Tag | Content |
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EnhancerAtlas ID | HS003-01323 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | A549 |
Coordinate | chr1:52198170-52205100 |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
Atoh1 | MA0461.2 | chr1:52204105-52204115 | AACATATGTT | + | 6.02 | Atoh1 | MA0461.2 | chr1:52204105-52204115 | AACATATGTT | - | 6.02 | IRF1 | MA0050.2 | chr1:52201545-52201566 | AGTTAGTTTCTCTTTCTTCTT | + | 7 | NKX2-5 | MA0063.2 | chr1:52198683-52198693 | CTCAAGTGGT | - | 6.02 | Nkx3-2 | MA0122.3 | chr1:52202796-52202809 | TTTAAGTGCTTTT | - | 6.03 | STAT1 | MA0137.3 | chr1:52202354-52202365 | TTTCCAGGAAA | + | 6.62 |
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| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 1 | Chromosome | Start | End |
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| Number: 5 | ID | Chromosome | Start | End |
GH01I051735 | chr1 | 52199873 | 52200272 | GH01I051734 | chr1 | 52200474 | 52201472 | GH01I051736 | chr1 | 52202273 | 52202907 | GH01I051737 | chr1 | 52203473 | 52203672 | GH01I051733 | chr1 | 52199073 | 52199472 |
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Enhancer Sequence | GTATTCCTCC TTAAATATTT TAATGAAGTT CTACCACACA CAGGCATTTA AAGCTACTTT 60 CCATCTTCCT TATTTTCCAT CTCCAGTCAC CAGGTCCTGT TATGTTTGCC TTAGTAATAT 120 TTTTCAGATT CGTCACTTTT TTCTAGATGA TAATGCTTTA ATTCAGGCCA TCATGGTCTC 180 TCACCTAGAC TTTTGCAAGG CTTTCTGACT AGTCTGTCAC TGGACTCCCC TTACCCCATC 240 CTTTTTATCC AAAAACAAAT TTGGAATGGG TTGCCGCTCT TATAGTTAAG AATGTGTTTT 300 GGCTCCTCCT TGCCAGAGTC CAGCTGCCCA GCATGTCCTG GAGGCCCTTC TTCATATTCT 360 GGTCCTGATT TATCTCTGAG TCCAGACTCA GCTCCAGGTG CTTTACCCAC GGCATCCACT 420 GTGAACTGTT TCTCATTGAG AACATGCCAT AGCCTCTCAC AGTTATTTGT CTTTTCACAG 480 CCTTTCCTTC TTGCTTAGAT TACCCCACTG TATCTCAAGT GGTAAGCCTC CAGTTCTTCC 540 TTAGCATACA GCTCCTGTGT TAACCTTTTC TATGATGCCT TCCTTCAGGC AGGGTGAGTT 600 TGTTACTCTT GTGTGTGCTA CTACAGCACT TTGCTCATAT CTCCATATCA CAGCCTTCAC 660 TAAGTTGTAT TGTAAATTTT TAAACATATG TGATTCTTGC ATTAAACCCT GATTTCCTAG 720 AGATCTGGGG TTCTCACTCA TCTTTGTATC CCCGGGGCCT TTGTCCCTAG TTTAGTGCAT 780 GGCACATAGT AGGTGTTCAG TAAGTGCTTA AGTGATCAAA ATATGTGACG ATAATAGCTT 840 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