCCCCAA CTGTAAGATG 480
GGGATAATAG CAGTACTCAC CTCTAAGAAT TATTGTGAAT ATGAAGTAAG GAAACGTGTA 540
TCAGGTGACT ATCCTACAGT AAATACTTGA AACGTGGTAA CTATTATTAT TTCCATTTTT 600
TTACATTCTC AAAGCCTGAT TTTCTTCAGG GTTGCAGGGG TCTTCCCCTC TCAATTTCCA 660
CGTATTGTTT TCTGGAGGTC TGTGAGGTTG GAAGAAGAGG ACCTGATGAT GCCTCCCCGA 720
GGAGCTTTTC TTCCCCGTGG GGTGGGCAGA ACTCTGGAAC GTTCCAAAAG TCTGGCTTCA 780
TGGCCCAGCT CCACCTTGTG ATTGGCGAGT TCCTTATTAC CAGTGAGCCT CAGTTTTCTC 840
TCTGTAAAAT AAGGCCCATA ATAATCTTTT TTTTTTTTTT GAGACGGAGT CTCACTCTTT 900
TTGCCCAGGC TGGAGTGCAC TGGCACAATC TCGGCTCACT AAAACCTCTG TCTCCCGGGT 960
TCAAGCGATT CTCCTGCCTC AGCCTCCTGA GTAGCTGTGA TTACAGGCGC CCACCACCAC 1020
GTCCACCTAA TTTTTTTGTA TTTTTAGTAG AGACAGGGTT TTACCATGTT TGGCCAGGCT 1080
GGTCTTGAAC TCCTGACCTC AAGTGATCCA CCCGCCTCGG TCTCCCAAAG TGCTGGGATT 1140
ACAGGTGTGA GCCACCGCGC CCGGCCCTCT TTTTTTTTTT TAAGACCCAG AATGATGTTG 1200
ACCTTGGAGA TCTCTGGGGA GGATTCAATG GCTTGGCCCT GGGCCTGGTG CACAGTAAGC 1260
CCTCCACAAG TGTTGAGTCT GAGGAAGTAA CCTGGCACCC TGAGGCTGGG GGAACAGCAA 1320
GGAGACCAGA AGGATCCTGA GAAGCCCAAG GACTGATGGG AAAAACAAAT AGCCTGGCAC 1380
AGTTTTGTTT TATTCTTAGA ATCATATTTC TCCAGAGAAG TGGAAAAACA ATGCCTTTCA 1440
TGCCGATATA ACTTTTTCTT TCTTTTTTTT TTTTTCTTTT TAGAGGTAGG GTCTTGCTAT 1500
GTTGCCCAGG CTGGCCTCAA ACTCCTGAGC TCAAGCAATC CTCCTGCCTC AGCCTCCCAA 1560
GTAGCTGGGA CAACAGGCCA GCACCACTGT ACCTGGCTTT GATATAACTT TGTAACTCTG 1620
CAAAACTCCT TCCCACATGT CATTCCTTGG GTCCTCCCCA CACCTTATGC TGCAGGCAAG 1680
ACTAGAATTA TTCATGTATC CACAGTTGTG AAAACTGAGG CACAGAGAAA TTAAGCCACT 1740
TGCTTGAGAT CACAGTGAAG AAGGAATTTG GAAGCAAATT GAAGGTGTAA AACCTGGGCC 1800
TCCTGACTTA TAGATACCAC CATGCAGCAA TTTGGATCTG AAAGAAAGCA CACAGCTTAT 1860
GCCCAGACAG AGCAGCCGGT GTCTAGCTGT GCCCGCTTGC CCCGCCCAGC TCCCACCTGG 1920
ATGCCACCTG GCAGTCATAT GCACATTCAT CACGGAGGAG CTGGCTGACT CACACATTAT 1980
ACTGGAGCTG ACTCATGCTT TGCAAGAGGG AGAGAGAATC GGTTGAGAGC CACAGGAGCC 2040
CCTGCTTTCC ACATTGAGGC TTGAAATTCA TGCCTCAAAT CCACCGCAGT TCATTTCTTT 2100
AAAAAGGGAA AGCAGTGTGA GCTGGCTGGA GCTGGGGATC TCTGGACTCA GAGAAGAGTG 2160
GTTTGGTTCA ACTCTGGGCT CTGTTACAAG TTGGCTGGGT GACTTCGGGC AAGTCATTGT 2220
CCCTCAGTCT CTTCAGCTTT GTAACAAAGG GGTTGCAACA GATAAGCGCC AAGACTCTTC 2280
AAGCGTCTGA AAGGCTGTTC TTGCTCTGGG TTGAGAAACC TTGTCATAAT AATGTTGTAT 2340
GTGTTGCTAA TTTACTATGT GCCAGGTAAG TGATTGGTAT GGAGTTATTA ATATCTCATT 2400
TAATTCTCAT AACGAATTCT AGATTTACTG TTTTTTATCC TGTTTCTCAA AGGAGGAAAC 2460
TGAAGCACAG TTTCAGAGTG ATTTGCCCAG GGTTGAGTAG GTCAGCAAGT GGCCGAGCTA 2520
ATAATTGAAC CTGGTTTGTC CCCAGACTTT GTATAAAATC TAGTCTAAGG CCGGGCGTGG 2580
TGGCTCATGC CTGTAATCCC AGCACTTTGG GAGGCCAAGG CGGGTGGATC ACAAGGTCAG 2640
GAGTTGGAGA CCAGCCTGGC CAACATGGTG AAACCCCATC TCTACTAAAA ATACAAAAAT 2700
TAGCCAGGCG CAGTGGCAGG CGCCTGTAAT CCCAGCTACT CGGGAGGCTG AGGCAGGAGA 2760
ATTGCTTGAA CCCGGGAGGC AGAGGTTGCA GTGAGCCGAG ATCGTGCCAC TGCACTCCAG 2820
CCTGGGTGAC AGAGCAAGAC TCCATCCCAG AAAAAAAAAA ATCTGCTCTA CACCTTTATC 2880
CTGTTAGACC TCAGTTTCCT CACTTAAAAT TAAACTACAT GACATAAATT TTACCATTTT 2940
ACCTATTTTA AGATTACAGT TCAGTGTCAT TAAGTGCATT CACACTGTTG TGCAACCATT 3000
GCCATCATCC ATCTGAACCC ACTAAATAAT AATTCCCCAT TCCCTGTTAC CCCTAATCCC 3060
TGGCAACCTC CGTTCTACTT TCTCTGTGAA TTTGACTACT CTAGGTATCT CATTTAAAGT 3120
TTCCTCATCT TTAAAACTAC GATAATAAAG ATCAAGTGTT ATTCAATCCT TCTCCCAGTA 3180
GCGCGGTTGG CTCAGACTTG AATTTAAGTC CCAGTTCTAT TCACCTACCC CTCAGGCAGG 3240
TTGCTTAACC CCTTTGCCTC CCTCATTCCC ATGTCCCTAA AGTTGGGCTG GTGGACCCTG 3300
ATGGGATGAT CACAGGAGAC AGTGGGGATG AAGGTACTTG GAAAGCCCAA TGCCACTTCT 3360
AGAACTTGTT ATACCATCTT CCTGGTGGGC TGGAACCCTG GCTTAGATTT ATAGGTGTGA 3420
CAGCTGGGGA GGCTTTAGAA TGGCACATTA CAACCTGGCC AGTGCCCAAC CCAACATTTG 3480
GGGCTGAGGC TGGGAGGCAG AAGCCACATC AAGGAGGGCT TTGACTGTTT GGCTATAGAG 3540
CCCTCCCCTC ATGGAGCTTA CATTCCAGCC TGTACACCTG GTATTGTAAA GTGGCTGGTG 3600
TAGTCTTTAC TTACAGAGAC TGCTCAGGCA GTAGTCTGTC CTGCGTGTTT CTTTTAACTG 3660
GTTCCTGCTC AGGCAGTAGT CTGTCCTGCG TGTTTCTTTT AACTGGTTCC CGGAGGCCTG 3720
GTCTTGTGGC TGAGAGTCCT ATCTTCCCTA TTTCCTTAAA GTAATGATTG TTAGGATATT 3780
TTGGTTGCAA GTATCAATGC ATTTAAACCA GCTGTCACCA AAAAGGGAGA TTTTTTTTTT 3840
TTTGAGATGG AGTTTCAGCT CTTGTCGCCC AGGCTGGAGT GCAATGGTGT GATCTTGGCT 3900
CACTGCAACC TCTGCCTCCC GGGTTCAAGT AAGTCTCCTG CCTCAGCCTC CCGAGTAGCT 3960
GGGATTACAG GTGCCTGCCA CCATGCCTGG CTAATTTTTG TATTTTTAGT AGAGATAGGG 4020
TTTCACCATG TTGGCCGGGC TGGTCCCAAA CTCCTGACCT CAGGTGATCC ACCTGCCCCA 4080
GCCTCCCAAA GTGCTGGGAT TATGGGAAAA AGGGAGAATT TAATAAAGGA TATAGAGATT 4140
GGATGCAGTG GCCCACACCT GTAATCCTAG CACTTTAGGT TTGCCAAGGT GGGAGGATTG 4200
CTTGATCCCA GGAGTTCCAG ACCAGCCTGG ACAATATAGC CAGACATTGT ACCTCAAAAA 4260
AAATTTAAAA ATTAGCCAGG CATGGTGGCA TGTGCCTACA GTCCCAGCTA CTTAGGAGAC 4320
TGAGGCAGGA GGATGGTTTG AGCCTAGAAA TTCGAGAATA CACTAAGCCG TGATTGTGCC 4380
ATCACACTCC AAACTGGGTG ACACAGCAAT ACCCTGTCTT TAAAAATACA AAAAAGTTAA 4440
AAAAAAAAAA ATAGGCTGGG CATGGTGGCT GATGCCTGTA ATCCCAGCAC TTTGAGAGGC 4500
CGAGGCGGGC AGATCACCTG AGGTCAGGAG TTCAAGACCA GCCTGGCCAA CGTGGCAAAA 4560
CCCCATCTCT ACTAAAAATG CAAAAATTAG CCAGGTGAAG TGGTGCGCGC CTGTAATCCC 4620
AACTACTCGG GAGGCTGAGG CAGGAGAATC 4650