EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS053-03309 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Foreskin_keratinocyte 
Coordinate
chr1:198135290-198139950 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6MA0677.1chr1:198135572-198135586TGACCTTTGACATG-6.49
SOX10MA0442.2chr1:198138043-198138054AAAACAAAGGA+6.32
Sox3MA0514.1chr1:198138043-198138053AAAACAAAGG-6.02
TBX21MA0690.1chr1:198138979-198138989AAGGTGTGAA+6.02
TBX2MA0688.1chr1:198138979-198138990AAGGTGTGAAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 32             
IDCoordinateTissue/cell
SE_12078chr1:198134229-198139560CD3
SE_13146chr1:198136359-198137316CD34_Primary_RO01480
SE_13489chr1:198135329-198145809CD34_Primary_RO01536
SE_14152chr1:198135910-198138000CD34_Primary_RO01549
SE_14152chr1:198138238-198140674CD34_Primary_RO01549
SE_15052chr1:198134360-198138072CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15052chr1:198138201-198139905CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16568chr1:198134498-198137203CD4_Naive_Primary_8pool
SE_18461chr1:198133773-198151182CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19334chr1:198133830-198140561CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20665chr1:198134206-198139764CD56
SE_21146chr1:198134688-198138025CD8_Memory_7pool
SE_22590chr1:198132517-198140223CD8_primiary
SE_25720chr1:198135582-198138235DND41
SE_25720chr1:198138720-198139971DND41
SE_39571chr1:198134027-198136851Jurkat
SE_39571chr1:198137012-198138201Jurkat
SE_39571chr1:198138346-198140040Jurkat
SE_43314chr1:198135140-198137067Lung
SE_43314chr1:198137134-198138050Lung
SE_43314chr1:198138853-198139589Lung
SE_49934chr1:198134943-198136814RPMI-8402
SE_49934chr1:198136843-198140606RPMI-8402
SE_54238chr1:198135377-198135952Spleen
SE_54238chr1:198136047-198137133Spleen
SE_54238chr1:198137208-198137828Spleen
SE_59976chr1:198125149-198149177Ly4
SE_61128chr1:198124885-198149566HBL1
SE_62565chr1:198125065-198159352Tonsil
SE_66295chr1:198134027-198136851Jurkat
SE_66295chr1:198137012-198138201Jurkat
SE_66295chr1:198138346-198140040Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1198136529198137056
chr1198136624198137000
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I198165chr1198134273198146049
Enhancer Sequence
CGTAAGGCTG TTTCACTTTC TTATCATTGG TGTGTTCACT GAGTATCACT TTTTTCTTTT 60
GTCTTTTTAT ACAGATGTTT TACTCAATTA TAGAAAATTT TAAACACATT CAAAATAAAC 120
AAAATAGTGT AATAGACCAG CTCCGAGCTT CAGCAACCAC TGATAATGTA CCATTTTGGA 180
CTAGCACTTT TAATTTCCTT CAAGAACTTC TCTTTTGCAT TCACAACTTG GCTGTTTGGC 240
TCCAGAGGCC TAGCTTCTGA GCTACTAGCT TCTGACCTGT CTTGACCTTT GACATGCCTT 300
TCTCACTAAG CTTAATCATT TCCAGCTTTT GATTTAAAGT GAGAGATGGG TGACTCTTTC 360
TTTCACTCGA ACACTTGAAG GCCATTGTAG GGTTATTAAT TGGCTTAATT TTCATTATTG 420
TTGTGTCTCA GGGAATAGTG AGGCCCAAGG AGAGGGAGAG AGATGGGAAC GGCTGGTGCA 480
GTGAAGCAGT CAGAACATTC ACACACCATG TATCGTTAAG TTTACCGTTT TATTTGGACA 540
TGATTCATGG TGCCCCAAAA CAAATACAGT AACATCAAAG ATTGCTGATC ACAGACCACC 600
ATAAAAGATA TAATAATAGT GACATAGTTT GAATTATTGC AAGAATATCC AATATGTGAC 660
ACAGAGATAT GGAGTGAGCA CATGCTATTG GAAAAATGAC ACTAACAGAC TAACTTCACA 720
TAGGGTTGCC ACAAACCTTC AGTTTATAAA AAACACAATG TGTGAAGCAC AATAAAATGA 780
GATATGCCTT CATTAGTTTT CTGTAACTGC TGTATCAAAT TATTACAAAC TAGATGGTAT 840
AAAACAACAA ATTTATTCTG TCACCATTCT GCAGGCCAGA AGTCAGAAGT CAGGGTGTTG 900
ACAGTGCCGT GTTCTCTCTG AAGGCTTAAG GGAGAATGTG GCTCATGCCT TTCTCTTAGC 960
TTCTGGTATT GGCAGCAATC CTTGTCTTTC CTTGGCTTGT GGATATATCA CTCCATTCTC 1020
TGCCTCTGAC ATGCAGGTTC TTCCTATGTG TTTTCGCTTG TGTCTCTTCT CATAAGGACA 1080
TCCTCATGAC CTCACCTTTG CTGCCTATCA CTCTTACACT TAAAATTCAA CAAGCAAAAT 1140
CTATGCTTTT CTATTCAGAT TCTTTACTTA GAAAAGATTT TCAAATTTCT GATGTTTTTG 1200
GTCTTAACAG CAGATTTTAA GATTGTGCGG AGGTTGTGTC TGAGAGATAA AGGCACCCAA 1260
GGCATCTTAT ATGATATGCA CTCATTAACA TGATGATGAT AATAACAGGA GAGAAAATGC 1320
CACTTCAAGC AAGGTGAAAG AAAATAGTAC ATCTAAGTGT TAGTTTTAGT TCCTTCTCAA 1380
CCAAACGGTC CCTTGTTACT GGACTGCTTA GGCTGTGTAC TGTTCTCACC ATTTTTGGCA 1440
TTTTTACAAA ATTTCTCTCA ACTGGGTGTG AAAGCTTACC ACTTCCCTTG CTCCTGAGGT 1500
GTTTTTTTGC ACAGGGGCAA AAGCTCTTTG CCTTGCCACT TAGAGATTTT GCCTCTAGTT 1560
ACCATTACCT ACCTGTAGTT CTCTATCTTG TTTCACAGCT CGACTGCACC AGACTTTTCT 1620
GTCTTGCATG TCTGGCCACG CTGGAAAGTG TTCAAGAACA TTATGATGAG TAACCTGTTC 1680
CTTTTTCCAT GACTGTCTTA TTTCCATCTG GGACTTTGAT AACAAGTGAC AGGCACTTGA 1740
GTCCCATCTA ACTTCCCTCC TTGTCAGTAG ATACAAGCCT TTGCATTCAA GTGTTGCTCT 1800
TTATTCAAAA GCCTGTTTGG CAATTTTAAA ACTGTTTTCT ATCAGCGATT TGTTTTCACC 1860
TTTTAAAAAA ATTTGGAGTT TATAAACAGC ACAAGCCCTT GTTGTTTATG ACCATTTCCC 1920
CTTCTCTTTA TTTATTATAA GAAGATGCAG CTTGACATAG AAAGTTTTCA AATCGTGGGT 1980
CAAGTCCAGG TGTATTTTTT TATTTTTCAA ATGCCAAACA TAGGTTCTGA CACTTAGTGT 2040
GAGCTAAATG TAATATATAT GGAACTCAGT TTAAGAGTTG AGTGCCTGGC CTAGGGGAGA 2100
GTGATTTTGT GGTTAATGAT TCAGATAATA TAAGAAGCAT GGGCTGTAAT GATGTACCAA 2160
CGGTATCTGG TTAGAAAATG TTGAGACTTT TGTCTCTTAG TGTGTGGTCC CTGGCAGGGC 2220
AGTACTACCA TTCCTAGGCC TTTTTTGTTT GTGTTGTGGG TTGTCATCCC CAGAACGTCA 2280
GCATTTCCAC ATTTTCCAAC TTGTGAACTT TGTGGGGTAT TTGCATATGC ATTTTGAGAA 2340
TGTTTGAAAG ATGATCCTGT TGACTGCACA GACTTGGTGT AAAGTCAGTT TCAAATTGAG 2400
GTGAGCCTTC TCTGAACTTG GGAGGCATAC TTGCCTGAAA TTTGAGGATA GACCGTGTGA 2460
TCTTTGGAGC CTTCTGGCAG CTGTAAAATG AGTGACTCTG TGATTACATT CCCTTTATAG 2520
TTCATCTTTT TGTTTCTTTT TTTTCTTTCC ATTTTCCAAC TTGGTCTTAT CAATCCACAG 2580
ACCAAAGAAA GATAAATTTG GGAGTTGTTG GTAGGTAGCT GAAAGTGAAT GAAATGATTA 2640
CAATTAAAAA AGGGACCATA GCAGGAGTGA GAGAGAAAAA CCTAGATGGC AGTGGCAATT 2700
TTAAGAGAGA TGTAATGGCT GGAATAAAGT AGGAGGAAGA AAAGAAACCT TTAAAAACAA 2760
AGGAGAGGAG TATGCAGAAC ATATGGGAAA GGAATATGGG GAAGCAGCTT TCTGTAATGT 2820
TTACTCATTT GAAAAGATTA TTCTGAGATT TCTCTGTATT ATAAAATTAG TATATAGGTT 2880
GCATAGTTGA TTCATGTGCA TAATTTATAG TTTAAAAGTA AAGTGGTCAG TACATATGGC 2940
TTAGCTCTAT GTGTTAGTTT TTAAAAAAAT CTACATTGTT TTGAGTGTTT GGTTATTAAT 3000
AGTTTATGGA TATAACTGCT GCACAGTAGT AACTCCTTCA TCTACTGGAA GGAAGGTCAA 3060
TTTTTCAGTC ATTAGAAATA GGTAGCTAAA TGAGATGCTT CTTATTTTTG CTTGGAGGTG 3120
CCAGGTTTAT TTGCCAACTT TCCACAGTTA GAAAGCACTT TGGATCACCA CTGTCAGATA 3180
TTTAGATTTC TTTTTGAGTC TGGAGGATTG TATTTCTTAT CAAAACAAAT ATCCAAGTTT 3240
ATGCTTTAAA AATATTTAAG TTTTTATTAA TTGCAGAATA TGAGAATAAA GGAACGACCA 3300
AATGCTGTAC CATATTGCCT GACTCACTCT GCCACTAAAT GGAGCCCCAC TTGATCCTCA 3360
CCTGGCTTTC TAGATTATTT ATTTCCTGTA TATTCCCCTA CATTTTAGTC ATATCTAACA 3420
ACTTACTGGG TTTTTTTTTT TTTTTGGAAA ATTTTGTACC CTTTCTGGCT TCTCCACTCT 3480
ATGCTTTTCT CACCACTTTA AATGTCCATT TTCCATATGT CACTGTTCAA TCTCAGTGCA 3540
TTAAAATAAT CTTTATCCTT TAAGGCCCTG CTCAAGTACT ATACAAAAAA ATACAAATAA 3600
ACCTCTTTCT TCTGCTTCTT TAAGCCGTTA GTACTTATTG AGTCTTGTTG TAGTTATCTT 3660
AGCTTCCTCT CTGGAGCATA AGCTTCTGGA AGGTGTGAAT CATGTCCTGT ACAGATCTGT 3720
GTTTTCTGTA GGGCCTAGGA CCATTCTTGT CAGAACTTGC CATTTAAAGA ATGGCAGATG 3780
ACTGCTTCCC AGAGACTACA CTTGACAGGA GGTCTAGGCA GGTCCTAGCA GTAAGGGAAT 3840
GCCCAGAACA ATTGAGCTGT TGGTTTCAGG AAAGGTCTAG GATGAATGCC AGGCACACGT 3900
CTCTGCAAGG CCCACAGAAC ATGGTATGAA GGAGGTCTTA TTGTTTGAAA TAGGTAAAGG 3960
TCTAATCTGT GAATGGTCAC TGTCAGGATA TTCAGGGATC TAGTCTGAGA TGCTTGGTTT 4020
TGTATCTGAA TTCTGAATTC CAAGGTCTGA AAGATCTCAG AGTGGGGTGA GATAGGAATC 4080
AGGACTAGGA AAAACGAGTG TGTCAGACAT GAACTTGGTG TGAGTGGGGA GGAGTGTGTG 4140
GAGACCAGAC AGAGACTAGT TTGGCAATTA AGTCTAAGTT AGAGGCTCGA GCAACAGGGA 4200
ATAAAGTGAG AGATAAGTCC TGGAGTTAAG ATATGATATT AAAACATGAC AGGCAGTTAG 4260
ATTAAATTGA CTTGAAGCTG ATTTGCTAAG CTGTTGACTG AGTATACTTA AATTTCCTTT 4320
CCTTAGAGCC CAGTTCATTC CTAGTTCTAG GTAAGTCGTT TGGCTTTCTG TAAAGGGGTA 4380
GGAACCTTTT TATTCCTTAA AGGTATGACT ATCTATTTGC CAATTAATTC CATGTTCCAA 4440
GGATCCCCTC ATGGAGAAAA TGTTGCACTG AGTTAAATAA GGAAATAACT GGACGAATAC 4500
TTGAGATTAT TCCCTTCATA AGAATAATTA CTAATTGTGA ATTGATGGTT TGAATACCAT 4560
GCTAAAATGA TTGAACCTCT TTTCTCTTGT GAAGTGATTG TGAAGTTACT TGTACCTTTA 4620
TGTTTTTAAA ATTTGATGAT AATAGCAATA AAAGCTTTAG 4660