EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS088-01212 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HeLa-S3 
Coordinate
chr1:27487930-27491330 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:27490589-27490604TGAACTTCTGACCTC-6.38
ONECUT1MA0679.1chr1:27490137-27490151GGAAAATCAATAAT+6.42
ONECUT2MA0756.1chr1:27490137-27490151GGAAAATCAATAAT+6.49
ONECUT3MA0757.1chr1:27490137-27490151GGAAAATCAATAAT+6.84
RARAMA0729.1chr1:27490586-27490604TCTTGAACTTCTGACCTC-6.88
Number of super-enhancer constituents: 7             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09350chr1:27487738-27488871CD14
SE_23485chr1:27487857-27489118Colon_Crypt_1
SE_24258chr1:27488306-27489028Colon_Crypt_2
SE_31553chr1:27487818-27489086Gastric
SE_50517chr1:27487684-27489162Sigmoid_Colon
SE_52500chr1:27487781-27489130Small_Intestine
SE_53642chr1:27487793-27489132Spleen
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr12748992827490015
chr12748810627488629
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I027161chr12748777227489011
GH01I027163chr12748968127489890
Enhancer Sequence
GGCCAAGTCC TCATTTTTTA ACCATTCCAG GCCCACACTG CTTTTGACTC GGAGAGGCCA 60
GGTCTCTGCA GACCCTTCCC CTGCAGATCC AGGACAGCCT CAGGAAGCCT GGACCCTGGG 120
TGGCATCTCC CCCTGCTTAA GCCATGTCTG CTCCCCAATC CCCTCCTTGA ATCCTTTCAC 180
TAAAAGTGCC TGGAGTTTTA TGGCACAAAA TGCATGGCCC TAGGAAAGAA TCTGCTCAGC 240
CCCTATTAGC TGCGCATTAT GAGCAAGTCA CACCTTGTTT CTGTCTCTCG CTGTGTTCAT 300
GTATATGAAA GCTGGGTGGA GTCACATTAC TTGCTTTGTA AGGTTTATTG TAAGGATGAA 360
AAGGCCACTG TATGTCAAGC ATAGTTCCTG GTACACAGTC AGCACGCAGT GACTGGGTTC 420
ATTTCCTTCT TTTGTTTTTT TTTTTTTTTG AGACAGAGTC TTGCTGTCAC CTAGGCTAGA 480
GTACAATGGT GCAATCATAG CTCACAGCAA CCTCAAACTC CTGGGCTCAA CCGATCCTCC 540
AGCCTCGCCC TCCCGAGCAG CTTGGACTAC AGGTACATGC CACCACACCT GACTAATTTT 600
TAAAAATATT TTTGGTAGGG ATAGGGTCTT ACTATATTGC CCAGGCTGGT CTCAAACCCC 660
TGGTCTTGAT TGATTCTCTT GCCTGGGCCT CCCAAAGTAT TGGGATTACA GGGGTAAGCC 720
ATTGTACTCA GCCGCTCCTT CTTTCATCAT AATGTCACAG CCCAGCAAAG CCTTCTTCCA 780
GTCTCCCCGG CACTCACTTC ACCACTGCCT CCTTCTATTT CTCAAACACT GGCAGACACA 840
CTTCTGCCTC AGGGTCTTTG CACTTGCTAT TCCTTCTGCC TGGAACACTC TTCCCCAGAT 900
ATCCACATGG CTGGTTACCT GACCTCCTTC AAGCCTTTCT GCGAATCTCG CTTCCTGACA 960
TGGCCTACTA TGTTATAATC CTATGTAATA GTGACACTTC CCCTGCCTGG CCACCACCAC 1020
TACCACCCAG CCCCTTCCCC TGCTCCTTTT TTCTTCTTTG TATAGCATGT TTCACCTTCT 1080
CACATACAGT ATAATTCTCC TATTTGTTAC TTTTATTCTT TTTTTTTTTT TTTTGAGACA 1140
GAGTCTTGCT CTGTCACCCA GGCTGGAGTG CAATGGCATG ATCTCGGCTC ACTGCAACCT 1200
CCACCTGTTG GGTTCAAGCA ATTCTCCTGC TTCAGCCTCC TGAGTAGCTG GGATTATAGG 1260
CGTGCGCCAC CATGCCCAGC TAATTTTTTT TTTTTTTTTT TTGAGACGGA GTTTTGCTCT 1320
TGTTGCCCAG GCTGGAGTGC AATGGCGCAA TCTTGGCTCA CTGCAACCTC CGCCTCCTGG 1380
GTTCAAGTGA TTCTCCCGCC TCAGCCTCCC TAGTAGCTGG GATTACAGGC ACCCGCCACC 1440
ATGCCCAGAT AATTTTTTTT TATTTTTAAT AAAGACGGGG TTTCACCATG GCCAGGCTGG 1500
TCTCGAACTC CTGACCTCAG GCAATCCACC TGCCTCGGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC 1560
AGGCATGAGC CACTGCACCC GGCCTAATTT TTGTATTTTT AGTGGAGACG GGGTTTCACC 1620
ATGTTGGTCA GGCTGGTCTC GAACTCCTGA CCTCGTGATC CACCCGCCTC TGCCTCCCAA 1680
AGTGCCAGGA TTACAGGTGT GAGCCACCGC GCCCGGCCTA TTACCTTTTT TTTTTTTTTT 1740
TTTTTTTACT GCATTTTTCT CCCTTCAGAA TGTGAGCTCA GCTAGGGCAG GGACCACGTC 1800
TATCTCATCC ATCACTGTTT CTCCACCATG TAGAACAATG CCCAGTGCAT ATTGGTACTC 1860
AATAAATATT TGCTGAGTGA ATGAATCACA GAATGCATTA TTTGCACATG AGAAAACCAA 1920
GACTCCCAGA GGAGAATTGC TTGTCTGAGG CCATAGAGCT GGGAAGAAGA GGAGCCAGGT 1980
TTGGATGCAG GTCTGCCTAA CTCTGAAGTC CAGGCTTTTC CCAGTTCTCC AGGCTGATAG 2040
CTACCATGAA AAAGCATGTA CATGTTGGGT AACTAGAAGA GAGTTCGGAG GTTGGTAAGG 2100
AGTTGGAATT TAGGATCCAG CGAATTGCCT TTAAGCTAAG TTCATAATTT TACAATAAAC 2160
ATTTAGTGAG TTCCTACTAT GTGCAACTCC CTGTGCTTTC TGCTGGAGGA AAATCAATAA 2220
TGGATTTGAT AAACACCTAT CGGCAACCTT GACACCCTAA TGTTCACTGA CTGGATGTCC 2280
CACAGGCACC TCCATCAACT TCACCCACCA TCTTCCACTA AACTTGCCCC CATTCTACAC 2340
TGTCAGAATC CTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTACTGGAAA AGTTAGGATT 2400
TAGCAGATCT GAGGGAACGG GTCCGGGATT GACTTTTTTT TTTTTTTTTT TGAGACGGAG 2460
TTTTGCTCTT GTCTCCCAGC TGCAGTGGCA CAATCTCGGC TCACTGCTCA CTGCAACTTC 2520
CGCCTCTTGG GTTCAAGGGC TTCTCCTGTC TCAGCCTCCC GCGTAGCTGG GATTACAACA 2580
AGCACCTGCC ACCACGCTCA GCTAATTTTT TTGTATTTTT AGTAGAGATG GGGTTTCACC 2640
ATGTTGATCA GGCTGGTCTT GAACTTCTGA CCTCAGGTGA TCTGCCCATC TCGGCCTCCC 2700
AAAGTGCTGG GATTACAGGC GTGAGCCACC ACCCTCAGCC TACACAGCTT TCAGGAAGAG 2760
CTGTCTGAGC CATGTTCATC CCCTGTTTAG ACAGGCACAT ACCCCATCCC AGCATGGCAC 2820
TCAAAGTCCT GCACACGATT TGGCCCACAA ACCTTTTTTT CCCCTAATTA TTTGTAAGAA 2880
AATTTAAAAG TATAAAGGTA ATATAGCAAA CATCCAAATT CAGAATTATC AGCTGTAACA 2940
GTTTGTTATA TTTACTTTCA ATAATATATG TATATTTTGG CCAGACACAG TAGCTCACTC 3000
CAGTAATCCC AGCACCTTAG AAGGCTGAGG TGGGAGGATC ACTTGAGGCC AGGAGTTCAA 3060
GACCAGCCTA GGCAACATAG GGAGAATCTG TGTCTACAAA ATAATTTATG TATTTATTTA 3120
TTTGTTGTTG TTGGTGGTGG TGGTGGTGTT TTGAGAAGGT CTCACTCTCT CGCCCAGGCT 3180
AGAGTGTAGT GGTGTGATTA TAGCTCACTG TAGCCTCAAA CTCCTGGACT CTAGCCATCC 3240
TCCCACCCCA GCTTCCTGAG TAACTAAGAC TACAGGTGCA TGCCACCATG CCCAGCTAAT 3300
TTTCTTATTT TTATTTTTAG TAGAGATGAG GTCTTGCTAT GTTGCCCAGG CTGATCTTAA 3360
GCTCCTGCAC TCAGGCAATC CTCCTGCCTC AGCCTCCCAA 3400