EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS051-00546 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_thymus 
Coordinate
chr1:28572200-28575950 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:28575155-28575174TGGCCTGCAGGGGGCGTTG+6.36
Gfi1bMA0483.1chr1:28575846-28575857AAATCACAGCC+6.02
LMX1BMA0703.2chr1:28572493-28572504AATTTAATTAA+6.32
Nfe2l2MA0150.2chr1:28575358-28575373CATAATGACTCTGCA+6.15
PHOX2AMA0713.1chr1:28575669-28575680TAATTGAATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr1:28575669-28575680TAATTGAATTA-6.14
RUNX1MA0002.2chr1:28573301-28573312AAACCACAGAG-6.14
SNAI2MA0745.2chr1:28572942-28572952AACAGGTGCA+6.02
SOX10MA0442.2chr1:28575393-28575404TTCTTTGTTTT-6.62
Sox6MA0515.1chr1:28574936-28574946AAAACAATGG-6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
SE_15081chr1:28571965-28577001CD4_Memory_Primary_7pool
SE_21005chr1:28572183-28576988CD8_Memory_7pool
SE_29182chr1:28569155-28576849Fetal_Intestine_Large
SE_40167chr1:28572835-28576978K562
SE_64750chr1:28572499-28577008NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr12857230028572395
Enhancer Sequence
GGTTTCCCCA TGTTGGTCAG GCTGGTTTCA AACTCCTGAC CTCAGGTGAT CCGCCCACCT 60
CAGCCTCCCA AAGTGCTGGG ATTACAGGCA TGAGCCACCG TGCCTGGCCC AAGAGTGTTA 120
AAGTCTGGTG CAGTGGCCTG TAGTCCCAGC TACCCCAGAG GCTGAAGCAG GAGGATCATG 180
TGAGCCCAGG AGTTTGAGAC CAACCTGGGC AACACAGCAA TACTCCCTCT CTTAAAAAAA 240
AAAAAGCCTT AAATTTATTT GTTCATAGTC TTCAACTCAC GAATTTTTCT AGGAATTTAA 300
TTAATCAGGA ATATAATTAT TTAAGAGTTT TATCTCATCT TGAAATATGT GAAAAATTGG 360
GAAGAAAACC CTAAATGTTC TCAATAAGGA TTAATAAATT ATAGCATACA TGAATAGTCT 420
GCAACCATTA ACAATTATAT TTAAGGAATA TTTAATATTA CAAAAATTAT GAAATGTGCT 480
AAGTGGAAAA AGCAGGCTAT ATAGCTATAC ATTATTAATA CGGTATATAA ACTTATATGC 540
TATAAAAATA ACCAACATGT TGGTTTCTCT TTGTAGTGCA ATTGGGATTT GAGGGAGTTC 600
TCCCTTCTCT GTTTAAAAGG ATCTCTTTAA AAAACAACAA ATGTAATACA ACTTAGCACA 660
TAGATAGATA TTAAATAAGT GTATTATATA AAGAATCTTA AAACTTCTCC CTTCTCCGTC 720
CACCCCAGAG CTAACCAATG GTAACAGGTG CAAACTACAC ATCTTTCCAG ATCTTTGTTT 780
CCTCTGTGTA ACTATGTATA CAACTATGAG ACTGTTCTAT ATGTATCATT GCGCAACCTC 840
GGTTTTTGCT TCGTTCTGTT TTAACCTAAC AGGAAATCCT GCATACCTTT CCATTTCAGA 900
GCACTTGGAG CTACCTTCTG TTTCTTTGCT GTAGAAGCCG TTGTGTGAAC AAATCCGTTT 960
ATTTCTCTCA TCAGTCTCCT TTGATAGACA TTTGGGTCAC GTCCGGTTTT ACGCTTTTAC 1020
AATACATCAG TGAACAGCAG TAATACGAGC TCAAGACAGA AGGCCTGAAA AACATTGAAA 1080
AACACAGAGA CGGAAAAAAA AAAACCACAG AGGGGGAAAT ATAATTTCGG GTTATTTCAG 1140
TTTCACCTTT ACACTTTGTT ATATTCCACA TTTTTTGCAA TAAATATAAA TTTGGAAGTA 1200
AAAGCATAAA ACGAAAATCA AACGATTGAT TGATTGATTG ATTGACTGAG ACGGAGTATC 1260
ACTCTCGTCG TCCAGGCTGG AGTGTAGTGG CGCGTTCTCG GCTCACTGCA ACCTCCGTCT 1320
CCCGGATTCA AGCGATTCTC CTGCCTCAGC CTCCCGAGTA GCTGGGATTA CAGGCGCCCG 1380
CCACCACGCC CGGCAAATTT CCAAACGTAT ATTTAAAAGA AGAAAAGGAA AAGAGGGGAA 1440
AAAAAGAAAG AAAGAAAGAA AGAAAGAAAT TAGAAGCAGA TGGGGCAGTT CAGCCTCTTC 1500
TCGCGGAGCG GGGCTAGACG GAGTCAGGGG CGGACCGCCA CAGCCTGCAC CAATCAGGAC 1560
CCGGTTGATA GGCAGAGCCT GGCGACTTCG AAGACTCGCC CCCAGTCAAA GAGCCCCGGG 1620
GATTCGTTTC CGTACGCAGC CTGGAAACCA GCCTGGGCCT ATCCTGCGCG CCGCTGCGGG 1680
CTACTATTGG CTGCCAAGAA ACCCCGCCCA TCTTCCTGCT CATTGGCCGG TGCGGTTTAC 1740
GTAAGAGGAG CCTGTTGCTG AGCGAAAAGT CTGTTCTGCA ATTTTCGCTA AGGAGTTGTT 1800
AACGCTGAAA CCGCACTGGG CGTCCTGGGG TCAAAAAAAC AATACTAGCC ACAGTTTATT 1860
AAACTGCAAC TAAATGCCAG GCTATGTGCG CCAAACTTTT AATATTAATG GTTGTAGGCA 1920
CCTTTCTTGA ACACCCACCA CTATCAGCCA GTCACTGAGC CAGATCCTTC AAAATAACAG 1980
TAAAAATATA GATAATCTAC AGTTTATTGA GCACTTCATC TGCATCAAGC CTTGTTAAGG 2040
GGTTTCCATG CATAAGCTCT CATTCTCACA ATAGAACGGT GGAGGTAAAC TATTGCCCCA 2100
TTTAACATTT AACATGCAGT CCTGTAGACC CAGCTACTCG GAAGGCTGAG GTGAGAGGAC 2160
CCAGGAGCTC CAAACTTAAG TGAGCTATGA TCGCGCCACT GCACTCCAGC CTGGGCAACA 2220
GAACGAGACC TGTCTCAGAA AAACAAAAAC GTAATAAAAG AAAAACAAAA ACAAAAAAAC 2280
AGGAAACGGG TTCAGAGAAG TGAAGTGTTT TGCTGAGGTT CACAAAGAAA GGGTTGGAAC 2340
TGGAACCTTC AACTCCGATA TCCTGATTCC AAGTGTGGCC TTTTTAGGGA GGGGGTCGGG 2400
GTACAGAATT CCGCTGGGGA TAGGGAAAGG TAGGACAGGA TGGTGGGAGG CCAGAGGCGT 2460
TGCTCCAGGG ACAAGCCTCA GGGTGGTTCT CTGAGAATAG GATGTATAGA GCCTCTAGGA 2520
GTGGAGGGTT GGGGAAGGAA GGGAGACCAG AGGAAAGGGA GAAGTTGTTC TTTCTGAAAA 2580
TGTGAGGCTT CTCTCCTGGG GCAGCCTATT AAGGTGTAGG TAGCCCTGGA CCTCGAGATT 2640
CTAGTCTCCA CTCTGTGGCC AACTTCCTAG GGAACCTTGG GCAAATTCCT CTCTCTCGAC 2700
CTGAGGCTTC CTGCCTTGTA AGAGAGGTAG TAAGCCAAAA CAATGGAAAG TGCATTCGGG 2760
CTGTGAAGTA TTTTAGGACT CTGGTCCTTG CTGGCAGCAG GGGGAATCTT CAGCAACCAC 2820
AGACCTTTAC TTAGCTGTTG CCTGGCCTCT TTTCAAGACC TTCAGGCGGT GACATGGACC 2880
CTAACAATCC TATAAACTCA AAACGGTTTG GGCCAGCCCT TTCCTACTCC ATTCTGACTT 2940
AGCTATAGCA GGATCTGGCC TGCAGGGGGC GTTGAGGAAC CACTCAGCCG ACAAAACTAA 3000
ACTAAATCAA CCAAGCAATT TGCCCAAAAG CACCCAGTGC GTTAGTTTTT GCATTTAAGA 3060
AGGGTAAACG TTTCCAAACC TGAAGATTTC TGTCCTCAGT ATGCAATCGA GAAGACGAAT 3120
TATATACACT GCCAGTTCTT TATGGCACCA GTTCTCTCCA TAATGACTCT GCAAGTTTAG 3180
AGCTAATTTC TATTTCTTTG TTTTACAGAT AGGGAAACAG ATTCAAAGAG CTGGAAAAAA 3240
AAAATTCAGT TTGGGTTACT TGGCTAAAAG CTGGCACCCG AATTGCCTGA CTCCTGGGAA 3300
GTGCTCTTAG GAGATAGTTG GCTTTGTTTC TGGGAGTCTG TGGTTGTACT GCCTGCTAAT 3360
GCACAACTCC AAAGGACAAT TTTGGTTGTG TAGCTTGACA GCTCGGCACC TGTCAGCTCT 3420
GTGCAGGAAG GACCTCCCTC CCCACCTAGC ACAATGCCTG CTTCATGAGT AATTGAATTA 3480
ATGTGTGACT AAGCCTTGAA GGATGGGTCT TCTTTGGCTT TATCAAACCA ATTGGAGTGG 3540
AACTTCTTTC CTGAAAGTTC CCCCTGGGCA GGAATTGTAT CTGAGATTAG TGGGTGGGGA 3600
GGGGGGAAAC AATAAGAAGA GCTCAGAAAA TGACATCTGG GGTGATAAAT CACAGCCCCC 3660
CGAATGGTCC CATTACAAGG TCATTATAGT AAAGTGATCT CAGAATTTGA GACTAGAAAA 3720
CTAATTCAGG AAGAATGAAT ACAGAACAGA 3750