EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

EnhancerAtlas 2.0

Tag

Content

EnhancerAtlas ID

HS088-03744

Organism

Homo sapiens

Tissue/cell

HeLa-S3

Coordinate

chr1:154686010-154687350

Target genes

Number: 29
Name	Ensembl ID

ATP8B2	ENSG00000143515
RP11	ENSG00000226855
IL6R	ENSG00000160712
TDRD10	ENSG00000163239
UBE2Q1	ENSG00000229780
CHRNB2	ENSG00000160716
PBXIP1	ENSG00000163346
PYGO2	ENSG00000163348
SHC1	ENSG00000160691
CKS1B	ENSG00000173207
FLAD1	ENSG00000160688
ZBTB7B	ENSG00000160685
ADAM15	ENSG00000143537
EFNA4	ENSG00000243364
EFNA3	ENSG00000143590
EFNA1	ENSG00000169242
SLC50A1	ENSG00000169241
DPM3	ENSG00000179085
HMGN2P18	ENSG00000223452
KRTCAP2	ENSG00000163463
MUC1	ENSG00000185499
THBS3	ENSG00000169231
AL713999.1	ENSG00000216109
GBA	ENSG00000177628
FAM189B	ENSG00000160767
SCAMP3	ENSG00000116521
CLK2	ENSG00000176444
FDPS	ENSG00000160752
RUSC1	ENSG00000160753

TF binding sites/motifs

Number: 13

JASPAR ID

Coordinate

Motif Sequence

Strand

-Log10(p-value)

RREB1	MA0073.1	chr1:154686745-154686765	GTGGTGTGTGTGGTGTGTGG	-	6.01
RREB1	MA0073.1	chr1:154686996-154687016	TGTTTGTGTGTGGTGTGTGT	-	6.06
RREB1	MA0073.1	chr1:154686860-154686880	GGGGTGTGTGTGTGTGGTGT	-	6.11
RREB1	MA0073.1	chr1:154686979-154686999	GGGGTGTGTGTGTGTGGTGT	-	6.11
RREB1	MA0073.1	chr1:154687016-154687036	GGGGTGTGTGTGTGTGGTGT	-	6.11
RREB1	MA0073.1	chr1:154686657-154686677	GGTGTGTGTGTGGTGTGTGT	-	6.16
RREB1	MA0073.1	chr1:154687020-154687040	TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT	-	6.16
RREB1	MA0073.1	chr1:154687031-154687051	GGTGTGTGTGTGGTGTGTGT	-	6.16
RREB1	MA0073.1	chr1:154686911-154686931	GGGGGGTGTGTGTGTGGTGT	-	6.23
RREB1	MA0073.1	chr1:154686896-154686916	GGATGTGTGGTGTGTGGGGG	-	6.36
RREB1	MA0073.1	chr1:154686877-154686897	TGTTTGTGTGTGGTGTGTGG	-	6.57
RREB1	MA0073.1	chr1:154686772-154686792	GGTGTGTGTGTGGTTTGTGT	-	6.94
RREB1	MA0073.1	chr1:154686948-154686968	GGTGTGTGTGTGGTTTGTGT	-	6.94

GeneHancer

Number: 1
ID	Chromosome	Start	End

GH01I154714

chr1

154686574

154689656

Enhancer Sequence

TGTGGGGAAG AATGGTAACA GGCAAGCCCT TCAAGTCCAT GCAAAGGTTT AGCCCCACCA 60
GCAGATCCTC CAGCCCTACC ACTGCCTCTG ATTTTGGAAC CCAGCATGGG GACCGTGAAC 120
CTGGGGAACA ACTGAGGCTT TTACTTTCCA GGGGCTTGTC ACATCCCCCC AGAAAGCAAA 180
CTCTTGTCTC CACGCATGCT CACCTTCAGT CACTGGTTTC TTGCTATTCC CAGATCATTT 240
CCCTGCCTCT ATGCCTGGGC TGCACCTTCC ATGTTGAGTG CCTTATTCTC AACTTTTCAG 300
GGATTCCCCA AACCTCTCCA TCAGAATGAA TGTTTTCATC CTTTGCTTTT CCACTATACT 360
TTTAAAAACT CCTCCATCAC AGAAAGCATC AGCCACGGTT TGTTTTGATT TGAGTTGCAA 420
TGCATGGTGT GTGTGATGTG TGGTGTGTGC GGGGTGTGTG TGTGTGTGGT GTTTGTGTGT 480
GGTGTGTATG GTGTGTGTGA TGTGTGGTGT GTGCGGGGTG TGTGTGTGTG TGGTGTTTGT 540
GTGTGGTGTT TGTGTGTGGT GTGTATGGTG TGTGTGATGT GGTGTGTGTG GGTTGTGTGT 600
GTGGTGTTTG TGTGTGGTAT GTATGGTGTG TGTGATGTGT GGTGTGTGGT GTGTGTGTGG 660
TGTGTGTGTC GTATGTGGTG TGCATGGTGT GTGTGGGGTG TGTGCGGTGT GTATGGTGTG 720
TGTGATGTGT GGTATGTGGT GTGTGTGGTG TGTGGTGTGT ATGGTGTGTG TGTGGTTTGT 780
GTGAGGTGTG TGTGTGTGGT GTTTGTGTGT GGTGTGTATG GTGTGTGTAT GGTTTGTGTG 840
AGGTGTGTGT GGGGTGTGTG TGTGTGGTGT TTGTGTGTGG TGTGTGGGAT GTGTGGTGTG 900
TGGGGGGTGT GTGTGTGGTG TTTGTGTGTG GTGTGTATGG TGTGTGTGTG GTTTGTGTGA 960
GGTGTGTGTG GGGTGTGTGT GTGTGGTGTT TGTGTGTGGT GTGTGTGGGG TGTGTGTGTG 1020
TGGTGTGTGT GTGGTGTGTG TGTGTGGTGT GTATGGTGTG TGTGATGTGT GGTGTGTGGT 1080
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTAGAATG TGAAAGCTCT TAGAGGTTCT 1140
TACTCTAGTT TTTACCTTCC ATAGCAGCCT GCCCAATTCC TGGCATGTGG CTGGTGCAGT 1200
CAGTGAGTGA TCAGACCCAG TTCACCACTC CACTTGTTGA GTGGAACAGA ATGGATTTCT 1260
TCTGTGCTAC TGACAGAGTT GTAGGAGTCC CGCCACTCCC AGTCTGGTCA TCTGATGGCT 1320
GAACCGCTCT GGCATACTCA 1340