EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS062-01463 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM18486 
Coordinate
chr1:208055590-208059080 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6671850chr1208057800hg19
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:208058583-208058602AGGCCAGCAGGTGGCGCCA+7.9
IRF1MA0050.2chr1:208056935-208056956TCTGAGTTTCAGTTTCTTTTT+7.9
IRF8MA0652.1chr1:208056939-208056953AGTTTCAGTTTCTT-6.03
IRF9MA0653.1chr1:208056939-208056954AGTTTCAGTTTCTTT-7.05
RUNX1MA0002.2chr1:208056449-208056460CTCTGTGGTTT+6.14
Number of super-enhancer constituents: 22             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03907chr1:208056217-208057280Brain_Anterior_Caudate
SE_03907chr1:208057743-208060627Brain_Anterior_Caudate
SE_12436chr1:208055742-208058024CD3
SE_13353chr1:208056372-208058013CD34_Primary_RO01536
SE_17929chr1:208055299-208058870CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_25552chr1:208055764-208062029DND41
SE_30242chr1:208057632-208059935Fetal_Muscle
SE_31189chr1:208055513-208062336Fetal_Thymus
SE_37661chr1:208057286-208068282HSMMtube
SE_39422chr1:208055123-208061722Jurkat
SE_41337chr1:208057654-208067896Left_Ventricle
SE_42838chr1:208057100-208066737Lung
SE_48845chr1:208057584-208063141Right_Atrium
SE_49854chr1:208055043-208065799RPMI-8402
SE_52485chr1:208055851-208056951Small_Intestine
SE_52485chr1:208056965-208057771Small_Intestine
SE_53314chr1:208055859-208060469Spleen
SE_55308chr1:208055966-208056385Thymus
SE_55308chr1:208056409-208057042Thymus
SE_55308chr1:208057094-208058064Thymus
SE_55308chr1:208058076-208058527Thymus
SE_66285chr1:208055123-208061722Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1208056200208056291
chr1208056600208057564
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I207882chr1208055729208059920
Enhancer Sequence
TGGGAAGCCT GAACTTCTAA CCTGGGCCAG CAATAATGAG GTACCCCCTT CACCCCATCC 60
CACCTCTCTG CCCTGAAGGT GTCAACAGCT GAATGGGGAA CCTGGACCCA CCAGTGTGGT 120
ATCAAAGGAG GGGTGCTAAA CAGAATCTTT CAATAAGATC CAGTCTTTCA ACATAAATCC 180
CAAATTTCCA GATGCAATTA AAATCACTGG TAATACCAAG AACCAGGAAA ATCTCAATTT 240
GATTGAGAAA AAACCATTAA CAGATGCCAA CATTGAGATG ATAAAGATGT TGAAACCATC 300
TGACAAGAAT TTTAAAACAG ACAGCCATCA TAAACATGCT TTAATGAGCA ATTGCAGCAT 360
GCTTGAAACA AAAGAACAGA AACACTCAGC AAAGAAATAG AAGGTATAAA GAAGAATCAC 420
ATGCTTTGCT TGAGCCTTAA AAGAATCACT CACATTTCTG GAACAATCAC CCTCACTTTG 480
CTCCTGGGAC AAGGCTTCTT CCTCTCTCGG GAACACCCAT ATCTCTCCTT TTCTCCTCTT 540
TAACTCCTGC TTGACCAAAG GATCAGTCCA GACGTCACTT CTCCTGGGAA GCCTTCCATG 600
GTCTTCCACG GCTTCCATGC CCCTCCCACT CAGAGCTTCC TATACCATAG CACTTACACT 660
CAATGCATAT TGTTCTGTCA TCTGTCCCTC CCACATCCAC CCAATGTAAA GACTTGACAG 720
AAGGGACTAT GTCTTATCCC AGGTGCCTGG CATAGTACCT GGCTTATAAT AAGCACTCAA 780
ATATTTTTTG AATAAATGAA TAAATTAATG AATAAATGGA AACTCTTCTG TGGCTCCTCT 840
TCTATTGGAT AAAATTAAAC TCTGTGGTTT AGCTTTAAAC ACCCTACACA AACTGTGACA 900
CCCGGATCTT TCTGGTACTC GGCTTCCCTT AACACATTCT ACTTCTCTGT CATACCAGAA 960
AACACATTGT CCTTTGACAG TACCTTATCT TTCCCCATCA CTACATATTG TATGTACTCT 1020
TCTATCAGTC TCAAATGTCC TTACTCATTA CTATCATCAA AATCGTATTC ATTTTTACAG 1080
GACCCACTCA GAAACCACCT GTTCATGACC CAGTCTCAGA TCTTCTCAGC TGGAAAGGGT 1140
CCTGCCCACA TCTAGATACA AAGCACTTCA TTTAGTCTTT CCTCGTGTTA TTTCTCACTT 1200
TCTGTTGTGC ATTTTTTTTC TTGCTTCTTT GTTTAAATGT GTGTTGTATT ATCCCCAAGA 1260
TTTAAACATT TGGGGTTCAA ATAAACTCAC ATCCTATTCA TCTTTGCCTC TGCCACTGTG 1320
CACGTAACAC AGTCCCTTGT TATTCTCTGA GTTTCAGTTT CTTTTTCTGA GATAATAGAA 1380
CCTACTTCAC AGGGTTTCTG TGAATGTTAA GTAAAATATG CTATTTAAAT ATTGGCACCA 1440
TATCTCAATT TTCATACAGT AAGCACTCAA AAACTGTTAG CTACTATCAT TGTAAATATG 1500
ATTATTATTT GAAGAAATAA ATAGACTGAG CAAGTCCTGT TACCTCTACT TTGAAACCAC 1560
TTTTTGAATT CTGCTTGATC TCATCACTGC CAATATGATC ACCTGCTCCC AGCCATGATC 1620
GTTCTTCTTG CTACGGTCTC CTTCTACTTT CTTATCCCTC AACCTCTATT CTCTACTCAG 1680
CAGCCAGCAT GATCCTTTTA AAACATAAAG CAGATGATAT GACTTCTCTG CTCAAAACCC 1740
TCCAGTGGCT TCCCAATCTA CAACTAAAAA GGCCCCATGT AGTCTGACCT CCTGCCTCTC 1800
CCCACCCCCA CTCACTGACA CAACCTCATG GCCATCTTGC CCCCTGCCAT CTGAGGCTTT 1860
CTGCACTTGG CAGCTTTTCA TCATAGGGCT TTGCACTTGT CCTTTCCCCT GTGTGGGATA 1920
ATCTCTCCCA GCTTGGCATA CAACCTGCTT CTCCACTTCA TTCAAGTGAA GCTGTGCTCT 1980
CCACTGTTAT TTTTCTAAAA GTAACCACCA TATGTAAAAT ACCAACCATT ATTCTCAATA 2040
TATTTTATGT TTTTCATAGC TCTCAATCCT GAAAACACAT GTATATACTT ACTGAGATGA 2100
CATTGTTTAC TGTCCTCTTC TGCTAGAATT ATAAGCTTCA TGAGTGTTTG CTGTATCCCC 2160
AGTCTCAAGA ACAGTGTCTG GCACATAACA GATGTTCTGG CACATTTCGC GCAGTGTCTG 2220
GCACATCATA AGACTTGATG AATGATTGAA TGGTGGCTGG AAGCCTCTTC GATGGGGGCT 2280
TTAGGAAGAG AAGCAGCATC CTGTTGCACA AAATCGATGA CCTATTACTG GTTTTGTGTG 2340
AAGAGGAAGT GTGGGATTAA TCTACCTAGA AGGGATGAGA TGGAAGTGAT CTATTTATCT 2400
GGACTTAGAT GGTATTCCCA TTTATCCATT CAGATGAAAA TCTGGCTGAA GATAATTCCA 2460
GATATGCTCT CCATAGTCAA CAGTGTAATA CCCTACAGCT AATTTTCCTG GGCTCACTGT 2520
GGGCGCCGAA GAAGCCGAAC CTCATGGCCT CCTGTGATCT TTGTCCTGGG GCTCCTCCAG 2580
GACCTGCTTG GCTGGCCAGG CCTAGGATAG CTTATGTTGA TGAAATGCTC CAGAAGTGAA 2640
GTCCCAAACC TATCTTCACA CTGCCACACT GGCTTCATGA CATCCAACTG GAGTAACACG 2700
GAGGACTCGG CAGAAGAGTA GGATGATATG ATGGAAGGGA AAACTACAGA TTCAGGACTT 2760
TGGAATTCTG GGTGATTGGG CAAGCCACCT CCCTTCTCTG AGCCTTAGTT TGTCTTTAAC 2820
TATACCATAA GGGAGTTTAA TTAAATGTAT CTTTAAAGTT CTCTTCAACA GTGACGTTCT 2880
ATAGTTATAT GAGCTTTGTG TACAAGAGAA ATTGGACTAG AGGGTGGGGC AGCCAGGGAG 2940
AGAAGCCCAA CATGGAGGCG ATTGAGCTGA GGCTGAGCAG TAGGACCTCA ATAAGGCCAG 3000
CAGGTGGCGC CATTGCTGTA CCAGGACGCT CAGGCCCACG GTGGGAAAGT TGGATTTTTC 3060
CAGAAAGCAG GCAAATTCTT CAGGGCAAGC TGTCCAGCTG TCAGAGGGAA CCAGCTGCCC 3120
CACCCCACCC CGCAATACAC ACACAGCCCT TCCTCCCAAA GCATACATAC ACATTCCAGC 3180
AAACTCAGGG TGAGATGCAT TGCAGGTTGC TAGGCCTGAA GCTGGAGGTG CATCCAAGTT 3240
GCCTTTTCCT CTCCTCCCAT ATTTCCTAGG AATCTGAACC CTGAACCCAC CCCTCCTACT 3300
TGATGTCCTA GCTGGGACAG ACCCTCACTG GATTACTCTC AAGGCAAGAT GTGCAACTAG 3360
ATGCAAGTGG GCTGGACTTC CCTACTGATT ACCATCGTCT TTTGCTCATC ATCCTTTGCT 3420
CCAACCCTCA AGGCAGCCAT CGCCTTTGAG GGAAGACTCT GAACCTCATC ATTTCGCCTC 3480
CCCTCTGTCC 3490