EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS073-00461 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19238 
Coordinate
chr1:40864330-40868960 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr1:40867920-40867931TTTGATACATT-6.02
Foxd3MA0041.1chr1:40866935-40866947AAACAAACAAAC-6.32
HES2MA0616.2chr1:40868263-40868273GGCACGTGCC+6.02
HES2MA0616.2chr1:40868263-40868273GGCACGTGCC-6.02
IRF1MA0050.2chr1:40865151-40865172TCTTTCTTTCTCTTTTTTTTT+6.9
LMX1BMA0703.2chr1:40864481-40864492GTTTTAATTAA+6.14
ZBTB18MA0698.1chr1:40867382-40867395TGTCCAGATGTTG+6.05
Number of super-enhancer constituents: 27             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03839chr1:40865351-40865884Brain_Angular_Gyrus
SE_04329chr1:40865107-40866704Brain_Anterior_Caudate
SE_04329chr1:40867235-40868072Brain_Anterior_Caudate
SE_04329chr1:40868151-40869137Brain_Anterior_Caudate
SE_09232chr1:40854600-40864981CD14
SE_09232chr1:40864987-40871101CD14
SE_10167chr1:40863945-40871047CD19_Primary
SE_10889chr1:40837614-40877708CD20
SE_11872chr1:40865290-40866496CD3
SE_14445chr1:40865130-40866832CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17325chr1:40838557-40873402CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18386chr1:40853889-40871285CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19424chr1:40865020-40866819CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20011chr1:40865177-40866460CD56
SE_22383chr1:40865273-40866472CD8_primiary
SE_22383chr1:40868029-40871034CD8_primiary
SE_32537chr1:40865161-40868928GM12878
SE_40132chr1:40865155-40866352K562
SE_50468chr1:40865482-40866266Sigmoid_Colon
SE_53508chr1:40854693-40864937Spleen
SE_53508chr1:40865270-40866485Spleen
SE_53508chr1:40867003-40867753Spleen
SE_53508chr1:40868281-40869013Spleen
SE_55131chr1:40865492-40865987Thymus
SE_58445chr1:40828930-40871082Ly1
SE_59998chr1:40841808-40870673Ly4
SE_62202chr1:40838568-40871500Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr14086560040866400
chr14086840040868800
chr14086611140866454
chr14086643140866538
chr14086772840867837
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I040398chr14086447440871496
Enhancer Sequence
AAGGATTTAC TTAGTTCTTT TGTTTTTTTG AGATAGGGTG TCAATATGTT GCCCAGGCTG 60
GCCTCAAACT CCTGGGCTCA AGTGATCCTC CAACCTCAGC CTCCTGAATA GCTGGGACTA 120
CAGACATGTG CCACTGCACC TAGAATACTT AGTTTTAATT AATCTTTAAG CAAATGTTGC 180
TTCCCTGCTA TGTTCAAGGA ACCATGCTAT GCCGTGAGTA TATGATAGTG AATGTTACAG 240
GTCTGGTGAC AGCTCTTGTG GCACACATAG TTAAGCGGGA AAGACATCTT AAACAATCAA 300
ATAATTAGAT AGTAACAAAA TATGGTATGA TTTAGAAAAA GTAAAGGGTG GCCAGGCACA 360
GTGGCTCACT CCTGTAATCT CAGTGCTTTG GGAGGCCAAA GTAGGAAAAT CACTTGAGGC 420
CAGGAGTTCA AGACCAGCCT GAGCAACATA GTGAGACCCT GTCTCTTTTT TATTTCATTG 480
ATTTATTTTT ATTTTTATTT TTTTCAGACA GAGCCTTGCT CTGTTGCCCA GGCTGGAGTG 540
CAGTGGTGGG ATCTCGGCCC ACTGCAACCT CCGCCTCCTG GGCTCACGTG ATTCTCCTGC 600
CTTAGCCTCC CAAGTAGCTG GGACTACAGG CATGTGCCAC TACGTGTGGC TATTTTTTTT 660
TTTTTTTTTT TTTGTATTTT TAGTAGAGAT GGGGTTTCAC CATGTTGGCC AGGCTTGTCT 720
CAAACTCCTG ACCTCAGGTC ATCTGTCCAC CTCTGCCTCC CAAAGTGTTG GGATTACAGG 780
CGTGAGCCAC CGTGCCTGGC CCATTTCTTT TTTTTTTCTT TTCTTTCTTT CTCTTTTTTT 840
TTTTTCCTGA CTCTTAACAC CACTCAATGA CCCATCTTTA CAAAAATAAA AAATTCAGCT 900
GAGCGTGGTG GCTCATGCAT CTAGTCCCAG CTACTTGGGA GACTGAGGTG GGAGGATTGC 960
CTGAGCCTGA CAGCCCAAGG CTGCTGTGAG CTATGATCGC ACCACTGCAC TCCAGCCTGG 1020
GTGAGAGAGT AAGACCCTGT CTCAAAAAAA AAAAAAGAAA AGAAAAGAAA GAGTGAAAAA 1080
AAGAGTAAAG GGTAAATGAA AGTTCATAAC CTTTAAAAAA AAAGTCCTTA TCTTTTAGAG 1140
ATATATGCTG AAGTATATAC AGATGAAATG GTATGATATT TAGGATTTGC TTCAGAATAA 1200
TCCAGGTTGG AGTTGAGGGG CAGTGGGTGG GAGTATAGCT GAAACAAAAT TGGCTAGGAG 1260
TTGATAATTG CTGAAGCTCA TGGTTAATTA TGCTCTGCTT TCGTTTGTTT GAAATTTTCT 1320
GTAAGGTAAA AACCAAAAGA AAGGGTAGAA GAGATGTTAC AGTCGGGTTT AGACTGGGGA 1380
GCCAAGGAAA GACTCCTTTG AGGAAGAAAC ATTTCAGCTG AGACCCTTGT GATGTATAGG 1440
AGTTGGCCAG GCTGCAAGTG GCATTTGGCA GTTAGGGAAA GAGTTTTTTT AGGCAGCAGG 1500
AGCAGCATGT ACAAAGTCCA GCAAGCCCTG AGGAAGGAAC ATGTTGGTCC CTTGAGGAAA 1560
TGAAAGAAGG CTGCTACCAT AGGAATTGAG AGGCTGCGGA AGGAGGCATG GGCTAGACCT 1620
TTAAGACCTT GGAAACTATG TTAAGGATTT TGTTATTTAA TCCAATAGTA ATAGAAGAAT 1680
TTTAAGCAGC ACAATGTGGC TTTGCTTCTT TAAGAGCTCA AGTTGGCTGT TTGGTGGAGA 1740
ATGGTTTTGG TTTGGGCTCA AGGGAGAAGA GAATGTAAAA GTGGAGAGAG AGCTATTAGG 1800
AGGTTATTGC AGTGGTCCGA AAGAGTCTGG TGGCTTTAGA TTACAGAAAT AGTGATACAG 1860
ATGGAGAGAA GAGATACTGA TTTGACAGAT ATTTTTGTCT TGGTGATGTG GGGGCTGAAG 1920
GAGAGAGGTT TCATGATGCA TAATTTTCTG ACTGACGCAA TGGAATGGAT GGAGGTGTAG 1980
TTGACTAAGA TGAAGAAAAA AGGAAGAGAT TTTGTAGCAA GAGATTGAGA GCTTAGTTTG 2040
GAATATGCTA TTCAGAAAAT GTGCACCAAT TTACATATTT ACCTTTGTGT ATGAGACTAC 2100
ATGGAAGGTT TATATTTAGA GGTGTGATCT GTACAGATTT GTGTTTTAGA AAGATTATTC 2160
TGGTGGTGGG ATTCTGGAGA CTAATTGCTT GTTAGTCTGT GAGCTTTTTG AATTGAGGAA 2220
TCTCATCCTT ATTTTCTCTG CCTTTGTATC CCCAGTACTT AGCAGGCAAA TTGCTTGGCA 2280
CATAGGTACA CAATAAATAA TGTTAAGAGA ACCAATGCTG GTTGGGCGCG GTGGCTCACA 2340
CCTGTAATCC CAGCACTCTG GGAGGCCGAG AAGGGCGGAT CACTAGGTCA GGAGATCGAG 2400
ACCATCCTGG CTACCAAGGT GAAACCCCGT CTCTACTAAA AATACAAAAA CAAAATTAGC 2460
CGGGCGTGAT CGCGGGCGCC TGTAGTCTCA GCTACTCGGG AGGCTGAGGC AGGAGAATGG 2520
CGTGAACTCG GGAGGCGGAA CTTGCAGTGA GCCGAGATCG CGCCACTGCA CTCCAGCCTG 2580
GGTGACAGAG CGAGATTCCG TCTCAAAACA AACAAACACA CACAAAAAAG AACGAATGCT 2640
TATAGGTGAG ACATGAGGTC TAGGTAGAAA TGGATAGATT CTGGAAAAGT TTCCAAGATA 2700
GATTCCACAG GATTTGGATG GAAGATGGGA AAGTTCTCTC CCTTCGCGTA GCCTGCCCGT 2760
TGAACTTTTT GACAGGTCCG TTATGCCAGC AGGTCTAAAT ATAGGTAGCC ATCAATTTAT 2820
CAATGTTTTT TCCTCCTCAA TATTTATTTG TTTGGAACTC CATAGATTAG AACTCAATGA 2880
TATAATTATT ATAATATTAG TAGTAGCTTG AAGTCCTCCA TCACGCTAGT TCCCCTTTTC 2940
TGTCTGCTGA GTTGTCAATC CCAGAGCCCC TCTAATCCTG GCAGCTTTGG TGGTGGGGGA 3000
AGTTTCAGCA GCAAGAGGAA TTTGCAGCAG TAGTTACTCC GTATGTAGAA GCTGTCCAGA 3060
TGTTGAATAT AAGTTGGATA TTACGTATAT GCTTTTCATT TTACAAATGG AGACATAAGC 3120
CCTAGAGAAA CTTGTCAAAA TACATGCAAC AGGTCCGTGT AAACCCAGAT TTTTCCGATA 3180
CTGAACTGGT ACTTAGGACA GTTGATTTCT TGACTGATCA ACCAAATCCA TCTCCATCTA 3240
CTTTTTTCAT TTTCCCTGAT CCCTTATTGC AGAGTGATTC TATGTTAGTT TTAGTATTGC 3300
TTGATGCTGC CCACGCCTGC TCTTAGGCTC CTGTTGAATA TGTGCACTTA TGTGTGACCT 3360
TGTTCTTGTG TTGTGCCGAT CACTACCAGT TTACATCACT TGTCTATCCT CTTTGCTTTC 3420
AAAATTGTTT GGCATATTGC CTCTCAGCAT TTCTTTTCAT TTTAAATTTC AAAATGGCAT 3480
CTTTTATATT TTTTTCCTTG ATTGCCATGA CCAATGTGTA TTAAACAATT GGTTTATCTC 3540
TTTTTATTGA TACATAATAG ATGTACATGT TTTCAGGGTA CAAGTGATAT TTTGATACAT 3600
TCACATAATG TGTAATAACC AAATCATGAT AATGCTATAT CCGTCACCTT AGACATTTAT 3660
CTTTTCTTTA TGCTGGGAAT ATTTGAATTA TTCTCTTCTA CCTATTTTGA GATATATGGT 3720
AGATTATTAT TTACTATAGT CACTGTACTG ATTTATTGAA CACTAGATCT TATTTCTTCT 3780
AACTGTATTT TTGTATTTTT GTTTTTTTTT TGAGACAAGG TCTCGCTGTC ATCTAGGCTG 3840
GAGTGCAGTG GTGTGATCTC GGCTCATTGC AACCTCTGAC TCCTGGATTC AAGCAATTCT 3900
CCTGCCTCAG CCTCCCCAGT AGCTGGGATT ACAGGCACGT GCCACCATGC CTGGCTAATT 3960
TTTTGTATTT TTAGTAGAGA TGGGGTTTCA CCGTGTTGGC CAGGCTGACT AACTGTATTT 4020
TTGTACCCAT TAATCAACCT CATTTCTTCC TCCATCCGCC TACCCTTCCT GGCTTCTAGA 4080
ACACCGATTT ACTCTCTCTT CATGAGATCC ACTATTTTTT AACTCACTAA CATTTGCAGC 4140
AACATGGATG GAATTGGAGG TCATTATGTT AAGTGAAACA ATTGGTTTCA CTTGCATTTT 4200
TGCAAGTTTA CCAGATTAAA GTAGGCTGGC CTTATAGCAG CAATACCAGG TACTGTGGAA 4260
TCCAAGTACC CACCACTTAG GTTGACAGCC TTGGGCCTTC TTTCTTTGCC TGTGTAGTGG 4320
GGGCATATGC AAGCACAAGG GCAGGGTGGG GGTGTGTAGC AGAGAAAGGG AACAGGTGAG 4380
GGTTTAAAAA GTGCATTTTC AAGAAATATT TTAAGAGAAA TAAAGGAAGC TGCTTAAATT 4440
TTCATGTTGC CTAGAAGACT TTGAAATTGG GTCTAGGGTA AATTTCTTCT CTCTGTATTC 4500
AGTTCATTTT GGTTCTGATA TTTTAGGACC AGAACTCATA TTCCTTTTTA AAAAAGAAGC 4560
ACTCTGGCTG AGCGCGGTGG CTCACGCCTG TAATCCCAGG CCTTTGAGAG GCCAAGGCGG 4620
GTACATCACC 4630