EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-01862 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:66804800-66810050 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr1:66808224-66808234TCTAATTAAA+6.02
FOXP2MA0593.1chr1:66807051-66807062TTTGTTTACAT-6.14
NFYAMA0060.3chr1:66806579-66806590AGCCAATCAGA+6.32
NKX2-5MA0063.2chr1:66805886-66805896CTCAAGTGGT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 21             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04069chr1:66805303-66806189Brain_Anterior_Caudate
SE_07288chr1:66805279-66806235Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_10326chr1:66804662-66806412CD19_Primary
SE_10951chr1:66793771-66843734CD20
SE_17976chr1:66804980-66806243CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18332chr1:66804716-66808279CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18332chr1:66808761-66810088CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_20316chr1:66805474-66806246CD56
SE_32694chr1:66804737-66809671GM12878
SE_34252chr1:66804757-66806523HCT-116
SE_34252chr1:66806587-66824529HCT-116
SE_38011chr1:66796858-66811052HUVEC
SE_51219chr1:66804689-66806260Skeletal_Muscle
SE_51219chr1:66806552-66808038Skeletal_Muscle
SE_55986chr1:66804882-66807990u87
SE_55986chr1:66808562-66819556u87
SE_58443chr1:66794442-66847442Ly1
SE_58986chr1:66795973-66869510Ly3
SE_60961chr1:66794456-66871060HBL1
SE_61831chr1:66795907-66847252Toledo
SE_62241chr1:66781876-66869563Tonsil
Enhancer Sequence
AAGGCATGGA ACATGACCAT AAAACAGAGA ATTAATGCTT CAGTAATATG TAAGGGAAAT 60
TTTTGGAAGT AACATGTCCA CTGTTTTCCT TGGGCATTGT CTTCAAATAA AGATGAAAGA 120
GAAGATTAAG CTATTTATTC TTTGTCATTG TTTCAGTTAC TCTTTCTATG ACAAAATGGA 180
GTTGTATTAG TGAGTATTAG TATTAGTGCA ATTCAGTATT CCAAGTTCTA GTCTTCTCAA 240
AACTTAGCAA ATCAAAGAGT TTGAAAGTTA TTTGGTGCTT TGTAGTAAGT TTGATTTGTA 300
ATCTGTTTTG TTTTATTCAA ATAGTTCTTC ATTGGTTTTA ACAGAACCAT TTCTTTACTC 360
AATGGTAATC CATTTGGCCC AATCTTTCTG CCTAACTCAC TTGAAAGTCC TCAAGTGAGC 420
AAGTCTCTAA AAAACAAACA GAAATGAAGA GGACATTGCC TTTGATTGTT TTACCTCTGG 480
CTACCTGATA AGAGAGCATA ATAGTCTCAA AATCTGATAA ATAAATCATT TTAAGGGGAG 540
TATCTTTCTC CACATTGGGG AAAAAATAAT AGTTATGTTT AGATTGTCAA ATGTAAATGT 600
AAATGTAGAA CACTAGTCTT CAAAAATAGA ATTCAACCCG TTAGCAGAAT AAATGTTTAG 660
TCTCCATTTT TTTAATACTT TTTTCTCATC TTTTAAAAAT TGTTTAGTTT TTTTTTGTTT 720
GTTTTTTTTG TTGTTTTTTT TTTTTTAGAA TATGTCCGAG TCTAAAAGGC TCCTAGGTTG 780
TATGCCATTG TTGTCTATGA AAGAAAAACC AAGGGCGATG GTGCTTGCAT TTGCAGTATT 840
CTTCCAAAAC ATTTTTCTTC TGAGTAAAAG TGTGCTCAAC AAGTGGAGAT AGCTCAGACA 900
TCTGGAAGCC AGGACTTACT AAACAAGAAG ATGCCAGGGC AAATTTGTGC CACAGTCAAT 960
AGGTTTCACA CTCTTGAAGG CATGGTGCCA GTTGTCAATA TGCTTTCCTG AGCATCCTTT 1020
CCCTCTAGCA TTTTTCAGGG ACCTACCAGC ACCTCTCTGT CTTGCTCACT TGTACGTGAT 1080
GTTTCCCTCA AGTGGTGCCA AACTGTTTAG TCTCTTGTGT ATTTCACTGT AACTTCCTTT 1140
GTTTGATTGA CTTTAAAGTA GCCAAGTGCT TCCACAAAGA AAGGACTGTT AAGTTATTTA 1200
GAAACGAAGA AGACAGTAAA ACTCCTGTTT CTTTTGTTTC TGCTTTGGGA AGTGCCAGAT 1260
AATTTTTTCT TCTTATGGAA TAGATTTTAA AGCTATAAAT CTTGCCATTC TGTTCAACAG 1320
TCACTTTTTT CCTTCTGCTA ATTAATTGTA ATTTTAAAAT GTATCAGTTT TGAAATCTAG 1380
AGCCCCCAAA GATTGAAGTT TAGTAAATTT ATTAAAATAA AATGTATCTT CATGGCTCAG 1440
TAACTTTCAT CTTCTAATTT TTTTAGCTAC TCAAAATAAT TATAATTTTT TAATTAACTA 1500
TTAAATACTT TACATGGCTG CCATCCCCTC ACTCTTTGCT AACAGCATAG TGCATAATGT 1560
TTTAACTTTA AGCAATTATA AAAATGAAAT TTGAATACAC ATACTGGGAA GTAAAAATGA 1620
CTAAGCCAAT TTTTAAATTT TAGATTTAGG ACAAGAGGTG TTGGCATTTG ATATCTAAAA 1680
AGATAGATTT TAAGTAGTTG TTTTAGAAAG AAAATAGTAA AAAGAAAAAT TATCAGTAAA 1740
TAAAAATAGA TTTCAACTCA ATTATATAGG CTATGCTAAA GCCAATCAGA CAGGGCACAG 1800
TGAAGTATTA ATTTACCAAC TATCTAATGT CTTTGGTCAC TATTGATGAA ATTTGATAAA 1860
TCAAACCAAA AAAGATCTAA ACATTTTCTT TCTAGTTATA GTTTTACATG ATTACATTAG 1920
ACAAAGTCCT AGAACTTTAA GCCTAGAAGA GAGCCTTAAG TATTATTTTC TATTTCTATT 1980
TGAAGTCATT TTATAGATGA GAAAAAGAGG TGGCTTTTGC CACTAATGAC AAGTGAGGAT 2040
TAAAGTACCT AATGTACTCC AAATAACTTT GTAAAATATA GAGCACATTC TAAATGAAAA 2100
GTAATTTTAT TATGGCATGA CTTCTCCAAA GTCTTAAGGT GTATTAGTGG GATTCAGGTA 2160
TTAAAGTATA GGTCTGATCA TAAATCTGGC TTACTGTTCA TCTTCAGCAA AAGGCTAGAT 2220
ATGTTTGAGA AAGACATGGG ACATTCTCTC TTTTGTTTAC ATTGACTTTT AGACTTCTCA 2280
TTCTTCATTT ACGTTTCTTG AGTAAAAGGT ATACATAAGT GTCTTAATAA TTTCAAGTAA 2340
AGAGAACTAA TTTAGTATGC CTGAAAATTT AGTGATCAAA ACATAGCAAG AACTAGTTGG 2400
AGTGAGTTAC TTTAAATGCC CCTGGTTTTA ATTTCAGAAT TTTTAAAAAA GCCTTAAATT 2460
TTTGAGGCTT TTGATTGTTG TTTGCTTTCT CACTCATTCC AATGTCAAAG TTTAGGTAGT 2520
AAAAATACCC TGTGGTTAGT GTAACTGCCC TTAACTTCTT TCTATTTCTT TCTTTCCTCT 2580
CTCTGAAACT GAAGATGATA AATTGGAAAG TTTTACCACT TGGATTGTTA AGCCTTGGGT 2640
TCTCTCTGCC ACTTTGCAGA GCTGTTAGCA TGGAAAGTTG AACGTGAGAT GGTGATTCCA 2700
GTTTGACCCT CTCCCTACAC CCTAGAATGT TTCTGCACAA TGAGCCAGAT TATGTAAAGC 2760
TCTCACAGCT CAAATATAAT TTCTAGACTC TTGAGTCATA TTACCAAGAT CCTAGTGGAG 2820
TTAGGTACAA TGGTGTTGGC AGCTGCCTTG TAAATAGTTT AAATCAAATA AGTCTAATTC 2880
ACAGCATATA GAGACACATT TTTATGTATT TAGCCAACTT AAAATCAGTC TTAGTATGTG 2940
TAGATCCCTA AGTTAGCTGA TACTGCAAGT ATTTTGCCAT AAAATTTGGA TAAATAATAA 3000
ACTATTAATG TAATTATTTA AATGTCGGGA AAAATCAAGG GAAAATGACT CGAGGAATTG 3060
AGCATCTTGG GATAATATTT ATTAAGGGAA ATTATTCCAG AAGATCCTTG AGAGTCTAAC 3120
GTTAGCTCTT TTTTCTCCAT AATTTCTAAT CATTATTTAC ATTTCAAAGT AGAACAAAGT 3180
AAAAGAAAAT TCCTTAGTAT ATAATGTAAG AAATTAAAAG AAAATTTCGA ATTCTTAAGT 3240
GAGTAAGAAA GCTTAGTGTT TTGGTTATTG GAATAAGATA CAGAAAACCT GAATTAAAAA 3300
GCTAAAAAGT GACTGGGCGC AGTGGCTCAC GCCTGTAATC CCAGCACTTT GGGAAGCCAA 3360
GGTGGGCGGA TTACTTGATG TCAGGAGTTT GAGACCAGCC TGGCCAACAT GATGAAATAC 3420
TGTCTCTAAT TAAAAAAAAA AAAAAAAGAA AAAAAAGAAA AAAAATTAGC TGGGCATGGT 3480
GGCACACACT GTAATCCCAG CTACTAGAGA GGCTGAGGCA GGAGAATCAC TTGAAACCAG 3540
GAGGTAGAGG GCAGTGAGCT AAGATCACAT CCACTGAACT CCAGCCTGGG CAACAAGAGT 3600
GAAACTCCAT CTCAAAAAAA AAAAAACAAA ACAAAGCTAA AATGAGGCCA GGCCAGTGGC 3660
TCACGCCTGT AATCCCAAAA CTCTGGGAGC CCTAAGAGGG CGAATCACTT GAGGCCAGGA 3720
GTTCAAGATC AGCCTGGCCA ACACGGAGAA ACCCTGTCTC TACTAAAAAT ACAAAAAATT 3780
AGCCGGACGC AGTGGTGCAT GCCTGTAGTT CCAGCTACTG GGGTGGCTGA GGCATGAGAA 3840
TCGCTTGAGC CCTGGAGGCA GAGGTTGTAG TGCACCAAGA TCGCACTACT GCACTTCTGC 3900
ACTCCAGCCT GGGTGCTGGG TGATGGGAGT GAAACCCTGT CAAAAAACAA CAACAAAAAA 3960
AAACAAAAAA AACTAAAATG GAGATTTTAT TGAGGGAAAA TCCATTTACA GGCTAGGAGA 4020
ATCATTTGTG TATAAAAAGG AAAGGCACAG ATTTTTTTTA AAAAAGAGAG ACTAAAATTG 4080
TTAGTAGCTC CTCTTGATTA AAACAGTGGA CTTCCAACTT CCTCTCTACC CTCAATGTCA 4140
GAAAATCTAT GGAAAATATG GCTTAAGAAT ATTATCATCA CTTGAGAATA AAGAAACAGA 4200
GGGATTTACC CTCCATCTTC ATATTCCATT GACTAGAAAA CTTCCCCTTG GCTCAAACAT 4260
GTCATCAGAT CAGACCCTGT GCTATGATTC TGCTCCTAGG ACGCCAAACT GTGGGGCTTT 4320
TTTTGAAACC CTCCCTTAGC TATTCTAACT TCCATAACAT TTTCAAAGGC CATCCTCTTA 4380
CCTATCTTAT CAATTAATAC CATAGCTAAC ATTTTAGTTA TCTGGGATTT TATTTATGTC 4440
TGCTCAGATT GCAAGTTTGA ATGTTTGAGA CTCCACTTTC CTTGCAGGAT TCGGGCTAAT 4500
ACATGCCAAG GAGGCATAGA TTTCTTTCTG TTTAATTGTA AGGATGGAAG TGAAAAGCAA 4560
AGAAAGTTTT TGTCAGTTGG TGGTAGTTGA TTTTTGGTTT ATTTTAAAAA GCTGTCTGCA 4620
GTTTTCTTGA TCATTTAAGA AATTTGTTGA CATGGCACTT TTAATAGATT ATCCTGCTTT 4680
TAAAGAATGC TGGCATGGGT AATGACCTCA CTGGTGGGCA CAGAACAATA ATAAAGATAG 4740
AATTTTTTTT TTTGTATTTT CAGAAATTTA AAGTTATGAA ACATTTTTAG ACTATCCAGT 4800
GGCAATGTGC ATTTCCAGTA TACTTTTGTA TGATGGTGAG AAGCTAGGGA CCTTCTAATG 4860
GGTCACTAAT GAAATGGACT CCAACTCCCA CTCTGGATCT CTCACTCATA ATCCACAAGG 4920
ATTAATTTAA CCTGCCAGAT GCTACCCATT TAGCAAGCTG AAAGGACACA GTGCCCCCCA 4980
ATGCCTGTAG CCTTGTCTGC TGTTATTGCT ATTGCTGGCT CCATTCTATA AGTGAGTCAG 5040
ATGATTTAGA TACATATATG TTTACTAATG CAATGGGTAG TTTTTCTTGG CCAGGCTCAG 5100
TATATTATTT GTGTTCTTGT CAGGGAGAGC TACCAGTGAA TTTTTTCCTG CTGTATTTTA 5160
ACACTCAGGA ACTGGTTGTG CAAAGTTTAT TTGCATCTTT CTTGTGCATT GCATGGGAGT 5220
GTCCTTGAGA ATATCTTGTA AACATTTGCT 5250