EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS040-02340 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Esophagus 
Coordinate
chr1:150538790-150543100 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs72700829chr1150540181hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr1:150540770-150540781GGGCGGGAAGA+6.14
ZNF263MA0528.1chr1:150540092-150540113GAAGAAGAGGGGGGTGGAGGA+6.32
Number of super-enhancer constituents: 82             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00755chr1:150531631-150544092Adipose_Nuclei
SE_01227chr1:150539000-150541802Adrenal_Gland
SE_01735chr1:150537832-150541914Aorta
SE_01735chr1:150541930-150543119Aorta
SE_02312chr1:150538694-150543027Astrocytes
SE_03050chr1:150538954-150541795Bladder
SE_03050chr1:150542018-150542463Bladder
SE_03050chr1:150542568-150543008Bladder
SE_03708chr1:150538812-150539334Brain_Angular_Gyrus
SE_03708chr1:150539819-150541671Brain_Angular_Gyrus
SE_04228chr1:150538692-150542114Brain_Anterior_Caudate
SE_07310chr1:150538444-150542117Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07310chr1:150542293-150543121Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08618chr1:150538730-150541912Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09026chr1:150540109-150540693Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_10265chr1:150532493-150542117CD19_Primary
SE_11160chr1:150532177-150553440CD20
SE_11968chr1:150538585-150541907CD3
SE_12974chr1:150539454-150540256CD34_Primary_RO01480
SE_12974chr1:150540269-150540950CD34_Primary_RO01480
SE_13457chr1:150538713-150539503CD34_Primary_RO01536
SE_13457chr1:150539536-150542072CD34_Primary_RO01536
SE_14155chr1:150539378-150541737CD34_Primary_RO01549
SE_15431chr1:150538918-150542057CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15874chr1:150539289-150541325CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16367chr1:150538875-150541810CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16925chr1:150539285-150541776CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17377chr1:150532162-150553370CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17879chr1:150532111-150553231CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18425chr1:150532151-150553362CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19272chr1:150538655-150541875CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19272chr1:150541910-150543410CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20081chr1:150532355-150543156CD56
SE_20809chr1:150539093-150541834CD8_Memory_7pool
SE_21519chr1:150539174-150541573CD8_Naive_7pool
SE_21978chr1:150538653-150542121CD8_Naive_8pool
SE_22540chr1:150532459-150546461CD8_primiary
SE_23425chr1:150540076-150541750Colon_Crypt_1
SE_25044chr1:150540130-150541468Colon_Crypt_3
SE_26032chr1:150531381-150542256Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27715chr1:150538686-150542465Fetal_Intestine
SE_30770chr1:150538593-150543400Fetal_Muscle
SE_31016chr1:150538591-150541880Fetal_Thymus
SE_31016chr1:150542378-150542911Fetal_Thymus
SE_32586chr1:150533309-150543254GM12878
SE_33016chr1:150539633-150541760H1
SE_33943chr1:150538842-150541855HCC1954
SE_33943chr1:150541926-150543152HCC1954
SE_36042chr1:150538542-150543022HMEC
SE_37389chr1:150531646-150544455HSMMtube
SE_38169chr1:150538408-150543237HUVEC
SE_39064chr1:150538812-150541759IMR90
SE_40964chr1:150530832-150543289Left_Ventricle
SE_42054chr1:150539572-150541428LNCaP
SE_42411chr1:150530284-150543186Lung
SE_43688chr1:150532235-150541859MM1S
SE_46030chr1:150532378-150543410Osteoblasts
SE_47642chr1:150538913-150540578Pancreas
SE_47642chr1:150540671-150541781Pancreas
SE_49753chr1:150540131-150540564Right_Ventricle
SE_49753chr1:150540681-150541760Right_Ventricle
SE_50200chr1:150531037-150543263Sigmoid_Colon
SE_51405chr1:150530419-150544422Skeletal_Muscle
SE_51911chr1:150538607-150543077Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53505chr1:150530243-150543121Spleen
SE_55206chr1:150538746-150541804Thymus
SE_55206chr1:150542149-150542815Thymus
SE_58716chr1:150532377-150553189Ly1
SE_58896chr1:150532323-150553188Ly3
SE_59735chr1:150532367-150553203Ly4
SE_60541chr1:150532429-150553188DHL6
SE_61243chr1:150532496-150553036HBL1
SE_61580chr1:150532299-150553306Toledo
SE_62270chr1:150532150-150553368Tonsil
SE_63690chr1:150538668-150543114HSMM
SE_64390chr1:150538543-150539465NHEK
SE_64390chr1:150539574-150543233NHEK
SE_65428chr1:150539386-150541513Pancreatic_islets
SE_67307chr1:150532235-150541859MM1S
SE_67962chr1:150539806-150541743u87
SE_68344chr1:150532799-150553352TC32
SE_69013chr1:150538863-150542064H9
Enhancer Sequence
GCTGGGATTA CAGGCATGAG CCACTGTGCC CAGCCCAAAC CTTGAATAGT TTTAAGTGTT 60
CTTGCTGTTT TTTTTCAAAT GTCTTTCAGG ACTTTTCAGC TAAAATTCTG TTTAAACTTT 120
TTCAGACTTT CAAGAAATTA GAAATGCTTT CAAATTCATG ATAGTTTTGT GTCATTTATA 180
CCCAATCCAG ACTTATTTAG ACCAAACAGC CTTTTTTTCC TACCAGTGTT TTCCAATTTT 240
TATCTTAAGA GGCAGGGTCT TGCTATGTTG CCCATGCTGG AGGGCGGTGG CTATTCACAG 300
GTGCAATTCT ACTACTGATG AGCACAGGAG TTTTGACCAG CTCTATTTCC AACGTAGGCA 360
GGTTCACCCC TCCTTAGGCA ACCTGGTGGT CCCCCACTCC CAAGAAGTCA CCATATTGAT 420
GCGGAACTTA GCATGAACAC CAGATCAACA TAGCGCACTA TAGCCCTGAA CTCCAGGGCT 480
CAAGTGATTC TTCTGCCTTA GCCTCCAGAA TATCTGGGAC TACAAGCGCG TGCAACTGCG 540
CCTGGCCAAT TTTCCTGGGT CCAGGAAATG ACAGTATTCC TGGTCTTTGT TTAAGGTACA 600
CTGTCTTGCA AACATAGGCT TATGTATAAT GGTAAGCCAC AAGCATTTAC TAAGTTTTTT 660
TTTGAGACAT AGTCTCACTG GCCCAGGCTG GAGTGCAGTG GCACGATCTA GGATCACTGC 720
AACCTCTGCA TCCCAGGTTC AAGCAATTCT CATGCCTCAG CCTCCTAAGT AGCTGGGACC 780
ACAGGTGCAC ACCACCACCC CCATTTTTAG TAGAGAGAGT TTTGCCATGT TGGTCAGGCT 840
GGTCTCAAAC TCCTGACCTC AGGTGATCCA CCCGCCTTGG CCTCTCAAAG TGCTGGGATT 900
ACAGGCATGA GCCACCGCGA CTGGTCAAAT TTTTCTTTCA TACAGTAGCA CTGATACATC 960
TTTCATGGTT CATGATGGGG AAAGGAAGAT ACAGCGACTT CCATCCTGTT TCATACCTGA 1020
CCCCAACTAC CCAGCTTTGA AGTGGGGCAA GGGGCAAGGA AGCAGGTAGC CCAGCACTCC 1080
TCCCCGCCAT CACCAGGCTC CTCTGCAGAG CTGTTGTTCC TTAAAGCTGA CAACAAGCCA 1140
CCTCATTTCA AAACACACAC ACACAACCTC ATTTTGACAC AAAGTTGTTT CCCTCTTTCT 1200
GTTTCTCTGC TTTGCCTCAT GAGGGATTTC TGAGAAATGA AAAAAAGTCA CCTCCCACAG 1260
CCGCAGCCTG CAGTTTTGTT TTTTGGTTTT GTTTTTACAG ATGAAGAAGA GGGGGGTGGA 1320
GGAAAGGAGT ATACCGCTTA AGCATCTAGT ATTAATCCAA AACTCTGCAA AGTAAGAGAA 1380
ATGCTCTTCC CATAGCCCTT CACCTGAGGT GTGTGCCCCA CTTTCCTTAG ATTTGGGCTC 1440
TCATGCAAAA GGAAATAAAC AAGGTATCCT CCCCTCAGGA AAGTTCAGTA ACAAAGCAGT 1500
GAAACCGAAC AGCTGCTCCC TTGCAGCAGG CCAGCTGTCT CCCCTCCCCC CATTTCCACC 1560
AAGGGCCGGA GACGGTGGGA ACTGCTCCAG GCAACCTAAA GGATGGCGTT GTGAGCTGAG 1620
AAAGGCAGGC CTGATAGATC TGGGCATAGG AGCTTCAGGA ATAAAATGCA TGTGAATGCG 1680
GTGTTTCCCA GGGAGAATTA ACCGCATTCT CGCCTTCAAA TCTGAATACC TGAGAGTCAT 1740
AACCAGCCCA GTAGGGTAGA CTATGAAATG TATAGCAAAA TTTTCAAAAC CAGCTCCTCC 1800
TACCAGACAA GAAAATTAAC ATTTTTTAGG GCACAGAACT GAAAGCATTT TTACTGAAAT 1860
CTAATCCAGG ATGAAACCTA ACAGTTAAAC ATTCTTTTCC TTCTCTGCTT CTTTGGCTCT 1920
CTATCCCAGC ACACCTTGTC CCAGGCTAAC TTGAGTAAAC ATACACATGT GACCACATGA 1980
GGGCGGGAAG AACACCAAGT GGGGGTGGTG AAATTCTGAA TGGAATGCAG CCCCAGCTAG 2040
TTAGGGGGCC CCGGGCTGAG ACCTCTGGCA CTGGCAGTAG ACTTATACAG GCAAAGAAGC 2100
CAAAACAATG AGCTCATGGG CAAGAATGCA GCCTGTGGGG AAGTCTGGGC AGCTAGAGCA 2160
AACTGGTTTT TTGAATCAGG ATGGGAATAG CAATAGTTGA GTCTCCCACG GGAACAGGAT 2220
CAGGGAGAGT GGAAGCCACC ATTCAGTATC TTAGGGTTCC AGTTAAATAA CTTTTGGAAG 2280
CTCTTATTAA AATTCTGTTC TGCAGACAGC ATAGTGCTCT TAGGCAAAAC CTTGGTTCCT 2340
TTCCCTGACT ATGTAAAACC TAGAGGGTGA AGGACCAGTG AGGCTCCAGT GACCTACCTT 2400
AGGTGATGCT CTTAAAAGAG CAACTTTATT CAAACCAGGC CTGCCAATGC CAACTCCTTC 2460
AGTCTAGATC CAAAGATGGC TATGATCCTG AGATTGTGTG TTTAGGGTCA CCACTTTAAC 2520
ATGATACAGG AAGCAATTGA GTCTTTTCTA CTTCCTAAAC ACAGTCCATC CAGTTGTGTG 2580
TCATTTATAC CCAGTCCAGA CTTATTTAGA CCAAAGAGCC TTTTTTTCCT ATCAGTGTTT 2640
TCCAAATTTT ATCTTAAGAG GCAGGGTCTT GTTATGTTGC CCATGCTGGA GAGCAGTGGC 2700
TATTCACAGG TGCAATTCTA CTACTGAGGA GCACAGGAGT TTTAACCAGC TCTATTTCCA 2760
ACCTAGGCAG GTTCACCCCT ACTTGGGCAA CCTGATGGTC CCCCACTCCC AGGAAGTCAC 2820
CATATTGATG CAGAACTTAG CGTGAACACC AGATCAACGT AGCACACTAT AGCCCTGAAC 2880
TCCGGGGCTC AAGTGATTCT TCTGCCTTAG CCTCCAGAAT ATCTGGGACT ATAGGTACGT 2940
ACAACTGTGC CTGGCCAAAT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTG AGATGGAGTC TCGCTCTGTC 3000
ACCCAGGCTG GAGTGCAGTG GCGTGATCAT GACTCACTGC AGCCTCTGCC TCCCGGGTTC 3060
AAGTGATTCT GGTGCCTCAG CCTCCCGAGT AGCTGGGACT ACAGGAATAA GCCACCACGC 3120
CCAGCTAATT TTTTTGTATT TTTAGTAGAG ATGGGGTTTC GCCATGTTGG CCAGGCTATC 3180
CTCGAACTCC TGACCTCAGG TGATCTGCTT GCCTCGGCCT CCCAAAGTGC TGGGATTACA 3240
GGCATGAGCC GCCACGCCTG GCTCTAATAT TTTTATATAA GGCCTGAGAT GGGAAAAACT 3300
GAAGTCATAC AGTATTCACT GACCAAGAGC GGCGAGCAGA GAAAGAAGGC AGGGAAGGAA 3360
GATGGAATAA GAAAATTACC TACACAGTCC ATCCCTGCTT CTCCCATCTC CATACACCCA 3420
GAGGGTCTTT CCCAATTCCA TGCTTTGGTA CGTGTTTCTT ACTCATCTTT TTTTTTGAGT 3480
CTCGTTCTGT TGCCCAGGCT GGAGTGCAGT GGCATGATCT CGGATCACTG CAGCCTCCAC 3540
CTCCCGGGCT CAAGTGATTC TCCGGCCTCA GCCCCCCAAG AAGCTAGGAT TACAGGTGTG 3600
CACCATCACG CTCATCAAAT TTTTGTGTTT TTAGTAGAGA TGGGGTTTTA CCATGTTGGC 3660
CACACTGGTG ACCTCGGGTG ATCTACCCAC CTCAGCCTCT CCAAGTGCTG GGATTACAGG 3720
TATGAGCCAC CGTGCCCAGC CTCGTTACTC ATGTTTTAAG GTCCAACCTC ACATTTCTTA 3780
TGAAGCCTTC TTTACCACCC TCTACGTCTA GAAGTTGTCA CCCTGCTTTT TCCCAACCCT 3840
ACAATGCTTT GTACAGTGCC TTCTAATTAT TTCTGTCCAT GTCTATGACT CTTACTAGAT 3900
TGTAAACTTT GTGTGTGTGT GTGTTTCTTT TTTTGTTAAG ATAGGGTCTC ACTCTGTTGC 3960
CTGGGCTGGA GTGCAGTGGC ACAATTTCAG CTCACTGCAA CCTCGACTTC GTAAGCTCAA 4020
GCGTTTCTCC CACCTCAGCC TCCCCAGTGG CTGGGACCAC AGGCACGTGC TACTATGCCA 4080
AGCTAATTTT TTTTATGTTT TATAGAGATG GAGTTTCACC ATATTGCCTG GGCTGGTCTC 4140
AAACTCCTGG GTTTAAGCAA TCTGCCTGCC TTAGCCTCCC AAAGTGCTGG GATTACAGGC 4200
ATGAGCCACT GCACCCAGCT AGATCACAAA CTTTAACATC TAGCCACATT TGCATTCTCA 4260
TTATGGGATT CGTTATGCAT AAATTCTTTA GCATGCATCT CCTAAAAACA 4310