EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
HS074-00108 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19239 
Coordinate
chr1:12231310-12234300 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 33             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr1:12233024-12233036TTCTGTTTACTT-7.22
FOXP2MA0593.1chr1:12233025-12233036TCTGTTTACTT-6.32
GATA2MA0036.3chr1:12232427-12232438TTCTTATCTGT+6.14
Gata1MA0035.3chr1:12232427-12232438TTCTTATCTGT+6.62
Nr5a2MA0505.1chr1:12231941-12231956TCTGACCTTGACCTT-6.94
RORAMA0071.1chr1:12231949-12231959TGACCTTGAT-6.02
Stat4MA0518.1chr1:12233725-12233739CGTTTTCCTGGAAG-6.23
ZNF263MA0528.1chr1:12231491-12231512TCTCCTTCCCTCGCTTCCTTC-6.08
ZNF263MA0528.1chr1:12234206-12234227TTCTTCTTCTTCTTCTCCTTC-6.52
ZNF263MA0528.1chr1:12234209-12234230TTCTTCTTCTTCTCCTTCTCC-6.7
ZNF263MA0528.1chr1:12234212-12234233TTCTTCTTCTCCTTCTCCTTC-7.12
ZNF263MA0528.1chr1:12234215-12234236TTCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.13
ZNF263MA0528.1chr1:12234221-12234242TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234227-12234248TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234233-12234254TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234239-12234260TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234245-12234266TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234251-12234272TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234257-12234278TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234263-12234284TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234269-12234290TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234275-12234296TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234218-12234239TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234224-12234245TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234230-12234251TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234236-12234257TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234242-12234263TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234248-12234269TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234254-12234275TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234260-12234281TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234266-12234287TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234272-12234293TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234278-12234299TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
Number of super-enhancer constituents: 31             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00369chr1:12226565-12247198Adipose_Nuclei
SE_01471chr1:12232095-12234188Adrenal_Gland
SE_04546chr1:12232368-12233932Brain_Anterior_Caudate
SE_06521chr1:12231395-12234253Brain_Hippocampus_Middle
SE_09154chr1:12224797-12249846CD14
SE_10696chr1:12231624-12233979CD19_Primary
SE_11902chr1:12231048-12236114CD3
SE_14553chr1:12231008-12236205CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15480chr1:12231304-12235464CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16369chr1:12231214-12235920CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16946chr1:12231228-12235850CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17650chr1:12231292-12241643CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17827chr1:12231021-12246713CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18389chr1:12226183-12250288CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19117chr1:12225970-12243644CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20048chr1:12231058-12236137CD56
SE_20873chr1:12231198-12236438CD8_Memory_7pool
SE_22347chr1:12226250-12242299CD8_primiary
SE_26251chr1:12232165-12234254Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27503chr1:12231615-12234368Esophagus
SE_30788chr1:12232018-12234343Fetal_Muscle
SE_32030chr1:12231844-12234207Gastric
SE_41498chr1:12232230-12236136Left_Ventricle
SE_42336chr1:12231389-12236106Lung
SE_48967chr1:12232188-12234263Right_Atrium
SE_50250chr1:12231283-12234299Sigmoid_Colon
SE_52522chr1:12231293-12236092Small_Intestine
SE_53313chr1:12231250-12236109Spleen
SE_55394chr1:12232096-12233341Thymus
SE_55394chr1:12233345-12234247Thymus
SE_61096chr1:12184746-12245090HBL1
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr11223209612232448
chr11223360012234159
chr11223169312231881
chr11223353112233800
chr11223380012234000
chr11223400012234197
Enhancer Sequence
TCCACCTGCC TCGGCCTCCC GAAGTGCTGG GATTATAGGC GTGAGCCACC CCACCCAGCC 60
CCATTCTCAC TTTTAAGCCA TGCTTTTCTG TCCTCAGATG TGCTGCACAC ACACCTGCTC 120
CAGGGCCTTT GCACTTGCTT TCCCCATCAC CTCCAATACT CCTCCTGCTG ACGTCTCTTG 180
GTCTCCTTCC CTCGCTTCCT TCTGCTGAAG TAGACAATCC TGCCTGTAGG TGCTCCCTGC 240
CAGGCACTCT CACTCCCTGA CCTGCTTTGT ATTCCTGTAT AATGCTCTTG ACCTATTCTA 300
TTTATTTCAC TTTTATTATG TCTTCCCACA AGATTGTAAG TACCGTGAGG ACAGGGACTC 360
ATTCACCACT GTAGACTCTA GCCTAGAAGA GGGTTTTTCA GTCAGTGCCT CTGACTTTAA 420
TTCTTTGTTG TGGGGCTGTC CCGTGAGCTG TAGGATGTTT AGCGACATCC CTGGCCTCTA 480
CTTATTGGAT GGCAGTAGCG CCACCCTCCC TCGTGACAAA AATATCTCCA GATATTGCTA 540
AGTGTCCTTT GGGGTTGGGG GATTGCCCCT GATTGAGAAC CACTGGCCTA GGACAGTGCC 600
TGGCACATAG TAAGTGTTCA AAAAATATTC ATCTGACCTT GACCTTGATA ATGGCCCTGT 660
TTTACAGATG AGACGGGGGT TTGAAAAGTC AGTGGTGGCA GGGTGGGGTT CTGTTTGCCT 720
CCATCTCTTG GGGTATTTTT CTGGGCTCCT CTTCCCATTG AGTGGTGTCT GCTGAGGTTA 780
GGGGTCCTCT CCCCAAATTG CTCACCCCCT CGACATCCCT CGTGTAGTGA GGGATGGGGC 840
CACTCACTGA CGGTGACTCA GGGCCCCAGA ATGCATGTGA TTTACCCAGA AGCGGGCAAG 900
GAGGGAAGCT GGGGTTTGGG GTGCCGGGGA TGAACAGGAA CAAAGGAGAG GCGCTGTGGC 960
TCCCCGTTCT GGACCCTCGT CTGGCCACAG GGAAGCAGCA CTGATGACTC TGGGGAAAGG 1020
CCCCGGCCTC TGAATCAGAT AAACCTCAAG TCGCTGCTCT GCTGTTTTAC TGGCTGTGTG 1080
ACCTGGGCAA GTCTTTCTAT CCCTCGGAGC CTCTGTGTTC TTATCTGTAA AATGGGAGTA 1140
ATCCTAGCCT CACGGGCTGG CTGTCAGGAT TAAAAGTGCT TTCTAATCCT GGCATTGGCA 1200
GCTATTTGAG CCATTGGTGG CTTTGCAGGT CTGACCCGAC TCTCTGGGCC ATGGGGTGGT 1260
GCTCGGGCCT AGGTGGGGAC CCCTGTGGAG TCAGACTGTC TGCTCTGAGC CCCAGGGCCC 1320
TGAAGCTTGG GTGGCAGCCC TGCAGTTGCC CAGAGTTCCT GTCTAAGTGG CTTTGTTGCC 1380
CATCATCTCA GAAAGCAACT TCTTTCCTCC CTGCCTTTTC CTGTCTGTGC TTCTGCCCCA 1440
GTGCCCCCTG GCTGGGCTCT CAAACCCACT GCTTGACAGC CTGGTCTTAG GACACTGTAT 1500
TGTGGCAAAG GCTGTGGGGT CAGGATATCC CCTCCCCTCC CTTTGCCACC CCTTTTAGTG 1560
AGTAACAGGT GCTGTGTGTT TTGGGGATGA GTGAAGGGTA CATTTGGTGA AGCACAGAGA 1620
GAGTGCACAA GGCTTCAGTT TGCAAGATGG GCACGGGAAG ATTCCAGGCC ATCTCCAAAA 1680
CCTCTTCCAT CTCCAACCTC TGTGCTGCTG AAGGTTCTGT TTACTTGTGA CCCTGAGAAG 1740
GGGATGCCCT ATGGGGGCTC TTCTGAGATC ATGCTGTCCA TTTTCCTGCC TCCAAGTGAC 1800
TTCTAAGACA GCATGGCTCT GAGGAAGGAG CACTGACTTG GGTGTTGGGA GATCACAGTT 1860
CCCATCTGAG CACCGTCACT GGCTTGCTGT GCTACCTTGC TTGGGTTACT TAACCTCTCT 1920
GGGCCTAAGC ATCCCTATCT ATGAAACCTA ACAACCCTGG TTCCAATGCT TTCCTAGAAT 1980
ATTGGGGAAG TGTCGGCTTT GAGTATACTT GACAAAGGCC ACAGATTGGG GGTGGGGTAT 2040
ATAAAAGTCT ACAGGAAGGA GAGCCCAGGA CTCCCCACTG TCAATATCTT GGTTCCCCAG 2100
CTTCTCTTCT TCTTGCTGAC CTCAATCTCA CTTGCTTTGG GTGGATTGAT TTCCTGACTC 2160
AGGCTCCAGG GCCATCAAGA ATTCACGGCT GCCTTTCAGC CTTCATGAAG GACATGGTGG 2220
AGCTCCTTAG GCAGAACTGG GGTTTGTGGA TGTCCTGCCT CTCTGCCCCT TGGTACCTAG 2280
GTGGCACCTT TTCAAGTTCG GGAGCTAGAT CCTTTCCCCT TCCCCACACT GTAGGAAAGT 2340
CCTTACTGTA GGCAGGCGCT GCAGAGCCTG CTGTCTGGGA ACCCACAGGT TCAAGGAAGC 2400
CTTGAGCAGG AAGGGCGTTT TCCTGGAAGA AGCCCTTTGT CGCTGGTAAT GGGTGCAGGC 2460
TGCTCTGACC CGGTTCTGAG TCCTGCCCCC TTCCAGGCCT AGGGCTTTGG GCCTTGATCA 2520
CCTCTGCTGA GTAGCTGACT GCGGGGCTGG GGCTCTGATG CTCAGGACCC ACCTCTCTGG 2580
GACCCACAGT CTTTTTCCAC TGTGGCGTGT AGTGATGTCA CAGGTGGCAG TGATGTCACT 2640
GTGGTTTGAG GTACTTGGCT GTGAGCCCCG GAGGAGGAAG TGTCTGTTCG CTGATGGGGG 2700
GTTGGAAGAG ATCATTGACT TCTGCCCCAA GCGTGAGCCC CAAGTGTGCA GGGGGGAGTG 2760
CGGGGGGAGG GCTGTTGGCG GCGCATCCCA GGGCTCTGGC TCTGCCCTTG CATCTAGCCT 2820
GTCTTTCCTG TGGGCTGTGA CAAGCCACTC TGCATCTCTG AGACTCCATT TCTTCTTCTT 2880
CTTCTTCTTC TTCTTCTTCT TCTTCTTCTT CTCCTTCTCC TTCTCCTTCT CCTTCTCCTT 2940
CTCCTTCTCC TTCTCCTTCT CCTTCTCCTT CTCCTTCTCC TTCTCCTTCT 2990